基因總覽
IRX1 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 iroquois homeobox 1。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 5p15.33。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000302006 ★ | 3,595,832–3,601,403 | 4 |
| ENST00001034165 | 3,595,832–3,601,408 | 4 |
| ENST00001122310 | 3,595,832–3,601,408 | 4 |
| ENST00001133145 | 3,595,832–3,601,408 | 4 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>IRX1 ENST00000302006 GRCh38 chr5:3594832-3595932 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CCGACGAGGCTGAGGATGGAGAGGGGAGACGCAGGGAGAAGAGGGACGCGGGACTTGGACCCAAGAGGCC GCTCCGTTGCCGGTCTGGCGGCGGCGCCGACTCGGGTTCGCGCGTTCCACACAAGTTTCCTGTCTGCCTC TGCACACCTGGTGGACAAACCGGGCGTCCAGGCCACACCGTCTTCCCCCTTCGCGGGGGCGCGGGGGATG TTTCCCTCCGGCTGCCAGGGGGCTTTCTGGGTGAAGAGAAAGCCCCTCCCCCCGCGTCTCCCCCACCCCT CCCTCCGAGAACCCGCGGCGCCGACTGCGCCTGCTTCCCCCGAGCTGGCGACTTCTCCGCGGGATTTGCC CTCGCTCAAAGTTTGCACAATTGAAAGAGCCCGCAGAGCTCGGCCGCTCCCCGCTTCCCCAAGGGCGGCG AGGCCGGTCATTGGCAGACGATCGGTTACTACCCAGTAGGGGCCCACGGGAACCCGCATCTGGAGTCGGG GGTGTCACGCCACGCCGGTTCAGTGGCTCGCGGAGAGCGTCCGGGTGCACTTCTGCCAAAGATGTCCCCT GGAGGCCCCGGCCGCGCGGGACTCGGGGGAGAGGCCGCTCCCCCCTCGCTGTCACCAGCGTCCAGGCCGC CGGCCCCTTCCCCGCTGCCCAAACAGTAGAAAAGCAGGCGCCAAGTTGTTTTTGTTAAAAAGGGGACACA CCTCGGCCGCGAAACTGCAAACCCGGTGTCAGACAGCTGTAAACCCGTGTCGACAGGTTGTCAGACAGCT GCGGGGGCTGGTCGGGAAGGAGCCCACGGCCTCCGGGCCCACACCCCGCCGCCCCGACGCGCGCGCCCAC CGCGAGAGTAGCTGGCCGGGCCGGCACGGGGCACCACGTGCTCGCGGGAGGGGCGGGAGCGGCCGGCGAG GGCGGGCGGGAGGCAGGGAGGGGGCGGGAGGGGAGCCAGGGGCGGGGCCTGCGCTCAAGGGGATGCCAAT CAAAGCATCAACTTCAAATTGTGTCTGAAAGCCCCGCCGCCGAGCGGAGGGCGGCCGCCGCAGTCGGCGC GCGATTGCGGATCCGGGCGCAGCCGGGAGCCGGGCGCCTGCGAGCACCGGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| IRX1_1 ↗ | 5:3,596,094 | 正股 | 3,596,045–3,596,104 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR5_BP8H · enhancer · 3590416–3591135 · regulatory
ENSR5_93FHH · enhancer · 3592407–3592679 · regulatory
ENSR5_CCM2 · enhancer · 3593749–3595682 · regulatory
ENSR5_5SSCB · CTCF_binding_site · 3594510–3594531 · regulatory
ENSR5_84T3T · promoter · 3595683–3595842 · regulatory
ENSR5_5ST93 · CTCF_binding_site · 3599859–3599880 · regulatory
ENSR5_93FKR · promoter · 3600178–3600678 · regulatory
· motif · 3592434–3592443 · motif
· motif · 3592434–3592443 · motif
· motif · 3594512–3594528 · motif
· motif · 3595661–3595677 · motif
· motif · 3595661–3595677 · motif
· motif · 3595704–3595713 · motif
· motif · 3595704–3595713 · motif
· motif · 3595704–3595713 · motif
· motif · 3595704–3595713 · motif
· motif · 3597122–3597132 · motif
· motif · 3597559–3597569 · motif
· motif · 3599656–3599666 · motif
· motif · 3599861–3599877 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：480 aa
IRX1 蛋白長 480 個胺基酸，屬於 TALE/IRO homeobox family。其 homeobox DNA 結合區位於第 125–188 個胺基酸；另有三段被註解為無序區，分別位於第 190–268、第 280–354 與第 401–480 個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源未提供此定位的條件或動態變化資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | IRX1 的定位註解為細胞核；此紀錄未提供定位變化的條件、實驗系統或其他細胞內位置資訊。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GTGTCTGAAAGCCCCGCCGCCGAGCGGAGGGCGGCCGCCG40CAGTCGGCGCGCGATTGCGGATCCGGGCGCAGCCGGGAGC80CGGGCGCCTGCGAGCACCGGGCAGAGGAGCCGCGACCGGC120CTCCATCTCCCGGCCCGCCCGAGCGCGCCCGGCCGGCCGC160CCGCTCCTCCCTAGACCCCTCGCGGCGCCCCCTGCAACCC200CCTCCGGCCGGCCTCCGCCTCCCTCCCCGCGCCTTTAATA240CTCGCCCGCTGCGGCGGTCGCCGAGTCCGCGGACATGTCC280TTCCCGCAGCTGGGCTACCCGCAGTACCTGAGCGCCGCGG320GGCCGGGCGCCTACGGCGGCGAGCGCCCGGGGGTGCTGGC360CGCGGCCGCTGCGGCGGCTGCCGCCGCCTCGTCGGGCCGA400CCGGGGGCCGCGGAGCTGGGCGGCGGGGCAGGCGCGGCTG440CAGTCACCTCGGTGCTGGGCATGTACGCGGCGGCGGGGCC480GTACGCGGGCGCGCCCAACTACAGCGCCTTCCTGCCCTAC520GCCGCGGATCTCAGCCTCTTCTCGCAGATGGGCTCGCAGT560ATGAACTGAAGGACAACCCTGGGGTGCACCCCGCCACCTT600CGCAGCCCACACGGCGCCGGCTTATTACCCCTACGGCCAG640TTCCAATACGGGGACCCCGGGCGGCCCAAGAACGCCACCC680GCGAGAGCACCAGCACGCTCAAGGCCTGGCTCAACGAGCA720CCGCAAGAATCCCTACCCCACCAAGGGCGAGAAGATCATG760CTGGCCATCATCACCAAGATGACCCTCACGCAGGTCTCCA800CCTGGTTCGCCAACGCGCGCCGGCGCCTCAAGAAGGAGAA840CAAGGTGACATGGGGAGCGCGCAGCAAGGACCAGGAAGAT880GGAGCGCTCTTCGGCAGCGACACCGAGGGCGACCCGGAGA920AGGCCGAGGACGACGAGGAGATCGACCTGGAAAGCATCGA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。