基因總覽
KIAA0930 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 KIAA0930。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 22q13.31。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000336156 ★ | 45,192,244–45,240,894 | 10 |
| ENST00000251993 | 45,192,160–45,212,488 | 10 |
| ENST00000391627 | 45,192,160–45,226,903 | 10 |
| ENST00000927183 | 45,192,160–45,240,944 | 10 |
| ENST00000944328 | 45,192,160–45,240,944 | 7 |
| ENST00000944329 | 45,192,160–45,240,944 | 10 |
| ENST00000944330 | 45,192,160–45,240,944 | 10 |
| ENST00000944331 | 45,192,160–45,240,944 | 5 |
| ENST00001132865 | 45,192,160–45,240,944 | 10 |
| ENST00000423262 | 45,195,828–45,205,849 | 8 |
| ENST00000414854 | 45,205,221–45,236,277 | 5 |
| ENST00000424508 | 45,205,223–45,213,499 | 5 |
顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>KIAA0930 ENST00000336156 GRCh38 chr22:45240794-45241894 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGAGAGAGGGAGGGAAGGCGGTCAGGGGAGTTTCTTTGAGGATGTGACACTCGGGACACAAAGGAAGCAA GTTACACAGGAATGGGGAGAAGAGGACTCCAGACAGGGGAAAGGGGGACCTTGATGGGTCTGGGGTCCAC ACACAGGCTGTGAATGCAGGGAGTGATGTAGATTTAGCTTTGGAGAGACCTGGAAATCAATGCTGGTCTC TCCATCTCCCCCTGTTCTTGGAAATGGACCACCAGGCGTGAGGTTTGGGGAGGCCACTGGCTGCTTCTCC GGTGTCTTCCTGTATCAGCCACAACTAGCACACGGAGGGATGCTGGCCAGACCTGGCTTCATCAGGATGA CACGCCCAGCTAACCTCATACCTCCCCCTTCATCAACACTCCCCCATGTTGGGGAGGCAAGGCAGGGAAA GGTCCCCCATGGTGCAGCTGAGGAAATGGAGGCGCAACACTCTGCACTGTGCCAGGTGCAGAGGAGGGGG GCCGGAAGGGCTTTGCCACGGTGTCCCCCAGGAGACCACCTTCTGGGAGCAGGTGACCTCTTGAGGGGTT CTGCGGAGGAAGTTCCCAGAAGTCAGCCGAGGGGACTTGGTGGAGGTGGCAACGCACAGGGCGGGTGACA AAGTACACATCCCGTGGGGTAGCAGCGGGGGAGGGGAGAGGTGCCCTGAAGGGGCGGCGGGAGGGGCTCA GAGGCGTGATCCCGTTGGTGGGGCGTTTAGGACCTTGGGTGGAGGCGGGACCCCGCGAGCGGTTTGAGGG AGGCTGTCCTGGGCATCCGAAGATTGGCGGAGACTGGCCGTTTGGAAGTGGGCGGGGCAAGGGAGGTCAG GGGGCGGGGCCAGGGAGCCGGGGTGGGTCCGGGCCGTTCAGAGGCGGGGCGGGAGGGGACAGGGGCGGGG CCGGGGCGGGGAAGGGGCGGGGCCGGACCGGGGCCGGGCCGGGCCGGGGCGGGGCGAGCGGAGCCGGGGG CGCGCGGGCGGCGGCGGCGCGGAGGTGCGCTCGCCGGTGCTGTGTTTGGCGGGTGGTGGCGGCGGCGGCG GCGACGGCGACGCGCACAGAGGCGGACTGTGGCTTCCTTGGTGCTCGCGGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| KIAA0930_3 ↗ | 22:45,200,229 | 負股 | 45,200,219–45,200,278 |
| KIAA0930_2 ↗ | 22:45,212,378 | 負股 | 45,212,368–45,212,427 |
| KIAA0930_1 ↗ | 22:45,240,891 | 負股 | 45,240,881–45,240,940 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR22_C6H79 · enhancer · 45235041–45236466 · regulatory
ENSR22_C6H7K · enhancer · 45239434–45240883 · regulatory
ENSR22_9MXSL · promoter · 45240884–45241384 · regulatory
ENSR22_9MXT5 · enhancer · 45242763–45243227 · regulatory
ENSR22_5DMBNS · CTCF_binding_site · 45242884–45242905 · regulatory
· motif · 45235911–45235920 · motif
· motif · 45235993–45236002 · motif
· motif · 45236053–45236062 · motif
· motif · 45236053–45236064 · motif
· motif · 45236053–45236064 · motif
· motif · 45236228–45236237 · motif
· motif · 45236310–45236319 · motif
· motif · 45237131–45237145 · motif
· motif · 45237314–45237329 · motif
· motif · 45237589–45237601 · motif
· motif · 45237822–45237844 · motif
· motif · 45237822–45237844 · motif
· motif · 45238014–45238026 · motif
· motif · 45239797–45239810 · motif
· motif · 45239797–45239810 · motif
· motif · 45240520–45240537 · motif
· motif · 45240642–45240657 · motif
· motif · 45240782–45240797 · motif
· motif · 45241005–45241015 · motif
· motif · 45241045–45241055 · motif
· motif · 45241067–45241077 · motif
· motif · 45241228–45241238 · motif
· motif · 45241343–45241355 · motif
· motif · 45242886–45242902 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:404 aa
KIAA0930 的蛋白質長度為 404 個胺基酸。序列註解預測第 261–307 與第 320–340 位胺基酸區段為無序區域。
蛋白質三維結構
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- SFNP31947 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- YWHAEP62258 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- CEP44Q9C0F1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ITGB3BPQ13352 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GGAGGTGCGCTCGCCGGTGCTGTGTTTGGCGGGTGGTGGC40GGCGGCGGCGGCGACGGCGACGCGCACAGAGGCGGACTGT80GGCTTCCTTGGTGCTCGCGGCGGGCTGCGGGCCGGGCCGC120CCGCCCTCCCCGCCGCCGCCGCCCCCGAGCCTGCGGGCGG160CGCCGAGGCCGAGGAGCGCTCGCTGCAGCACATGCTGCGT200GCCATAGCGGAGGAGCGCGGCCGTCTTAGCCTGCGCCGCG240AGGTCTGCGGCCTCGGGTGCTTCAAGGATGACCGCATCGT280CTTCTGGACTTGGATGTTCTCCACCTACTTCATGGAGAAA320TGGGCTCCCCGGCAGGACGACATGCTTTTCTATGTGCGCC360GGAAGCTGGCGTACTCCGGCAGCGAAAGCGGTGCAGACGG400GAGGAAGGCAGCTGAGCCTGAGGTGGAGGTGGAGGTGTAC440CGGCGGGACTCCAAGAAGCTGCCAGGCCTGGGAGACCCTG480ACATCGACTGGGAGGAGAGCGTCTGCCTGAATCTCATCCT520GCAGAAGCTGGACTACATGGTGACCTGTGCGGTGTGCACA560CGTGCTGACGGCGGGGACATTCACATCCATAAGAAGAAAT600CTCAGCAAGTGTTCGCGTCCCCCAGTAAACACCCCATGGA640CAGCAAGGGGGAGGAGTCCAAGATCAGCTACCCCAACATC680TTCTTCATGATTGACAGCTTCGAGGAGGTGTTCAGCGACA720TGACCGTAGGGGAAGGAGAGATGGTCTGTGTGGAGCTGGT760GGCTAGTGACAAAACCAACACGTTCCAGGGGGTCATCTTT800CAGGGCTCCATCCGCTACGAGGCGCTCAAGAAGGTGTATG840ACAACCGGGTGAGCGTGGCCGCCCGCATGGCACAGAAGAT880GTCGTTTGGCTTCTACAAGTACAGCAACATGGAGTTTGTG920CGCATGAAGGGCCCCCAGGGCAAGGGCCACGCCGAGATGG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。