演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

LPAR3LP-A3

lysophosphatidic acid receptor 3

LPAR3 編碼 lysophosphatidic acid receptor 3,是辨識溶血磷脂酸(LPA)的受體,可能參與卵巢癌發展。

Homo sapiens1p22.3UniProt Q9UBY5
OFFICIAL SYMBOL
LPAR3
CHROMOSOME
1
UNIPROT
Q9UBY5
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

LPAR3 的產物 lysophosphatidic acid receptor 3 是一種辨識溶血磷脂酸(LPA)的受體,屬於 G protein-coupled receptor 1 family。現有資料指出,此受體可能與異源三聚體 G 蛋白家族 G(i)/G(o) 和 G(q) 偶聯;資料未提供更詳細的結構或分子作用描述。

Official symbol
LPAR3
Gene name
lysophosphatidic acid receptor 3
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14298
UniProt
Q9UBY5
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
LP-A3Edg-7RP4-678I3HOFNH30LPA3EDG7

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11p22.3
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegLPAR3pq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr1:84,811,541–84,893,540
Gene span
82,000 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000370611 ★84,811,602–84,893,2063
ENST0000044088684,811,541–84,866,1592
ENST0000093096384,811,541–84,893,5403
ENST0000093096484,811,541–84,893,3434
ENST0000093096584,811,541–84,893,3435
ENST0000093096684,811,541–84,893,3434
ENST0000094229984,811,541–84,893,3434
ENST0000094230084,811,541–84,893,3434
ENST0000094230184,811,541–84,893,3434
ENST0000094230284,811,541–84,893,3434
ENST0000094230384,811,541–84,893,3435
ENST0000102811684,811,541–84,893,3433

顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

lysophosphatidic acid receptor 3 是溶血磷脂酸(LPA)的受體。LPA 可介導多種細胞活動,LPAR3 因而參與細胞對此介質的受體辨識。現有資料將其描述為受體,未進一步列出 LPA 誘發的特定細胞反應或下游作用方式。

此受體似乎與異源三聚體 G 蛋白的 G(i)/G(o) 與 G(q) 家族偶聯。來源以「似乎」表述此關係,因此應視為尚帶有不確定性的功能描述;資料未交代各 G 蛋白家族所介導的訊號結果,也未指出其作用條件或具體細胞情境。

LPAR3 可能在卵巢癌發展中發揮作用,但來源未說明此關聯的機制或證據細節,因此不能據此判定其作用方向或因果關係。整體而言,現有資料支持的功能重點是 LPA 受體身分、可能的 G 蛋白偶聯,以及其與卵巢癌發展可能相關的有限描述。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 84893206 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>LPAR3 ENST00000370611 GRCh38 chr1:84893106-84894206 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTATTATGGTCTATAGGATAAGACCCACGGAGTAAGGGACGTAACCTTATTAAAACATCCTCTGCAGAGA
AAACAGAATCTCTTTGATGGTAGGGGACAGATTATCTAACAGGTTGTTTGCAAGGATGAGGTTCCTAGCT
GGCACACAGAAGGGCGCAGTATTAATGGTGAATGCAAGATGAATGAATGAACGGATGGATGGATGGCAAA
GGGTCACAGGAAGACATCTGGGCACACAACTCTCATTGCTTCCTAAGGGCCTGAAGTCTGAGTGGGAAGG
ACTTCACCTCACAGTATTTCCTTTTTGTAAGGTCACCAGGAAAGCACAACTTTGAACATTTCTGTGACTT
CGTTATTGCTTTGCAGAATTCAGAGAGAACAATGCCTTCATGACATTTGTTTTACTTTGCATCTTTCTTC
TTTACTAAAGGTGGGTCAGTGGAGGTTTTATATTTCAGCTTTGAAAAACAAAGTATCCAGGACTATTTGC
CCCAGGAGGCCAAGAAACCTCTTACAAGAACCTTAAATATTGTTGGTTGCCTCTGGGGGCTGTCCGCACC
CTCGGGTAGCTTTGGGGTTGAGGTTTCCAGCGTTAGGTCGGGCTTGGAGTAGAGCCTGCCTCCCACGGGG
GTGGTGGGTGTGGGCTGCACTTCCCGCAGCCACTTCAAACAAATCTCTGAGGACAGAGGGGCAGAGGGAC
TGCGTTCTAATACGGAGCTCCGAGGTATGGCTCCGTGAGGCTTGTGGGTACTAGCGGTCCTTTAGTGGGC
GCTTTTCCCTCTCGGGGCCGGCCGACCACCCACCTGGGGACGATCCCAGGCAGGAACGCGTCTGCAAGAG
CGCTGCCCTCCCGCGGCTCGCACGGGCCCCTTTGAGCGCAGCTCGCGGCCTTGCAGGTTGGGGACGCTCT
CCAGTGGGAACGTCGAACGCACCCGGCGGGGCGGGGCGGGGCAGGGAGGGGCCGCTGTCCCTAGGTCCCT
CCCTCGCACCGCCAAACTTTCCTTTGGCTCTGGACGCGTCGCAGGGGTCGCTGGAGAGGAGGCGCTCCGC
CCGCCCGCCGCGTCCTCCGCTGCTTCTCCGCGCCCGGCTGGAGCCCGGCGC
LPAR3 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
LPAR3_1 ↗1:84,893,206負股84,893,196–84,893,255

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_938NPQ · enhancer · 84888747–84889075 · regulatory

ENSR1_BLSTX · enhancer · 84892361–84893195 · regulatory

ENSR1_938NR4 · promoter · 84893196–84893696 · regulatory

ENSR1_5PZ5H7 · CTCF_binding_site · 84893432–84893453 · regulatory

ENSR1_76ZR6P · enhancer · 84894606–84894730 · regulatory

· motif · 84892673–84892682 · motif

· motif · 84892673–84892682 · motif

· motif · 84893434–84893450 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:353 aa

1 aa353 aa跨膜區拓樸區域
依 Q9UBY5 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

lysophosphatidic acid receptor 3 長 353 個胺基酸,屬於 G protein-coupled receptor 1 family。序列註解預測其含有七段螺旋型跨膜區域,並在各跨膜區之間分布胞外與胞質區段;胞質端延伸至蛋白質末端。

拓樸區域Extracellular1–31 aa
跨膜區Helical; Name=132–52 aa
拓樸區域Cytoplasmic53–67 aa
跨膜區Helical; Name=268–88 aa
拓樸區域Extracellular89–101 aa
跨膜區Helical; Name=3102–124 aa
拓樸區域Cytoplasmic125–146 aa
跨膜區Helical; Name=4147–167 aa
拓樸區域Extracellular168–186 aa
跨膜區Helical; Name=5187–207 aa
拓樸區域Cytoplasmic208–240 aa
跨膜區Helical; Name=6241–261 aa
拓樸區域Extracellular262–276 aa
跨膜區Helical; Name=7277–297 aa
拓樸區域Cytoplasmic298–353 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9UBY5…

AlphaFold · Q9UBY5

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

lysophosphatidic acid receptor 3 位於細胞膜,屬於多次跨膜蛋白。 現有資料未描述其定位隨條件改變的情形、異構型差異或細胞內移動動態。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 50 個夥伴 · 最多顯示 50 個
LP-A3LPAR3AQP6ARL13BASZ1BCL2L13C16orf54CD53CD74CD79ACLDN2CLDN7CLDN9CLEC12BCPLX4CREB3L1CYB561CYBRD1EDAERGIC3FAM209AFAM210BFFAR2FNDC9GJB5GORABGPX8JAGN1KCNC1KCNJ6LEPROTL1LHFPL5LIME1MFFMGST3MRM1MS4A4ANDUFAF2OPRM1PGRMC2RELL2RETREG3SCN3BSGMS2SHISAL1SLC10A6SLC35C2TFECTHAP4TMEM14BTMEM237TMEM41A
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 53 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能lysophosphatidic acid receptor 3 是溶血磷脂酸(LPA)的受體;LPA 可介導多種細胞活動。此受體似乎與異源三聚體 G 蛋白的 G(i)/G(o) 和 G(q) 家族偶聯。來源另指出,它可能在卵巢癌發展中發揮作用,但未提供其作用機制或因果證據。資料庫紀錄
證據與來源

Receptor for lysophosphatidic acid (LPA), a mediator of diverse cellular activities. May play a role in the development of ovarian cancer. Seems to be coupled to the G(i)/G(o) and G(q) families of heteromeric G proteins

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位lysophosphatidic acid receptor 3 位於細胞膜,並屬於多次跨膜蛋白。資料庫紀錄
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000370611 · 3,515 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1CCTTTGGCTCTGGACGCGTCGCAGGGGTCGCTGGAGAGGA40
41GGCGCTCCGCCCGCCCGCCGCGTCCTCCGCTGCTTCTCCG80
81CGCCCGGCTGGAGCCCGGCGCCCGGTCGCCCCGTCGCGCT120
121CGACCCCGAGGGCATGCGGCAGCCGCAGGGGCCCCCGCTC160
161CCGGGCTCGGCGGCGCGGGTGAACGTGAGCGGATGTTCAC200
201TTCTCCACAATGAATGAGTGTCACTATGACAAGCACATGG240
241ACTTTTTTTATAATAGGAGCAACACTGATACTGTCGATGA280
281CTGGACAGGAACAAAGCTTGTGATTGTTTTGTGTGTTGGG320
321ACGTTTTTCTGCCTGTTTATTTTTTTTTCTAATTCTCTGG360
361TCATCGCGGCAGTGATCAAAAACAGAAAATTTCATTTCCC400
401CTTCTACTACCTGTTGGCTAATTTAGCTGCTGCCGATTTC440
441TTCGCTGGAATTGCCTATGTATTCCTGATGTTTAACACAG480
481GCCCAGTTTCAAAAACTTTGACTGTCAACCGCTGGTTTCT520
521CCGTCAGGGGCTTCTGGACAGTAGCTTGACTGCTTCCCTC560
561ACCAACTTGCTGGTTATCGCCGTGGAGAGGCACATGTCAA600
601TCATGAGGATGCGGGTCCATAGCAACCTGACCAAAAAGAG640
641GGTGACACTGCTCATTTTGCTTGTCTGGGCCATCGCCATT680
681TTTATGGGGGCGGTCCCCACACTGGGCTGGAATTGCCTCT720
721GCAACATCTCTGCCTGCTCTTCCCTGGCCCCCATTTACAG760
761CAGGAGTTACCTTGTTTTCTGGACAGTGTCCAACCTCATG800
801GCCTTCCTCATCATGGTTGTGGTGTACCTGCGGATCTACG840
841TGTACGTCAAGAGGAAAACCAACGTCTTGTCTCCGCATAC880
881AAGTGGGTCCATCAGCCGCCGGAGGACACCCATGAAGCTA920
921ATGAAGACGGTGATGACTGTCTTAGGGGCGTTTGTGGTAT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。