演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

KCNK17K2p17.1

potassium two pore domain channel subfamily K member 17

KCNK17 編碼雙孔域鉀離子通道家族成員,能在膜去極化時傳導外向整流電流;其在心臟傳導系統中的功能可能與心肌細胞動作電位及搏動頻率調節有關。

Homo sapiens6p21.2UniProt Q96T54
OFFICIAL SYMBOL
KCNK17
CHROMOSOME
6
UNIPROT
Q96T54
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

KCNK17 是蛋白質編碼基因,產物為 potassium two pore domain channel subfamily K member 17,屬於 two pore domain potassium channel 家族。此蛋白質是多次穿越細胞膜的通道蛋白,包含四段跨膜螺旋與兩個選擇性過濾區,構成其離子通道的基本結構。它可形成同源或異源二聚體;不同組合具有不同的調控與閘控特性。

Official symbol
KCNK17
Gene name
potassium two pore domain channel subfamily K member 17
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14465
UniProt
Q96T54
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
K2p17.1TALK-2TALK2TASK4TASK-4

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 66p21.2
chr6 · 170,805,979 bp · GRCh38chr6p25.3 · 1–2300000 · gnegchr6p25.2 · 2300001–4200000 · gpos25chr6p25.1 · 4200001–7100000 · gnegchr6p24.3 · 7100001–10600000 · gpos50chr6p24.2 · 10600001–11600000 · gnegchr6p24.1 · 11600001–13400000 · gpos25chr6p23 · 13400001–15200000 · gnegchr6p22.3 · 15200001–25200000 · gpos75chr6p22.2 · 25200001–27100000 · gnegchr6p22.1 · 27100001–30500000 · gpos50chr6p21.33 · 30500001–32100000 · gnegchr6p21.32 · 32100001–33500000 · gpos25chr6p21.31 · 33500001–36600000 · gnegchr6p21.2 · 36600001–40500000 · gpos25chr6p21.1 · 40500001–46200000 · gnegchr6p12.3 · 46200001–51800000 · gpos100chr6p12.2 · 51800001–53000000 · gnegchr6p12.1 · 53000001–57200000 · gpos100chr6p11.2 · 57200001–58500000 · gnegchr6p11.1 · 58500001–59800000 · acenchr6q11.1 · 59800001–62600000 · acenchr6q11.2 · 62600001–62700000 · gnegchr6q12 · 62700001–69200000 · gpos100chr6q13 · 69200001–75200000 · gnegchr6q14.1 · 75200001–83200000 · gpos50chr6q14.2 · 83200001–84200000 · gnegchr6q14.3 · 84200001–87300000 · gpos50chr6q15 · 87300001–92500000 · gnegchr6q16.1 · 92500001–98900000 · gpos100chr6q16.2 · 98900001–100000000 · gnegchr6q16.3 · 100000001–105000000 · gpos100chr6q21 · 105000001–114200000 · gnegchr6q22.1 · 114200001–117900000 · gpos75chr6q22.2 · 117900001–118100000 · gnegchr6q22.31 · 118100001–125800000 · gpos100chr6q22.32 · 125800001–126800000 · gnegchr6q22.33 · 126800001–130000000 · gpos75chr6q23.1 · 130000001–130900000 · gnegchr6q23.2 · 130900001–134700000 · gpos50chr6q23.3 · 134700001–138300000 · gnegchr6q24.1 · 138300001–142200000 · gpos75chr6q24.2 · 142200001–145100000 · gnegchr6q24.3 · 145100001–148500000 · gpos75chr6q25.1 · 148500001–152100000 · gnegchr6q25.2 · 152100001–155200000 · gpos50chr6q25.3 · 155200001–160600000 · gnegchr6q26 · 160600001–164100000 · gpos50chr6q27 · 164100001–170805979 · gnegKCNK17pq1 bp170,805,979 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr6:39,298,998–39,314,461
Gene span
15,464 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000373231 ★39,299,001–39,314,4195
ENST0000088480539,298,998–39,314,4615
ENST0000088480639,298,998–39,314,4616
ENST0000088480739,298,998–39,314,4615
ENST0000096985839,298,998–39,314,4616
ENST0000113339639,298,998–39,314,4615
ENST0000108744539,299,001–39,314,4615
ENST0000097587339,299,002–39,314,4616
ENST0000045341339,299,012–39,314,4616

顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

KCNK17 產物可傳導鉀離子電流,並在細胞膜去極化時呈現電壓依賴性的外向整流電流。其閘門開啟方式與離子流動方向相關:外向鉀離子流可開啟通道,內向流則不會。來源將此描述為「離子通量閘控」模式,顯示通道閘控與鉀離子的電化學梯度相連,而非單由膜電壓變化決定。

KCNK17 可形成同源二聚體,也能與其他通道亞基形成異源二聚體;不同二聚體組成具有不同的調控及閘控特性。來源指出它可與 KCNK5、KCNK16 形成異源二聚體,並可形成以雙硫鍵連結的同源二聚體。這些組合關係提供了通道功能差異的結構基礎,但來源未進一步說明各組合的具體調控差異。

除鉀離子外,KCNK17 通道也可通透其他單價陽離子,例如 Rb(+) 與 Cs(+);其中 Rb(+) 的通透性依序列相似性推定,Cs(+) 則有來源所列的實驗證據。這些離子通透資料補充了其選擇性特徵,但不能據此推定其他未列出的離子也可通過。

KCNK17 存在於心臟傳導系統。來源提出它可能參與調節心肌細胞的動作電位持續時間及搏動頻率;此處為可能的生理作用,並未表述為已確立的因果關係。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 39314419 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>KCNK17 ENST00000373231 GRCh38 chr6:39314319-39315419 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ACTTCATCACTCCCTCTGGGCTCCTGCCTTCTCAAGAGCCTTTCCAAACACCCCATGGGAAGCCAGAGAG
CCAGCAGATCCCAGGATCCTTCCAGAAAGTGAGCTCCATGAACGTCTGGCCTCTCTCAGGAATGCATTCT
CCAGGTCTGGCCTTTCCCCTGCCAGACTGCAACATCCCTGACCAGGAGAGATTTAGACCACTCCATCCCG
GGGCCTGGAAATTTTGGCCTTTGCCTCTCCCATCATCCAACAGCAAGTGGGCTCCTATGTGGCTGGGTTC
CTCTGCACAGGTCTGAGGCAAGGCTGTGGAGCCAAGGCGGCTCCAGGCAGGAGACCCAGGAGAGGCTCTA
CAGCAGCAAGAGGAGTCCAAGTCACACCCCAGGACTTCCCCATATCCAAGAAAGGACTGGGAAGCTGAGG
ACCCACGGACTCTTCACACAGCCTAGACGCTTCCTCCACTCCAGGTAGAGGGATTTCGGGGGCCTTCTCA
GAAGCAAGGAGTGGACAAGCCTCTTGGTTAAGGCTCCTCTTACCTCCCAAGCTCATGGACAAGTGGCAAT
CAGCTGGGGTCCCTCTTTTGGGGTACAAAGGAAAGGACAGAGGTGTGGGAGACCCAAGGTGGTCTTGAGA
TTGACAGACAGCAAGTCCTTGGAGATAGCCCCCGAGTCCAAGAACTTAGGCAGGGGCCCCAAGACAATAA
AGTTGGTCTCTACTATCTCCTACCTCTGAGTGCGGTTTCCAGAAGTCCCTCCCATTGTTCATTTCAGGAA
ATGTGAGGGGGCTCTGGGCCCCTTCCCTCAGCGCCTGCGGTCACCCAGCAGCTTCCTCCTTCTCCCTGGC
CTAGGCCTAGCAGGTGGGCACCCCGCACACATTTGAGGCGGGGCCAGATGCCCACAGTTCAGAGCCTCTT
TTTGTCCCGGGGATTGGATCCCAGGGCTGGGTGGGGCCAGGCTGTCCCATTCCCCAACACTCCTCCTCCC
CGGCGAAACCGGGCACCAGCAGGCGTTTGCGAGAGGAGATACGAGCTGGACGCCTGGCCCTTCCCTCCCA
CCGGGTCCTAGTCCACCGCTCCCGGCGCCGGCTCCCCGCCTCTCCCGCTAT
KCNK17 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
KCNK17_1 ↗6:39,314,419負股39,314,409–39,314,468

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR6_B9RM8 · enhancer · 39309829–39310434 · regulatory

ENSR6_5C8MDN · CTCF_binding_site · 39309974–39309995 · regulatory

ENSR6_5C8MFB · CTCF_binding_site · 39310112–39310135 · regulatory

ENSR6_5C8N34 · CTCF_binding_site · 39313739–39313760 · regulatory

ENSR6_9KLBQ · promoter · 39314409–39314745 · regulatory

· motif · 39309976–39309992 · motif

· motif · 39310114–39310130 · motif

· motif · 39310116–39310132 · motif

· motif · 39310677–39310690 · motif

· motif · 39310677–39310690 · motif

· motif · 39310678–39310691 · motif

· motif · 39310678–39310691 · motif

· motif · 39313741–39313757 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:332 aa

1 aa332 aa功能區域跨膜區拓樸區域
依 Q96T54 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

KCNK17 蛋白質長 332 個胺基酸,具有四段預測的跨膜螺旋;N 端、兩段跨膜區之間的區段及 C 端均位於細胞質側。蛋白質含兩個選擇性過濾區,位置註解依序列相似性推定;第 287–312 位胺基酸另被註解為無序區。

拓樸區域Cytoplasmic1–20 aa
跨膜區Helical21–43 aa
跨膜區Helical128–148 aa
拓樸區域Cytoplasmic149–179 aa
跨膜區Helical180–200 aa
跨膜區Helical244–264 aa
拓樸區域Cytoplasmic265–332 aa
功能區域Selectivity filter 1116–121 aa
功能區域Selectivity filter 2221–226 aa
功能區域Disordered287–312 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q96T54…

AlphaFold · Q96T54

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

KCNK17 是多次穿越膜的蛋白質,定位於細胞膜。 來源未提供其定位會隨條件、異構型或細胞狀態改變的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
K2p17.1KCNK17
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

KCNK17 可形成以雙硫鍵連結的同源二聚體,也可與 KCNK5 或 KCNK16 形成異源二聚體。來源將這些關係描述為二聚體組成;未提供其他蛋白質結合或更大型複合體的資訊。不同二聚體具有不同調控及閘控特性,屬功能特性描述。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

6 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 6 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能KCNK17 是鉀離子通道,在細胞膜去極化時傳導電壓依賴性的外向整流電流。其閘控與鉀離子電化學梯度相連,呈「離子通量閘控」模式:外向而非內向離子流會開啟閘門。它可形成具有不同調控與閘控特性的同源或異源二聚體,存在於心臟傳導系統,可能調節心肌細胞動作電位持續時間與搏動頻率;依序列相似性也推定可通透 Rb(+) 與 Cs(+)。含實驗來源
證據與來源

K(+) channel that conducts voltage-dependent outward rectifying currents upon membrane depolarization. Voltage sensing is coupled to K(+) electrochemical gradient in an 'ion flux gating' mode where outward but not inward ion flow opens the gate. Homo- and heterodimerizes to form functional channels with distinct regulatory and gating properties. Present in the cardiac conduction system where it may regulate action potential duration and beating frequency of cardiac myocytes. Permeable to other monovalent cations such as Rb(+) and Cs(+) (By similarity)

PMID 11248242 ↗ · PMID 11263999 ↗ · PMID 24972929 ↗ · PMID 26919430 ↗ · PMID 36063992 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性K(+)(in) = K(+)(out)含實驗來源
證據與來源

K(+)(in) = K(+)(out)

PMID 11248242 ↗ · PMID 11263999 ↗ · PMID 26919430 ↗ · PMID 36063992 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性Rb(+)(in) = Rb(+)(out)推論支持
證據與來源

Rb(+)(in) = Rb(+)(out)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性Cs(+)(in) = Cs(+)(out)含實驗來源
證據與來源

Cs(+)(in) = Cs(+)(out)

PMID 26919430 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用KCNK17 可形成以雙硫鍵連結的同源二聚體,也可與 KCNK5 或 KCNK16 形成異源二聚體。含實驗來源
證據與來源

Homodimer; disulfide-linked. Heterodimer with KCNK5 and KCNK16

PMID 36063992 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位KCNK17 是多次穿越細胞膜的蛋白質,定位於細胞膜。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 24972929 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 6 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000373231 · 1,524 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1AGGCGTTTGCGAGAGGAGATACGAGCTGGACGCCTGGCCC40
41TTCCCTCCCACCGGGTCCTAGTCCACCGCTCCCGGCGCCG80
81GCTCCCCGCCTCTCCCGCTATGTACCGACCGCGAGCCCGG120
121GCGGCTCCCGAGGGCAGGGTCCGGGGCTGCGCGGTGCCCA160
161GCACCGTGCTCCTGCTGCTCGCCTACCTGGCTTACCTGGC200
201GCTGGGCACCGGCGTGTTCTGGACGCTGGAGGGCCGCGCG240
241GCGCAGGACTCCAGCCGCAGCTTCCAGCGCGACAAGTGGG280
281AGCTGTTGCAGAACTTCACGTGTCTGGACCGCCCGGCGCT320
321GGACTCGCTGATCCGGGATGTCGTCCAAGCATACAAAAAC360
361GGAGCCAGCCTCCTCAGCAACACCACCAGCATGGGGCGCT400
401GGGAGCTCGTGGGCTCCTTCTTCTTTTCTGTGTCCACCAT440
441CACCACCATTGGCTATGGCAACCTGAGCCCCAACACGATG480
481GCTGCCCGCCTCTTCTGCATCTTCTTTGCCCTTGTGGGGA520
521TCCCACTCAACCTCGTGGTGCTCAACCGACTGGGGCATCT560
561CATGCAGCAGGGAGTAAACCACTGGGCCAGCAGGCTGGGG600
601GGCACCTGGCAGGATCCTGACAAGGCGCGGTGGCTGGCGG640
641GCTCTGGCGCCCTCCTCTCGGGCCTCCTGCTCTTCCTGCT680
681GCTGCCACCGCTGCTCTTCTCCCACATGGAGGGCTGGAGC720
721TACACAGAGGGCTTCTACTTCGCCTTCATCACCCTCAGCA760
761CCGTGGGCTTCGGCGACTACGTGATTGGAATGAACCCCTC800
801CCAGAGGTACCCACTGTGGTACAAGAACATGGTGTCCCTG840
841TGGATCCTCTTTGGGATGGCATGGCTGGCCTTGATCATCA880
881AACTCATCCTCTCCCAGCTGGAGACGCCAGGGAGGGTATG920
921TTCCTGCTGCCACCACAGCTCTAAGGAAGACTTCAAGTCC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。