演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

LXN

latexin

LXN 編碼 latexin,屬於蛋白酶抑制劑 I47(latexin)家族;其產物可抑制 CPA1、CPA2 與 CPA4。

Homo sapiens3q25.32UniProt Q9BS40
OFFICIAL SYMBOL
LXN
CHROMOSOME
3
UNIPROT
Q9BS40
PDB / ALPHAFOLD
2BO9
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

LXN(latexin)是蛋白質編碼基因,其產物屬於蛋白酶抑制劑 I47(latexin)家族。latexin 長 222 個胺基酸,具有兩個 Cystatin LXN-type 結構域,中間由一段 α 螺旋連接區相連。來源將其描述為 CPA1、CPA2 與 CPA4 的抑制劑,並指出它可能參與發炎;作用方式與可能的生物學意義詳見功能說明。

Official symbol
LXN
Gene name
latexin
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13347
UniProt
Q9BS40
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 33q25.32
chr3 · 198,295,559 bp · GRCh38chr3p26.3 · 1–2800000 · gpos50chr3p26.2 · 2800001–4000000 · gnegchr3p26.1 · 4000001–8100000 · gpos50chr3p25.3 · 8100001–11600000 · gnegchr3p25.2 · 11600001–13200000 · gpos25chr3p25.1 · 13200001–16300000 · gnegchr3p24.3 · 16300001–23800000 · gpos100chr3p24.2 · 23800001–26300000 · gnegchr3p24.1 · 26300001–30800000 · gpos75chr3p23 · 30800001–32000000 · gnegchr3p22.3 · 32000001–36400000 · gpos50chr3p22.2 · 36400001–39300000 · gnegchr3p22.1 · 39300001–43600000 · gpos75chr3p21.33 · 43600001–44100000 · gnegchr3p21.32 · 44100001–44200000 · gpos50chr3p21.31 · 44200001–50600000 · gnegchr3p21.2 · 50600001–52300000 · gpos25chr3p21.1 · 52300001–54400000 · gnegchr3p14.3 · 54400001–58600000 · gpos50chr3p14.2 · 58600001–63800000 · gnegchr3p14.1 · 63800001–69700000 · gpos50chr3p13 · 69700001–74100000 · gnegchr3p12.3 · 74100001–79800000 · gpos75chr3p12.2 · 79800001–83500000 · gnegchr3p12.1 · 83500001–87100000 · gpos75chr3p11.2 · 87100001–87800000 · gnegchr3p11.1 · 87800001–90900000 · acenchr3q11.1 · 90900001–94000000 · acenchr3q11.2 · 94000001–98600000 · gvarchr3q12.1 · 98600001–100300000 · gnegchr3q12.2 · 100300001–101200000 · gpos25chr3q12.3 · 101200001–103100000 · gnegchr3q13.11 · 103100001–106500000 · gpos75chr3q13.12 · 106500001–108200000 · gnegchr3q13.13 · 108200001–111600000 · gpos50chr3q13.2 · 111600001–113700000 · gnegchr3q13.31 · 113700001–117600000 · gpos75chr3q13.32 · 117600001–119300000 · gnegchr3q13.33 · 119300001–122200000 · gpos75chr3q21.1 · 122200001–124100000 · gnegchr3q21.2 · 124100001–126100000 · gpos25chr3q21.3 · 126100001–129500000 · gnegchr3q22.1 · 129500001–134000000 · gpos25chr3q22.2 · 134000001–136000000 · gnegchr3q22.3 · 136000001–139000000 · gpos25chr3q23 · 139000001–143100000 · gnegchr3q24 · 143100001–149200000 · gpos100chr3q25.1 · 149200001–152300000 · gnegchr3q25.2 · 152300001–155300000 · gpos50chr3q25.31 · 155300001–157300000 · gnegchr3q25.32 · 157300001–159300000 · gpos50chr3q25.33 · 159300001–161000000 · gnegchr3q26.1 · 161000001–167900000 · gpos100chr3q26.2 · 167900001–171200000 · gnegchr3q26.31 · 171200001–176000000 · gpos75chr3q26.32 · 176000001–179300000 · gnegchr3q26.33 · 179300001–183000000 · gpos75chr3q27.1 · 183000001–184800000 · gnegchr3q27.2 · 184800001–186300000 · gpos25chr3q27.3 · 186300001–188200000 · gnegchr3q28 · 188200001–192600000 · gpos75chr3q29 · 192600001–198295559 · gnegLXNpq1 bp198,295,559 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr3:158,591,891–158,672,732
Gene span
80,842 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000264265 ★158,666,414–158,672,6486
ENST00001126396158,591,891–158,672,7326
ENST00000482640158,645,822–158,669,5934
ENST00001126397158,659,434–158,672,7326
ENST00001093529158,666,414–158,672,7326
ENST00001143698158,666,414–158,672,7326
ENST00001114406158,669,132–158,672,7323

顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

latexin 是 CPA1、CPA2 與 CPA4 的強效抑制劑。來源指出,這種抑制作用具有非競爭性,且幾乎不可逆;也就是說,latexin 對這些標的的抑制並非以競爭方式描述,並具有難以逆轉的特性。這項資料未進一步說明作用的分子步驟或其發生條件,因此不宜延伸推論更細部的機制。

除對上述三種 CPA 的抑制作用外,來源也提出 latexin 可能在發炎中發揮作用。不過,這項描述保留「可能」的限定,未指出其在發炎中的具體作用方向、涉及的細胞或分子環節,也未提供足以判定因果關係的細節。因此,目前可概括為:latexin 的已述功能包括抑制 CPA1、CPA2 與 CPA4,並可能與發炎相關;來源未進一步界定兩者之間是否存在直接關聯。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 158672648 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>LXN ENST00000264265 GRCh38 chr3:158672548-158673648 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TCCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGAACCCAGGAGGCGGACGTTGCAGTGAGCCGA
GATAGCACCATTGCACTCCAGCCTAGGCAACAAGAGTGAAATTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
GAAAAGAAAAGAAAAAAAGGTCTCAATCCAGGCAGCGAAGACCTTGGCCAAACTTTGGTAGAATCTCCAA
GTTATCCTAGCCCAATTAACCTAAGACCACCAAGGATAAACCTGTACTTCTACAAAGTCAGGTTTATAGG
CCCATTGCAATGAGGTAGACCACATACCAGAGAGAGTGCTTTGTATAAGTTCAGTTTTTAAGTTTATTTT
AATCCTTGAAGTAAAATATTCAAAATGACTCAAGTTGGAAGCATGGCGTTACATCAAAACTTATCATTTT
AAGATTAGTAAAGGAGAGGGGTACAGGTGCATTTTTTTATTTCTCCTGATCCAAATTACATAATCTCCCA
ATTTAATACTATAGTTTGCAGATTCTCATACTTTGATTTGGGCAGAACTGGTCCAAACCCACAAAAAGCT
GAGGATGAGCAAGCCTCTTCCTGGACTCTCATAAGGGGAAGGGAAATGAAGGAATCGAATCACTACCTGG
AGTACTGTGTACCTTGCCCTGCCAGGGACGCTGCATGCGGTGTATAAGGAAGTTGTGCTCCAGTATGCAA
GCGAAGCAACCAGACTTTTTTCCCATGGACAGGAAACTAGAGTCTTCAGAGATGTCCTATATCAGCGAAA
GCCCCACCCTGCACTTCTATAAAGGTTAATGAAACGAAAGATGCAATCCCAGCGAACCTAGCCCACTGAC
TCCCTCCCCACACCTCCACCTGCTGGTGCCTGACAAGCATGCTGGCCTCTCCTCCAGTAGGAACCAGCAG
GCGGAGTAAGGAAGCCCGCTGCAGGCAGTAGTGGGGCGGGGCCTCAGAAGCAGTCAGCCCAGGGCTCTCG
GATGCAGGGAGCCTGGGCCCAAACAGCAGCTTCCGGAGTCGGAAGGAGCTGAGGAAGAAGACTGACTGAA
GGAGCTTGCGACTTTTCCGCCTCGGCAACCGGACCCAGCAGCAAGCAGGAC
LXN 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
LXN_1 ↗3:158,672,644負股158,672,634–158,672,693

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR3_86MXS6 · enhancer · 158668596–158668832 · regulatory

ENSR3_94BZG9 · promoter · 158672638–158673106 · regulatory

ENSR3_53DBN92 · CTCF_binding_site · 158672729–158672750 · regulatory

ENSR3_53DBN98 · CTCF_binding_site · 158672779–158672800 · regulatory

· motif · 158672363–158672375 · motif

· motif · 158672366–158672373 · motif

· motif · 158672366–158672381 · motif

· motif · 158672731–158672747 · motif

· motif · 158672781–158672797 · motif

· motif · 158672965–158672976 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:222 aa

1 aa222 aa結構域功能區域
依 Q9BS40 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

latexin 長 222 個胺基酸,含有兩個 Cystatin LXN-type 結構域:第一個位於第 1–97 個胺基酸,第二個位於第 118–222 個胺基酸。兩者之間的第 98–117 個胺基酸區段為 α 螺旋連接區。

結構域Cystatin LXN-type 11–97 aa
結構域Cystatin LXN-type 2118–222 aa
功能區域Alpha-helical linker98–117 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2BO9…

PDB · 2BO9

X-ray · 1.60 A · B/D=1-222

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

latexin 位於細胞質。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 25 個夥伴 · 最多顯示 50 個
LXNLXNBOCCA3COX6A1CYBC1DNAJC11DPYDFCGR3AGSG1LIGSF11MAGEA8MCMDC2NSMFPAX6PPP1R3CRNF4SHKBP1SPAG7TMEM14ATRAIPTRIM39YIF1BZCCHC17ZKSCAN4ZNF430ZNF679
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 25 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能latexin 是 CPA1、CPA2 與 CPA4 的強效、非競爭性且幾乎不可逆的抑制劑;來源另指出它可能參與發炎,但未說明具體作用方式或關聯。含實驗來源
證據與來源

Hardly reversible, non-competitive, and potent inhibitor of CPA1, CPA2 and CPA4. May play a role in inflammation

PMID 15738388 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位latexin 位於細胞質。推論支持
證據與來源

Cytoplasm

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000264265 · 1,071 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AAACAGCAGCTTCCGGAGTCGGAAGGAGCTGAGGAAGAAG40
41ACTGACTGAAGGAGCTTGCGACTTTTCCGCCTCGGCAACC80
81GGACCCAGCAGCAAGCAGGACGGGCGGCGCTCTGCTACTG120
121GTCCCGTTAAGCCAGAGTAGCCCAAGCCCTGAAGTCACTG160
161CTCATCCGGAATGGAAATCCCGCCGACCAACTACCCAGCC200
201TCCAGGGCGGCCTTGGTGGCACAGAACTACATCAACTACC240
241AGCAGGGGACCCCGCACAGGGTGTTTGAGGTGCAGAAGGT280
281CAAACAAGCCAGCATGGAGGATATTCCAGGAAGAGGACAT320
321AAGTATCACCTTAAATTTGCTGTTGAAGAAATTATACAAA360
361AACAAGTTAAGGTGAACTGCACAGCTGAAGTACTTTACCC400
401TTCAACGGGACAAGAAACTGCACCAGAAGTCAACTTCACA440
441TTTGAAGGAGAAACTGGAAAGAATCCAGATGAAGAAGACA480
481ACACATTTTATCAAAGACTTAAGTCCATGAAGGAACCGCT520
521AGAAGCACAAAATATTCCAGACAATTTTGGAAATGTATCT560
561CCAGAAATGACGCTCGTTCTACATTTAGCCTGGGTTGCCT600
601GTGGTTATATAATATGGCAAAATTCTACTGAAGACACATG640
641GTATAAAATGGTAAAAATTCAAACTGTCAAGCAAGTGCAA680
681AGAAATGATGACTTTATTGAATTAGACTACACCATTCTAC720
721TTCATAATATAGCATCTCAGGAGATTATTCCCTGGCAAAT760
761GCAAGTTCTCTGGCATCCACAATACGGCACTAAAGTAAAA800
801CATAATAGCCGTCTGCCAAAGGAAGTACAACTGGAATAAA840
841CAAAAACCCTAACACTGGAAGTGTAAACATGTCTATTGAT880
881GTGTATGCCAATTTCACTGGCATCTAGCTTATGAGGCCAA920
921ATAATCCCAAAGTGTCACTTTATATAAATGTCTTGATTAC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。