01 / GENE OVERVIEW
基因總覽
LY6G6C 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 lymphocyte antigen 6 family member G6C。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 6p21.33。
Official symbol
LY6G6C
Gene name
lymphocyte antigen 6 family member G6C
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13936
UniProt
O95867
02 / NOMENCLATURE
基因異名與舊稱
Alternative gene names & synonyms
G6cNG24C6orf24
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
03 / GENOMIC CONTEXT
染色體位置與基因結構
Chromosome 66p21.33
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr6:31,718,648–31,721,746
Gene span
3,099 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000375819 ★ | 31,718,648–31,721,746 | 3 |
| ENST00000495859 | 31,718,648–31,721,679 | 4 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
04 / BIOLOGICAL FUNCTION
分子功能與生物學過程
目前匯入的來源未提供可採用的功能敘述。這不代表此基因缺乏生物學作用；有新的可用註解時可再補充。
05 / GENE REGULATION
Promoter 與基因調控
依所選 TSS 來源，取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算；調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>LY6G6C ENST00000375819 GRCh38 chr6:31721646-31722746 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGTAGCTGGAACTACAGGTGCATGCCACCACACCTGACTAATTTTTGTATTTTCAGTAGAGATGGGGTTT CACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCGATCTCTTGACCTTGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCT GAGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCCGGCCTACTATTTCTATTCTTATTTTAGCTTCTACCTCACCTC TCTGTGCCCATGCTGTTCCTCCTGGCTTGGTACCCTGCCCAAGTTGGCAGGTTTTGACTGGGGAGGTGCT TTGGAGCAGGTGCACACAGCCACACCTAGGACAATTGCTGCTGCTGGACTGGAGCAACAAGGCCACACCA AGCGCAAGTGGAGCACGGGTGACATCCTGAGAACCTTCATGGGAGCCTGAGGCAGCCCTACTTAGCAGAC CTGTGGTGGCTCTCCTGGATGAGTAGCCCCAGCCCCTGCCTCTGCTGCTGTGGCATCACAGAAGCCATCA GTGAGTCACTTATTGCTGAGCAGGCATTGGAAAGACCGAGTGGGGGCTGAATGGAGATTAATTTGACCCA TTCCTCCCCCAATTTCCACCAGCATGCCCCTATCAATGCCCAGCAGGGACCCAGGGACCCAAATTCAGCA ATTAATTTGGGCCACATCCTTTTGTCCATTTTCCAGGAACCAGCAGAAGCTGCCACCATGGACACTGTAA ATCACAGAGGCCTTTGATGATGCTCATTCAGAGGACTGAGCAGCAGGACTCTTAGCTGGGGACCAGGAAG GGCATCTTGGCCTGAAACCAAGAACCACAATGGCATTGGCCACTAGTGGCACCTGCCTTCCCCCATCCCT CTCTCCCATCCCTACTCCCCACTCAGTCCTGCTCAGTGCCTTCCCACCCCTTGTCTTTTCTCTGGTCAGC TGCGTAGTAAGTGAGAAGGGAGGGGCTACCAGAGGCAGGGAAGGGAGGAGCCTTTGGGTTTATAAATTCC AAAAAGGCCACTCAACTCCTAGAGCTGGATCCTTGAAAATCTACTCTATCAGCTGCTGTGGTTGCCACCA TTCTCAGGACCCTCGCCATGAAAGCCCTTATGCTGCTCACCCTGTCTGTTC
LY6G6C 位於負股。上下游依轉錄方向計算，序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示；負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| LY6G6C_2 ↗ | 6:31,720,383 | 負股 | 31,720,373–31,720,432 |
| LY6G6C_1 ↗ | 6:31,721,746 | 負股 | 31,721,736–31,721,795 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算；該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：125 aa
LY6G6C 的蛋白質長 125 個胺基酸，具有位於第 1 至 18 位的訊號胜肽，以及第 20 至 111 位的 UPAR/Ly6 結構域。
訊號胜肽1–18 aa
結構域UPAR/Ly620–111 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY
蛋白質三維結構
自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O95867…
08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION
細胞內定位
定位：Cell membrane
LY6G6C 位於細胞膜，並以脂質錨定形式連結；來源註明其具有 GPI-anchor。
UniProtKB
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
09 / PROTEIN NETWORK
交互作用與訊號網絡
圖中 7 個夥伴 · 最多顯示 50 個
來源支持的結構／直接結合關係其他來源關係紀錄
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
7 個夥伴
- ARLNQ8WVX3-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SLC38A7Q9NVC3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SLC39A2Q9NP94 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SLC41A2Q96JW4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMEM203Q969S6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBE2J1Q9Y385 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- YIPF6Q96EC8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
第 1 頁
LY6G6C 以單體形式存在；來源未提供其與其他蛋白質結合或形成複合體的資訊。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX
Contextual Functional Evidence Matrix
功能證據與細胞情境矩陣
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
2 筆功能證據／註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預／量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」，空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | Monomer | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | LY6G6C 位於細胞膜，並透過脂質錨定；其膜錨定形式註明為 GPI-anchor。 | 含實驗來源 |
情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀，不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識；未逐篇核對原始方法的紀錄，不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER
核酸與蛋白質序列
完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列，保留非編碼區。
1
AGAGCTGGATCCTTGAAAATCTACTCTATCAGCTGCTGTG4041
GTTGCCACCATTCTCAGGACCCTCGCCATGAAAGCCCTTA8081
TGCTGCTCACCCTGTCTGTTCTGCTCTGCTGGGTCTCAGC120121
TGACATTCGCTGTCACTCCTGCTACAAGGTCCCTGTGCTG160161
GGCTGTGTGGACCGGCAGTCCTGCCGCCTGGAGCCAGGAC200201
AGCAATGCCTGACAACACATGCATACCTTGGTAAGATGTG240241
GGTTTTCTCCAATCTGCGCTGTGGCACACCAGAAGAGCCC280281
TGTCAGGAGGCCTTCAACCAAACCAACCGCAAGCTGGGTC320321
TGACATATAACACCACCTGCTGCAACAAGGACAACTGCAA360361
CAGCGCAGGACCCCGGCCCACTCCAGCCCTGGGCCTTGTC400401
TTCCTTACCTCCTTGGCTGGCCTTGGCCTCTGGCTGCTGC440441
ACTGAGACTCATTCCATTGGCTGCCCCTCCTCCCACCTGC480481
CTTGGCCTGAGCCTCTCTCCCTGTGTCTCTGTATCCCCTG520521
GCTTTACAGAATCGTCTCTCCCTAGCTCCCATTTCTTTAA560561
TTAAACACTGTTCCGAGTGGTCTCCTCATCCATCCTTCCC600601
ACCTCACACCCTTCACTCTCCTTTTTCTGGGTCCCTTCCC640641
ACTTCCTTCCAGGACCTCCATTGGCTCCTAGAAGGGCTCC680681
CCACTTTGCTTCCTATACTCTGCTGTCCCCTACTTGAGGA720721
GGGATTGGGATCTGGGCCTGAAATGGGGCTTCTGTGTTGT760761
CCCCAGTGAAGGCTCCCACAAGGACCTGATGACCTCACTG800801
TACAGAGCTGACTCCCCAAACCCAGGCTCCCATATGTACC840841
CCATCCCCCATACTCACCTCTTTCCATTTTGAGTAATAAA880881
TGTCTGAGTCTGA893cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。
13 / DATA PROVENANCE