基因總覽
LTN1 是蛋白質編碼基因，產物屬於 LTN1 family，名稱為 listerin E3 ubiquitin protein ligase 1。此蛋白質是核糖體品質控制複合體（RQC）的 E3 ubiquitin ligase 成員，與翻譯過程中未完整合成的產物處理有關。蛋白質長 1,766 個胺基酸，含多個 HEAT repeats，並在靠近 C 端處具有 RING-type zinc finger。這些序列特徵構成其蛋白質架構；其於 RQC 中的具體作用見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000361371 ★ | 28,928,144–28,992,877 | 30 |
| ENST00000389194 | 28,927,886–28,992,949 | 30 |
| ENST00000614971 | 28,927,886–28,992,956 | 30 |
| ENST00000881243 | 28,927,886–28,992,956 | 29 |
| ENST00000912877 | 28,927,886–28,992,956 | 29 |
| ENST00000912878 | 28,927,886–28,992,956 | 30 |
| ENST00000912879 | 28,927,886–28,992,956 | 29 |
| ENST00001131892 | 28,927,886–28,992,877 | 30 |
| ENST00000389195 | 28,961,317–28,992,949 | 13 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
LTN1 是核糖體品質控制複合體（RQC）中的 E3 ubiquitin-protein ligase。RQC 與核糖體相連，負責處理翻譯未能完成時產生的新生多肽鏈：先將這些不完整產物進行 ubiquitination，再促進其自核糖體相關狀態中抽取，並送往 proteasome 降解。這套處理方式針對的是未完整合成的蛋白質，而非一般已完成翻譯的產物。
在 RQC 中，LTN1 由 NEMF 招募至停滯的 60S ribosomal subunit，並對停滯的新生多肽鏈進行 ubiquitination。這項修飾涉及將 ubiquitin 從 E2 ubiquitin-conjugating enzyme 轉移至受體蛋白的 lysine；資料亦將其活性歸類為蛋白質修飾與蛋白質 ubiquitination。來源指出，經 ubiquitination 的不完整翻譯產物會促進 VCP/p97 的招募，後者參與抽取與降解過程；此一連結標示為依相似性推定。
因此，LTN1 的功能位於翻譯品質控制的處理鏈中：它在停滯核糖體附近標記未完成的新生鏈，與後續從核糖體相關環境中移除並降解該產物相銜接。此功能描述聚焦於 RQC 對不完整翻譯產物的處理，不應延伸為來源未提及的其他蛋白質品質控制途徑。
Promoter 與基因調控
>LTN1 ENST00000361371 GRCh38 chr21:28992777-28993877 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GAGCTCAGGGGAGGGGCCGCATGAAAGTAGAATTCAGATCTCTGAGGAGAGCACTGACTGCTGCTGTGAT CTCTGAGGGGTGCAATAAGGCTGATTCTGTGATTGTTGGAAAAAGGATAGAGATTAAAACCACCTTTTGG CTAAAGCAATTGCTCCTGCCACGGTAAAATGCAGCTGCTGCTGGCATGATGCTTACAGAATGGAGCAAGT CCCTTCTTCCTCTTGCCTTTGTTTCCCTCTTGTTCGTCCTGTTGGTGGAATCTAGCAGAAGCCCCCCCAG TAACATGGAGTTGAGTATAAAAGGGTGACTGCGTGGACAAGAAACAATAACCAGCACACATTTACTTGTT TCTCTGGTGTGATTCTGAGTCGCACAATCAATGGGTTACAGGATTTGTACATTTCAAATTTTAATAGGGA CTCCCACATTATCCTCTTTCCTAAACTGCACGTTAACAGTTTCAATATGAATAAAAGGGGACGGGGAGGG GAGATTTAGAGAGAATAGTGCCTACAGCAGTAATCAAATTTTAACAAGACTTGGGAATACTGTCAAAATG CAGGATCTGATTCAGGAGTTCTGAGGGGCCCGAGTTGGCCTTTTCTAAAAAACGCCCAGGTGATACTGAT GATTGCATCATGTTGGAAGTCTAAAACACTCCCATCTTCCCACAGCCTCTACCATAACATTCTAATGCTA CCCTTATGTGAAACTGCCCCTCTGATGATTCACGCCAGTTTCCTACCCTCTAAGCAAGGAACAAACCTAG CTTCTGAAAGCGGGGAGGACAGGATTTGGCGCCACGGGTCCAATGCTTGGCTTCCTATTGGCCAGGAATG ACATCACTCAGACAGGCGTGGCTTTAGCTGTGACGTCTCCGGTGGCGGATGGTCAGGGACACAGCGGGAG GCGGGAGCGGAAGTGGGGCAGCAAATGGACAGGGTGGGTGGCGGAAAAGGGCCCGGGGGAAGTTATTACA GGGTGTCCTCTTCCGCCGCCAGAAGCCGGAAGTTGTGTCCCGGACGTGTCAACCGGGGTCTGAGTGCTCA GAGTACAGCTGCAACCGCGACCATGGGCGGGAAGAACAAGCAGCGAACTAA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| LTN1_1 ↗ | 21:28,992,863 | 負股 | 28,992,853–28,992,912 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR21_8T2FC · promoter · 28992867–28993113 · regulatory
ENSR21_B7QCN · enhancer · 28993114–28993973 · regulatory
· motif · 28992596–28992611 · motif
· motif · 28992794–28992805 · motif
· motif · 28992864–28992873 · motif
· motif · 28992864–28992875 · motif
· motif · 28992864–28992875 · motif
· motif · 28992864–28992877 · motif
· motif · 28992953–28992962 · motif
· motif · 28992953–28992964 · motif
· motif · 28993029–28993042 · motif
· motif · 28993029–28993042 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1766 aa
LTN1 蛋白質長 1,766 個胺基酸，屬於 LTN1 family。序列中註解有多個 HEAT repeats，分布於蛋白質前段至中後段；C 端附近則有 RING-type zinc finger，位於胺基酸 1715–1762。這些是資料所列的結構特徵。
蛋白質三維結構
細胞內定位
LTN1 的定位註解為細胞質與胞質溶膠。 資料未提供定位改變的條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- IRF7Q92985 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- STING1Q86WV6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TIRAPP58753 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
LTN1 是 RQC 的組成成員；該複合體由 LTN1、TCF25 與 NEMF 組成，並與 60S ribosomal subunit 相關。來源另指出，RQC 可能也含有 VCP/p97 及其 ubiquitin-binding cofactors，但此組成以依相似性推定，並非確定描述。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | LTN1 是核糖體品質控制複合體（RQC）的 E3 ubiquitin-protein ligase 成員。RQC 會將未完整合成的新生鏈進行 ubiquitination，並促進其抽取與 proteasomal degradation。LTN1 由 NEMF 招募至停滯的 60S ribosomal subunit，負責標記停滯的新生鏈；後續 VCP/p97 的招募及不完整翻譯產物的抽取、降解則標示為依相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源E3 ubiquitin-protein ligase component of the ribosome quality control complex (RQC), a ribosome-associated complex that mediates ubiquitination and extraction of incompletely synthesized nascent chains for proteasomal degradation. Within the RQC complex, LTN1 is recruited to stalled 60S ribosomal subunits by NEMF and mediates ubiquitination of stalled nascent chains. Ubiquitination leads to VCP/p97 recruitment for extraction and degradation of the incomplete translation product (By similarity) PMID 23685075 ↗ · PMID 25132172 ↗ · PMID 25578875 ↗ · PMID 28757607 ↗ |
| 分子活性 | S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + [acceptor protein]-L-lysine = [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + N(6)-ubiquitinyl-[acceptor protein]-L-lysine. | 推論支持 | 證據與來源S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + [acceptor protein]-L-lysine = [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + N(6)-ubiquitinyl-[acceptor protein]-L-lysine. PMID 25578875 ↗ |
| 分子活性 | LTN1 的功能註解包括蛋白質修飾，具體類別為蛋白質 ubiquitination。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | LTN1 是核糖體品質控制複合體（RQC）的組成部分；該複合體由 LTN1、TCF25 與 NEMF 組成，並與 60S ribosomal subunit 相關。RQC 可能也包含 VCP/p97 及其 ubiquitin-binding cofactors，此組成是依相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the ribosome quality control complex (RQC), composed of the E3 ubiquitin ligase LTN1, TCF25 and NEMF associated with the 60S ribosomal subunit. The complex probably also contains VCP/p97 and its ubiquitin-binding cofactors (By similarity) PMID 25578875 ↗ |
| 細胞定位 | LTN1 的細胞定位註解為細胞質與胞質溶膠。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGAAGCCGGAAGTTGTGTCCCGGACGTGTCAACCGGGGTC40TGAGTGCTCAGAGTACAGCTGCAACCGCGACCATGGGCGG80GAAGAACAAGCAGCGAACTAAAGGGAACCTGAGGCCTTCA120AACAGTGGCCGAGCTGCAGAACTCCTTGCCAAAGAACAGG160GAACAGTGCCTGGATTTATTGGTTTTGGAACATCTCAGAG200TGACCTAGGCTATGTTCCTGCTATTCAAGGAGCTGAAGAA240ATTGACAGTCTTGTAGATTCTGATTTCCGAATGGTGCTGC280GGAAACTTTCAAAGAAAGATGTCACCACAAAATTAAAAGC320TATGCAGGAATTTGGAACCATGTGTACAGAGAGAGACACA360GAAACTGTGAAAGGAGTTCTTCCATATTGGCCAAGAATTT400TTTGCAAAATTTCACTTGATCATGACCGTCGCGTCCGAGA440AGCCACACAACAAGCTTTTGAAAAACTTATCCTTAAAGTA480AAGAAACAGTTGGCTCCCTACTTAAAAAGTTTAATGGGAT520ATTGGCTAATGGCTCAGTGTGATACTTACACACCAGCTGC560GTTTGCAGCAAAAGATGCATTTGAAGCGGCTTTTCCTCCA600AGCAAGCAACCTGAAGCCATAGCATTTTGTAAGGATGAAA640TTACAAGTGTGCTGCAGGATCATCTTATAAAAGAAACACC680TGATACACTCAGTGACCCGCAAACTGTTCCAGAGGAAGAA720AGAGAAGCTAAATTCTACCGGGTTGTAACTTGTTCCTTAT760TGGCATTAAAGAGATTACTTTGCCTTTTACCTGATAATGA800GCTTGATTCTCTGGAGGAGAAATTTAAGTCTCTTTTATCA840CAGAATAAGTTTTGGAAGTATGGAAAACACAGTGTACCTC880AGATTCGCTCAGCTTATTTTGAGTTAGTCTCTGCATTGTG920CCAGCGCATTCCACAGTTGATGAAAGAGGAAGCATCCAAA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。