基因總覽
KAT6A(lysine acetyltransferase 6A)是蛋白質編碼基因,產物屬於 MYST(SAS/MOZ)家族。其蛋白質長 2004 個胺基酸,具有 MYST-type HAT 催化區,並包含多個鋅指結構域及其他功能區域。KAT6A 可組成 MOZ/MORF 複合體;來源指出該複合體具有組蛋白 H3 乙醯轉移酶活性。其已知作用對象還包括 RUNX1、RUNX2 與 p53/TP53,涉及轉錄調控。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000265713 ★ | 41,929,479–42,051,987 | 17 |
| ENST00000406337 | 41,929,479–42,051,998 | 18 |
| ENST00000396930 | 41,929,479–42,051,998 | 18 |
| ENST00000855880 | 41,929,479–42,051,998 | 17 |
| ENST00000919320 | 41,929,479–42,051,998 | 18 |
| ENST00000967392 | 41,929,479–42,051,998 | 18 |
| ENST00001135472 | 41,929,479–42,051,998 | 17 |
| ENST00000649817 | 41,930,762–41,974,734 | 11 |
| ENST00000648335 | 41,933,188–42,051,987 | 18 |
| ENST00000485568 | 41,942,049–42,051,998 | 14 |
| ENST00000647746 | 41,964,351–41,977,135 | 3 |
| ENST00001110091 | 41,974,081–42,051,998 | 9 |
顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
KAT6A 是組蛋白乙醯轉移酶,可在體外乙醯化組蛋白 H3 與 H4 的 lysine 殘基。它也是 MOZ/MORF 複合體的組成成分;該複合體具有組蛋白 H3 乙醯轉移酶活性。其催化反應以 acetyl-CoA 為乙醯基來源,將乙醯基轉移至蛋白質的 lysine 殘基,並產生 CoA 與 H⁺。
KAT6A 可能作為轉錄共活化因子,協助 RUNX1 與 RUNX2 的轉錄調控。另有資料指出,KAT6A 乙醯化 p53/TP53 的 Lys-120 與 Lys-382,並透過與 PML 的關聯調控 p53/TP53 的轉錄活性;來源描述的是這種關聯下的調控作用,未將其概括為對所有情境皆相同的效果。
KAT6A 可能參與白血病相關基因的轉錄。這項功能描述保留「可能」的限制;來源未提供足以進一步界定其作用範圍或普遍性的細節。
Promoter 與基因調控
>KAT6A ENST00000265713 GRCh38 chr8:42051887-42052987 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTTAAAGTAGATGAAAGGCAAGACAAAGAAACGTCCATACAGCCAGTAGTGGACAGGCAGGCCATGAAGA ACCGCCTGCTCGTGGTTCCAACGCCCTAAGTATGGACAAGAGTTCCGCACAGGGCAAGAAGGGAAGACCG GCTTTGGAATAAGACAAATCTCAGTCCCAGGCTCAGGTGCGCGCCACATACTAGCTGTGTGACCTTGTCC AAGTCACACGACCCAGGTCTGTGGAGTCTCCCATAAAATGGCTCTAGTGAGCTCCAAGAACCCTCTCAGC TGCTGGGGGAGGGAAGAAATGAAGTCACTGCTGAAAGGGGTTAAGACGGGTGCTTCTGGTTCCACCCTCT CCCCAACTCTTCCCACCGACACAGGAGAGCCGTCGGGGGCTGAGGCGAGCTGCCAGGGGTGAGGACGGGA AGCCGCCTCCTCTCCGCCCCCCAGGCCCCGCCCTCGGGCTCCGGAAAGTCGCTGTGCAGGCAAATGAGTG GGGAGGGAGGGCTCACTAACTGTAAACAGACGCCGCCGAGAGTTCCCATCCTGCGTGGCTGCCGGATTTC CGTGCCACACTGAAGCCACCCCACCCAGACTCCTGCCCTCAGTTTCCCCAGCGGTGGCATGGGGTGCACC AGCTCCTCCTCTCCCGGGTCGCCGTCTGACTTAAACGCGTGAGACGGGAGAGGAGGAACCCCCGCTCCCC AGCCTCCAGCCCCACCAAGTCCTCCTCCTCCCCTGGCTTTGGCCTTTTGTACCGGCCCCACGTGACCCCG CCGGCCGGCTCTTCCCTGCTGCCCCGCCCCGCCCTCCGGCCTTTCCCGGCTCTCGGCCCAGCTCTTCCCG CTCTCGGCCGCCCCCCACCCGCGCTGCCGGGCCTCCGCCTCCCCTCGCCGCCCGCCCAGGCTCTTCCAGC TCCCTCCCCCAGGCCGCCGTTCCCTCGCGACGCTCCCCTCCCCCCGCGGCTGTTCCGCCGCCTTGCCTCC CCTCCCCCCGGCTGGAGCTCACTGTCTCCAAGATGGCGGCCGTGTCAGTTTGGGGCATCTCCGCGGTCCG GCCCGGGGCCCCGGGATCTCGGCTGTCCTTCCTCCCGGTAAGTAGCCGAGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| KAT6A_1 ↗ | 8:42,051,987 | 負股 | 42,051,977–42,052,036 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR8_838D99 · enhancer · 42049484–42049719 · regulatory
ENSR8_838D9J · enhancer · 42050010–42050166 · regulatory
ENSR8_C66MW · enhancer · 42050643–42051976 · regulatory
ENSR8_5CW3GB · CTCF_binding_site · 42051368–42051389 · regulatory
ENSR8_5CW3J5 · CTCF_binding_site · 42051762–42051783 · regulatory
ENSR8_9LNMW · promoter · 42051977–42052484 · regulatory
ENSR8_838DD8 · enhancer · 42054680–42054855 · regulatory
ENSR8_838DFH · enhancer · 42056800–42057049 · regulatory
· motif · 42050082–42050095 · motif
· motif · 42051106–42051115 · motif
· motif · 42051106–42051115 · motif
· motif · 42051293–42051302 · motif
· motif · 42051293–42051302 · motif
· motif · 42051293–42051302 · motif
· motif · 42051293–42051302 · motif
· motif · 42051370–42051386 · motif
· motif · 42051764–42051780 · motif
· motif · 42051967–42051977 · motif
· motif · 42052000–42052010 · motif
· motif · 42052034–42052044 · motif
· motif · 42052039–42052049 · motif
· motif · 42052068–42052078 · motif
· motif · 42052182–42052192 · motif
· motif · 42052187–42052197 · motif
· motif · 42052217–42052229 · motif
· motif · 42052219–42052226 · motif
· motif · 42052222–42052231 · motif
· motif · 42052222–42052231 · motif
· motif · 42052234–42052249 · motif
· motif · 42052618–42052629 · motif
· motif · 42052780–42052792 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:2004 aa
KAT6A 蛋白長 2004 個胺基酸,屬於 MYST 家族。其註解包含 SAMD1-like winged helix、H15 與 MYST-type HAT 結構域,以及兩個 PHD-type zinc finger 和一個 C2HC MYST-type zinc finger。序列另有多段註解為無序區域;MYST-type HAT 區域被標示為催化區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
KAT6A 位於細胞核內,包括核仁、核質與 PML body。 DNA 損傷後,KAT6A 會被招募至 PML body。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- KMT2AQ03164 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- WDR5P61964 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
KAT6A 是 MOZ/MORF 複合體的成員;複合體至少包含 ING5、KAT6A、KAT6B、MEAF6,以及 BRPF1、BRD1/BRPF2、BRPF3 其中之一。KAT6A 與 RUNX1、RUNX2 及 p53/TP53 有互作;RUNX1 磷酸化會增強其與 KAT6A 的互作。KAT6A 也與 PML isoform PML-4 互作,該互作會正向調節 KAT6A 對 p53/TP53 的乙醯化活性。當 KAT6A 被乙醯化或巴豆醯化時,會直接與 MLLT1/ENL 及 MLLT3/AF9 互作。
疾病與遺傳關聯
涉及 KAT6A 的染色體異常可能與急性骨髓性白血病有關,包括與 CREBBP 或 EP300 的易位,以及產生 KAT6A-NCOA2 的倒位。來源指出,KAT6A-CREBBP 可能藉由抑制 RUNX1 介導的轉錄誘發白血病;KAT6A-NCOA2 則可結合 CREBBP 並干擾其轉錄活化功能。另有 KAT6A-ASXL2 融合蛋白與治療相關骨髓增生不良症候群相關的染色體異常記載。KAT6A 基因變異也與常染色體顯性 Arboleda-Tham syndrome 有關;其特徵包括智能障礙、特殊面容、精神動作發展遲緩及缺乏語言。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | KAT6A 可在體外乙醯化組蛋白 H3、H4 的 lysine 殘基,並是具有 H3 乙醯轉移酶活性的 MOZ/MORF 複合體成員。它可能協助 RUNX1、RUNX2 進行轉錄調控,也會乙醯化 p53/TP53 的 Lys-120、Lys-382,並透過與 PML 的關聯調控其轉錄活性;此外可能參與白血病相關基因轉錄。 | 含實驗來源 | 證據與來源Histone acetyltransferase that acetylates lysine residues in histone H3 and histone H4 (in vitro). Component of the MOZ/MORF complex which has a histone H3 acetyltransferase activity. May act as a transcriptional coactivator for RUNX1 and RUNX2. Acetylates p53/TP53 at 'Lys-120' and 'Lys-382' and controls its transcriptional activity via association with PML. May play a role in leukemogenic gene transcription PMID 11742995 ↗ · PMID 11965546 ↗ · PMID 12771199 ↗ · PMID 16387653 ↗ · PMID 17925393 ↗ · PMID 23431171 ↗ · PMID 39794553 ↗ |
| 分子活性 | L-lysyl-[protein] + acetyl-CoA = N(6)-acetyl-L-lysyl-[protein] + CoA + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源L-lysyl-[protein] + acetyl-CoA = N(6)-acetyl-L-lysyl-[protein] + CoA + H(+) PMID 11313971 ↗ · PMID 11742995 ↗ · PMID 17925393 ↗ |
| 交互作用 | KAT6A 是 MOZ/MORF 複合體成員,該複合體至少含 ING5、KAT6A、KAT6B、MEAF6,並含 BRPF1、BRD1/BRPF2、BRPF3 其中之一。KAT6A 與 RUNX1、RUNX2、p53/TP53 及 PML isoform PML-4 互作;RUNX1 磷酸化會增強互作,PML 互作則正向調節其對 p53/TP53 的乙醯化活性。乙醯化或巴豆醯化的 KAT6A 會直接與 MLLT1/ENL、MLLT3/AF9 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the MOZ/MORF complex composed at least of ING5, KAT6A, KAT6B, MEAF6 and one of BRPF1, BRD1/BRPF2 and BRPF3. Interacts with RUNX1; phosphorylation of RUNX1 enhances the interaction. Interacts with RUNX2. Interacts with p53/TP53. Interacts with PML (isoform PML-4) and this interaction positively regulates its acetylation activity towards p53/TP53. When acetylated or crotonylated, interacts with MLLT1/ENL; the interaction is direct. When acetylated or crotonylated, interacts with MLLT3/AF9; the interaction is direct PMID 11742995 ↗ · PMID 11965546 ↗ · PMID 16387653 ↗ · PMID 18794358 ↗ · PMID 23431171 ↗ · PMID 39794553 ↗ |
| 細胞定位 | KAT6A 位於細胞核、核仁、核質及 PML body;DNA 損傷後,KAT6A 會被招募至 PML body。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Nucleus; Nucleus, nucleolus; Nucleus, nucleoplasm; Nucleus, PML body; Recruited into PML body after DNA damage |
| 疾病關聯 | 涉及 KAT6A 的染色體異常可能是急性骨髓性白血病的原因,包括與 CREBBP 或 EP300 的易位,以及形成 KAT6A-NCOA2 的倒位。KAT6A-CREBBP 可能藉抑制 RUNX1 介導的轉錄誘發白血病;KAT6A-NCOA2 由 KAT6A N 端與 NCOA2/TIF2 C 端構成,能結合 CREBBP 並干擾其轉錄活化功能。 | 含實驗來源 | 證據與來源Chromosomal aberrations involving KAT6A may be a cause of acute myeloid leukemias. Translocation t(8;16)(p11;p13) with CREBBP. Translocation t(8;22)(p11;q13) with EP300. KAT6A-CREBBP may induce leukemia by inhibiting RUNX1-mediated transcription. Inversion inv(8)(p11;q13) generates the KAT6A-NCOA2 oncogene, which consists of the N-terminal part of KAT6A and the C-terminal part of NCOA2/TIF2. KAT6A-NCOA2 binds to CREBBP and disrupts its function in transcription activation PMID 10824998 ↗ · PMID 11742995 ↗ · PMID 12676584 ↗ · PMID 8782817 ↗ |
| 疾病關聯 | 涉及 KAT6A 的染色體異常與治療相關骨髓增生不良症候群有關;t(2;8)(p23;p11.2) 與 ASXL2 易位會產生 KAT6A-ASXL2 融合蛋白。 | 含實驗來源 | 證據與來源A chromosomal aberration involving KAT6A is a cause of therapy-related myelodysplastic syndrome. Translocation t(2;8)(p23;p11.2) with ASXL2 generates a KAT6A-ASXL2 fusion protein |
| 疾病關聯 | Arboleda-Tham syndrome(ARTHS)為常染色體顯性疾病,特徵包括智能障礙、特殊面容、精神動作發展遲緩及缺乏語言。此疾病由影響本條目所代表基因的變異所致。 | 含實驗來源 | 證據與來源Arboleda-Tham syndrome ARTHS An autosomal dominant disorder characterized by intellectual disability, dysmorphic facial features, delayed psychomotor development, and lack of speech. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 616268 PMID 25728775 ↗ · PMID 25728777 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACTGTCTCCAAGATGGCGGCCGTGTCAGTTTGGGGCATCT40CCGCGGTCCGGCCCGGGGCCCCGGGATCTCGGCTGTCCTT80CCTCCCGGCATAAGATGCACATTTTTCTGCTCTGGAGCCG120GGAATGAAATATTCTTGAGTTCTTACAACTTTATGACGAG160ACCCATGTGTGGTGCTATTGAGAAATTCATTGGGAAGTTG200GAAGACATTTCAATCAACAGGTTGTTTTGGTTTCTATAGT240ACAATTGGGGTGGCATTCTGTTTTGTGAAAGGAGGAAGGA280CTTAGGCCAGAAAACTCATATGCTATGGTTAACTGGTTCC320CAGCCTCCGAGAATCTTGTTTTCCATGGTGTAAAACTTAC360TCAGCATCAGGATAAGGGATAACGACTCTATGGATATACA400GAATCCTTCACCATGGTAAAACTCGCAAACCCGCTTTATA440CTGAGTGGATTTTGGAGGCCATCAAAAAAGTGAAAAAGCA480GAAACAGCGTCCTTCAGAAGAAAGGATATGCAATGCTGTG520TCTTCATCCCATGGCTTGGATCGTAAAACTGTTTTAGAAC560AATTGGAGTTGAGTGTTAAAGATGGAACAATTTTAAAAGT600CTCAAATAAAGGACTCAATTCCTATAAAGATCCTGATAAT640CCTGGGCGAATAGCACTTCCTAAGCCTCGGAACCATGGAA680AATTGGATAATAAACAAAATGTGGATTGGAATAAACTGAT720AAAGCGGGCAGTTGAGGGCTTGGCAGAGTCTGGTGGCTCA760ACTTTGAAAAGCATTGAACGTTTTTTGAAAGGTCAGAAGG800ATGTGTCTGCATTATTCGGAGGCAGTGCTGCCTCTGGCTT840TCACCAGCAGTTACGATTGGCTATCAAACGTGCCATTGGC880CACGGCAGACTCCTTAAAGATGGACCTCTTTATCGGCTCA920ACACTAAAGCAACCAACGTGGATGGGAAAGAGAGTTGTGA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。