基因總覽
LST1 的正式名稱為 leukocyte specific transcript 1，屬於蛋白質編碼基因。其蛋白質產物屬於 LST1 family。現有資料將其與免疫反應調節的可能角色相連結，但未提供足以進一步說明其家族特性或整體結構的資訊；具體的細胞形態變化及異構型功能，見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000438075 ★ | 31,586,277–31,588,909 | 5 |
| ENST00001103046 | 31,581,065–31,588,910 | 3 |
| ENST00001103047 | 31,582,584–31,588,910 | 4 |
| ENST00001103048 | 31,582,584–31,588,910 | 5 |
| ENST00001103049 | 31,582,584–31,588,910 | 4 |
| ENST00001103050 | 31,582,584–31,588,910 | 3 |
| ENST00001103051 | 31,582,584–31,588,910 | 4 |
| ENST00000418507 | 31,586,124–31,588,910 | 4 |
| ENST00000376096 | 31,586,124–31,588,909 | 3 |
| ENST00000376099 | 31,586,124–31,588,910 | 3 |
| ENST00000376110 | 31,586,124–31,588,911 | 4 |
| ENST00000868366 | 31,586,124–31,588,911 | 5 |
顯示 12/50 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
LST1 的可能作用之一是調節免疫反應，但現有資料以「可能」描述此角色，未進一步界定其作用方式或所涉及的免疫反應環節，因此不宜視為已確立的完整機制。
在多種細胞類型中，過量表現 LST1 會引起形態變化，包括產生絲狀偽足（filopodia）與微棘（microspikes）。這項觀察描述的是過量表現條件下的細胞表型；資料未指出這些形態變化是否直接造成其他免疫功能改變。
LST1 也可能參與樹突細胞成熟。此項關聯同樣屬可能性描述，來源未提供成熟過程中的具體分子步驟或作用方向。不同異構型則有較明確的功能差異：isoform 1 與 isoform 2 對淋巴球增殖具有抑制作用。來源未說明其抑制作用的機制，也未提供其他異構型的相關結果。這些資料支持 LST1 與免疫調節、樹突細胞成熟可能性及淋巴球增殖抑制之間的關聯，但不足以據此推定更廣泛的免疫效應。
Promoter 與基因調控
>LST1 ENST00000438075 GRCh38 chr6:31585277-31586377 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATGTTAATAGTAGCATCTAGGTGGTAAGAATATGTTCACTGTACAATTATTCTCATTTCACCCTATGTTT GCACTTTTTAATAATAAAATGTAAAAAAAACAAAACAAACAAACAAAAAACCCTGAATATTATTCAGCAT GGGGAACATGGAGGATGGGGAGAAGGGTGGGGGAGGAAGTAGAAGGTTCTTGAATTTGGAAGGGGAAACG CAAATTAATATGGACCCACCCAGGCACCACATCTCCTCCTCACCCCTTGCCTTACAGGCGCTCCCCAGTC TTCACCCTCCTCAAGGAGTGGGTGTGCAATCCTCCAGCACCCATCTCCTTCTCCATCACAGTGCCACTAA GAAGCCTTCACCCAGGTCTCTCCAGAGAGCCTCAGGCCGCTGCCTTTACTTAGTTCTGTGTTCAATGCCA GAATGCTGCCTCCTACAGGAAGTCCACCTGTATTGCCCACACCTCCTTTCCTGTCACCAACTTGTCACCA ACTTTCTGTCCTTGATCTATCCACAGGGCTCATGTAGATCTAGTATGGCTGCCTTTAACTCTCATGTTTG TTAATCAGACAGCCAAGCAGCCTGCTGCATAGAGCTGCAGAACACCAAGTGGGTCACCAGAACACCAAAT ATGCCAGAGCTCCCAGTCTGAACTGGAGCAGGGTACATGTGTCCACAGACATATGCCAAGATCAAGAGGT CTCAACAGATGCAGTGTAAGAGGTAATAGAGAAGAGTTAATCAAGGAAGACACCTGAAGGTGGTGGGTGT TTGCTGACTAGTGGCAGGATCAGTGAAATGACTGGAGCTGAGGCAGATTATGGCCCTAGCTACAGGCCCA GAAGTTTGAAAAGAAAGATGTTGTAACCCTAACCCTGGAGCCGAACTTCCTCTCCTAACAATGCTGGGGA GGAACCCAGGCTGGGGGAGAAGTTAAAGCCAGAGGAGGGGCAGGAATGTCTGAGGTGGCAACACTTCTCT TCAGCCAGACAGCACTGGCCAGTTTGGAGTCTGTCCATCCTGCAGGCCACAAGCTCTGGGTAAGCTGGGA ATGGGCAGGGACCTTGGTGGAAGGATGGTCACACCCCAGAGTGGGGTGAAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 6 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| LST1_5 ↗ | 6:31,582,650 | 正股 | 31,582,601–31,582,660 |
| LST1_1 ↗ | 6:31,586,277 | 正股 | 31,586,228–31,586,287 |
| LST1_4 ↗ | 6:31,586,699 | 正股 | 31,586,650–31,586,709 |
| LST1_6 ↗ | 6:31,586,847 | 正股 | 31,586,798–31,586,857 |
| LST1_2 ↗ | 6:31,587,010 | 正股 | 31,586,961–31,587,020 |
| LST1_3 ↗ | 6:31,587,240 | 正股 | 31,587,191–31,587,250 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_59FKBT · CTCF_binding_site · 31582187–31582208 · regulatory
ENSR6_9GJGH · promoter · 31582414–31582917 · regulatory
ENSR6_C55LW · promoter · 31585634–31587310 · regulatory
ENSR6_59FKX5 · CTCF_binding_site · 31585699–31585720 · regulatory
ENSR6_8X42P · enhancer · 31587311–31587450 · regulatory
ENSR6_9GJJ4 · enhancer · 31587889–31588304 · regulatory
· motif · 31581321–31581332 · motif
· motif · 31582179–31582196 · motif
· motif · 31582189–31582205 · motif
· motif · 31582491–31582500 · motif
· motif · 31582760–31582768 · motif
· motif · 31582760–31582775 · motif
· motif · 31582812–31582829 · motif
· motif · 31585701–31585717 · motif
· motif · 31586444–31586455 · motif
LST1 受 IFNG／IFN-gamma 調控；在自體免疫性發炎及細菌誘發的發炎情況下，表現量會上升。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：97 aa
LST1 蛋白長 97 個胺基酸，屬於 LST1 family。其第 8 至 28 位胺基酸區段註記為螺旋型跨膜區；第 59 至 97 位胺基酸區段則註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
LST1 蛋白被註記為單次跨膜蛋白，位於膜及高基氏體膜，亦見於內膜系統；另在核周、對應高基氏體的位置及細胞質中均有檢出。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Membrane；Endomembrane system。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | LST1 可能參與免疫反應調節；在多種細胞類型中過量表現時，會引起包括絲狀偽足與微棘生成在內的形態變化，也可能參與樹突細胞成熟。此外，isoform 1 與 isoform 2 會抑制淋巴球增殖。 | 含實驗來源 | 證據與來源Possible role in modulating immune responses. Induces morphological changes including production of filopodia and microspikes when overexpressed in a variety of cell types and may be involved in dendritic cell maturation. Isoform 1 and isoform 2 have an inhibitory effect on lymphocyte proliferation PMID 10706707 ↗ · PMID 11478849 ↗ |
| 細胞定位 | LST1 被註記為單次跨膜蛋白，定位於膜、高基氏體膜及內膜系統；另外也在核周、對應高基氏體的位置，以及細胞質中檢出。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Membrane / Single-pass membrane protein; Golgi apparatus membrane / Single-pass membrane protein; Endomembrane system / Single-pass membrane protein; Also detected in a perinuclear region corresponding to the localization of the Golgi apparatus and throughout the cytoplasm |
| 調控 | LST1 受 IFNG／IFN-gamma 調控；在自體免疫性發炎及細菌誘發的發炎情況下，其表現量會上升。 | 含實驗來源 | 證據與來源By IFNG/IFN-gamma. Up-regulated upon autoimmune and bacterially-induced inflammation PMID 16362817 ↗ · PMID 7590964 ↗ · PMID 9367684 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTTTGGAGTCTGTCCATCCTGCAGGCCACAAGCTCTGGA40TGAGGAACTTGAGGCAAGTCACCAGCCCCTGATCATTTCG80CCTAAAAGAGCAAGGACTAGAGTTCCTGACCTCCAGGCCA120GTCCCTGATCCCTGACCTAATGTTATCGCGGAATGATGAT160ATATGTATCTACGGGGGCCTGGGGCTGGGCGGGCTCCTGC200TTCTGGCAGTGGTCCTTCTGTCCGCCTGCCTGTGTTGGCT240GCATCGAAGAGTAAAGAGGCTGGAGAGGAGCTGGGCCCAG280GGCTCCTCAGAGCAGGAACTCCACTATGCATCTCTGCAGA320GGCTGCCAGTGCCCAGCAGTGAGGGACCTGACCTCAGGGG360CAGAGACAAGAGAGGCACCAAGGAGGATCCAAGAGCTGAC400TATGCCTGCATTGCTGAGAACAAACCCACCTGAGCACCCC440AGACACCTTCCTCAACCCAGGCGGGTGGACAGGGTCCCCC480TGTGGTCCAGCCAGTAAAAACCATGGTCCCCCCACTTCTG520TGTCTCAGTCCTCTCAGTCCATCTCGAGCCTCCGTTCAAA560TTGATCATCATCAAAACTTATGTGGCTTTTTGACCTTTGA600ATAGGGAATTTTTTAAATTTTTTAAAAATTAAAATAAAAA640AAACACATGGCTCACCCTTCCACCCA666cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。