基因總覽
LRRC1 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 leucine rich repeat containing 1。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 6p12.1。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000370888 ★ | 53,795,005–53,924,125 | 14 |
| ENST00000960208 | 53,794,640–53,924,125 | 15 |
| ENST00000370882 | 53,794,969–53,884,145 | 5 |
| ENST00001106513 | 53,794,969–53,917,775 | 11 |
| ENST00001126988 | 53,794,969–53,924,688 | 14 |
| ENST00001126989 | 53,794,969–53,924,382 | 14 |
| ENST00001140651 | 53,794,969–53,924,125 | 14 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>LRRC1 ENST00000370888 GRCh38 chr6:53794005-53795105 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACAGTTACAGGCAAAGAGGGGCAGTTCAGGATTCCGGCCGTGGTCCGCAGGAATGAGTCGGGGCGAGGGA ATGGTTGTTATAACCCAATAGTGAGCCTCCCCGGTCATCCGGGCTGGACGGGACTGGGGTTGTAGCAGAA AAGCAGGAGCTGTATGGAGGATGCTCACCTGGCAGCCTCGATCTGCCCCTCTTCCCTCGCTCCTCCCTCC GCACCAGCCACAGCTAGTTGTCAGGGGCCAACATCTGGGCCGGGCTGGAACTGGCTCAGAAACTCGCGTT TGCCTGCTTATTTCTGCAGCTGGGCTCCTTGCCAGGTGCAACCACATCTATGAGAATCTCGCAGACTCTC AGACTCCTATGCCTTTGCTGGTACAGGGAGGAGGATTTACTATCACTCACTGCATAAACCATGATCACCA GAGATGTGCTCCCAAGTTACAAAGCCTGCAGGCGGTGCCCGAGGACCAGAGGGCCGGGCGCGGCCAGCTC ACACTTCTGGGGCAGCCGTGAGCAGCGGGCACACGGGCAGCCACGAAAGCAGCAGCGAGGGTGGTGCAAA CACCTCAAAACTACACCGAATCCAGTAGCGCCTGGCGCCCCCGGCGCGCAAGGTACGCTTTGGGGCGGTC CTGTGTGACCCCGGAAGAGAAAGTTGTTTTGGGGAAGGGGAGCAAGGAGAGGAGTGCGAGTTAAATAAAA CTAAATATCAAAGTTGTTCTGCTCTGCTCAGGCCGCCTCTACTCCGCCTCATCTTTGTCCCAAGTCCTTT CACAGTCTGCCTTCCTCAAACGGCCCGATGCGCCCCCGTCTTTGCCGGAGTAAGCAGACCGCCAGCAGCC GGCCCGCAGGTCAGTCGACCCTCTCTGGATGCAGGTCGCCGGGAAAACCCGGAGCGGAGCATCCCTCGGG CCGGGAAACGCCCTCGGCGCGCACCCACTGGCGCGCATGCTCAGTCCGCGCGGCGGCTGCGAGTAGGAAG CTCCGCGCGGCGGCGGGGGCGGCGACGGCGACTGGCGGGTGGGAGTGGAGGCACCGGCTGGCGGGCGGGG GTACAGGGACGGGGCAGGGGCTCCCGCTCCAGGTTCCTTGAAGCACTTCCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| LRRC1_3 ↗ | 6:53,794,393 | 正股 | 53,794,344–53,794,403 |
| LRRC1_1 ↗ | 6:53,795,005 | 正股 | 53,794,956–53,795,015 |
| LRRC1_2 ↗ | 6:53,795,121 | 正股 | 53,795,072–53,795,131 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_756DWH · enhancer · 53792171–53792276 · regulatory
ENSR6_C7C5C · enhancer · 53793230–53794384 · regulatory
ENSR6_BDN8R · promoter · 53794385–53795100 · regulatory
ENSR6_C7C5H · enhancer · 53795101–53796959 · regulatory
· motif · 53793374–53793387 · motif
· motif · 53793381–53793394 · motif
· motif · 53793381–53793395 · motif
· motif · 53793381–53793396 · motif
· motif · 53793466–53793476 · motif
· motif · 53793685–53793696 · motif
· motif · 53793712–53793723 · motif
· motif · 53793712–53793723 · motif
· motif · 53793822–53793836 · motif
· motif · 53793847–53793867 · motif
· motif · 53793916–53793924 · motif
· motif · 53794639–53794646 · motif
· motif · 53794642–53794653 · motif
· motif · 53794946–53794957 · motif
· motif · 53794946–53794957 · motif
· motif · 53794988–53795001 · motif
· motif · 53794994–53795007 · motif
· motif · 53795023–53795033 · motif
· motif · 53795236–53795249 · motif
· motif · 53795242–53795255 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：524 aa
Leucine-rich repeat-containing protein 1（LRRC1）長524個胺基酸，含有17個連續排列的 leucine-rich repeat（LRR），分布於第11至405個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
LRRC1 位於細胞質及膜周邊，並定位於上皮細胞的基底外側。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
LRRC1 與 DLG1、DLG4 互作；此外，LRRC1 可能與 DLG1 和 ERBIN 形成複合體，但 LRRC1 與 ERBIN 之間的互作為間接作用。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | LRRC1 與 DLG1、DLG4 互作；也可能與 DLG1 及 ERBIN 形成複合體。不過，LRRC1 與 ERBIN 之間並非直接互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with DLG1 and DLG4. May form a complex with DLG1 and ERBIN, where interaction between LRRC1 and ERBIN is indirect PMID 11440998 ↗ |
| 細胞定位 | LRRC1 位於細胞質及膜周邊，並定位於上皮細胞的基底外側。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Membrane / Peripheral membrane protein; Localized at the basolateral side of epithelial cells PMID 11440998 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GGCGACGGCGACTGGCGGGTGGGAGTGGAGGCACCGGCTG40GCGGGCGGGGGTACAGGGACGGGGCAGGGGCTCCCGCTCC80AGGTTCCTTGAAGCACTTCCGACCGCGAAGCCCGGCGCGA120GAAGCGAGCTAACCCAAGAGCCAACAACGAGCGCGGAGAG160GGCAGCGGACTGAGCGGAGCCGCCGGCCAGAGCGGGCTCG200GAGCCCGGGTCTCCGCCGCTCGGGACCCGGCTAGGCGGCG240GCGGGGGCGGCGATGTTCCACTGCATCCCCCTGTGGCGGT280GCAACCGTCATGTGGAGAGCATCGACAAGCGCCACTGCTC320GCTGGTCTACGTCCCCGAGGAGATCTACCGCTATGCCCGG360AGCCTGGAGGAGCTGCTGCTGGACGCCAACCAGCTCCGCG400AGCTGCCCGAGCAATTTTTCCAGCTAGTCAAATTACGAAA440GCTTGGACTTAGTGATAATGAAATTCAGCGGCTCCCTCCA480GAAATAGCAAACTTCATGCAGCTGGTGGAACTAGATGTGT520CTCGAAATGAGATTCCTGAAATTCCAGAAAGCATTTCATT560CTGTAAAGCACTGCAGGTAGCTGACTTCAGCGGAAACCCA600CTGACTAGGTTGCCAGAAAGCTTTCCTGAATTACAGAATT640TAACATGTCTTTCTGTAAATGACATCTCACTACAGTCTCT680ACCTGAAAATATTGGCAATCTTTATAACCTGGCTTCACTG720GAACTGAGAGAGAATCTTCTTACATATCTTCCTGACTCTC760TTACCCAGCTGCGAAGACTAGAAGAACTTGATTTAGGAAA800CAATGAAATATATAATTTGCCAGAATCAATTGGAGCCCTC840TTACATCTAAAAGATCTCTGGTTGGATGGAAATCAACTGT880CAGAATTACCTCAGGAAATAGGAAATCTGAAGAACCTGCT920GTGTTTAGATGTCTCTGAAAACAGGTTGGAAAGACTTCCT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。