基因總覽
LY6D 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 lymphocyte antigen 6 family member D，屬於 lymphocyte antigen 6 家族。其產物為 Lymphocyte antigen 6D，來源資料將它與淋巴細胞發育早期的細胞命運指定相關聯；目前的描述聚焦於其作為早期標記的可能性，並未提供更廣泛的分子功能或表現資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000301263 ★ | 142,784,882–142,786,539 | 3 |
| ENST00001100173 | 142,784,881–142,786,546 | 3 |
| ENST00001100174 | 142,784,882–142,786,546 | 3 |
| ENST00001135639 | 142,784,882–142,786,546 | 3 |
| ENST00001100175 | 142,784,883–142,786,546 | 3 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Lymphocyte antigen 6D 可能在淋巴細胞發育早期擔任細胞命運指定的標記。來源將其作用放在B細胞與T細胞發育分流的最早階段，並指出它標示B細胞命運指定開始的最早階段。
這項描述將 LY6D 與早期B細胞發育的辨識聯繫起來，但措辭為「可能」擔任標記；資料未進一步說明它如何參與細胞命運決定，也未提供實驗條件或其他作用機制。因此，現有資訊支持的是其作為早期指定標記的可能角色，而非已確立的因果功能。
Promoter 與基因調控
>LY6D ENST00000301263 GRCh38 chr8:142786439-142787539 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGGCCCTGGGTGCTGGGGCCCAGCCCCAAAGAGTTCACGATTTTGGGGAGACTGGAGCCGGGACACCTAG AGCAATAGTTACAAAGTGGCCGGGATGGCGCTGCCCCCAACGTAGCAGGAGGGGCCTGGAGAGTGGGGGA AGGAATCCCACGGGGAGGGCTTCTGGGGCCCTGGAGGGCGGGAGGCAGGGCTGGTGGAGACCAGGAGGGC TCAGTCTCTCCCTGCACAACGCAGGGTGGAGTTGCTGCCTCCACAGCCCGGGCCTTCTGCCCACAGGGCT CCCCAGGCAACTTCGAGGGCCGGGTCCTCACAGTCCTCACTCTGTCCAGTGCTCACCTCACTGCTGCCCC AGCTGCCCTCCCTGCCTCGGAGTGGCCTCTGCCTCTGCCTCTGCCTCACACACCCCATCAGCCCACAGCC ACCCCGAGCCCTTGCAGCTCAAGGACCTTCTGCATCCCCGGCAGCAACCCTGAGCCCAGAGCCAGGAGAG TAGGACCAGCACCTGCCCTTCCTACCTCCCCTGCCCTGGACACCCACGGGCACCCACAGGGCACCGGGCA CAGGCTGCAACTCTATTGAGGGAACTATGGGGGGAATGCAGGGACAAAGACACAGGATGGTGATGGATGG TGGGGGGTGGGGGGCGGGGGGTAGCGGGTGGCAGGTCAGAGACAAAGTGACCCAGGAACGGACGGCAGCG AGAGAACAAGACCCACAGAGACAGAGAAGTGAAAGTGGGAGAGATGGAGGCACAGCAGCAGGAACAGCAG GGCCAGGAGGCCACTGGGCCCCGTTGCGGAGGGCAGACCTCTGCCTGGCGGGGGGCAGCAGGGGCAGCGC CCAGCGACAGCCAGGCTGGTGGGCGTGGGCCAGGCAGGGTGGGGCAGGTGCCCGTCCTGGGCTGACGCTT GCACAGAGCCCTGCAGAATGCCGCTGGCTGGCGGACTGCCCACCCCCGCCCAGCCCGTGCCTATAAGGCC TTGGCAATGCAGGGGCCCGCACTGCTCCCAGACGACATCAGAGATGAGGACAGCATTGCTGCTCCTTGCA GCCCTGGCTGTGGCTACAGGGCCAGGTGAGGGGCTGGGCCAAGGGGACGGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| LY6D_1 ↗ | 8:142,786,539 | 負股 | 142,786,529–142,786,588 |
| LY6D_2 ↗ | 8:142,788,598 | 負股 | 142,788,588–142,788,647 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR8_CJ6JL · enhancer · 142781865–142783113 · regulatory
ENSR8_538KQLT · CTCF_binding_site · 142782661–142782682 · regulatory
ENSR8_538KQN9 · CTCF_binding_site · 142782960–142782981 · regulatory
ENSR8_538KQNG · CTCF_binding_site · 142782998–142783019 · regulatory
ENSR8_538KQT6 · CTCF_binding_site · 142784014–142784035 · regulatory
ENSR8_538KQWJ · CTCF_binding_site · 142784310–142784331 · regulatory
ENSR8_538KR4B · CTCF_binding_site · 142785346–142785367 · regulatory
ENSR8_867CDQ · enhancer · 142785854–142786071 · regulatory
ENSR8_CJ6K3 · enhancer · 142788057–142789790 · regulatory
· motif · 142782663–142782679 · motif
· motif · 142782962–142782978 · motif
· motif · 142783000–142783016 · motif
· motif · 142784016–142784032 · motif
· motif · 142784312–142784328 · motif
· motif · 142785348–142785364 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：128 aa
Lymphocyte antigen 6D 長 128 個胺基酸。其序列第1至20位為 Signal 區域，第21至108位註記為 UPAR/Ly6 Domain；來源未提供其他結構區域的描述。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Lymphocyte antigen 6D 位於細胞膜，並以脂質錨定方式連結；來源標示其錨定形式為 GPI-anchor。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- AQP6Q13520 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ELOVL4Q9GZR5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMEM86BQ8N661 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | LY6D 可能在淋巴細胞發育早期，於B細胞與T細胞發育分流的階段作為細胞命運指定標記；來源另指出，它標示B細胞命運指定的最早階段。此描述保留其可能性，未說明具體分子機制。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源May act as a specification marker at earliest stage specification of lymphocytes between B- and T-cell development. Marks the earliest stage of B-cell specification |
| 細胞定位 | Lymphocyte antigen 6D 定位於細胞膜，並透過脂質錨定連結；來源將其錨定形式標示為 GPI-anchor。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
ACTGCTCCCAGACGACATCAGAGATGAGGACAGCATTGCT40GCTCCTTGCAGCCCTGGCTGTGGCTACAGGGCCAGCCCTT80ACCCTGCGCTGCCACGTGTGCACCAGCTCCAGCAACTGCA120AGCATTCTGTGGTCTGCCCGGCCAGCTCTCGCTTCTGCAA160GACCACGAACACAGTGGAGCCTCTGAGGGGGAATCTGGTG200AAGAAGGACTGTGCGGAGTCGTGCACACCCAGCTACACCC240TGCAAGGCCAGGTCAGCAGCGGCACCAGCTCCACCCAGTG280CTGCCAGGAGGACCTGTGCAATGAGAAGCTGCACAACGCT320GCACCCACCCGCACCGCCCTCGCCCACAGTGCCCTCAGCC360TGGGGCTGGCCCTGAGCCTCCTGGCCGTCATCTTAGCCCC400CAGCCTGTGACCTTCCCCCCAGGGAAGGCCCCTCATGCCT440TTCCTTCCCTTTCTCTGGGGATTCCACACCTCTCTTCCCC480AGCCGCAACGGGGGTGCCAGGAGCCCCAGGCTGAGGGCTT520CCCCGAAAGTCTGGGACCAGGTCCAGGTGGGCATGGAATG560CTGATGACTTGGAGCAGGCCCCACAGACCCCACAGAGGAT600GAAGCCACCCCACAGAGGATGCAGCCCCCAGCTGCATGGA640AGGTGGAGGACAGAAGCCCTGTGGATCCCCGGATTTCACA680CTCCTTCTGTTTTGTTGCCGTTTATTTTTGTACTCAAATC720TCTACATGGAGATAAATGATTTAAACCAG749cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。