基因總覽
LY6G6D 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 lymphocyte antigen 6 family member G6D。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 6p21.33。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000375825 ★ | 31,715,348–31,717,919 | 3 |
| ENST00001141601 | 31,715,285–31,717,919 | 3 |
| ENST00000375824 | 31,715,356–31,717,804 | 3 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>LY6G6D ENST00000375825 GRCh38 chr6:31714348-31715448 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGATCCCTTTGATCCCCCCAAGCTTCAACATTCCTACCCTGTAATTATCCCTGCCAGCTTTACTACCTTG GAGGAAAGAAATAACCACGGGTGGGGCTGGAGGGCCTGCTGATGTGCTTGCACTGGGGAGAAATCACTAG AAAGGAAGGCATGGATGGGATTTGGGGTAGGGGGGTGGTGATACAGCCTGGAAGGCTGGGGTTGAAGAGA CTGGGAAGGAGGAAGGCCCATCTGGGGAATCAGAGCCAGCATGTACCAGGAGGAGTAAGACTAGGAACAG GGAGTGAAGATAGGGGAGACACAGGTGCCCAGGAGAGCAGCTCTTTTCAAAAATATTGATCTCAGGACCT CTTTACACTTTTCAAAGTTACTTAAGACTCTGAAGAGCTTTTCTTTATGAGGTTATATCAATATTTACTA CATTAAAAATTAAAACAGAAAATTTAAAGTAGGTATTTATTGATTTATTTAAACAATAAAAATAATAAAG TATTACATGCTAACAAAATACAGTTTTGTGAAAAATAACTATTATTTCTCCACAGCACAGTGAGAAGCTG AGCATTGCTTTACATTTTTGTGAATCTAGTGTCAGGCTTCGTGGGAGATGCCTGGGTTTTCCTATCTGCT TCTGCATTCAGTCTGTTGGGATATGTTGTTTTCGTTGAAGTCCAGTATATGAAGAAAATCTGACCTTACA CAGATAGTTGCAAAAGGAGGACCCTCAAGGACCCTGTGAAAGGGTATCAGGGATCCTCAGGGGTTCTTGT TGGTCCACAGACTGCTGCTGAGGATAAAGGAGTTTGAGGACTCCAGAGGATGCTGAGAGCATGCTGTGGG GCCCCTCCCTGTCCCCACTGGGGCCCTTGGTGCCTGCTGGGGGAGACTCTTTCTTCCTTTTTTATAGCCC TATAAAGCTCAAGGCACGGGGGATATAAGGCAGGCAGAGCCGGGCTGGGGAGGGGGGTGGGCAGGAGGTA GAGGCGGTCCTGACACGGGCAGACTGCGATGAAACCCCAGTTTGTTGGGATCTTGCTCAGCTCCCTGCTA GGGGCTGCCTTGGGTAAGGAGGCGGCCAGCTAGCTTCTCACACAGGCCTTC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| LY6G6D_1 ↗ | 6:31,715,348 | 正股 | 31,715,299–31,715,358 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：133 aa
Lymphocyte antigen 6 complex locus protein G6d 長 133 個胺基酸，序列第 1–19 位為訊號序列，第 22–116 位為 UPAR/Ly6 結構域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
LY6G6D 定位於細胞膜，並以 GPI 脂質錨定；另記錄於 filopodium（絲狀偽足）。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Cell projection, filopodium。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- HSPA5P11021 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MEOX2Q6FHY5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NCALDP61601 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NCS1P62166 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBQLN2Q9UHD9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
LY6G6D 被註記為同源二聚體；此資料未提供其他互作或複合體資訊。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | Homodimer | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | LY6G6D 定位於細胞膜，透過脂質錨定中的 GPI 錨定形式附著，並記錄於細胞突起 filopodium。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGACTGCGATGAAACCCCAGTTTGTTGGGATCTTGCTCAG40CTCCCTGCTAGGGGCTGCCTTGGGAAACCGAATGCGGTGC80TACAACTGTGGTGGAAGCCCCAGCAGTTCTTGCAAAGAGG120CCGTGACCACCTGTGGCGAGGGCAGACCCCAGCCAGGCCT160GGAACAGATCAAGCTACCTGGAAACCCCCCAGTGACCTTG200ATTCACCAACATCCAGCCTGCGTCGCAGCCCATCATTGCA240ATCAAGTGGAGACAGAGTCGGTGGGAGACGTGACTTATCC280AGCCCACAGGGACTGCTACCTGGGAGACCTGTGCAACAGC320GCCGTGGCAAGCCATGTGGCCCCTGCAGGCATTTTGGCTG360CAGCAGCTACCGCCCTGACCTGTCTCTTGCCAGGACTGTG400GAGCGGATAGGGGGAGTAGGAGTAGAGAAGGGAACAAGGG440AGCAAGGGAACAAGGGACATCTGAACATCTAATGTGAGAA480GAGAAACATCCTTCTGTGAGTCATTAAAATCTATGAACCA520CTCTA525cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。