基因總覽
KCNQ1DN 是人類非蛋白質編碼 RNA 基因，正式名稱為 KCNQ1 downstream neighbor。登錄類型為 RNA, long non-coding。此基因座位於 11p15.4。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000441418 ★ | 2,870,033–2,872,105 | 2 |
顯示 1/1 個RNA轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>KCNQ1DN ENST00000441418 GRCh38 chr11:2869033-2870133 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCCAGAGTCGCTGTTGCTAAGTCCTCTTCTTGCAGCCTGGGGATCCCAGAGGACCCCGGCCCAGTCCATC AGCTGGGCTGGGTCTTTAATATTTAAAGAGCTCTCCCGGACATTTCAAGAACTCCCCGACACGATTTTCT GTGATGCGTGGGCTGTCGGGACATCTGTCTTCTATACCTAATAAAGTCGCCCGACGCAGAATGAACTCCT CGGCATCGCTTTGAATCCGGGCTCACATATGGTTGCTAATTAGCTGGCTATCTCTTGGAGTTAAATGATT TTTTTTCTCGCCCCGTTCGCATCCATAATAGACGCGAACAGAGTCGTGATTGTTCCCTGTTGCGGGACAT TCTGCGCCTGAATGAGCGGGGGCTGCTGTGTCGACGCGGATTTGCCATATGGTTGCGCGGAGCCAGGAAG AATGGGCCCCTGTGTGTGCGACCGGGACGCAGCGGCGCGGGCCGTGCCAGCCGGGCGGAGCCGGGTGCCC GACGGCGCAGGACGAGCGGGCGCAGGACGAGCGAGCGCAGCGGGCGCGGGCGCACCGTCGGGGCGCGGGG ACCCCGAGGGCCAGCGGAGCCGTGCTGCGCGCAGGGATGGACGCTGGGCGCCCAAGGCCCGTTCCCGTGG ACAGGCGCGCGGAGGGCAGCAGGACCGATGCACCGACGGACGCACCGACGGACGCGCGGACAGATGCGCC GACCGCAGGCTCTCCCGCCGTCCCGGGGCCGTCGTGCCCGTGCAGGCCGCGAGCAGCGGCGGGGCCGGCT CTGCGGCTGCAGCAGCCCCATTGTGAGGCCGGCGAGACAATGGGCGGCCCGAGGAGGCACCTGCTCGCCT GAAAGGCCCATAAATCGCCGCCGCGTCCAGCTGCCTTCCCGCCCCTCCCCGCGGACCCGCTAGCGGGAAG CGCGGCCGCGGCCGGGAGGGGGAGGCTCGGTCCGACAGTCGGGCAGGGCCGCCTGGGCCACCGCCGCGCG CTCCCTCCCGCCTGGGCGCAGCTGCCCGCACGCCCCGACGGGAGCTGCGCCCAGCCTCCCCTCTGGAGTC GGCGCTCCAGGCTGCTGCCCGGCCGGTGGCCAAGGCCCCAGCACCACCGTC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| KCNQ1DN_1 ↗ | 11:2,869,996 | 正股 | 2,869,947–2,870,006 |
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_C9NG · enhancer · 2867478–2868840 · regulatory
ENSR11_935QF · promoter · 2869760–2870043 · regulatory
ENSR11_5N84T · CTCF_binding_site · 2869950–2869971 · regulatory
ENSR11_5N879 · CTCF_binding_site · 2870471–2870492 · regulatory
ENSR11_849JB · promoter · 2870644–2870857 · regulatory
ENSR11_935QQ · promoter · 2870978–2871289 · regulatory
· motif · 2867360–2867374 · motif
· motif · 2867360–2867374 · motif
· motif · 2868342–2868353 · motif
· motif · 2869952–2869968 · motif
· motif · 2870473–2870489 · motif
· motif · 2874329–2874340 · motif
RNA 轉錄本與序列
KCNQ1DN 依 HGNC／Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000441418 ★ | lncRNA | 1,093 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
DNA 與 RNA 序列
GCTGCCCGCACGCCCCGACGGGAGCTGCGCCCAGCCTCCC40CTCTGGAGTCGGCGCTCCAGGCTGCTGCCCGGCCGGTGGC80CAAGGCCCCAGCACCACCGTCCCTCCTGCAGGGCATCCAG120CACCTACCCTTCCACTGGGCGGCTCCTGGTTCTGGTCCCG160GCTGGCTCACTCAGGCTGCCTTTGGACCAGATTCTTGAAC200TTTTCCACCAAGGATGTTGCTGCTGTTTGTAGCGTCGGAT240CCTGGAAAATCGCTGTGTTGGGGAGCAGCAGGCTCTCCCT280TGCTCCCCCAGGGCCTGGGAAAATCAACCCACCTCTGCCC320CCCGACCCCAGGGCTGTAACCTGGTGTCTGGTAGCCCCAC360TGTGATAAACCGAAGCCCAGCACAGTTTGGGACTCGCCCC400GAGTTGACTTATGCAGCCCCCAGAACAGAGGCTGAAACCC440GGCGCATCCTGGTGAAGCCACACCCAGCCGGCCTGGTCCC480AGGCCCCGGGCACGGGGTCCCCTCCACTCCCATCTGCTTC520CCTTTCAGAGCCGGGGCTGAGTCGGCAGGGACGCAGGCTC560AGGGCCCTGGATTCCCGCTTTCTGGACACTTGCGTGCATG600CCCAGCACCAGCTCGCCCTTCTGAGAAAGCAATCCCTCCT640CAGAGGGGAGAAGCCGTGGCTGTGATGGGCAGGAAGTGGT680CAGGACCCACTGCCGAGCACCAACTCCCCATGCCACCACC720AGGGGTGCGCCTGGACTCCTGGAAAGGGGTCGCGTCAGGG760TGCAGCCCATCAAAGGCTTCCCAAGAGGCAAGAGGCAAGG800AGAAGTGTCCTACTTTAAACGGCCAGCCTCAGTGGTCGGC840CCTGTTCACTCTGCCACCTCAGAGAGAGTGAACCCAGCAG880AGGTGTGACGGGAGGCTGGGGAGAGACCCCAGCACCTTGA920GCACACAGGAGCCAGGAGGAGCCCAACAGAGCAGCAGGGG960cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。