基因總覽
JPT1(Jupiter microtubule associated homolog 1)是蛋白質編碼基因,產物屬於 JUPITER 家族。其蛋白質全長 154 個胺基酸,序列被註記為無序區域。來源所載的功能涵蓋訊號調節、細胞週期與細胞黏附;具體分子作用及其條件見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000409753 ★ | 75,135,248–75,154,512 | 5 |
| ENST00000476258 | 75,135,243–75,154,243 | 5 |
| ENST00000482348 | 75,135,243–75,153,293 | 5 |
| ENST00000356033 | 75,135,243–75,154,675 | 4 |
| ENST00000470924 | 75,135,243–75,153,866 | 5 |
| ENST00000481647 | 75,135,243–75,153,826 | 5 |
| ENST00000882069 | 75,135,243–75,154,675 | 3 |
| ENST00001088460 | 75,135,243–75,154,675 | 5 |
| ENST00001102320 | 75,135,243–75,154,675 | 2 |
| ENST00001143011 | 75,135,243–75,154,675 | 5 |
| ENST00001088461 | 75,135,248–75,154,675 | 5 |
| ENST00001088465 | 75,135,248–75,154,675 | 5 |
顯示 12/19 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
JPT1 可負向調節 AKT 介導的 GSK3B 訊號。相關作用包括改變 GSK3B 的抑制性 Ser-9 磷酸化狀態:JPT1 抑制此磷酸化,使 GSK3B 的活性受到的抑制減少,並促進 CTNNB1 在 Ser-33 位點磷酸化,進而促使 CTNNB1 降解。這條作用路徑將 GSK3B 的調控狀態與 CTNNB1 的穩定性連結起來。
在 APC、CTNNB1 與 GSK3B 組成的複合體中,JPT1 相關作用會抑制該複合體的功能,並影響 CTNNB1 與黏著連結中的 CDH1(E-cadherin)之間的交互作用。這些變化與細胞黏附調節相關;來源亦指出 JPT1 參與細胞週期調控,但未進一步提供具體的週期階段或分子步驟。
JPT1 也對 AR 訊號路徑具有抑制作用,其方式是促進受體經蛋白酶體降解。這項作用與其對 GSK3B/CTNNB1 相關調控的描述不同,來源未指出兩者之間的直接因果連結。整體而言,資料支持 JPT1 參與訊號傳遞、細胞黏附及細胞週期調節,但未提供足以延伸至特定生理或疾病結果的資訊。
Promoter 與基因調控
>JPT1 ENST00000409753 GRCh38 chr17:75154412-75155512 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTTCCAACTACCTGAAAGGTGGCTTTGCAAAGAGGAATGTGGTTCAATTATTATGGAAATATTGAGACAA GCAAAGACATCTGCCTTGAGGAAATATGCAAGACATGAGAAGGGCCTGCCCTCTTTTGCCCAAGGCTTTC CTATTATGATCTTGTAAACCATCATTCCTGAATCCTCCAAGTGTGTCTGCATTTGTCGCATGGATAGATT TACCCAGACAGGTGGAAGAGTCATGACTTAAGGGTTATAAACAGCTGCAGAGGCCTGAGCTGCTTCCATA GTCTTGGTAGCAGGGAATGAGTCCATTCCTGGTGCCAGGCATTAACCAGCCTTAGAATAGGCCCCCAAAT AGGAGCGACTGTAATTTTGGTCCAGTACATGCACCACCCATTACAACTAAACAGTAACATTAAAATGTAA GGAATTTCCAGTCCTTTTAAAAGGGATCATCTTGGTGCGCTCTCTGTTGCTGACTCATTGTGCGGCTGCT TTGAGACTATTAGGTTTCTAAATGGGACACACAGTAGGTATTCAACAGATAAATGTCAACTTGTTGCAGT ACTTTTCATCCTTTAAGGAGGATGCCCTTACTATCCCACCATCAGTAAAGCAAATGAGAGAACAGTAACA GTGACAAATCTCCCTTCTGCTTGCCGAGGTTGTAACTCCCCAAGAAAGAGCTTCCCCCTCTGTCAGGTAA CGTTTTACAGTGACAGCCAGCACGACTTCCACCCAGCGCGAGGTAGATTCGCCTTCCGTCCAATCATCGC CGAGATTTTGGGGTGGGGGAGGGGAGAGAGTCCCAAGGCCTTCCCAGTCCAGGAAGGGGGCGGGCTTAGG CTGAGCCGTGGCCGCCACAGCCCATCGTAATGCCGCATGGTGCTTGGCACTCCAGAGAGCCAATAGGAAT GAAAGAATTCATTTGAATCGGCCAATGCCGGCGGGTTAGGGGGCGGGGGTTGAAAACCCTATAAAGGCGT CGATCGGCCGGACAGGCGGCAGCGGCGGCTCCTGCAGCGGTGGTCGGCTGTTGGGTGTGGAGTTTCCCAG CGCCCCTCGGGTCCGACCCTTTGAGCGTTCTGCTCCGGCGCCAGCCTACCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| HN1_1 ↗ | 17:75,154,512 | 負股 | 75,154,502–75,154,561 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR17_847MQR · enhancer · 75151990–75152209 · regulatory
ENSR17_BJWNS · enhancer · 75152724–75153282 · regulatory
ENSR17_934SDR · promoter · 75153283–75153783 · regulatory
ENSR17_C9GCJ · promoter · 75153816–75155165 · regulatory
ENSR17_5MN9J2 · CTCF_binding_site · 75154169–75154190 · regulatory
ENSR17_847MWK · enhancer · 75158482–75158718 · regulatory
ENSR17_BJWPQ · enhancer · 75158958–75159968 · regulatory
· motif · 75152100–75152113 · motif
· motif · 75152100–75152113 · motif
· motif · 75153723–75153738 · motif
· motif · 75153724–75153737 · motif
· motif · 75153877–75153892 · motif
· motif · 75154171–75154187 · motif
· motif · 75154252–75154269 · motif
· motif · 75154379–75154396 · motif
· motif · 75154421–75154437 · motif
· motif · 75154554–75154564 · motif
· motif · 75154677–75154687 · motif
· motif · 75154718–75154728 · motif
· motif · 75154749–75154769 · motif
· motif · 75155032–75155046 · motif
· motif · 75155032–75155046 · motif
· motif · 75155035–75155043 · motif
JPT1 的 mRNA 與蛋白質表現可受 EGF 誘導;雄性激素也會誘導 JPT1。相對地,miR-132 對 JPT1 具有負向調控作用。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:154 aa
JPT1 蛋白質長 154 個胺基酸,屬於 JUPITER 家族。其全長序列皆被註記為無序區域;來源未提供其他結構域或具體功能區域資訊。
蛋白質三維結構
細胞內定位
JPT1 位於細胞核與細胞質;來源未提供其定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
- CASP6P55212 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCKP06307 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HIP1O00291 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LAMP2P13473-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- OTX2P32243-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RANP62826 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SH3GLB1Q9Y371 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
JPT1 與至少包含 APC、CTNNB1 和 GSK3B 的複合體交互作用;其中 GSK3B 為失活形式,即 Ser-9 已磷酸化的狀態。此處描述的是與複合體的交互作用,未提供其他直接結合夥伴資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | JPT1 負向調節 AKT 介導的 GSK3B 訊號,並抑制 GSK3B 的 Ser-9 抑制性磷酸化,促使 CTNNB1 在 Ser-33 磷酸化及降解;此作用會抑制 APC、CTNNB1、GSK3B 複合體功能,並影響 CTNNB1 與黏著連結中 CDH1(E-cadherin)的交互作用。JPT1 亦參與細胞週期和細胞黏附調節,並可藉由促使受體經蛋白酶體降解而抑制 AR 訊號路徑。 | 含實驗來源 | 證據與來源Modulates negatively AKT-mediated GSK3B signaling. Induces CTNNB1 'Ser-33' phosphorylation and degradation through the suppression of the inhibitory 'Ser-9' phosphorylation of GSK3B, which represses the function of the APC:CTNNB1:GSK3B complex and the interaction with CDH1/E-cadherin in adherent junctions. Plays a role in the regulation of cell cycle and cell adhesion. Has an inhibitory role on AR-signaling pathway through the induction of receptor proteasomal degradation PMID 21323578 ↗ · PMID 22155408 ↗ · PMID 25169422 ↗ · PMID 25450365 ↗ |
| 交互作用 | JPT1 與至少由 APC、CTNNB1 和 GSK3B 組成的複合體交互作用;此交互作用涉及 GSK3B 的失活形式,也就是 Ser-9 已磷酸化的 GSK3B。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with the complex composed, at least, of APC, CTNNB1 and GSK3B; the interaction takes place with the inactive form of GSK3B (phosphorylated at 'Ser-9') PMID 25169422 ↗ |
| 細胞定位 | JPT1 的細胞內定位包括細胞核與細胞質。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | EGF 可在 mRNA 與蛋白質層級誘導 JPT1;雄性激素也會誘導 JPT1。miR-132 則對 JPT1 具有負向調控作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Induced by EGF growth factor at mRNA and protein levels. Induced by androgens. Negatively regulated by the microRNA miR-132 PMID 21323578 ↗ · PMID 22155408 ↗ · PMID 25450365 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGCGGCGGCTCCTGCAGCGGTGGTCGGCTGTTGGGTGTGG40AGTTTCCCAGCGCCCCTCGGGTCCGACCCTTTGAGCGTTC80TGCTCCGGCGCCAGCCTACCTCGCTCCTCGGCGCCATGAC120CACAACCACCACCTTCAAGGGAGTCGACCCCAACAGCAGG160AATAGCTCCCGAGTTTTGCGGCCTCCAGGTGGTGGATCCA200ATTTTTCATTAGGTTTTGATGAACCAACAGAACAACCTGT240GAGGAAGAACAAAATGGCCTCTAATATCTTTGGGACACCT280GAAGAAAATCAAGCTTCTTGGGCCAAGTCAGCAGGTGCCA320AGTCTAGTGGTGGCAGGGAAGACTTGGAGTCATCTGGACT360GCAGAGAAGGAACTCCTCTGAAGCAAGCTCCGGAGACTTC400TTAGATCTGAAGGGAGAAGGTGATATTCATGAAAATGTGG440ACACAGACTTGCCAGGCAGCCTGGGGCAGAGTGAAGAGAA480GCCCGTGCCTGCTGCGCCTGTGCCCAGCCCGGTGGCCCCG520GCCCCAGTGCCATCCAGAAGAAATCCCCCTGGCGGCAAGT560CCAGCCTCGTCTTGGGTTAGCTCTGACTGTCCTGAACGCT600GTCGTTCTGTCTGTTTCCTCCATGCTTGTGAACTGCACAA640CTTGAGCCTGACTGTACATCTCTTGGATTTGTTTCATTAA680AAAGAAGCACTTTATGTACTGCTGTCTTTTTTTTTTTTCT720TTTGAAGAACAGGTTTCTCTCTGTCCTTGACTCTTGGGTC760TGTGGGCCATGGCATGAGTGTTTTCTAGTAGTAGATTGGA800GGGAAAGCTTTGTGACACTTAGTACTGTGTTTTTAAGAAG840AAATAATTTGGTTCCAGATGTGTTAGAGGATCTTTTGTAC880TGAGGTTTTTAACACTTTACTTGGGTTTACCAAGCCTCAA920CTGGACAGACCATAAACAGTCCACAGGCACCGTTCCTGCC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。