基因總覽
INO80B 基因為蛋白質編碼基因，產物名稱為 INO80 complex subunit B。現有資料將此蛋白質描述為染色質重塑 INO80 complex 的核心成分之一；該複合體與轉錄調控、DNA 複製，以及可能的 DNA 修復有關。這些資料提供了 INO80B 的複合體角色與相關生物過程，但未進一步說明其完整分子機制或在不同細胞情境中的作用差異。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000233331 ★ | 74,455,087–74,457,944 | 5 |
| ENST00000409917 | 74,455,078–74,457,662 | 5 |
| ENST00001117431 | 74,455,078–74,457,032 | 5 |
| ENST00001140126 | 74,455,078–74,457,958 | 5 |
| ENST00000431187 | 74,455,087–74,457,367 | 5 |
| ENST00000409493 | 74,455,116–74,457,400 | 5 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
INO80B 被提出為染色質重塑 INO80 complex 的核心成分。此複合體涉及轉錄調控與 DNA 複製，也可能參與 DNA 修復；其中 DNA 修復的關聯帶有推測性，現有資料未提供其作用步驟或具體底物。因此，INO80B 的功能描述主要定位於複合體層級，不能據此將上述過程中的特定分子作用直接歸於 INO80B 本身。
另有資料指出，INO80B 可誘導細胞生長停滯及細胞週期停滯，停滯發生於 G1 期。這項觀察將 INO80B 與細胞增殖狀態的調節相連，但來源未說明促成停滯的分子途徑、實驗條件或效應的細胞類型，也未指出此現象是否由其作為 INO80 complex 成分所介導。
合併來看，資料支持兩類不同層次的功能關聯：一是 INO80B 作為染色質重塑複合體的成分，該複合體涉及基因轉錄調節、DNA 複製及可能的 DNA 修復；二是細胞生長與 G1 期停滯的觀察。現有資訊不足以判定這兩類作用之間的因果關係，也未詳述其生物學條件或相互依存性。
Promoter 與基因調控
>INO80B ENST00000233331 GRCh38 chr2:74454087-74455187 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCGTGCCATCACGCCGGCTAAT TTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCGTATTAGCCAGGATGGGAAATTTACT TTTCTTATTTCGTGTATCAGCACATACAAACCTACCTGTTTTTATGTCTTTTTTAAAATGAGGTAAAATA TACACGTTTTATACAAAATTCAAAAGGCACAAGAGGGTATAATCATAAAAAAATAGGTCGCCATCCACCC TTGTTCTCTAGATGCTCATCAGCAAATGACTCTTACCAATTTCCTAGATAGCCTTCTGGGGCGCCTCATT TCTTTTCCAAGCTGCTTAACATCCCACTGTATGGATACACCAATTCATCAGGACACTTAGATTGTTTAAA TTCTGTGTCAATCTCATTAATTACTTACAACTCAACTTTTCTTAGCAATATGGTGTTCCGCATTGTACAG CTGCACCGTAATTCATTTATTCATTTCCCTACTTATGAAAATTGAAGTTTAAATACCTAAACTGCATCTG CTCTTAGGGCACTCGTGCTGTTTAACCATTTCGGCCATTTTGTCATCAATATAGTTTATGTATTCCTCCA CCCAACTGTGAGTTCCTCAAGGACAGGGGCGGTGTTCATATTCATCTTTGCATCCTCTTAGACTAGCTTC CCGCACTTGGTCTAGTGTATACATTCACCAAACTTGTGTTCAATAATTGACTCATCCGCGCTGAGTTCTG AAAGCTAGCGTGGGGAGGCGGAGCCAGGGGAAAGCCCTGCCCATTTGGGCTGTCCCGACCTCAGAGGGAC CGGAACGTTCGTTGGAAGGATCCTCGTTTCTCAGGGACGATTTTGGACGCGAAGCGTGCCCCGCACAAGG ATGGTTGCCATGAACCGGAAGTAACTGGTTGTTTTGCTGGCTCCAGTTTTTCCGCGGGGCGGAAAAGGCG TGTCTGCGTGTGTCCCAACCATTTCTAGTCCCCTTTCCTCGCAGGACCTCATGAGTAAGCTGTGGCGGCG TGGGAGCACCTCTGGGGCTATGGAGGCCCCTGAGCCGGGTAAGCGCGAATA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| INO80B_1 ↗ | 2:74,455,093 | 正股 | 74,455,044–74,455,103 |
| INO80B_2 ↗ | 2:74,455,577 | 正股 | 74,455,528–74,455,587 |
| INO80B_3 ↗ | 2:74,455,819 | 正股 | 74,455,770–74,455,829 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR2_BJQXJ · enhancer · 74452560–74453157 · regulatory
ENSR2_BJQXS · promoter · 74454597–74455112 · regulatory
ENSR2_5MHT26 · CTCF_binding_site · 74457169–74457190 · regulatory
ENSR2_5MHT3H · CTCF_binding_site · 74457461–74457482 · regulatory
ENSR2_BJQZB · promoter · 74457910–74458479 · regulatory
· motif · 74452602–74452615 · motif
· motif · 74454833–74454841 · motif
· motif · 74454979–74454995 · motif
· motif · 74454979–74454995 · motif
· motif · 74455008–74455019 · motif
· motif · 74455008–74455019 · motif
· motif · 74455010–74455019 · motif
· motif · 74455287–74455302 · motif
· motif · 74455287–74455302 · motif
· motif · 74457171–74457187 · motif
· motif · 74457450–74457461 · motif
· motif · 74457463–74457479 · motif
· motif · 74457583–74457598 · motif
· motif · 74457664–74457677 · motif
· motif · 74457933–74457942 · motif
· motif · 74457963–74457973 · motif
· motif · 74458160–74458168 · motif
· motif · 74458160–74458175 · motif
· motif · 74458279–74458292 · motif
· motif · 74458518–74458528 · motif
· motif · 74458720–74458740 · motif
· motif · 74459645–74459658 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：356 aa
INO80 complex subunit B 長 356 個胺基酸。其第 305–336 位含有 HIT-type 鋅指；另有數段被註記為無序區，分別位於第 1–71、124–150、246–269 及 286–310 位。資料未提供這些區域的具體功能說明。
蛋白質三維結構
細胞內定位
INO80 complex subunit B 的定位資料列於細胞核及核仁；來源未描述不同條件下的定位變化或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 62 個夥伴
- ABI2Q9NYB9-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BANPQ8N9N5-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BLZF1Q9H2G9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BOLLQ8N9W6-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CARD9Q9H257-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CAVIN1Q6NZI2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC85BQ15834 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CDR2Q01850 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CDR2LQ86X02 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CEP70Q8NHQ1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CSNK2BP67870 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CYSRT1A8MQ03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DPPA4Q7L190 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DVL3Q92997 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FLACC1Q96Q35-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GOLGA6L9A6NEM1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPRASP3Q6PI77 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HMBOX1Q6NT76 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HMGXB4Q9UGU5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HOXA1P49639 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- HSF2BPO75031 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IGFBP2P18065 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- KANK2Q63ZY3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KCTD7Q96MP8-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT34O76011 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
INO80B 是染色質重塑 INO80 complex 的組成成分，並屬於與 INO80 的 helicase ATP-binding 與 helicase C-terminal domain 相關的複合體模組。資料另指出 INO80B 與 RP9 互作，但未說明此互作是否為該複合體的一部分。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | INO80B 可誘導細胞生長停滯及細胞週期停滯，所述的細胞週期停滯發生在 G1 期。資料未提供誘發此效應的條件或分子機制。 | 含實驗來源 | |
| 功能 | INO80B 被提出為染色質重塑 INO80 complex 的核心成分；該複合體涉及轉錄調控與 DNA 複製，並可能參與 DNA 修復。DNA 修復的關聯具有推測性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Proposed core component of the chromatin remodeling INO80 complex which is involved in transcriptional regulation, DNA replication and probably DNA repair PMID 15556297 ↗ |
| 交互作用 | INO80B 是染色質重塑 INO80 complex 的組成成分，並位於與 INO80 的 helicase ATP-binding 及 helicase C-terminal domain 相關的複合體模組中。資料也指出 INO80B 與 RP9 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the chromatin remodeling INO80 complex; specifically part of a complex module associated with the helicase ATP-binding and the helicase C-terminal domain of INO80. Interacts with RP9 PMID 15556297 ↗ · PMID 16230350 ↗ · PMID 18922472 ↗ · PMID 21303910 ↗ |
| 細胞定位 | INO80B 的定位資料包括細胞核與核仁；來源未提供定位變化的條件或異構型差異。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ATTTCTAGTCCCCTTTCCTCGCAGGACCTCATGAGTAAGC40TGTGGCGGCGTGGGAGCACCTCTGGGGCTATGGAGGCCCC80TGAGCCGGGAGAAGCCCTGGAGTTGAGCCTGGCGGGTGCC120CATGGCCATGGAGTGCACAAGAAAAAACACAAGAAGCACA160AGAAGAAACACAAGAAGAAACACCATCAGGAAGAAGACGC200CGGGCCCACGCAGCCGTCCCCTGCCAAGCCTCAGCTCAAA240CTCAAAATCAAGCTTGGGGGACAAGTCCTGGGGACCAAGA280GTGTTCCTACCTTCACTGTGATCCCAGAGGGGCCTCGCTC320ACCCTCTCCCCTTATGGTTGTGGATAATGAAGAGGAACCT360ATGGAAGGAGTCCCCCTTGAGCAGTACCGTGCCTGGCTGG400ATGAAGACAGTAATCTCTCTCCCTCTCCACTTCGGGACCT440ATCAGGAGGGTTAGGGGGTCAGGAGGAAGAGGAGGAACAG480AGGTGGCTGGATGCCCTGGAGAAGGGGGAGCTGGATGACA520ATGGAGACCTCAAGAAGGAGATCAATGAGCGGCTGCTTAC560TGCTCGACAGCGAGCTCTGCTCCAGAAGGCGCGGAGTCAA600CCTTCCCCTATGCTGCCGCTGCCTGTAGCTGAGGGCTGCC640CACCTCCCGCCCTCACAGAGGAGATGCTGCTGAAGCGCGA680GGAGCGGGCGCGGAAGCGGCGGCTCCAGGCGGCGCGGCGG720GCAGAAGAGCACAAGAACCAGACTATCGAGCGCCTCACCA760AGACTGCGGCGACCAGTGGGCGGGGAGGCCGGGGGGGCGC800ACGGGGCGAGCGGCGGGGAGGGCGGGCTGCGGCTCCGGCC840CCCATGGTGCGCTACTGCAGCGGAGCACAGGGTTCCACCC880TTTCCTTCCCACCTGGCGTCCCCGCCCCCACGGCAGTGTC920TCAGCGGCCATCCCCCTCAGGCCCGCCGCCGCGCTGCTCT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。