基因總覽
KLF15（KLF transcription factor 15）是蛋白質編碼基因，其產物為轉錄調節因子。資料指出，KLF15 可辨識特定啟動子序列，並調節多個基因的表現；部分相關作用具有「By similarity」註記，表示該項功能是依相似性推定。其已知功能涉及心臟生物學，也包括足細胞分化。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000296233 ★ | 126,342,635–126,357,408 | 3 |
| ENST00000892073 | 126,342,635–126,357,458 | 3 |
| ENST00000892074 | 126,342,635–126,357,462 | 3 |
| ENST00000892075 | 126,342,635–126,357,462 | 4 |
| ENST00000892076 | 126,342,635–126,356,213 | 2 |
| ENST00000892077 | 126,342,635–126,353,888 | 3 |
| ENST00001138725 | 126,342,635–126,357,462 | 3 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
KLF15 是轉錄調節因子，可結合 CLCNKA 啟動子中的 GA 元件，也能結合 KCNIP2 啟動子，並調節心臟中 KCNIP2 的晝夜節律性表現；後一作用標註為「By similarity」，應視為依相似性推定的功能。
在心臟相關調控中，KLF15 會抑制 CCN2 表現，參與心臟纖維化的控制。它也透過抑制 MEF2A 與 GATA4，參與心臟肥大的調節；此作用同樣標註為「By similarity」。此外，KLF15 可抑制 MYOCD 活性。
KLF15 亦被指出參與足細胞分化，該功能為「By similarity」推定。另有資料顯示，KLF15 是 TP53 乙醯化的負向調節因子，並可透過抑制 EP300 依賴的 RELA 乙醯化，抑制 NF-kappa-B 活化。這些作用說明 KLF15 能透過調節轉錄因子活性或乙醯化，影響不同的基因調控過程。
Promoter 與基因調控
>KLF15 ENST00000296233 GRCh38 chr3:126357308-126358408 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTCTACCTCTCTACCTGCTCCTTCCCAGCTGTGGGGCTGGGGAGGGCTGGTGCCCTCTCTGAGTCGGTTT CTTCATCTGTAAAGTGCTTGGCTGAGGATCCAGCTGGAGTGTGGATTAAAGGGCACAGCAGGGTGCCTAG CACCGTCAGCCCACGTGTTTTTCTTGGGCAAGCCACTCTGAGCCTTACTCTTCCTGTCTCTAAGCGGGAA CCCAAATGCGAGCCAGGATTGCTGCGGACTAAAGCAGTCTACGAACGCTTTTGTAGACTGCGAAGCATTG TTTGGTCTTCAGAAAGGTGCCCCAGAGACAAGGTGTCATTGGTTTCAGGTGGGGGGGGGGGGGGCCGGTC AGCAAACCTCCTTAGTCCTGGAGGGCAGGGTGGCAGCGCAGAGCGCGCGCAATTTCCGGAGGGTAACTGA TTGTCCTGCTGAAAGCCCAATACCGTATTTATCCAAAAATACGTCCTTCTAGGCAAGTGATTTATCTGAC ACTCAGCGGGGGACAGAGCTGCTTGTACCGCGCTGGGGATGAAGGTGGGGACGTGGGCCAGACCGGGCCA GACAGGCTCCCCAGCGCTTCCCGCTCAATCACGCAGACTGCACTTTGGGGCGATCTCAGAGCTTTTCTTA AGTCTTCAGGCCAGTCTCACGTTCTCACCTTGGGAACCGAGCTTTAGAAGCCGGCCCTCGTGGACGCCGC GAGACAGCGGCGAGAGGTGGGAAGCAAGGAGGTGGCTGCGGGCCAGGGACCAGGCAGCGTGTTGGGGGGC GTGCGCGTCTGGCAGCTCCGGGATCCCCGAGCATCCGCCGCTCAAGTCCGGGAGCCGCGCGGGCGGGCCG GGGCGGGGCCAGGGCGGGGCCAGGGCGGGGCGGGACGTGTGACGCGCAGCGCGGGCCAATGGGGCGCGCG CCCGGGGCCGAGCCTCCTGCGAGCCTTCGCGGCGCCCGCTGCGTCACGTGAGCGGCGGGGAGTGAGTGCC CAGCGAGCTGCGGGCGGGCTAGTGCTCCGCCGCAGCGACCCGCGGGCCGGCGGGCGATCGAGCCAGCGCA GGACCCGCGGCTCGGCCCCCGGCCGCCGCCGGACCGAGAGTCTAGCCGCCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| KLF15_1 ↗ | 3:126,357,408 | 負股 | 126,357,398–126,357,457 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR3_D8996 · enhancer · 126355302–126357397 · regulatory
ENSR3_93T65S · promoter · 126357398–126357898 · regulatory
· motif · 126353007–126353020 · motif
· motif · 126353016–126353026 · motif
· motif · 126353155–126353164 · motif
· motif · 126353294–126353309 · motif
· motif · 126353411–126353424 · motif
· motif · 126353891–126353906 · motif
· motif · 126354337–126354350 · motif
· motif · 126354523–126354537 · motif
· motif · 126354524–126354537 · motif
· motif · 126355611–126355626 · motif
· motif · 126355612–126355626 · motif
· motif · 126355937–126355946 · motif
· motif · 126355937–126355946 · motif
· motif · 126355937–126355946 · motif
· motif · 126355973–126355983 · motif
· motif · 126356016–126356031 · motif
· motif · 126356021–126356031 · motif
· motif · 126356027–126356037 · motif
· motif · 126356143–126356159 · motif
· motif · 126356143–126356159 · motif
· motif · 126357447–126357456 · motif
· motif · 126357447–126357456 · motif
· motif · 126357706–126357722 · motif
· motif · 126357706–126357722 · motif
· motif · 126358059–126358069 · motif
· motif · 126358063–126358073 · motif
· motif · 126358064–126358074 · motif
· motif · 126358065–126358075 · motif
· motif · 126358066–126358076 · motif
· motif · 126358067–126358077 · motif
· motif · 126358068–126358078 · motif
· motif · 126358070–126358080 · motif
· motif · 126358241–126358257 · motif
· motif · 126358241–126358257 · motif
· motif · 126358250–126358259 · motif
· motif · 126358250–126358259 · motif
· motif · 126358284–126358297 · motif
· motif · 126358490–126358500 · motif
在足細胞中，retinoic acid 可上調 KLF15。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：416 aa
KLF15 蛋白長 416 個胺基酸，屬於 Sp1 C2H2-type zinc-finger protein 家族。其序列含有三個 C2H2-type zinc finger，位置分別為 321–345、351–375 與 381–403；另有一段標註為無序區域，位於 156–219。第 75–83 位標註有 9aaTAD motif。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 40 個夥伴
- AIRIMQ9NX04 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BAG6P46379-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BANPQ8N9N5-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- C11orf68Q9H3H3-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC57Q2TAC2-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- COL26A1Q96A83-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DNALI1O14645 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DR1Q01658 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DVL3Q92997 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- FOSP01100 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRB2P62993 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRIA1P42261 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRNP28799 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GTF2BQ00403 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GTF3C3Q9Y5Q9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HNRNPFP52597 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSF1Q00613 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSPB1P04792 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KBTBD7Q8WVZ9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KIF1BO60333-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KLF11O14901 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MAT2AP31153 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NFYCQ13952-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NRF1Q16656-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PIAS4Q8N2W9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
資料記載 KLF15 與 MYOCD、EP300 會發生交互作用；來源未進一步說明其交互作用形式或相關複合體。
疾病與遺傳關聯
KLF15 缺失與 QT 間期節律性變化消失及心臟復極異常相關。資料亦指出，KLF15 可能與心室性心律不整的易感性，以及導致心衰竭的病理性心臟肥大發展有關；這些描述屬於疾病關聯，並未表明 KLF15 缺失必然造成後兩種狀況。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | KLF15 是轉錄調節因子，可結合 CLCNKA 啟動子中的 GA 元件，也會結合 KCNIP2 啟動子並調節心臟中 KCNIP2 的晝夜節律性表現；後者屬於依相似性推定的功能。它可抑制 CCN2 表現，參與心臟纖維化控制，並透過抑制 MEF2A 與 GATA4 參與心臟肥大調節；後者同樣為相似性推定。此外，KLF15 參與足細胞分化（相似性推定）、抑制 MYOCD 活性及 TP53 乙醯化，並藉由抑制 EP300 依賴的 RELA 乙醯化而抑制 NF-kappa-B 活化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Transcriptional regulator that binds to the GA element of the CLCNKA promoter. Binds to the KCNIP2 promoter and regulates KCNIP2 circadian expression in the heart (By similarity). Is a repressor of CCN2 expression, involved in the control of cardiac fibrosis. It is also involved in the control of cardiac hypertrophy acting through the inhibition of MEF2A and GATA4 (By similarity). Involved in podocyte differentiation (By similarity). Inhibits MYOCD activity. Is a negative regulator of TP53 acetylation. Inhibits NF-kappa-B activation through repression of EP300-dependent RELA acetylation PMID 18586263 ↗ · PMID 20375365 ↗ · PMID 20566642 ↗ · PMID 23999430 ↗ |
| 交互作用 | 資料記載 KLF15 與 MYOCD 及 EP300 會發生交互作用；此項敘述未提供更具體的結合形式、作用條件或所屬複合體資訊。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | KLF15 的細胞內定位為細胞核；此項定位註解未說明定位改變的條件或不同異構型之間的差異。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | 在足細胞中，retinoic acid 會上調 KLF15；此註解指出了特定細胞類型與調控方向，未提供其他條件或調控細節。 | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | KLF15 缺失與 QT 間期節律性變化消失及心臟復極異常相關。KLF15 也可能與心室性心律不整易感性，以及可能進展至心衰竭的病理性心臟肥大有關；後兩者描述的是可能的關聯，並非確定因果。 | 含實驗來源 | 證據與來源KLF15 deficiency results in loss of rhythmic QT variation and abnormal heart repolarization. It may play a role in susceptibility to ventricular arrhythmias, and development of pathological cardiac hypertrophy leading to heart failure PMID 20375365 ↗ · PMID 22367544 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTGCTCCGCCGCAGCGACCCGCGGGCCGGCGGGCGATCG40AGCCAGCGCAGGACCCGCGGCTCGGCCCCCGGCCGCCGCC80GGACCGAGAGTCTAGCCGCCGCCCCCAGCCCAGCCCGCCC120GGCCGCAGGACCGCCGGGGCCTGGCCGCCGGTCCGGCGTG160CGCCAAGTTCAGCCGCCACCGGCACGGCCAGGCCAGCATG200GTGGACCACTTACTTCCAGTGGACGAGAACTTCTCGTCGC240CAAAATGCCCAGTTGGGTATCTGGGTGATAGGCTGGTTGG280CCGGCGGGCATATCACATGCTGCCCTCACCCGTCTCTGAA320GATGACAGCGATGCCTCCAGCCCCTGCTCCTGTTCCAGTC360CCGACTCTCAAGCCCTCTGCTCCTGCTATGGTGGAGGCCT400GGGCACCGAGAGCCAGGACAGCATCTTGGACTTCCTATTG440TCCCAGGCCACGCTGGGCAGTGGCGGGGGCAGCGGCAGTA480GCATTGGGGCCAGCAGTGGCCCCGTGGCCTGGGGGCCCTG520GCGAAGGGCAGCGGCCCCTGTGAAGGGGGAGCATTTCTGC560TTGCCCGAGTTTCCTTTGGGTGATCCTGATGACGTCCCAC600GGCCCTTCCAGCCTACCCTGGAGGAGATTGAAGAGTTTCT640GGAGGAGAACATGGAGCCTGGAGTCAAGGAGGTCCCTGAG680GGCAACAGCAAGGACTTGGATGCCTGCAGCCAGCTCTCAG720CTGGGCCACACAAGAGCCACCTCCATCCTGGGTCCAGCGG760GAGAGAGCGCTGTTCCCCTCCACCAGGTGGTGCCAGTGCA800GGAGGTGCCCAGGGCCCAGGTGGGGGCCCCACGCCTGATG840GCCCCATCCCAGTGTTGCTGCAGATCCAGCCCGTGCCTGT880GAAGCAGGAATCGGGCACAGGGCCTGCCTCCCCTGGGCAA920GCCCCAGAGAATGTCAAGGTTGCCCAGCTCCTGGTCAACA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。