演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

KLF10EGRA

KLF transcription factor 10

KLF10 是具轉錄抑制作用的蛋白質,參與生理時鐘調節,並與肝臟脂質生成及糖質新生等相關基因的晝夜表現有關。

Homo sapiens8q22.3UniProt Q13118
OFFICIAL SYMBOL
KLF10
CHROMOSOME
8
UNIPROT
Q13118
PDB / ALPHAFOLD
2EPA
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

KLF10(KLF transcription factor 10)是人類蛋白質編碼基因,產物屬於 Sp1 C2H2-type zinc-finger protein family。其蛋白質長 480 個胺基酸,具有三個 C2H2 型 zinc finger,位於蛋白質序列後段。KLF10 的基本分子角色是轉錄抑制因子,能辨識特定 DNA 序列;其 DNA 結合與轉錄調控特性,構成此蛋白質參與基因表現調節的基礎。

Official symbol
KLF10
Gene name
KLF transcription factor 10
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11810
UniProt
Q13118
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
EGRATIEG1TIEG

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 88q22.3
chr8 · 145,138,636 bp · GRCh38chr8p23.3 · 1–2300000 · gnegchr8p23.2 · 2300001–6300000 · gpos75chr8p23.1 · 6300001–12800000 · gnegchr8p22 · 12800001–19200000 · gpos100chr8p21.3 · 19200001–23500000 · gnegchr8p21.2 · 23500001–27500000 · gpos50chr8p21.1 · 27500001–29000000 · gnegchr8p12 · 29000001–36700000 · gpos75chr8p11.23 · 36700001–38500000 · gnegchr8p11.22 · 38500001–39900000 · gpos25chr8p11.21 · 39900001–43200000 · gnegchr8p11.1 · 43200001–45200000 · acenchr8q11.1 · 45200001–47200000 · acenchr8q11.21 · 47200001–51300000 · gnegchr8q11.22 · 51300001–51700000 · gpos75chr8q11.23 · 51700001–54600000 · gnegchr8q12.1 · 54600001–60600000 · gpos50chr8q12.2 · 60600001–61300000 · gnegchr8q12.3 · 61300001–65100000 · gpos50chr8q13.1 · 65100001–67100000 · gnegchr8q13.2 · 67100001–69600000 · gpos50chr8q13.3 · 69600001–72000000 · gnegchr8q21.11 · 72000001–74600000 · gpos100chr8q21.12 · 74600001–74700000 · gnegchr8q21.13 · 74700001–83500000 · gpos75chr8q21.2 · 83500001–85900000 · gnegchr8q21.3 · 85900001–92300000 · gpos100chr8q22.1 · 92300001–97900000 · gnegchr8q22.2 · 97900001–100500000 · gpos25chr8q22.3 · 100500001–105100000 · gnegchr8q23.1 · 105100001–109500000 · gpos75chr8q23.2 · 109500001–111100000 · gnegchr8q23.3 · 111100001–116700000 · gpos100chr8q24.11 · 116700001–118300000 · gnegchr8q24.12 · 118300001–121500000 · gpos50chr8q24.13 · 121500001–126300000 · gnegchr8q24.21 · 126300001–130400000 · gpos50chr8q24.22 · 130400001–135400000 · gnegchr8q24.23 · 135400001–138900000 · gpos75chr8q24.3 · 138900001–145138636 · gnegKLF10pq1 bp145,138,636 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr8:102,648,781–102,655,729
Gene span
6,949 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000285407 ★102,648,784–102,655,7254
ENST00000395884102,648,783–102,654,3754
ENST00000911510102,648,783–102,655,7284
ENST00001103471102,648,783–102,655,7283
ENST00001134063102,648,783–102,655,7284
ENST00000907828102,648,784–102,655,7284
ENST00001060594102,648,784–102,655,7284

顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

KLF10 是轉錄抑制因子,可結合共識序列 5'-GGTGTG-3'。在生理時鐘調節中,KLF10 會結合核心時鐘成分 ARTNL/BMAL1 啟動子中的 GC box 序列,並抑制其轉錄活性。這項作用將 KLF10 的 DNA 結合能力連結至核心時鐘成分的轉錄調控。

在肝臟,KLF10 參與調節脂質生成、糖質新生與糖解作用相關基因的晝夜表現。這表示其作用涉及這些代謝相關基因隨生理時鐘變化的表現調控;來源未進一步列明各基因或其調控方向。

KLF10 也會抑制 PCK2 的表現。來源指出 PCK2 是糖質新生過程中的限速酵素,並以相似性推定(By similarity)支持這項功能描述,因此不宜將其視為已在此處明確證實的結論。此外,KLF10 可能參與細胞週期調節,但來源僅指出可能性,未提供更具體的作用方式。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 102655725 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>KLF10 ENST00000285407 GRCh38 chr8:102655625-102656725 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCAGGCAGGACGCTTCCAGAGGTCTTGGTCCAGGGGTGGGGGTGAGGTGGGGTCTACCTTTGAAACAGCT
ACAATTTAAACTTCAGCTACACCGAGCTCAAACTCGATTCCGCAGCCGAGTGTCGGCGCCAGAGAAGGAT
AAAAACTCGGGTCTACGGCTCCCCACCACGCCCCTGGTCCGGTCCTCTGGGCTTCCAGGAGTCCTCACGC
CATCCTCTGGGTTGCCCAGGAGGAAGGATGGGCGGGGCGGGCAGGCGCTGCGGGCGCTGCAGATGGGGAG
GGCGAGCCCGCGGCACGGCGTGAGCGGGGGAGAGGCGCGCGAGCAGGTGTCGGCTCCGTGACAGGGTCCC
CCATCCCGCGCCCCAGTGCTCCCCGAGGCTTAGTGAGGCAAAACCCAGCAAATGCTTCAGAAATGCAGCT
CAGTCGGTCACCGGGTTCTGCTTCCTCATCAGACGCGCAAGAGGATGGCGCTTCCAATGCAAATCTCTTG
GCTCCGGCCCCTTGGCTGGCAGCCGCCGCGTCCCCCGCCTGCCTGGCGTCCCGCCCACTCCGTGGCGGGC
TGAGACGAGGCCCGGCGCGGAGGGGACGGGGCGGAGCGGGCATCCCTCCCCACCCCCCACGTGGGGCTGG
CCCTCCGCAGTGCCTGGGCGCGCTGCAGTCGCCGCGCCTCCCCGGCCGCGGCACCGCCTCTCTAGGCAGG
GGCGGGGGACGAGGGGCAAGGAGTGGGCGAGGGGTGGGCGAGGGGCGGGGGGCGTCACTCAATCAGGTGG
CCTCTGGAGTTCCCCGGGGCAGGGCAGAGGGAACACGCTGCCGGGGATTGTGTACACGCTCCACTGACAC
CAGCTTCACGCTGCCGGGCAGTCGCCGATCACGCGTGGCCCCGCGAGCCCATTGGCCGGCGCCTCACACA
CCTTTGCCGTTGATTGGCCGGCCTCAGGCTCCGCCCCCACCCCCGCCCGCGGCGCGGGGCAGGCTGAGCG
GCTACCTGAATGGGGAGGGGGCAGACGGCGCTGAGCGCGGCGGCGGCGGGAGCGGCGTCGAGTGTCTCCG
TGCGCCCGTCTGTGGCCAAGCAGCCAGCAGCCTAGCAGCCAGTCAGCTTGC
KLF10 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
KLF10_1 ↗8:102,655,723負股102,655,713–102,655,772

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

來源指出,KLF10 受 TGFB1 與 BMP2 調控;未提供調控方向或具體條件。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:480 aa

1 aa480 aa鋅指
依 Q13118 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

KLF10 蛋白質長 480 個胺基酸,屬於 Sp1 C2H2-type zinc-finger protein family。蛋白質序列中有三個 C2H2 型 zinc finger,分別位於第 369–393、399–423 與 429–451 個胺基酸位置。

鋅指C2H2-type 1369–393 aa
鋅指C2H2-type 2399–423 aa
鋅指C2H2-type 3429–451 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2EPA…

PDB · 2EPA

NMR · - · A=359-423

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
EGRAKLF10SP1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能KLF10 是可結合 5'-GGTGTG-3' 共識序列的轉錄抑制因子,參與生理時鐘調節;它會結合核心時鐘成分 ARTNL/BMAL1 啟動子中的 GC box,抑制其轉錄活性。KLF10 也調節肝臟脂質生成、糖質新生與糖解作用相關基因的晝夜表現,並抑制糖質新生限速酵素 PCK2 的表現;此項 PCK2 描述為相似性推定(By similarity)。此外,KLF10 可能參與細胞週期調節。含實驗來源
證據與來源

Transcriptional repressor which binds to the consensus sequence 5'-GGTGTG-3'. Plays a role in the regulation of the circadian clock; binds to the GC box sequence in the promoter of the core clock component ARTNL/BMAL1 and represses its transcriptional activity. Regulates the circadian expression of genes involved in lipogenesis, gluconeogenesis, and glycolysis in the liver. Represses the expression of PCK2, a rate-limiting step enzyme of gluconeogenesis (By similarity). May play a role in the cell cycle regulation

PMID 8584037 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位KLF10 位於細胞核。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

調控KLF10 受 TGFB1 與 BMP2 調控;來源未說明調控的方向或條件。含實驗來源
證據與來源

By TGFB1 and BMP2

PMID 8532536 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000285407 · 2,915 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCAGACGGCGCTGAGCGCGGCGGCGGCGGGAGCGGCGTCG40
41AGTGTCTCCGTGCGCCCGTCTGTGGCCAAGCAGCCAGCAG80
81CCTAGCAGCCAGTCAGCTTGCCGCCGGCGGCCAAGCAGCC120
121AACCATGCTCAACTTCGGTGCCTCTCTCCAGCAGACTGCG160
161GAGGAAAGAATGGAAATGATTTCTGAAAGGCCAAAAGAGA200
201GTATGTATTCCTGGAACAAAACTGCAGAGAAAAGTGATTT240
241TGAAGCTGTAGAAGCACTTATGTCAATGAGCTGCAGTTGG280
281AAGTCTGATTTTAAGAAATACGTTGAAAACAGACCTGTTA320
321CACCAGTATCTGATTTGTCAGAGGAAGAGAATCTGCTTCC360
361GGGAACACCTGATTTTCATACAATCCCAGCATTTTGTTTG400
401ACTCCACCTTACAGTCCTTCTGACTTTGAACCCTCTCAAG440
441TGTCAAATCTGATGGCACCAGCGCCATCTACTGTACACTT480
481CAAGTCACTCTCAGATACTGCCAAACCTCACATTGCCGCA520
521CCTTTCAAAGAGGAAGAAAAGAGCCCAGTATCTGCCCCCA560
561AACTCCCCAAAGCTCAGGCAACAAGTGTGATTCGTCATAC600
601AGCTGATGCCCAGCTATGTAACCACCAGACCTGCCCAATG640
641AAAGCAGCCAGCATCCTCAACTATCAGAACAATTCTTTTA680
681GAAGAAGAACCCACCTAAATGTTGAGGCTGCAAGAAAGAA720
721CATACCATGTGCCGCTGTGTCACCAAACAGATCCAAATGT760
761GAGAGAAACACAGTGGCAGATGTTGATGAGAAAGCAAGTG800
801CTGCACTTTATGACTTTTCTGTGCCTTCCTCAGAGACGGT840
841CATCTGCAGGTCTCAGCCAGCCCCTGTGTCCCCACAACAG880
881AAGTCAGTGTTGGTCTCTCCACCTGCAGTATCTGCAGGGG920
921GAGTGCCACCTATGCCGGTCATCTGCCAGATGGTTCCCCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。