基因總覽
JMJD8 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 jumonji domain containing 8，其產物名稱為 JmjC domain-containing protein 8。來源將其描述為與 TNF 誘導的 NF-kappa-B 訊號，以及血管新生和細胞代謝調節相關的蛋白質；後兩項關聯涉及與 PKM 的交互作用。蛋白質序列註解包含 N 端訊號序列及位於 C 端的 JmjC 結構域。現有資料未提供更細緻的家族分類或結構功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000609261 ★ | 681,670–684,334 | 9 |
| ENST00000562824 | 681,666–684,363 | 8 |
| ENST00000562111 | 681,666–684,346 | 8 |
| ENST00000880258 | 681,666–684,407 | 9 |
| ENST00000880259 | 681,666–684,353 | 9 |
| ENST00000880260 | 681,666–684,407 | 8 |
| ENST00000880261 | 681,666–684,407 | 9 |
| ENST00000880262 | 681,666–684,407 | 9 |
| ENST00000880263 | 681,666–684,407 | 7 |
| ENST00000917366 | 681,666–684,407 | 9 |
| ENST00000917367 | 681,666–684,407 | 9 |
| ENST00000917368 | 681,666–684,407 | 9 |
顯示 12/22 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
JMJD8 被報告為 TNF 誘導之 NF-kappa-B 訊號的正向調節因子，表示其與該訊號反應的促進有關。現有資料未進一步說明這項調節如何發生，也未提供實驗條件或分子作用細節，因此不能據此推定其直接作用於訊號途徑中的特定成分。
此外，JMJD8 與 PKM 的交互作用和血管新生及細胞代謝調節相關。來源將這些生物學作用與該交互作用並列，但未詳述其分子機制、調節方向或作用條件；因此可確定的是兩者具有報告中的功能關聯，而不宜延伸為未記載的因果機制。
Promoter 與基因調控
>JMJD8 ENST00000609261 GRCh38 chr16:684234-685334 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGCGACGTGCAGATGGCTGTGTCTGTGCTCATCGTCCTGGGTGAACGGGTGCGCAAGGACATCGACGAGC AGACCCAGGTGTGTGGTGGGCGGGGCCTCCCCCCTGCAGCGCCGCCCCTGGCACCCAGATCCTGACTGCC GGGCGCTCCCTCCCCCAGGAGCACTGGTACACTTCCTACATCGACCTGCTGCAGCGCTTCCGCCTCTGGA ACGTGTCCAACGAGGTGGTCAAGCTGAGCACCAGCCGCGCCGTCAGCTGCCTCAACCAGGCCTCCACCAC CCTGCACGTCAACTGCAGCCACTGCAAGCGGCCCATGAGCAGCCGGGGCTGGGTCTGCGACAGGTGGGGC AGTGGGGTCGGGAGGTGGGGCAGGGGCCTGCAGGCAGCGCAGCAGCCCCCGCTGAGGCACCCTCCCTCCC GCCCGCCCCCAGGTGCCACCGCTGCGCCAGCATGTGTGCCGTCTGCCACCACGTAGTCAAGGGTCTCTTC GTGTGGTGCCAGGGCTGCAGCCACGGCGGCCACCTGCAGCACATCATGAAGTGGCTGGAAGGCAGCTCCC ACTGTCCCGCAGGCTGCGGCCACCTCTGCGAGTACTCCTGACGGGGCATCTGCTGGGCTTGCCCGGGCGG CCGCGTGCAGAACCCCGCCTGGTCTTGTGCCCGAGACGGGCGGAGGCTGGAACTTGAGACCTCAATAAAG GAAGTAGAGCCGCTGTCGGCACTGCGTGTCACCCCATAGCGCGGCGGGCTCGCCGTAGGCCCGCGGGGCA GCTGGCGGGCGGGGGCTTTCGGCGGGGTTGTCGCCATGGTAACCGGCGGCGCCCATAGTCGCTCTCGGGG CGGCCTTCCCAGTGCCTCCCGTAGAGGCCTCTTCCGGGGCGGGCCAAAGGAGGTCACTTCCGGGGTCCGT CCCGGTTCCCGGCCGTTGCCACGACGACGAAGCTGCCGGCCAATGGCTGGCGGATGGGCCCAAGGTTCCC GGCGTGCAGCGCGGCTGCCTGAGGGCGGCAGGCTCATGGCGCCGGCGTCGCGGTTGCTCGCGCTCTGGGC GCTGGCGGCTGTGGCTCTACCCGGCTCCGGGGCGGAGGGCGACGGCGGGTG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| JMJD8_1 ↗ | 16:684,332 | 負股 | 684,322–684,381 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR16_999J · promoter · 679009–679509 · regulatory
ENSR16_999M · enhancer · 679510–679774 · regulatory
ENSR16_B5MD · promoter · 679775–680420 · regulatory
ENSR16_999Z · promoter · 680547–681047 · regulatory
ENSR16_56BRC · CTCF_binding_site · 681113–681134 · regulatory
ENSR16_B5N3 · promoter · 684324–684853 · regulatory
ENSR16_56CQW · CTCF_binding_site · 686853–686874 · regulatory
ENSR16_56CTD · CTCF_binding_site · 687389–687410 · regulatory
· motif · 679726–679739 · motif
· motif · 680242–680255 · motif
· motif · 680335–680346 · motif
· motif · 680335–680346 · motif
· motif · 680361–680372 · motif
· motif · 680361–680372 · motif
· motif · 680382–680395 · motif
· motif · 680390–680401 · motif
· motif · 680392–680401 · motif
· motif · 681115–681131 · motif
· motif · 683979–683991 · motif
· motif · 683981–683988 · motif
· motif · 684193–684202 · motif
· motif · 684193–684202 · motif
· motif · 684195–684207 · motif
· motif · 684198–684205 · motif
· motif · 684396–684411 · motif
· motif · 684396–684411 · motif
· motif · 684429–684440 · motif
· motif · 684429–684440 · motif
· motif · 684431–684440 · motif
· motif · 684521–684536 · motif
· motif · 684521–684536 · motif
· motif · 686855–686871 · motif
· motif · 687391–687407 · motif
· motif · 689164–689175 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：264 aa
JmjC domain-containing protein 8 長 264 個胺基酸。序列註解標示第 1 至 23 個胺基酸為訊號序列，JmjC 結構域則位於第 131 至 264 個胺基酸。資料未提供這些區域的進一步功能描述。
蛋白質三維結構
細胞內定位
JMJD8 被記錄位於內質網腔與細胞質。 現有定位資料未說明不同位置出現的條件、定位變化或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
JMJD8 被記錄可形成寡聚體及二聚體；資料未指出這兩種狀態是否互斥或彼此如何關聯。此外，JMJD8 與 PKM 有交互作用，並與血管新生及代謝調節相關；來源未提供更詳細的複合體資訊或作用機制。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | JMJD8 是 TNF 誘導之 NF-kappa-B 訊號的正向調節因子；此外，它透過與 PKM 交互作用，參與血管新生及細胞代謝的調節。資料未說明相關作用的具體機制或條件。 | 含實驗來源 | 證據與來源Functions as a positive regulator of TNF-induced NF-kappa-B signaling. Regulates angiogenesis and cellular metabolism through interaction with PKM PMID 27199445 ↗ · PMID 27671354 ↗ |
| 交互作用 | JMJD8 可形成寡聚體及二聚體，並與 PKM 交互作用；該交互作用與血管新生及代謝調節相關。來源未說明寡聚體與二聚體的關係，也未提供更細節的機制。 | 含實驗來源 | 證據與來源Oligomer. Dimer. Interacts with PKM; regulates angiogenesis and metabolism PMID 27199445 ↗ · PMID 29133832 ↗ |
| 細胞定位 | JMJD8 的定位記錄包括內質網腔與細胞質。資料未指出其在不同位置的條件、定位變化或異構型差異。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GAGGGCGGCAGGCTCATGGCGCCGGCGTCGCGGTTGCTCG40CGCTCTGGGCGCTGGCGGCTGTGGCTCTACCCGGCTCCGG80GGCGGAGGGCGACGGCGGGTGGCGCCCGGGCGGGCCGGGG120GCCGTGGCGGAGGAGGAGCGCTGCACGGTGGAGCGTCGGG160CCGACCTCACCTACGCGGAGTTCGTGCAGCAGTACGCCTT200CGTCAGGCCCGTCATCCTGCAGGGACTCACGGACAACTCG240AGGTTCCGGGCCCTGTGCTCCCGCGACAGGTTGCTGGCTT280CGTTTGGGGACAGAGTGGTCCGGCTGAGCACCGCCAACAC320CTACTCCTACCACAAAGTGGACTTGCCCTTCCAGGAGTAT360GTGGAGCAGCTGCTGCACCCCCAGGACCCCACCTCCCTGG400GCAATGACACCCTGTACTTCTTCGGGGACAACAACTTCAC440CGAGTGGGCCTCTCTCTTTCGGCACTACTCCCCACCCCCA480TTTGGCCTGCTGGGAACCGCTCCAGCTTACAGCTTTGGAA520TCGCAGGAGCTGGCTCGGGGGTGCCCTTCCACTGGCATGG560ACCCGGGTACTCAGAAGTGATCTACGGTCGTAAGCGCTGG600TTCCTTTACCCACCTGAGAAGACGCCAGAGTTCCACCCCA640ACAAGACCACGCTGGCCTGGCTCCGGGACACATACCCAGC680CCTGCCACCGTCTGCACGGCCCCTGGAGTGTACCATCCGG720GCTGGTGAGGTGCTGTACTTCCCCGACCGCTGGTGGCATG760CTACGCTCAACCTTGACACCAGCGTCTTCATCTCCACCTT800CCTCGGCTAGCCAAAACAGCTGGCAGGACTGCCGGTCACA840CACCAGCACGTCCCACCTCGTGCTCACGGATTTTATTACA880CAGATAGTGGCGGCAATGGCCTCAGCCCAGCCCACCCTCA920CCTGCTTTTCCAGCCCACAAAGGGGGACGATCACGGCCCA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。