基因總覽
LAPTM4B 的正式名稱為 lysosomal protein transmembrane 4 beta，屬於蛋白質編碼基因；其產物為 LAPTM4/LAPTM5 transporter family 的成員。這是一種多次跨膜蛋白，主要與溶酶體相關功能有關，也參與細胞內膜系統中的分子運輸與調節。來源所述的功能涉及溶酶體胺基酸輸送、EGFR 降解調節、TGFB1 生成，以及神經醯胺自晚期胞內體移出等不同面向。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000521545 ★ | 97,775,788–97,853,013 | 7 |
| ENST00000445593 | 97,775,057–97,854,225 | 7 |
| ENST00000929553 | 97,775,057–97,854,225 | 6 |
| ENST00000929555 | 97,775,057–97,854,225 | 6 |
| ENST00000929554 | 97,775,057–97,854,225 | 6 |
| ENST00000883453 | 97,775,057–97,854,225 | 2 |
| ENST00000929556 | 97,775,057–97,854,225 | 5 |
| ENST00000883454 | 97,775,057–97,854,225 | 8 |
| ENST00000883455 | 97,775,057–97,854,225 | 7 |
| ENST00000929557 | 97,775,057–97,854,225 | 5 |
| ENST00001110923 | 97,775,057–97,807,908 | 2 |
| ENST00001119976 | 97,775,057–97,854,225 | 7 |
顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
LAPTM4B 對最佳溶酶體功能具有必要性。它參與調整 EGFR 的胞內運輸與降解：在 EGF 刺激下，LAPTM4B 可阻止 EGFR 被分選至胞內體腔並降解；另一方面，與 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 結合後，LAPTM4B 對 PIP5K1C 的交互作用受到調節，並抑制 HGS 泛素化，因而解除其對 EGFR 降解的抑制作用。
在溶酶體營養感知方面，LAPTM4B 會將胺基酸轉運相關蛋白 SLC3A2 與 SLC7A5 招募至溶酶體，促進 leucine 及其他必需胺基酸進入該胞器。這會刺激液泡型質子轉運 ATPase（V-ATPase）蛋白幫浦活化，進而促進 mTORC1 活化。
LAPTM4B 也與免疫調節及脂質運輸相關。在調節性 T 細胞中，它具有負向調節 TGFB1 生成的作用；此外，它能結合 ceramide，並促進 ceramide 離開晚期胞內體，以調控細胞死亡途徑。這些作用顯示，LAPTM4B 的功能涵蓋胞器內物質運輸，以及細胞訊號和生物學過程的調節。
Promoter 與基因調控
>LAPTM4B ENST00000521545 GRCh38 chr8:97774788-97775888 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTGAAAATACAACAAATTAGCCAGGCGTGGT GGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGTGGAG CTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTACCGGAAGCACAGCGAGGATGTCCTTGACACACATCCTATTTTC TGGGAAAAGATTACTACCACAGTAATTGAGCTGTGAAGCGGAGACAAATTGCTCTCGGTGGTGGTTCAAA GTACTGCAATTGACTGGAATAGCACCGCGCAGTTTTCCTTCCTCTCGTGCAAGATAAGAGTGATAGGAGC TGTATCGATTACCTGCAAGATAGAAGTAGAAGCGGGCCGGGTGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCA CTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCATTCGACGTCAGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGTGAA ACCCCGTCTCTACTAAAAATACAACAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCAAGCGCCTGTAATCCCAGCTACTC GGTTGGTTGGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCATTG CACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGTAGAAGGGAAGAA AATCGCAAGGAACTAGACTAAAAGAATCTCGACCCTTGAATGGAGTTACACGAACGGCCAGATGAAAGAA GGAAGGCCCGGACCTCCACTCAGGGCCGACTAGGGGACTGGCGGAGGGTGCACGCTGATGGATTTACTCA CCGGGTGCTTGGAGCTCCAGCAGCTGGCTGGAGCCCGCGATGACGTCACGGACTCGGGTCACATGGCCAA GTCCGCCCCGCCCCCTCCCCGTCCCCGCCGCTGCAGCGGTCGCCTTCGGAGCGAAGGGTACCGACCCGGC AGAAGCTCGGAGCTCTCGGGGTATCGAGGAGGCAGGCCCGCGGGCGCACGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| LAPTM4B_1 ↗ | 8:97,775,788 | 正股 | 97,775,739–97,775,798 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR8_84TLMP · promoter · 97774874–97775067 · regulatory
ENSR8_5SZX8N · CTCF_binding_site · 97774911–97774932 · regulatory
ENSR8_93FRSJ · promoter · 97775298–97775798 · regulatory
ENSR8_CCNZ3 · enhancer · 97777421–97778737 · regulatory
· motif · 97774913–97774929 · motif
· motif · 97775129–97775144 · motif
· motif · 97775129–97775144 · motif
· motif · 97775735–97775748 · motif
· motif · 97775735–97775748 · motif
· motif · 97776444–97776460 · motif
· motif · 97776453–97776462 · motif
· motif · 97776453–97776462 · motif
· motif · 97777745–97777756 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：317 aa
LAPTM4B 蛋白長 317 個胺基酸，註解出四段螺旋型跨膜區，分別位於第 117–137、163–183、191–211 與 244–264 個胺基酸。第 25–73 位為無序區域；第 205–221 位則註解為 NEDD4 交互作用所需區域。此蛋白屬於 LAPTM4/LAPTM5 transporter family。
蛋白質三維結構
細胞內定位
LAPTM4B 定位於細胞內膜系統，並見於溶酶體與胞內體膜，包括晚期胞內體及多囊泡體相關區域；來源也記載其位於細胞膜與細胞突起。 這些註解涵蓋不同膜性區室，未提供足以說明定位改變條件或異構型差異的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Endomembrane system；Cell projection。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 21 個夥伴
- ABCB1P08183 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CGRRF1Q99675 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CTXN3Q4LDR2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CYB561A3Q8NBI2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EGFRP00533 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- EMP1P54849 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EXOC4Q96A65 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GJA8P48165 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPX8Q8TED1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IFNAR1P17181 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IGFBP5P24593 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ISLR2Q6UXK2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MTIF3Q9H2K0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NAALADL2Q58DX5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NRG1Q02297-10 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ODF4Q2M2E3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SCARB2Q14108 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMEM86BQ8N661 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TUSC5A5PKU2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- Q96FB2Q96FB2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PIK3R1P27986 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
LAPTM4B 到達溶酶體後可形成同源寡聚體，也與 MCOLN1、NEDD4、PIP5K1C、HGS、SNX5、SLC3A2、SLC7A5、LRRC32、BECN1 及 EGFR 有交互作用。功能關係方面，它可招募 SLC3A2 與 SLC7A5 至溶酶體；與 PIP5K1C 的交互作用受其產生的 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 調節，且該激酶活性為 SNX5 與 LAPTM4B 關聯所需。LAPTM4B 也促進 HGS 與 NEDD4 的關聯；與 BECN1 的結合則會與 EGFR 競爭 LAPTM4B。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | LAPTM4B 對最佳溶酶體功能具有必要性，並能調節 EGF 刺激下 EGFR 的胞內分選與降解；其與 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 的結合會影響 PIP5K1C 交互作用及 HGS 泛素化。它也促進 SLC3A2、SLC7A5 介導的胺基酸進入溶酶體並促進 mTORC1 活化，在調節性 T 細胞中負向調節 TGFB1 生成，且可促進 ceramide 離開晚期胞內體以調控細胞死亡途徑。 | 含實驗來源 | 證據與來源Required for optimal lysosomal function. Blocks EGF-stimulated EGFR intraluminal sorting and degradation. Conversely by binding with the phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate, regulates its PIP5K1C interaction, inhibits HGS ubiquitination and relieves LAPTM4B inhibition of EGFR degradation. Recruits SLC3A2 and SLC7A5 (the Leu transporter) to the lysosome, promoting entry of leucine and other essential amino acid (EAA) into the lysosome, stimulating activation of proton-transporting vacuolar (V)-ATPase protein pump (V-ATPase) and hence mTORC1 activation. Plays a role as negative regulator of TGFB1 production in regulatory T cells. Binds ceramide and facilitates its exit from late endosome in order to control cell death pathways PMID 21224396 ↗ · PMID 25588945 ↗ · PMID 25998567 ↗ · PMID 26126825 ↗ · PMID 26280656 ↗ |
| 交互作用 | LAPTM4B 到達溶酶體後可形成同源寡聚體，並與多種蛋白質交互作用。它招募 SLC3A2、SLC7A5 至溶酶體，且與 PIP5K1C、SNX5、HGS、NEDD4 等蛋白的關聯涉及溶酶體分選或 EGFR 降解調節；與 LRRC32 的交互作用和調節性 T 細胞中的 TGFB1 生成降低相關。它也與 BECN1 競爭性地結合 EGFR，並與 EGFR 活化呈正相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homooligomer; upon reaching the lysosomes. Interacts with MCOLN1. Interacts with NEDD4; may play a role in the lysosomal sorting of LAPTM4B; enhances HGS association with NEDD4; mediates inhibition of EGFR degradation. Interacts with PIP5K1C; promotes SNX5 association with LAPTM4B; kinase activity of PIP5K1C is required; interaction is regulated by phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate generated by PIP5K1C. Interacts with HGS; promotes HGS ubiquitination. Interacts with SNX5. Interacts with SLC3A2 and SLC7A5; recruits SLC3A2 and SLC7A5 to lysosomes to promote leucine uptake into these organelles and is required for mTORC1 activation. Interacts with LRRC32; decreases TGFB1 production in regulatory T cells. Interacts with BECN1; competes with EGFR for LAPTM4B binding; regulates EGFR activity. Interacts with EGFR; positively correlates with EGFR activation PMID 21224396 ↗ · PMID 22096579 ↗ · PMID 25588945 ↗ · PMID 25998567 ↗ · PMID 26126825 ↗ · PMID 28479384 ↗ |
| 細胞定位 | LAPTM4B 是多次跨膜蛋白，定位於細胞內膜系統，記錄位置包括晚期胞內體膜、溶酶體膜、胞內體膜及多囊泡體膜與腔內，也包括細胞膜和細胞突起。此定位資料列出多種區室，但未指出特定條件下的定位變化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Endomembrane system / Multi-pass membrane protein; Late endosome membrane; Cell membrane; Cell projection; Lysosome membrane; Endosome membrane; Endosome, multivesicular body membrane; Endosome, multivesicular body lumen PMID 12902989 ↗ · PMID 21224396 ↗ · PMID 22096579 ↗ · PMID 25588945 ↗ · PMID 26280656 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GTCCCCGCCGCTGCAGCGGTCGCCTTCGGAGCGAAGGGTA40CCGACCCGGCAGAAGCTCGGAGCTCTCGGGGTATCGAGGA80GGCAGGCCCGCGGGCGCACGGGCGAGCGGGCCGGGAGCCG120GAGCGGCGGAGGAGCCGGCAGCAGCGGCGCGGCGGGCTCC160AGGCGAGGCGGTCGACGCTCCTGAAAACTTGCGCGCGCGC200TCGCGCCACTGCGCCCGGAGCGATGAAGATGGTCGCGCCC240TGGACGCGGTTCTACTCCAACAGCTGCTGCTTGTGCTGCC280ATGTCCGCACCGGCACCATCCTGCTCGGCGTCTGGTATCT320GATCATCAATGCTGTGGTACTGTTGATTTTATTGAGTGCC360CTGGCTGATCCGGATCAGTATAACTTTTCAAGTTCTGAAC400TGGGAGGTGACTTTGAGTTCATGGATGATGCCAACATGTG440CATTGCCATTGCGATTTCTCTTCTCATGATCCTGATATGT480GCTATGGCTACTTACGGAGCGTACAAGCAACGCGCAGCCT520GGATCATCCCATTCTTCTGTTACCAGATCTTTGACTTTGC560CCTGAACATGTTGGTTGCAATCACTGTGCTTATTTATCCA600AACTCCATTCAGGAATACATACGGCAACTGCCTCCTAATT640TTCCCTACAGAGATGATGTCATGTCAGTGAATCCTACCTG680TTTGGTCCTTATTATTCTTCTGTTTATTAGCATTATCTTG720ACTTTTAAGGGTTACTTGATTAGCTGTGTTTGGAACTGCT760ACCGATACATCAATGGTAGGAACTCCTCTGATGTCCTGGT800TTATGTTACCAGCAATGACACTACGGTGCTGCTACCCCCG840TATGATGATGCCACTGTGAATGGTGCTGCCAAGGAGCCAC880CGCCACCTTACGTGTCTGCCTAAGCCTTCAAGTGGGCGGA920GCTGAGGGCAGCAGCTTGACTTTGCAGACATCTGAGCAAT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。