演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

KIF13BGAKIN

kinesin family member 13B

KIF13B(kinesin family member 13B)是蛋白質編碼基因,其產物參與皮質細胞骨架重組,並與軸突形成及細胞內蛋白質運輸有關。

Homo sapiens8p12UniProt Q9NQT8
OFFICIAL SYMBOL
KIF13B
CHROMOSOME
8
UNIPROT
Q9NQT8
PDB / ALPHAFOLD
3GBJ
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

KIF13B(kinesin family member 13B)是蛋白質編碼基因,所產生的蛋白質屬於 kinesin family,並歸入 TRAFAC class myosin-kinesin ATPase superfamily。其序列包含 kinesin motor、FHA 與 CAP-Gly 結構域,另有多段被註記為無序的區域。這些家族與結構特徵構成辨識 KIF13B 蛋白質的基本資訊;來源亦指出它與皮質細胞骨架重組及軸突形成相關。

Official symbol
KIF13B
Gene name
kinesin family member 13B
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14405
UniProt
Q9NQT8
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
GAKINKIAA0639

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 88p12
chr8 · 145,138,636 bp · GRCh38chr8p23.3 · 1–2300000 · gnegchr8p23.2 · 2300001–6300000 · gpos75chr8p23.1 · 6300001–12800000 · gnegchr8p22 · 12800001–19200000 · gpos100chr8p21.3 · 19200001–23500000 · gnegchr8p21.2 · 23500001–27500000 · gpos50chr8p21.1 · 27500001–29000000 · gnegchr8p12 · 29000001–36700000 · gpos75chr8p11.23 · 36700001–38500000 · gnegchr8p11.22 · 38500001–39900000 · gpos25chr8p11.21 · 39900001–43200000 · gnegchr8p11.1 · 43200001–45200000 · acenchr8q11.1 · 45200001–47200000 · acenchr8q11.21 · 47200001–51300000 · gnegchr8q11.22 · 51300001–51700000 · gpos75chr8q11.23 · 51700001–54600000 · gnegchr8q12.1 · 54600001–60600000 · gpos50chr8q12.2 · 60600001–61300000 · gnegchr8q12.3 · 61300001–65100000 · gpos50chr8q13.1 · 65100001–67100000 · gnegchr8q13.2 · 67100001–69600000 · gpos50chr8q13.3 · 69600001–72000000 · gnegchr8q21.11 · 72000001–74600000 · gpos100chr8q21.12 · 74600001–74700000 · gnegchr8q21.13 · 74700001–83500000 · gpos75chr8q21.2 · 83500001–85900000 · gnegchr8q21.3 · 85900001–92300000 · gpos100chr8q22.1 · 92300001–97900000 · gnegchr8q22.2 · 97900001–100500000 · gpos25chr8q22.3 · 100500001–105100000 · gnegchr8q23.1 · 105100001–109500000 · gpos75chr8q23.2 · 109500001–111100000 · gnegchr8q23.3 · 111100001–116700000 · gpos100chr8q24.11 · 116700001–118300000 · gnegchr8q24.12 · 118300001–121500000 · gpos50chr8q24.13 · 121500001–126300000 · gnegchr8q24.21 · 126300001–130400000 · gpos50chr8q24.22 · 130400001–135400000 · gnegchr8q24.23 · 135400001–138900000 · gpos75chr8q24.3 · 138900001–145138636 · gnegKIF13Bpq1 bp145,138,636 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr8:29,067,278–29,263,124
Gene span
195,847 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000524189 ★29,067,278–29,263,07040
ENST0000099780829,067,278–29,263,10440
ENST0000113517029,067,278–29,263,10440
ENST0000052313029,070,494–29,108,1925
ENST0000052151529,145,863–29,263,10418
ENST0000111038229,160,113–29,263,10413
ENST0000112368929,262,303–29,263,1042

顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

KIF13B 參與皮質細胞骨架的重組,並與軸突形成的調節有關。來源指出,它可促進額外軸突的形成;因此,KIF13B 的功能與軸突形成過程相連。現有資料沒有進一步說明此作用涉及的分子步驟或條件,故不宜據此推定更具體的機制。

KIF13B 也可能在 MAGUKs 及其相關蛋白質複合體的細胞內運輸中具有功能重要性。此敘述帶有「可能」的限制,表示來源提出其潛在作用,但未將其表述為已確立的必要功能。資料未交代運輸的方向、目的地或所依賴的分子互作,因此無法進一步描述其運輸機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 29263070 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>KIF13B ENST00000524189 GRCh38 chr8:29262970-29264070 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTTCACACTCTGTTACCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGCAATCCTCCTGCCTCAGCATCCTA
AAATGCTGGGATTCCAGGTGTGAGCCCCTGCACCTGGCCACAAATCTGATTTTTATGTGTTGGCCAACAC
TGTTGGGCCAAACAGAACATGTTTGCGTGCTGGCTCTGGCACCCAGGCCACCTGTTAGAATGTCTGCCAG
GGCTAATAAAAAGCTAATTTTAGTGTGGCCTCATTCATTAATTCATGCAATTAATGTTTATGGGTCTCTA
CTAAAGGCTAGGTTACACATATGTTAATCTTATTTAAAAATGTACCTATTTTACTAGGTATTAGTATCAT
ATCCACTTTTCATATTAAAGACAAGCCCAGAGCGGTCAAATAACTTGCCCCTGGTCACACAGTGGGAAGC
GCTGAGGTGGGCTTTGAACTCAGATGGTTTTCAGAGCCCAAGGTCCTGTCTCAAAGGAGGGGGACTCACA
GGACAATGTTAACCCGTGGACCTATGGACACTCCCAGAAAACGTGATTTGCAACTTGTCGTGAAGGACGA
GCTCAGCAAACAAGGCCGGACGTCAATCCAGGCAGAGGAAATAACTTGAGCCAGGGATCAAACACTAAGA
TTGGCAGGAAATGAGCAGGAAGAGGTAGCGGGGTCCCTGACGCCATCTATTCAATTGTTTTTCAGAAGAG
GTATCAGCTCTTGAAGGCTTACTTCTCAATACTGGCTGCGAGAGCAAGAATGGTGTGTAATTTACAAAAG
CCGTCATTGCTGTAGGTAAGTTGTAGCAAACGACTCGCGCCCGAGCATTCCCGCCCCCGCCTTCGCTGCG
GCCCCGCCCACGACGACCCTGGGGAACTACAAGTCCCGCCATACAGCGGGGAGCGCCCGGAGCTCGCGCC
GGCCCCGCCCCCAGCCCGGTCCCCACCCCCGGCTCCGCCCCCGGCCCCCTCCCGCCGGGTCAACCCCGAA
GAGTCGCCGGTGGCCGCGGCAGACGGAAGCCGAACGAGTTCCTCGGCGGCTGCAGGATGGGGGACTCCAA
AGTGAAAGTGGCGGTGCGGATACGACCCATGAACCGGCGAGGTGAGAGCCG
KIF13B 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
KIF13B_1 ↗8:29,263,070負股29,263,060–29,263,119

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1826 aa

1 aa1826 aa結構域功能區域
依 Q9NQT8 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

KIF13B 蛋白質長 1,826 個胺基酸,屬於 kinesin family。其 N 端包含 kinesin motor 結構域(第 5–353 位),另有 FHA(第 471–535 位)與 CAP-Gly(第 1,721–1,763 位)結構域。序列中另有四段被註記為無序區域,分布於第 546–582、1,367–1,420、1,579–1,650 及 1,662–1,698 位。

結構域Kinesin motor5–353 aa
結構域FHA471–535 aa
結構域CAP-Gly1721–1763 aa
功能區域Disordered546–582 aa
功能區域Disordered1367–1420 aa
功能區域Disordered1579–1650 aa
功能區域Disordered1662–1698 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 3GBJ…

PDB · 3GBJ

X-ray · 2.10 A · A/B/C=4-351

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, cytoskeleton;Cell projection, axon

KIF13B 位於細胞質與細胞骨架,也見於軸突細胞突起。 它會累積在軸突尖端微管的遠端區域;來源特別指出,這種累積未見於樹突的微管尖端。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Cell projection, axon。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
GAKINKIF13BADAP1DLG1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

KIF13B 可與 DLG1 及 DLG4 結合。它也會與 14-3-3 互作,但此互作有明確條件:KIF13B 的 Ser-1381 與 Ser-1410 必須經磷酸化。來源未指出這些互作所形成的複合體或其功能後果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能KIF13B 參與皮質細胞骨架重組,並透過促進額外軸突形成來調節軸突形成;它也可能對 MAGUKs 及其相關蛋白質複合體的細胞內運輸具有功能重要性。含實驗來源
證據與來源

Involved in reorganization of the cortical cytoskeleton. Regulates axon formation by promoting the formation of extra axons. May be functionally important for the intracellular trafficking of MAGUKs and associated protein complexes

PMID 20194617 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用KIF13B 可與 DLG1 和 DLG4 結合;此外,當 KIF13B 的 Ser-1381 與 Ser-1410 經磷酸化時,會與 14-3-3 互作。含實驗來源
證據與來源

Binds to DLG1 and DLG4. Interacts (when phosphorylated at Ser-1381 and Ser-1410) with 14-3-3

PMID 10859302 ↗ · PMID 20194617 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位KIF13B 位於細胞質、細胞骨架及軸突細胞突起,並累積於軸突尖端微管的遠端部分;來源指出,樹突的微管尖端沒有這種累積。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm, cytoskeleton; Cell projection, axon; accumulates at the distal part of the microtubules in the tips of axons, but not of dendrites

PMID 20194617 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000524189 · 8,743 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGACGGAAGCCGAACGAGTTCCTCGGCGGCTGCAGGATGG40
41GGGACTCCAAAGTGAAAGTGGCGGTGCGGATACGACCCAT80
81GAACCGGCGAGAGACTGACTTGCATACCAAATGTGTGGTG120
121GATGTGGATGCAAACAAGGTTATTCTTAATCCTGTAAATA160
161CGAATCTTTCCAAAGGAGATGCCCGGGGCCAGCCGAAGGT200
201GTTTGCTTATGATCATTGTTTCTGGTCTATGGATGAATCT240
241GTCAAAGAAAAGTATGCAGGTCAAGATATTGTTTTCAAGT280
281GCCTTGGAGAGAATATCCTGCAGAATGCTTTTGATGGCTA320
321CAATGCATGTATCTTTGCCTATGGACAGACTGGCTCTGGA360
361AAATCTTATACCATGATGGGCACAGCTGACCAACCTGGAT400
401TAATCCCAAGACTTTGCAGTGGACTCTTTGAACGAACTCA440
441GAAAGAGGAAAATGAAGAACAGAGTTTTAAAGTAGAAGTG480
481TCCTACATGGAAATTTATAATGAAAAAGTTCGAGACCTTC520
521TTGATCCCAAAGGAAGCCGTCAGACGTTGAAAGTCAGAGA560
561GCATAGTGTGTTGGGACCTTATGTCGACGGACTTTCTAAA600
601CTGGCTGTCACAAGCTACAAGGATATTGAGTCGTTGATGT640
641CTGAGGGTAACAAATCTCGCACAGTTGCTGCAACCAACAT680
681GAACGAGGAGAGTAGCCGATCCCATGCAGTTTTCAAAATC720
721ACCCTCACACATACTCTCTACGATGTGAAGTCTGGGACAT760
761CTGGAGAGAAAGTGGGCAAACTCAGCCTGGTGGATTTAGC800
801TGGCAGTGAACGAGCAACGAAGACAGGCGCTGCAGGGGAC840
841AGGCTGAAGGAAGGGAGCAACATTAACAAGTCCCTCACAA880
881CCCTCGGTCTGGTTATCTCAGCTCTTGCAGATCAGAGTGC920
921TGGCAAAAACAAGAATAAATTTGTTCCATATCGTGACTCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。