演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

JPT2FLJ13092

Jupiter microtubule associated homolog 2

JPT2 是 JUPITER 家族蛋白,可結合 NAADP,參與細胞內鈣離子釋放的調節;也與 SARS-CoV-2 的內體-溶體運輸有關。

Homo sapiens16p13.3UniProt Q9H910
OFFICIAL SYMBOL
JPT2
CHROMOSOME
16
UNIPROT
Q9H910
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

JPT2(Jupiter microtubule associated homolog 2)是蛋白質編碼基因,產物屬於 JUPITER 家族。其蛋白質長 190 個胺基酸,整段序列均被註記為無序區,表示目前資料未標示出明確的結構化區段。功能資料指出,JPT2 可結合 nicotinic acid adenine dinucleotide phosphate(NAADP),並參與細胞內鈣離子訊號;此外,在微生物感染情境下,它也與 SARS-CoV-2 的內體-溶體運輸相關。

Official symbol
JPT2
Gene name
Jupiter microtubule associated homolog 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14137
UniProt
Q9H910
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
FLJ13092L11KIAA1426C16orf34HN1L

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616p13.3
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegJPT2pq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr16:1,678,256–1,702,859
Gene span
24,604 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000248098 ★1,678,279–1,702,0865
ENST000005626841,678,277–1,701,4906
ENST000005615161,678,277–1,699,5994
ENST000009063671,678,277–1,699,8835
ENST000009323781,678,277–1,702,8596
ENST000009323791,678,277–1,702,8596
ENST000010856841,678,277–1,702,0795
ENST000011258781,678,277–1,702,8596
ENST000011295491,678,277–1,679,3762
ENST000011375101,678,277–1,702,0865
ENST000003827111,678,280–1,699,2376
ENST000005667421,678,290–1,700,2256

顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

JPT2 是 NAADP 結合蛋白,對 NAADP 引發的細胞內鈣離子釋放具有必要作用。此功能將 JPT2 定位為 NAADP 訊號與鈣離子動員之間的關聯因子;來源並指出,它可使雙孔道(two-pore channels,TPCs)複合體具備對 NAADP 的敏感性,說明 JPT2 與 TPCs 複合體共同參與 NAADP 相關的鈣離子訊號反應。

另一條相關路徑涉及內質網中的鈣離子釋放。JPT2 可使 NAADP 得以透過 ryanodine receptors 促進內質網釋放 Ca(2+)。因此,來源描述了 JPT2 在兩類通道相關反應中的作用:一方面使 TPCs 複合體對 NAADP 敏感,另一方面協助 NAADP 透過 ryanodine receptors 引發內質網鈣離子釋放。這些資料支持 JPT2 參與 NAADP 誘發的細胞內鈣離子動員,但未進一步界定兩條路徑之間的先後或相互依賴關係。

在微生物感染情境下,JPT2 也被列為參與人類冠狀病毒 SARS-CoV-2 內體-溶體運輸的因子。現有敘述僅指出其與此運輸過程相關,未說明作用方向、分子步驟或對病毒感染結果的影響,因此不宜據此推定更具體的抗病毒或促病毒作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 1678279 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>JPT2 ENST00000248098 GRCh38 chr16:1677279-1678379 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTAAAAGTACAGAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCATGCCCATAATCCCAGCTACTGAGGAGACTTGAGGT
AGGAGAATCACTTGAACCTCAGCGGCGGAGGTTGCAGTGAGTCGAGATCGCGCCAGTGCACTCCAGCCTG
GGCAAGAAGAGCGAAACTGGGTCTCAAGTTAAAAAAAGAAAGCAAGGAAAGAGTAATTTACAACGAAGGA
AAAAAACCCACAGCACACCCTTCGCGGCTGTCAGCGCTCTCCTGATGTCACAGTGGCTGCGTGTCCTTGG
GGTGGGTGAGGTGTGGGGAGCCCAGCCCCTGGCCCTGCCTCCCGCGCCCCGCTCCCCTTCTCTCTCTTAC
TCGGTTAAGCCATAGCGAGGCCTCCGCTCGTTTCAGATATGAATTTGTTTTATAGATTATAAATATGCAT
ATACAGTGTATGTATAAAGCAGAATGCCTGCCTTTCCTGGTTATTTTTTGTACCATATTGTAAATTATAT
TATTTATTCTTTACCAATTTTGGGAATAAAAGGTGTTTTGGTTATTTAATATAATAAGAGCTGTTAAACT
TCTGTTTAAATTTCCAGTTCAACTTGTAAATGTTTTTATTGTGCATAAATACATACTAATGTTGATCTAA
GGACTGTCGTTTGTGCCTGTTCTTCAGGGCCGCGCGCCCATGCCCGCAGTCCCTGGTCGGGCAGGTGCGG
CCCAGGTGCGGCCCCGCGGTCGGCTCGCGGGCTCCCGCAGACCGGGCTTCCTCCCGAGGGCGCGGCCGTC
CCAGGGCCCGCCCGGCCCGCCGCCCAATGCGAGCTCCCACCTCCGCGAGCGGCGTCGCCTTCCCCAATCG
GCTGCGGGCGCGGCGCCGACCGTTCAAAGCCTAAGTCGTCGGGGGTGGGCGTGAGGGGCGGTGGCCGCGC
TGAGATAGGCTGCGGAGGGATGATTGGCGTCTTGGCGCCCAATGGGCGCTGGCGGGCGGCCTTGAGTACC
TGCGCTGGGCGGGCGGGAACGGCGCGCGGCGAGCTGAGGGTGGCGGCGGTCGACATGTTCCAGGTCCCGG
ATAGCGAGGGCGGCCGCGCCGGCTCCAGGTGCGGCGCGGGGCACACGGGAG
JPT2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
HN1L_1 ↗16:1,678,279正股1,678,230–1,678,289
HN1L_2 ↗16:1,680,363正股1,680,314–1,680,373

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_83BWH · enhancer · 1675175–1675406 · regulatory

ENSR16_BBZQ · promoter · 1677787–1678323 · regulatory

ENSR16_5DMPN · CTCF_binding_site · 1678024–1678045 · regulatory

ENSR16_BBZT · enhancer · 1678324–1679331 · regulatory

ENSR16_5DMW4 · CTCF_binding_site · 1678975–1678996 · regulatory

ENSR16_9N25 · promoter · 1679871–1680347 · regulatory

ENSR16_83C2H · enhancer · 1680348–1680579 · regulatory

· motif · 1677968–1677977 · motif

· motif · 1677970–1677986 · motif

· motif · 1677970–1677986 · motif

· motif · 1677979–1677988 · motif

· motif · 1678026–1678042 · motif

· motif · 1678163–1678173 · motif

· motif · 1678352–1678361 · motif

· motif · 1678396–1678405 · motif

· motif · 1678396–1678405 · motif

· motif · 1678398–1678414 · motif

· motif · 1678763–1678776 · motif

· motif · 1678763–1678776 · motif

· motif · 1678968–1678981 · motif

· motif · 1678977–1678993 · motif

· motif · 1679035–1679049 · motif

· motif · 1679035–1679049 · motif

· motif · 1679478–1679490 · motif

· motif · 1679480–1679487 · motif

· motif · 1679480–1679495 · motif

· motif · 1680155–1680169 · motif

· motif · 1680510–1680524 · motif

JPT2 在鱗狀細胞癌、腺癌、腺鱗癌、細支氣管肺泡癌,以及乳房與子宮腫瘤中被報告為表現上調;資料未提供上調幅度或調控機制。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:190 aa

1 aa190 aa功能區域
依 Q9H910 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

JPT2 蛋白長 190 個胺基酸,歸屬於 JUPITER 家族。序列註解將第 1 至 190 位胺基酸全段標示為無序區;此註解描述的是整段序列的無序特徵,來源未列出其他結構域或功能區域。

功能區域Disordered1–190 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9H910…

AlphaFold · Q9H910

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Nucleus

JPT2 被報告位於細胞質與細胞核,並與 type 1 ryanodine receptor(RYR1)共定位。 資料未說明這些定位是否因細胞狀態或條件而改變。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
FLJ13092JPT2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

JPT2 可單體或二聚體形式存在;來源也記載它與 TPCN1 互作。資料未將 TPCN1 的互作描述為特定複合體,也未進一步說明該互作的條件或功能後果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能JPT2 是 nicotinic acid adenine dinucleotide phosphate(NAADP)的結合蛋白,對 NAADP 引發的細胞內鈣離子釋放具有必要作用。它可使雙孔道(TPCs)複合體對 NAADP 敏感,也能使 NAADP 透過 ryanodine receptors 促進內質網釋放 Ca(2+)。含實驗來源
證據與來源

Nicotinic acid adenine dinucleotide phosphate (NAADP) binding protein required for NAADP-evoked intracellular calcium release. Confers NAADP-sensitivity to the two pore channels (TPCs) complex. Enables NAADP to activate Ca(2+) release from the endoplasmic reticulum through ryanodine receptors

PMID 33758061 ↗ · PMID 33758062 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

功能在微生物感染情境下,JPT2 參與人類冠狀病毒 SARS-CoV-2 的內體-溶體運輸;來源未進一步說明其作用方向或對感染的影響。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Involved in the endolysosomal trafficking of human coronavirus SARS-CoV-2

PMID 33758061 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用JPT2 可單體或二聚體形式存在,並與 TPCN1 互作。來源未進一步說明這些形式之間的關係,也未將與 TPCN1 的互作描述為特定複合體。含實驗來源
證據與來源

Monomer. Dimer. Interacts with TPCN1

PMID 33758061 ↗ · PMID 33758062 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位JPT2 被報告位於細胞質與細胞核,並與 type 1 ryanodine receptor(RYR1)共定位;來源未說明定位變化的條件。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Nucleus; Colocalizes with type 1 ryanodine receptor (RYR1)

PMID 15094197 ↗ · PMID 33758062 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

調控JPT2 在鱗狀細胞癌(SCC)、腺癌(AC)、腺鱗癌(ASCC)、細支氣管肺泡癌(BAC),以及乳房與子宮腫瘤中被報告為表現上調;來源未提供幅度或調控機制。含實驗來源
證據與來源

Up-regulated in squamous cell carcinoma (SCC) adenocarcinoma (AC), adenosquamous cell carcinoma (ASCC), bronchioalveolar carcinoma (BAC), breast and uterus tumors

PMID 15334068 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000248098 · 3,695 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGCGCGCGGCGAGCTGAGGGTGGCGGCGGTCGACATGTTC40
41CAGGTCCCGGATAGCGAGGGCGGCCGCGCCGGCTCCAGGG80
81CCATGAAGCCCCCAGGAGGAGAATCGAGCAATCTTTTTGG120
121AAGTCCAGAAGAAGCTACTCCTTCCAGCAGGCCTAATAGG160
161ATGGCATCTAATATTTTTGGACCAACAGAAGAACCTCAGA200
201ACATACCCAAGAGGACAAATCCCCCAGGGGGTAAAGGAAG240
241TGGTATCTTTGACGAATCAACCCCCGTGCAGACTCGACAG280
281CACCTGAACCCACCTGGAGGGAAGACCAGCGACATTTTTG320
321GGTCTCCGGTCACTGCCACTTCACGCTTGGCACACCCAAA360
361CAAACCCAAGGATCATGTTTTCTTATGTGAAGGAGAAGAA400
401CCAAAATCGGATCTTAAAGCTGCAAGGAGCATCCCGGCTG440
441GAGCAGAGCCAGGTGAGAAAGGCAGCGCCAGAAAAGCAGG480
481CCCCGCCAAGGAGCAGGAGCCCATGCCCACAGTCGACAGC520
521CATGAGCCCCGGCTGGGGCCGCGGCCTCGCTCTCACAACA560
561AGGTCCTGAACCCACCGGGAGGCAAATCCAGCATCTCCTT600
601CTACTAAGAGAAGCCACTGCTCCACCCGGAGCCAGACCAG640
641AAACTCAAGAGATAGGGTAGCCATGTTTTCATTTCCTTTT680
681GCCCAAATGAGCGGGGTGGGAAGAGGGTTAGTCTTATGTG720
721AGCCTGGCTGCTCAGCGTCTCCTGGCCGTCATGACAGCTG760
761CTTGGAGACCCGTGCCTTCCAGATGGCTGGGAGATGCCTC800
801TGTGGGGATGAAATGGGGCACCCCTGGCCATCACTCATGT840
841GTAGTCCAGGTTTGAGAGGAACTGGAAGGGGGGTGAGGGT880
881GGGGAGGTGGGGCAGGGCATGGTCCTTGGATCAACAGCCC920
921GCCAGCTGATTGGATGTCTAGGAATGACTGAAAGAAACCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。