基因總覽
KCNK15 的正式名稱為 potassium two pore domain channel subfamily K member 15,屬於蛋白質編碼基因。其產物被描述為可能的鉀離子通道次單元,名稱所指向的是 two pore domain potassium channel 家族。現有資料對它的基本認識主要來自這項可能的通道次單元身分;具體通道功能仍有不確定性,因為在異源表現系統中未觀察到通道活性。資料並指出,它可能需要與另一種蛋白質結合,才能形成具功能的通道。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000372861 ★ | 44,745,865–44,752,313 | 2 |
| ENST00001124008 | 44,745,785–44,751,028 | 2 |
| ENST00001132545 | 44,745,785–44,752,677 | 2 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
KCNK15 的產物被認為可能是鉀離子通道的次單元,但目前資料不足以將其通道功能視為已確立。尤其在異源表現系統中,尚未觀察到通道活性,因此不能據此確認單獨表現的 KCNK15 能形成可測得功能的通道。
一種可能的解釋是,KCNK15 需要與另一種蛋白質結合,才能組成具功能的通道。這表示其功能可能取決於與其他蛋白質的共同組成,而非單靠 KCNK15 即可呈現;不過,現有資料沒有指出所需夥伴的身分,也未說明這種組成如何影響通道活性。
因此,對 KCNK15 的功能描述應保留「可能」的限定:它可能參與鉀離子通道的形成,但異源系統中未見通道活性,且是否能在其他組成條件下形成具功能的通道仍未獲此資料直接證實。
Promoter 與基因調控
>KCNK15 ENST00000372861 GRCh38 chr20:44744865-44745965 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCACCATCCCTTTTCCCCATGACAGCCAGGGGCTCTTTAAAAAATATGAATCAGATCATTGTGGTGGTGT TGCGTGTGTGTTTGTTTGCCTGTGTTTGTAATACAGCCTTTCCATGGCTTTCAATAAACCCACATAAGGG CTTGTAAGACCCTGTGTGAAGTTGCCTCTTTGCCTTCCTTCTGCTCCCCCAAAGTATCTGCCCCCCAGTT CTCTGGGCTCCAGCGACACCGGCTCCTCTGCTATTCTGGCTGCCAAGTCATGCTCAGTTCTGTTTTAAGC ACCACCTTAGATGGTGGGGTTCACCTTCCCCAAGAAACTATCCCTTTTCCTTCTTTCTCACTCCTGTCTT AAATTAGTTTCTTGTTTGTTAGCTGGCCCTCCTCACTAGGATATCACTTTTACTTACAACAGGAATGTTG TTTGCACCAGTAGGTGCTTGGTAAATATTTGTCAGAGGATTGACTGACTGAATGAAAGAAGGAAGGAAGG AGAGAAGGAAGGGAAGAAGAGATGAAGGGACGAAGGGAGGAAGGGAGGGACGGAGGGAGGAAGGGAGGGA CGGAGGGAGGAAGGGAGGGACGGAGGGAGGAAGGATGGGAGGGAAGAAGGGAGGGAGGGATGGGGAAAGG AGTGAAAGGAAGGAAGGAAGGAAAGGAGGGAGGGAGGGAGGAAGGGAGGGGAGGGGGGAGGGGAGGGAGG GAAAAAGGAAGGAAGGAAGGACGGAAGGAAGGACGGAAGACTGGCACGAGGTCACAACATGAGTTAGTGG CGGGAACAGGACTTCTGCAGGCCCGGGGTTTGGGCCTTTGCTTCAGATCTCACTATTCACAGACACATGA ACCCCGGGCAGGCGAGTGGGAGGCGGACAGGGGAGCGGTTCTTCCGGCCCCCACCCGTGGCGATCCCAGC CTCCAGGTTCCCGGCAGTCGCCCCGCCTCGCCCGTCACAACCCTGCCGCGTGGGGCCGGGGTTGGAGGGG GCGGAGCGCGCGGTCCGGGCACACGGAGCAGGTTGGGACCGCGGCGGGTACCGGGGCCGGGGCGCCATGC GGAGGCCGAGCGTGCGCGCGGCCGGGCTGGTCCTGTGCACCCTGTGTTACC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| KCNK15_1 ↗ | 20:44,745,865 | 正股 | 44,745,816–44,745,875 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR20_9MQJ8 · promoter · 44745375–44745875 · regulatory
ENSR20_BBTQP · promoter · 44746011–44746652 · regulatory
ENSR20_C6FTX · enhancer · 44746653–44748305 · regulatory
ENSR20_5DJ6Q5 · CTCF_binding_site · 44747442–44747463 · regulatory
ENSR20_5DJ6R8 · CTCF_binding_site · 44747682–44747703 · regulatory
ENSR20_5DJ785 · CTCF_binding_site · 44750253–44750274 · regulatory
ENSR20_5DJ79J · CTCF_binding_site · 44750556–44750577 · regulatory
· motif · 44745609–44745625 · motif
· motif · 44745609–44745625 · motif
· motif · 44747444–44747460 · motif
· motif · 44747684–44747700 · motif
· motif · 44750255–44750271 · motif
· motif · 44750558–44750574 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:330 aa
KCNK15 蛋白長 330 個胺基酸,屬於 two pore domain potassium channel 家族。序列註解標示四段螺旋型跨膜區,另有多段細胞質區域;第 256–276 位胺基酸區段被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
KCNK15 被註記為多次穿膜蛋白,位於膜。 現有資料未提供其在不同條件下的定位變化、異構型差異或更細緻的細胞內位置資訊。
未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
資料將 KCNK15 標示為異源二聚體,但未列出另一個組成蛋白的名稱或提供更多複合體細節。另有功能性描述指出,KCNK15 可能需要與另一種蛋白質結合,才能形成具功能的通道;此為可能的功能依賴關係,來源未確認特定結合夥伴。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | KCNK15 可能是鉀離子通道的次單元;在異源表現系統中尚未觀察到通道活性。它可能需要與另一種蛋白質結合,才能形成具功能的通道,但資料未指出該蛋白質的身分。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Probable potassium channel subunit. No channel activity observed in heterologous systems. May need to associate with another protein to form a functional channel |
| 交互作用 | Heterodimer | 推論支持 | |
| 細胞定位 | KCNK15 被註記為位於膜的多次穿膜蛋白;此描述未提供更細緻的細胞內位置或定位變化資訊。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
ACACGGAGCAGGTTGGGACCGCGGCGGGTACCGGGGCCGG40GGCGCCATGCGGAGGCCGAGCGTGCGCGCGGCCGGGCTGG80TCCTGTGCACCCTGTGTTACCTGCTGGTGGGCGCTGCTGT120CTTCGACGCGCTCGAGTCCGAGGCGGAAAGCGGCCGCCAG160CGACTGCTGGTCCAGAAGCGGGGCGCTCTCCGGAGGAAGT200TCGGCTTCTCGGCCGAGGACTACCGCGAGCTGGAGCGCCT240GGCGCTCCAGGCTGAGCCCCACCGCGCCGGCCGCCAGTGG280AAGTTCCCCGGCTCCTTCTACTTCGCCATCACCGTCATCA320CTACCATCGAGTACGGCCACGCCGCGCCGGGTACGGACTC360CGGCAAGGTCTTCTGCATGTTCTACGCGCTCCTGGGCATC400CCGCTGACGCTGGTCACTTTCCAGAGCCTGGGCGAACGGC440TGAACGCGGTGGTGCGGCGCCTCCTGTTGGCGGCCAAGTG480CTGCCTGGGCCTGCGGTGGACGTGCGTGTCCACGGAGAAC520CTGGTGGTGGCCGGGCTGCTGGCGTGTGCCGCCACCCTGG560CCCTCGGGGCCGTCGCCTTCTCGCACTTCGAGGGCTGGAC600CTTCTTCCACGCCTACTACTACTGCTTCATCACCCTCACC640ACCATCGGCTTCGGCGACTTCGTGGCACTGCAGAGCGGCG680AGGCGCTGCAGAGGAAGCTCCCCTACGTGGCCTTCAGCTT720CCTCTACATCCTCCTGGGGCTCACGGTCATTGGCGCCTTC760CTCAACCTGGTGGTCCTGCGCTTCCTCGTTGCCAGCGCCG800ACTGGCCCGAGCGCGCTGCCCGCACCCCCAGCCCGCGCCC840CCCGGGGGCGCCCGAGAGCCGTGGCCTCTGGCTGCCCCGC880CGCCCGGCCCGCTCCGTGGGCTCCGCCTCTGTCTTCTGCC920ACGTGCACAAGCTGGAGAGGTGCGCCCGCGACAACCTGGG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。