基因總覽
LPIN3 是蛋白質編碼基因，產物為 lipin 3，屬於 lipin 家族。其蛋白質具有鎂依賴性的 phosphatidate phosphatase 活性，來源指出這項酵素功能與脂質生合成及脂肪酸代謝調節相關。此蛋白質包含 N-LIP 與 C-LIP 區域，並具有 LNS2 及兩段 LNS2-associated Ig-like 結構域；其序列也含有預測的無序區域。這些特徵構成 lipin 3 的基本分子性質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000373257 ★ | 41,340,821–41,360,582 | 20 |
| ENST00000884415 | 41,340,786–41,360,583 | 21 |
| ENST00000884417 | 41,340,786–41,360,583 | 20 |
| ENST00000632009 | 41,340,794–41,360,583 | 20 |
| ENST00000884416 | 41,340,794–41,360,583 | 19 |
| ENST00001132275 | 41,340,794–41,360,583 | 20 |
| ENST00000445975 | 41,352,681–41,358,470 | 9 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
lipin 3 是鎂依賴性的 phosphatidate phosphatase，可催化 phosphatidic acid 轉換為 diacylglycerol。反應中，1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphate 與水生成 1,2-diacyl-sn-glycerol 和 phosphate，完成磷酸基的移除。
這項轉換發生於 triglyceride、phosphatidylcholine 與 phosphatidylethanolamine 的生合成過程。由於產物 diacylglycerol 是這些脂質合成路徑所涉及的中間物，lipin 3 的酵素作用與脂質生成相連。
來源並指出，lipin 3 因參與上述脂質合成而調節脂肪酸代謝；但所提供資料未進一步說明其調節方式或其他生物學條件。
Promoter 與基因調控
>LPIN3 ENST00000373257 GRCh38 chr20:41339821-41340921 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTCCTCCTCACCGCCCAGTCGTTTCTAAGCCTGGCTCGTCGCCGTTGCTGCTCCGCCAAGCCTTTCCTCG GTGCCCTCTCTCTTTTAGAACAAATTACTTCATCTCCAGGCCCTTCTCAGGGCAGCTTCTTTGCAGGGGC CATAGGGCGTCGGAAAGGTCTTTGGTCCAGGAAAGCCGCGAGCCACAGATCCAAGAGGAAAAAGCCGTTC CCGGCCCGGGCCTTGCCCAAGGCACGAGAGTAAATGCACCTTCCGCGTGCCTCGGCGCACCTGGGCTCAC CTGTCCCCTCCCGCAGTGCCTGCAGACAGGGAGGGAGCGCGGCTGGGCCAGAAGGCTGATCACCGCCTGC CCCCTGCTGGCCAGTGTCAGTATTGAGCCCGCTGCCGCTCGACCAGAACGTCCCAGGGATGGAATGAAGG TGCGGGCATTTATGGAGCGCCTGCTGTTTGTCAGGCGAGGTACTGATAAGCGCTGGAGTGTAAGGATGTA CGTGACCTGCTCTCAGAGTTCAAATTTAAATGAAGAGATATACATTAATCAAGTAGTCATTCAAGCAAAT ATGAAATTACAACTGTGGGCTATGCGAACAGATGACGCGAGGGGCCTGTCCAGTCTGGGAGATACGGGTG GGTTCAGGAAAAGCTGCCCCCAGGAGGGGACGTTTGAGCGCCAGGAGCCGCGCAAAGTCATTTCATGTCA TCTCTAAAATCCTGCAAGGCGGCTTTCCCCCTTGACAAAACAGGAAATGGGATCAAATTGAGGAAGGAAT TCACCCAAGATCACACAGCAAGCTGGAAGCAAATCTGGGAGGAGCTAGGTCCGCCCCGTTCCGAAATCCA CACTTTTCTGGAGGTGGGGCAGGCGGTGGCACAGGGACTTGGGGCGGGGTCTGGTGGGCGGGGCATGAAG TCTGGCCCCGCCCCCGCCTCCGAGGCCAAAGGGCGCCCTGGGCGGGGATCGGAGCAGGGGCGGGGTCTTT CCAGGGAGTGGAGCCTGGGCAGATTGGGGCCTGTGGAGGCCGCACTAGGATCGTAGAAGGAGTGGAGCCG TGCTCTCACCCTGTCTTAGAGGACCCGGAAGCGCCAAGTGACTGAGGGCCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| LPIN3_1 ↗ | 20:41,340,821 | 正股 | 41,340,772–41,340,831 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR20_5CPJHN · CTCF_binding_site · 41340164–41340185 · regulatory
ENSR20_BB7HZ · promoter · 41340331–41340982 · regulatory
ENSR20_BB7J4 · enhancer · 41340983–41341722 · regulatory
ENSR20_837S6C · enhancer · 41344610–41344807 · regulatory
· motif · 41340086–41340095 · motif
· motif · 41340166–41340182 · motif
· motif · 41340204–41340220 · motif
· motif · 41340558–41340569 · motif
· motif · 41340670–41340680 · motif
· motif · 41340700–41340710 · motif
· motif · 41340714–41340724 · motif
· motif · 41340735–41340745 · motif
· motif · 41340741–41340751 · motif
· motif · 41340752–41340765 · motif
· motif · 41340752–41340766 · motif
· motif · 41340786–41340796 · motif
· motif · 41340889–41340903 · motif
· motif · 41340892–41340903 · motif
· motif · 41340892–41340903 · motif
· motif · 41340894–41340903 · motif
· motif · 41341030–41341045 · motif
· motif · 41341271–41341286 · motif
· motif · 41341340–41341355 · motif
· motif · 41341342–41341355 · motif
· motif · 41342645–41342656 · motif
· motif · 41342690–41342701 · motif
· motif · 41343242–41343257 · motif
· motif · 41343242–41343257 · motif
· motif · 41343245–41343258 · motif
· motif · 41344132–41344146 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：851 aa
lipin 3 長 851 個胺基酸，屬於 lipin 家族。蛋白質包含 N-LIP（第 1–108 位）與 C-LIP（第 590–792 位）區域，以及 LNS2 結構域（第 638–822 位）和兩段 LNS2-associated Ig-like 結構域。註解另列出核定位訊號、DXDXT motif 與 LXXIL motif；部分序列區域被註解為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源將 lipin 3 的定位註記為細胞核，未提供定位改變的條件、異構型差異或動態資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | lipin 3 是鎂依賴性的 phosphatidate phosphatase，可在 triglyceride、phosphatidylcholine 與 phosphatidylethanolamine 生合成期間催化 phosphatidic acid 轉為 diacylglycerol，因此參與脂肪酸代謝調節。 | 推論支持 | 證據與來源Magnesium-dependent phosphatidate phosphatase enzyme which catalyzes the conversion of phosphatidic acid to diacylglycerol during triglyceride, phosphatidylcholine and phosphatidylethanolamine biosynthesis therefore regulates fatty acid metabolism |
| 分子活性 | a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphate + H2O = a 1,2-diacyl-sn-glycerol + phosphate | 推論支持 | |
| 細胞定位 | 此筆定位註記將 lipin 3 的細胞內位置標示為細胞核；資料未提供定位發生的條件、動態變化或不同異構型之間的定位差異。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AGATTGGGGCCTGTGGAGGCCGCACTAGGATCGTAGAAGG40AGTGGAGCCGTGCTCTCACCCTGTCTTAGAGGACCCGGAA80GCGCCAAGTGACTGAGGGCCGAAGACACTCACCTGTGGAG120CCTGTGCACGTAGGTAGAGGCGGCGGCTCTGAGTCCAGGA160GCTCCAGTGGGCAGCTCCCCAGCACCAGCCATGAACTACG200TGGGGCAGCTGGCGGAGACGGTGTTTGGGACGGTGAAGGA240GCTGTACCGGGGCCTGAACCCAGCCACACTGAGCGGCGGC280ATTGACGTGCTGGTGGTGAAGCAGGTGGACGGCTCGTTCC320GGTGCTCACCCTTCCACGTGCGTTTTGGCAAGCTGGGCGT360CCTGCGGTCGCGGGAGAAGGTGGTAGACATTGAGCTCAAT400GGGGAGCCTGTGGACTTGCACATGAAGCTTGGGGACAGCG440GGGAGGCCTTCTTTGTTCAGGAGCTGGAGAGCGATGATGA480ACATGTGCCTCCCGGCCTGTGCACCTCACCCATCCCTTGG520GGGGGTCTGTCTGGCTTCCCCTCGGACTCCCAGCTGGGCA560CTGCCAGTGAGCCTGAGGGCCTCGTCATGGCAGGCACGGC600CTCCACTGGGCGGAGGAAGAGGCGTCGCAGGAGGAAACCC640AAGCAGAAAGAGGATGCAGTGGCAACTGATTCTAGTCCAG680AGGAACTGGAGGCAGGCGCTGAGAGTGAGCTATCCCTGCC720GGAAAAGCTGAGGCCAGAGCCCCCAGGTGTCCAGTTGGAA760GAGAAGTCTTCACTGCAGCCCAAAGACATCTACCCCTACT800CGGATGGCGAGTGGCCCCCCCAGGCCAGCCTCTCAGCAGG840TGAGCTAACATCCCCTAAGAGCGACTCGGAGCTGGAGGTG880CGGACCCCGGAGCCCAGTCCCCTAAGAGCCGAGTCCCACA920TGCAGTGGGCCTGGGGGAGGCTGCCTAAGGTGGCCAGAGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。