基因總覽
LPAR3 的產物 lysophosphatidic acid receptor 3 是一種辨識溶血磷脂酸(LPA)的受體,屬於 G protein-coupled receptor 1 family。現有資料指出,此受體可能與異源三聚體 G 蛋白家族 G(i)/G(o) 和 G(q) 偶聯;資料未提供更詳細的結構或分子作用描述。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000370611 ★ | 84,811,602–84,893,206 | 3 |
| ENST00000440886 | 84,811,541–84,866,159 | 2 |
| ENST00000930963 | 84,811,541–84,893,540 | 3 |
| ENST00000930964 | 84,811,541–84,893,343 | 4 |
| ENST00000930965 | 84,811,541–84,893,343 | 5 |
| ENST00000930966 | 84,811,541–84,893,343 | 4 |
| ENST00000942299 | 84,811,541–84,893,343 | 4 |
| ENST00000942300 | 84,811,541–84,893,343 | 4 |
| ENST00000942301 | 84,811,541–84,893,343 | 4 |
| ENST00000942302 | 84,811,541–84,893,343 | 4 |
| ENST00000942303 | 84,811,541–84,893,343 | 5 |
| ENST00001028116 | 84,811,541–84,893,343 | 3 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
lysophosphatidic acid receptor 3 是溶血磷脂酸(LPA)的受體。LPA 可介導多種細胞活動,LPAR3 因而參與細胞對此介質的受體辨識。現有資料將其描述為受體,未進一步列出 LPA 誘發的特定細胞反應或下游作用方式。
此受體似乎與異源三聚體 G 蛋白的 G(i)/G(o) 與 G(q) 家族偶聯。來源以「似乎」表述此關係,因此應視為尚帶有不確定性的功能描述;資料未交代各 G 蛋白家族所介導的訊號結果,也未指出其作用條件或具體細胞情境。
LPAR3 可能在卵巢癌發展中發揮作用,但來源未說明此關聯的機制或證據細節,因此不能據此判定其作用方向或因果關係。整體而言,現有資料支持的功能重點是 LPA 受體身分、可能的 G 蛋白偶聯,以及其與卵巢癌發展可能相關的有限描述。
Promoter 與基因調控
>LPAR3 ENST00000370611 GRCh38 chr1:84893106-84894206 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTATTATGGTCTATAGGATAAGACCCACGGAGTAAGGGACGTAACCTTATTAAAACATCCTCTGCAGAGA AAACAGAATCTCTTTGATGGTAGGGGACAGATTATCTAACAGGTTGTTTGCAAGGATGAGGTTCCTAGCT GGCACACAGAAGGGCGCAGTATTAATGGTGAATGCAAGATGAATGAATGAACGGATGGATGGATGGCAAA GGGTCACAGGAAGACATCTGGGCACACAACTCTCATTGCTTCCTAAGGGCCTGAAGTCTGAGTGGGAAGG ACTTCACCTCACAGTATTTCCTTTTTGTAAGGTCACCAGGAAAGCACAACTTTGAACATTTCTGTGACTT CGTTATTGCTTTGCAGAATTCAGAGAGAACAATGCCTTCATGACATTTGTTTTACTTTGCATCTTTCTTC TTTACTAAAGGTGGGTCAGTGGAGGTTTTATATTTCAGCTTTGAAAAACAAAGTATCCAGGACTATTTGC CCCAGGAGGCCAAGAAACCTCTTACAAGAACCTTAAATATTGTTGGTTGCCTCTGGGGGCTGTCCGCACC CTCGGGTAGCTTTGGGGTTGAGGTTTCCAGCGTTAGGTCGGGCTTGGAGTAGAGCCTGCCTCCCACGGGG GTGGTGGGTGTGGGCTGCACTTCCCGCAGCCACTTCAAACAAATCTCTGAGGACAGAGGGGCAGAGGGAC TGCGTTCTAATACGGAGCTCCGAGGTATGGCTCCGTGAGGCTTGTGGGTACTAGCGGTCCTTTAGTGGGC GCTTTTCCCTCTCGGGGCCGGCCGACCACCCACCTGGGGACGATCCCAGGCAGGAACGCGTCTGCAAGAG CGCTGCCCTCCCGCGGCTCGCACGGGCCCCTTTGAGCGCAGCTCGCGGCCTTGCAGGTTGGGGACGCTCT CCAGTGGGAACGTCGAACGCACCCGGCGGGGCGGGGCGGGGCAGGGAGGGGCCGCTGTCCCTAGGTCCCT CCCTCGCACCGCCAAACTTTCCTTTGGCTCTGGACGCGTCGCAGGGGTCGCTGGAGAGGAGGCGCTCCGC CCGCCCGCCGCGTCCTCCGCTGCTTCTCCGCGCCCGGCTGGAGCCCGGCGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| LPAR3_1 ↗ | 1:84,893,206 | 負股 | 84,893,196–84,893,255 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR1_938NPQ · enhancer · 84888747–84889075 · regulatory
ENSR1_BLSTX · enhancer · 84892361–84893195 · regulatory
ENSR1_938NR4 · promoter · 84893196–84893696 · regulatory
ENSR1_5PZ5H7 · CTCF_binding_site · 84893432–84893453 · regulatory
ENSR1_76ZR6P · enhancer · 84894606–84894730 · regulatory
· motif · 84892673–84892682 · motif
· motif · 84892673–84892682 · motif
· motif · 84893434–84893450 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:353 aa
lysophosphatidic acid receptor 3 長 353 個胺基酸,屬於 G protein-coupled receptor 1 family。序列註解預測其含有七段螺旋型跨膜區域,並在各跨膜區之間分布胞外與胞質區段;胞質端延伸至蛋白質末端。
蛋白質三維結構
細胞內定位
lysophosphatidic acid receptor 3 位於細胞膜,屬於多次跨膜蛋白。 現有資料未描述其定位隨條件改變的情形、異構型差異或細胞內移動動態。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 53 個夥伴
- AQP6Q13520 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ARL13BQ3SXY8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ASZ1Q8WWH4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BCL2L13Q9BXK5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- C16orf54Q6UWD8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CD53P19397 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CD74P04233-2 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- CD79AP11912 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CLDN2P57739 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CLDN7O95471 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CLDN9O95484 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CLEC12BQ2HXU8-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CPLX4Q7Z7G2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CREB3L1Q96BA8 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- CYB561P49447 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CYBRD1Q53TN4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EDAQ92838 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ERGIC3Q9Y282 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM209AQ5JX71 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM210BQ96KR6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FFAR2O15552 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FNDC9Q8TBE3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GJB5O95377 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GORABQ5T7V8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPX8Q8TED1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | lysophosphatidic acid receptor 3 是溶血磷脂酸(LPA)的受體;LPA 可介導多種細胞活動。此受體似乎與異源三聚體 G 蛋白的 G(i)/G(o) 和 G(q) 家族偶聯。來源另指出,它可能在卵巢癌發展中發揮作用,但未提供其作用機制或因果證據。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Receptor for lysophosphatidic acid (LPA), a mediator of diverse cellular activities. May play a role in the development of ovarian cancer. Seems to be coupled to the G(i)/G(o) and G(q) families of heteromeric G proteins |
| 細胞定位 | lysophosphatidic acid receptor 3 位於細胞膜,並屬於多次跨膜蛋白。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
CCTTTGGCTCTGGACGCGTCGCAGGGGTCGCTGGAGAGGA40GGCGCTCCGCCCGCCCGCCGCGTCCTCCGCTGCTTCTCCG80CGCCCGGCTGGAGCCCGGCGCCCGGTCGCCCCGTCGCGCT120CGACCCCGAGGGCATGCGGCAGCCGCAGGGGCCCCCGCTC160CCGGGCTCGGCGGCGCGGGTGAACGTGAGCGGATGTTCAC200TTCTCCACAATGAATGAGTGTCACTATGACAAGCACATGG240ACTTTTTTTATAATAGGAGCAACACTGATACTGTCGATGA280CTGGACAGGAACAAAGCTTGTGATTGTTTTGTGTGTTGGG320ACGTTTTTCTGCCTGTTTATTTTTTTTTCTAATTCTCTGG360TCATCGCGGCAGTGATCAAAAACAGAAAATTTCATTTCCC400CTTCTACTACCTGTTGGCTAATTTAGCTGCTGCCGATTTC440TTCGCTGGAATTGCCTATGTATTCCTGATGTTTAACACAG480GCCCAGTTTCAAAAACTTTGACTGTCAACCGCTGGTTTCT520CCGTCAGGGGCTTCTGGACAGTAGCTTGACTGCTTCCCTC560ACCAACTTGCTGGTTATCGCCGTGGAGAGGCACATGTCAA600TCATGAGGATGCGGGTCCATAGCAACCTGACCAAAAAGAG640GGTGACACTGCTCATTTTGCTTGTCTGGGCCATCGCCATT680TTTATGGGGGCGGTCCCCACACTGGGCTGGAATTGCCTCT720GCAACATCTCTGCCTGCTCTTCCCTGGCCCCCATTTACAG760CAGGAGTTACCTTGTTTTCTGGACAGTGTCCAACCTCATG800GCCTTCCTCATCATGGTTGTGGTGTACCTGCGGATCTACG840TGTACGTCAAGAGGAAAACCAACGTCTTGTCTCCGCATAC880AAGTGGGTCCATCAGCCGCCGGAGGACACCCATGAAGCTA920ATGAAGACGGTGATGACTGTCTTAGGGGCGTTTGTGGTAT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。