基因總覽
LPXN 是蛋白質編碼基因，產物 leupaxin 屬於 paxillin 家族。這種蛋白質具有多個 LIM zinc-binding 結構域，並含有 LD motif；其序列也包含一段被註解為無序的區域。這些結構特色構成 leupaxin 的基本分子特徵，並與其作為細胞內調節蛋白的角色相符。leupaxin 參與細胞黏附、細胞展開與細胞移動的調控，也可作為 androgen receptor（AR）和 serum response factor（SRF）的轉錄共活化因子。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000395074 ★ | 58,526,871–58,575,856 | 9 |
| ENST00000528954 | 58,526,871–58,578,173 | 9 |
| ENST00000528489 | 58,526,871–58,578,220 | 8 |
| ENST00000985472 | 58,526,871–58,575,856 | 8 |
| ENST00001028165 | 58,528,854–58,575,856 | 8 |
| ENST00001110737 | 58,549,529–58,575,922 | 7 |
| ENST00001110738 | 58,563,075–58,575,907 | 3 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
leupaxin 參與細胞黏附、細胞展開與細胞移動的調控。在整合素介導的細胞黏附事件中，它具有負向調節作用，並會抑制整合素誘發的 paxillin（PXN）酪胺酸磷酸化。這些作用指出，leupaxin 可影響黏附相關訊號與細胞行為；來源未進一步界定其在各類細胞中的作用方式或具體下游步驟。
leupaxin 也是 androgen receptor（AR）與 serum response factor（SRF）的轉錄共活化因子，能促進這兩種因子的轉錄活性。其對 SRF 依賴性基因轉錄的調節會受到細胞內定位影響：焦點黏附激酶 PTK2/FAK 活性增強時，leupaxin 在細胞核中的累積減少，其增強 SRF 依賴性轉錄的能力也受到限制。
在破骨細胞中，leupaxin 可能作為接頭蛋白，對黏附區的形成具有關鍵作用。這項功能描述帶有可能性，來源並未提供更具體的分子步驟。另一方面，leupaxin 會負向調節 B-cell antigen receptor（BCR）訊號；BCR 活化時，leupaxin 也會被招募至 B 細胞膜。這些資料顯示其作用涵蓋黏附相關調節、轉錄共活化及 BCR 訊號抑制，但各作用之間的因果關係並未在來源中說明。
Promoter 與基因調控
>LPXN ENST00000395074 GRCh38 chr11:58575756-58576856 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGAGGTTACACTGAACTATGATAGTACCTTTGCACGCCAGCCTGGGTGACAGAGAGCTTGTCTTAAAAAA AGTAAAGAAGGCTACGGTGTTGTAGAGGAAAGATCCCAGACTTTGCAATTATAGTAAGTAGCAAAGCTAC CAATTAATTATCTTAGCAAGTTGCTATTACATGAACCTATTTCACCATTGGTAAAAAGGGGGAAAAAATC TATTTCACAGGGCCATAATTATAGTTCCTTACGTATTGCTTTTTTATAGTAGGCCTTTTGTAAATGTTTA ATTCAAGGTGAATAAATCACAGTGGTAAAAAAGGTGAAGAGTTAACCTCAGTGTTACTTTCCAAAGAAAT TGCTATAAGGCAGTGTATCTAGGCAGGGATTATGCTTAATTGAGATGCACACAGTTTAACATCTGGTGTC AAACCTGGCTTCCTTCTTTGTGACCACCCTATAGATGTTTGCTTTTGGGACCACTGAGTAAACCAGGCCC TGAGAATCCAAGCATGAATCCACTTCTGCCCTACTTTTAAGGATTTACGTTCCATGCAGGAAAGCAGATA ACCATAATTTCTGAATAAATAAGACAACAAAATGAAATGGATGCTGGTCAACTCTGATGCAAATTTTAAG AAGGAGACTATGCCTCTGTGTCTCCCAGCTTCACAGAAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAGATGCTCAGAG TGGGGTACCTACACTTGGAAAAAACGCAAGTATAAGTCTGCCATTCCCATGAATCCAAGATGAATCCTGG CACAGAGTAGGTCCTCAAATTTTGCAAAATTAATTTTGAATCTTTATCACCCTGGCCAATGCACTGCCAT AATGCAAATCTTACTATCTACCTTTCTATGTCAGTCACATTTTTAAAACTGTGTAACCTATGAAAAAAAA AAAAAAGCTCACCAAATCAAAAGAGAGGAAGTGCTAAGCAAATACAGGAACCAAAAAGGTTTATAGAGGC TGCCTTATGCTGTCTCATCCAGTTCCTTTGCGGTCCTCTTCTTCAGCACATGCCAAAGCTGTTCCTCACG GCCTGTGAGACAAGAGCATCTTGGATGTAGGACAATGGAAGAGTTAGGTGA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| LPXN_1 ↗ | 11:58,575,856 | 負股 | 58,575,846–58,575,905 |
| LPXN_2 ↗ | 11:58,578,356 | 負股 | 58,578,346–58,578,405 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_C7RX5 · enhancer · 58573375–58574403 · regulatory
ENSR11_BFLTF · enhancer · 58574858–58575845 · regulatory
ENSR11_9T8Q4 · promoter · 58575846–58576191 · regulatory
ENSR11_C7RXD · enhancer · 58576806–58578155 · regulatory
ENSR11_BFLTW · promoter · 58578156–58578838 · regulatory
ENSR11_83PHJT · promoter · 58578939–58579073 · regulatory
ENSR11_68W298 · CTCF_binding_site · 58579720–58579760 · regulatory
· motif · 58573602–58573615 · motif
· motif · 58573832–58573845 · motif
· motif · 58573832–58573845 · motif
· motif · 58573890–58573903 · motif
· motif · 58573991–58574000 · motif
· motif · 58574824–58574839 · motif
· motif · 58575148–58575160 · motif
· motif · 58575423–58575436 · motif
· motif · 58575436–58575448 · motif
· motif · 58575608–58575630 · motif
· motif · 58575608–58575630 · motif
· motif · 58575894–58575907 · motif
· motif · 58577697–58577705 · motif
· motif · 58577697–58577714 · motif
· motif · 58577714–58577723 · motif
· motif · 58577978–58577990 · motif
· motif · 58577981–58577988 · motif
· motif · 58578006–58578014 · motif
· motif · 58578062–58578075 · motif
· motif · 58578173–58578183 · motif
· motif · 58578212–58578221 · motif
· motif · 58578214–58578230 · motif
· motif · 58578240–58578251 · motif
· motif · 58578240–58578251 · motif
· motif · 58578242–58578251 · motif
· motif · 58578310–58578318 · motif
· motif · 58578426–58578437 · motif
· motif · 58578426–58578437 · motif
· motif · 58578465–58578475 · motif
· motif · 58578483–58578493 · motif
· motif · 58578636–58578647 · motif
· motif · 58578692–58578709 · motif
· motif · 58578718–58578727 · motif
· motif · 58578763–58578772 · motif
· motif · 58578765–58578777 · motif
· motif · 58578782–58578792 · motif
· motif · 58578844–58578859 · motif
· motif · 58578845–58578858 · motif
· motif · 58578850–58578862 · motif
· motif · 58578964–58578974 · motif
· motif · 58579010–58579020 · motif
· motif · 58579023–58579033 · motif
· motif · 58579065–58579076 · motif
· motif · 58579065–58579076 · motif
· motif · 58579067–58579078 · motif
· motif · 58579067–58579078 · motif
· motif · 58579069–58579080 · motif
· motif · 58579069–58579080 · motif
· motif · 58579071–58579082 · motif
· motif · 58579071–58579082 · motif
· motif · 58579110–58579120 · motif
· motif · 58579114–58579124 · motif
· motif · 58579196–58579209 · motif
· motif · 58579228–58579241 · motif
· motif · 58579234–58579247 · motif
· motif · 58579722–58579738 · motif
· motif · 58579741–58579757 · motif
· motif · 58579744–58579759 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：386 aa
leupaxin 長 386 個胺基酸，屬於 paxillin 家族。蛋白質含有四個連續的 LIM zinc-binding 結構域，另有三個 LD motif；其中 LD motif 3 位於 N 端區段。第 13 至 41 個胺基酸被註解為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
leupaxin 可在細胞質與細胞核之間穿梭，也可出現在焦點黏附、膜、周核細胞質及 podosome。 B 細胞的 BCR 交聯後，leupaxin 會被招募至細胞膜。 PTK2/FAK 活性增強會減少其核內累積；對 bombesin 的反應中，定位至焦點黏附是 leupaxin 發生酪胺酸磷酸化的必要條件。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Cell junction, focal adhesion；Cell projection, podosome。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 36 個夥伴
- AGXTP21549 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- APBA2Q99767 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- AQP1P29972 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG1Q12959 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG2Q15700 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG3Q92796 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG4P78352 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FRMPD2Q68DX3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRID2IPA4D2P6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GRIP1Q9Y3R0 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- GRIP2Q9C0E4 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- HOXC9P31274 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- IL16Q14005 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LMO1P25800 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- LMO3Q8TAP4-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX2Q8N448 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI2Q86UL8 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- MPDZO75970 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NHERF4Q86UT5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- OPTNQ96CV9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PATJQ8NI35 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- PDZK1Q5T2W1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PLEKHH2Q8IVE3 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- PLEKHN1Q494U1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
leupaxin 與未磷酸化的 ITGA4、PTK2B/PYK2、PTPN12、AR 及 SRF 交互作用；與 PTPN22 的交互作用依據為序列相似性。leupaxin 透過 LD motif 3 與 LYN 及 PTK2/FAK 交互作用，其中與 LYN 的交互作用會在 BCR 活化後誘發。來源描述的是分子交互作用，未將這些關係一概界定為同一複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | leupaxin 是 androgen receptor（AR）與 serum response factor（SRF）的轉錄共活化因子，並參與細胞黏附、細胞展開及細胞移動的調控。它負向調節整合素介導的黏附事件，抑制整合素誘發的 paxillin（PXN）酪胺酸磷酸化；在破骨細胞中可能作為接頭蛋白參與黏附區形成，並負向調節 B-cell antigen receptor（BCR）訊號。 | 含實驗來源 | 證據與來源Transcriptional coactivator for androgen receptor (AR) and serum response factor (SRF). Contributes to the regulation of cell adhesion, spreading and cell migration and acts as a negative regulator in integrin-mediated cell adhesion events. Suppresses the integrin-induced tyrosine phosphorylation of paxillin (PXN). May play a critical role as an adapter protein in the formation of the adhesion zone in osteoclasts. Negatively regulates B-cell antigen receptor (BCR) signaling PMID 17640867 ↗ · PMID 18451096 ↗ · PMID 18497331 ↗ · PMID 20543562 ↗ |
| 交互作用 | leupaxin 與 PTPN22（依序列相似性）、未磷酸化的 ITGA4、PTK2B/PYK2、PTPN12、AR 及 SRF 交互作用。它透過 LD motif 3 與 LYN 及 PTK2/FAK 交互作用；其中與 LYN 的交互作用會在 B-cell antigen receptor（BCR）活化後誘發。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with PTPN22 (By similarity). Interacts with unphosphorylated ITGA4. Interacts with PTK2B/PYK2, PTPN12, AR and SRF. Interacts (via LD motif 3) with LYN and the interaction is induced upon B-cell antigen receptor (BCR) activation. Interacts (via LD motif 3) with PTK2/FAK PMID 10604475 ↗ · PMID 17329398 ↗ · PMID 17640867 ↗ · PMID 18451096 ↗ · PMID 18497331 ↗ · PMID 9565592 ↗ |
| 細胞定位 | leupaxin 可在細胞質與細胞核之間穿梭，並定位於焦點黏附、周核細胞質、podosome 及細胞膜。B 細胞經 B-cell antigen receptor（BCR）交聯後，它會被招募至細胞膜；PTK2/FAK 活性增強則會減少其核內累積，並限制其增強 serum response factor（SRF）依賴性基因轉錄的能力。對 bombesin 的反應中，定位至焦點黏附是其酪胺酸磷酸化的必要條件。 | 推論支持 | 證據與來源Cytoplasm; Cell junction, focal adhesion; Nucleus; Cytoplasm, perinuclear region; Cell projection, podosome; Cell membrane; Shuttles between the cytoplasm and nucleus. Recruited to the cell membrane following B-cell antigen receptor (BCR) cross-linking in B-cells. Enhanced focal adhesion kinase activity (PTK2/FAK) attenuates its nuclear accumulation and limits its ability to enhance serum response factor (SRF)-dependent gene transcription. Targeting to focal adhesions is essential for its tyrosine phosphorylation in response to bombesin |
核酸與蛋白質序列
AGTTCCTTTGCGGTCCTCTTCTTCAGCACATGCCAAAGCT40GTTCCTCACGGCCTGTGAGACAAGAGCATCTTGGATGTAG80GACAATGGAAGAGTTAGATGCCTTATTGGAGGAACTGGAA120CGCTCCACCCTTCAGGACAGTGATGAATATTCCAACCCAG160CTCCTCTTCCCCTGGATCAGCATTCCAGAAAGGAGACTAA200CCTTGATGAGACTTCGGAGATCCTTTCTATTCAGGATAAC240ACAAGTCCCTTGCCGGCGCAGCTCGTGTATACTACCAATA280TCCAGGAGCTCAATGTCTACAGTGAAGCCCAAGAGCCAAA320GGAATCACCACCACCTTCTAAAACGTCAGCAGCTGCTCAG360TTGGATGAGCTCATGGCTCACCTGACTGAGATGCAGGCCA400AGGTTGCAGTGAGAGCAGATGCTGGCAAGAAGCACTTACC440AGACAAGCAGGATCACAAGGCCTCCCTGGACTCAATGCTT480GGGGGTCTGGAGCAGGAATTGCAGGACCTTGGCATTGCCA520CAGTGCCCAAGGGCCATTGTGCATCCTGCCAGAAACCGAT560TGCTGGGAAGGTGATCCATGCTCTAGGGCAATCATGGCAT600CCTGAGCATTTTGTCTGTACTCATTGCAAAGAAGAGATTG640GCTCCAGTCCCTTCTTTGAGCGGAGTGGCTTGGCCTACTG680CCCCAACGACTACCACCAACTTTTTTCTCCACGCTGTGCT720TACTGCGCTGCTCCCATCCTGGATAAAGTGCTGACAGCAA760TGAACCAGACCTGGCACCCAGAGCACTTCTTCTGCTCTCA800CTGCGGAGAGGTGTTTGGTGCAGAAGGCTTTCATGAGAAG840GACAAGAAGCCATATTGCCGAAAGGATTTCTTAGCCATGT880TCTCACCCAAGTGTGGTGGCTGCAATCGCCCAGTGTTGGA920AAACTACCTTTCAGCCATGGACACTGTCTGGCACCCAGAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。