基因總覽
LINC01587 的正式名稱為 long independently transcribed non-coding RNA 1587，屬於非編碼 RNA。現有資料將它列為 RNA 基因，而非蛋白質編碼基因，因此不應以蛋白質或胺基酸序列描述。關於其 RNA 結構、所屬家族及分子角色，來源未提供足以說明的資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000818285 ★ | 5,518,179–5,527,801 | 5 |
| ENST00000818286 | 5,518,179–5,527,801 | 2 |
| ENST00000515342 | 5,524,569–5,527,595 | 4 |
| ENST00000623565 | 5,525,156–5,527,801 | 3 |
| ENST00000818287 | 5,525,257–5,527,801 | 3 |
| ENST00000505296 | 5,525,390–5,527,800 | 3 |
| ENST00000504943 | 5,527,054–5,527,801 | 2 |
顯示 7/7 個RNA轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前資料指出，LINC01587 在神經母細胞瘤中有表現；不過，這項表現資訊尚未釐清它在該細胞情境中的作用，也不能據此推定其參與特定生物過程。來源明確說明，LINC01587 的功能尚未確定，因此目前無法描述其分子作用方式、調控對象或生物學意義。
Promoter 與基因調控
>LINC01587 ENST00000818285 GRCh38 chr4:5517179-5518279 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TGCCTTACTAACTTGCTATAAGCTATACATTGTTAAGAGAAAAAAAGAAAACTTTTGTTAAATCTGTAAA GCATGATGTTAAAGAATCATCAGTGTTTTAGACAAAAGTCATAAAAAGTTATCTTCATCAGTTTGTTTAG TCCCATGTAATTAACTCTTATTCTGCTGGATTTTGTGATAGTACTTCCAAGAACCCATCGGTTTCTTCAT TGGAGTTCTGGAAATTCTTACCCCGTCTGGCTATACGGTCTTAAAGTTACTAGAAAACTGTGTTTTAGAG TACTTGTCAGGGGCTTTTTCTATGACTCTGTTTGAAACAGTAGCAACTTTAGCCAGTAGCTGATTGTAAA TGCCTTCAGGAAGAATCAAAATAAACAATAGCTGTCTGTGAATAACGAAAGACTCAAAATGGCCATGGTT AAGGATCTGATAAGAGTTCACTAAAATGATGATTAAACTGACAAGGAATTTGGTTATTCCTATGACATAC AACATTTTAACATGCTAACTAGAATCATTGCTGGTAATGTATTAGAACATATCACATTTCCAGGAATTTT ATATAATTTTTAGAACACTTATATTAATGATATACATTCATATAAATATAACATGAAGGTTAAATATCAT TTTGACTATGTTTCCATATACTTTAATATATCAAATAAGCGTAATTCGTTTACTATCTTCCTTAGTGTAA GGAGAGAAAACAACTCTTTTGTAATCCTCCAGATAACCATCTGCAAAATTCTAAAGTTTGCTCAAGGTCA AATAGATTTTATTTAGAATTTGGTTTTGGAAAGTTTATCAAAAATGTCAAAAAGTTAAAATAATTAATTA AAACACGATCGTAGATCGTGAAATAATACCAAAGTGACAAAAGATTTCAGAGGCAAATACAGAAAGTTAC ATCATTATTAAAAAAAAAAAAAAAAACTTTAGCTTTGTTCATATTGAGAAAACTTAGTTTACTTAAGTAA TCAAAGACAATAAAGACAATATGGGAGGGAGCCAAGATGGCCGAATAGGAACAGCTCCAGTCTACAGCTT CCAGCATCAGCGACGCAGAAGACGGGTGATTTCTGCATTTCCATCTGAGGT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
· motif · 5522175–5522189 · motif
· motif · 5522175–5522189 · motif
RNA 轉錄本與序列
LINC01587 依 HGNC／Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000818285 ★ | lncRNA | 867 nt | 5 |
| ENST00000818286 | lncRNA | 513 nt | 2 |
| ENST00000515342 | lncRNA | 576 nt | 4 |
| ENST00000623565 | lncRNA | 873 nt | 3 |
| ENST00000818287 | lncRNA | 811 nt | 3 |
| ENST00000505296 | lncRNA | 659 nt | 3 |
| ENST00000504943 | lncRNA | 622 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | LINC01587 在神經母細胞瘤中有表現，但目前尚未確定其功能。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源This gene is expressed in neuroblastoma; however, the function of this gene is not yet determined. |
DNA 與 RNA 序列
ATGGGAGGGAGCCAAGATGGCCGAATAGGAACAGCTCCAG40TCTACAGCTTCCAGCATCAGCGACGCAGAAGACGGGTGAT80TTCTGCATTTCCATCTGAGAATCCTGGAGAGCTGGCTAAC120TGCTGGGCACAAGCCCAACAGCTTGAGCCCCAGGCTGATA160GAAACCAAAGAGCACATTTTCACTGATTACAAAGCCAAGC200TCTTATGACTTCAGAGAAGATGAAGCAGAGTCTGATGCAG240GACAGTTGAATTTGGGAAGGAAGGAACACGCAAAAATTTT280TACCTTCTTCTTTCAATTGGACACTATGGACGGAAATCCA320GGAGAGCTGACCTTGGAACTGCAGACACTGCAGATAAAAC360AGAGCCAGAATGCTTTGCTGCCAGCTGGACCTTTGACCCA400AACCCCAGTGTGACTGTCTCCGGTGCTCACTCAACTGCAG440TGCATCAATGAAGGAAAAAAGAACTGAGCATTGGCAAAAA480GCTGAGGATGACAAGCTTAGGGGATGAAAGGCTGCCTTTT520CCCCCCCTTCTGAGCGTTTCTGACAGCTCCCAGCTGGGAG560AAACCAACATGACGAAAAGACAAAGAATACTGGAGAAGAG600AGAGGGTGGGCAGAGCCACAACCTCATCCTCCCAGTGGTT640CCTCTTGAGTTTGATTTGACAAGATGCCTTCCCACCCAGG680TAACCCCGTGGGAACGTGCCAGTACCTCACCGCACGACCT720CACTGAGTCCTCACAACAAATCCAGGCTGCAGATTTTTTT760CCCCACTTGGAGATGACAAATTGAAATGCAGGAAGGTTAA800AGAGTTTGCCTGAGGTTGCTTAGATAATAAAAGAATCTGG840ATTAGAACCCAGACCTACCCAGCTAAA867cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。