基因總覽
IL25 基因是蛋白質編碼基因,其產物 interleukin 25 屬於 IL-17 family。這種細胞激素可由嗜酸性球、T-helper type 2(Th2)細胞及上皮細胞等多種細胞產生,主要角色是調節細胞激素生成,參與適應性免疫反應的調控。IL25 的作用可促進局部或全身性的 T-helper type 2 反應;其細胞激素訊號由受體介導。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000397242 ★ | 23,372,809–23,376,403 | 3 |
| ENST00000329715 | 23,372,861–23,376,403 | 2 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
IL25 是由嗜酸性球、T-helper type 2(Th2)細胞或上皮細胞等多種細胞產生的細胞激素,參與適應性免疫反應的調節,作用之一是調控細胞激素生成。它可在局部或全身促進並增強 Th2 反應,因而影響與此類免疫反應相關的細胞激素分泌。
IL25 透過由 IL17RA 和 IL17RB 組成的受體傳遞訊號;此受體組成的描述屬於相似性推論。訊號傳遞會刺激 JAK2-STAT5A pathway,並促進 IL4、IL9 與 IL13 等第二型相關細胞激素的分泌。這些作用將 IL25 的受體訊號與 Th2 反應中的細胞激素產生連結起來。
在嗜酸性球中,IL25 也會促使 IL8 與 IL6 釋出;此作用涉及 MAPK 與 NF-kappa-B pathways 的共同活化。這項結果指出,IL25 對細胞激素釋放的影響不限於促進第二型相關細胞激素,也包括嗜酸性球的 IL8、IL6 釋出。
此外,IL25 可透過促進 IL4、IL5 與 IL13 的產生,抑制 T-helper(Th17)細胞分化。來源所述的這些作用涵蓋 Th2 反應增強、細胞激素分泌調節,以及 Th17 分化受抑;其對免疫反應的影響與相關細胞激素的生成相連。
Promoter 與基因調控
>IL25 ENST00000397242 GRCh38 chr14:23371809-23372909 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCAATAGGCAAGCATGAAGAGAAGGACCTGGGGGGAAGGACACACTGGCCCACTCTCAGCACAGTGTCTC CCAAGCAGGCTGGACCCGGCTGACCTGTGTCTTTGGGGTCAAGCCCAACTGTAAGCCTTTCTGGGGCACA CATACACCCTCCTGGCTAACAGTGGCCCATGTTTCTGGACCTGCTGAGGCTGAGTGGGCTCACTTCATGG CCTGAAAGCAGTAGCTGACCCTGTCATGGGCTTGGTCCCCAAGGCTCTGTGAATGAGAGCAGGTTGGTTC CTGGAACTGAGACCTCCTTCCTGTTGGGTCTTAGGTGAGGCTGTTTCAGTTTCCCTCCTCTTCCTTGCTT CACCTTCTCATTTGTGCAATGGGGACACTCACCCACAGCTTCTTCCATCAGACCTTGCCCATCCAGCCAA CAAACTTAGGAAGTCAGGGTCTTCCAGCAGCCCTGTGAGGGTAGGCTTGTATCCCCGGTGGGGGGCAGTG ACTGGCGAGGGCAAGGGGGAGTTAGGGAGTGGGTCATGGACAATGGGGGAGAAGTCATAGCTGATGGGGG TCATAGAATTTTGGGGTCATTGAAAATGTGGAAGAGGTCAGAGAACAAAGGGGATGGGAGTCAAAGGATG TCTAAGGGAAAGGAAATAATCACGAAGGTGGATGATCAGAGGGACACCTGGGAAGAGGGGAATGGTGAAA CCAGACCCTGGATGGGGGGAGCAGGGATCATGGAAACGAGGCCTCTTGAAGGGAGGCCACAAGACATTTC CTAATTTTGGCTACCAAACCAACCAGGGAAATCCCGCTAATGCCAGTTCACAAGAATGCAGAACAGCAGA CTGTTATTGCTTTGACCCCATGGCCAGAAAAATTCAAAGAGCAAAGTTTACCCAATCAGCTACCAGGCAT ATAATGATGGTCATCACAACTTCCATGAGTATTGCATTTTAAGCAGCCTTTGGAAATACTTTCAGAGTTT TTTTGGTTTTGTTTTTTAACCTCAAGTCACTCCCTAAAAAGACAGTGGAAATAAATTTGAATAAACAAAA CAGGCTTGCTGAAAATAAAATCAGGACTCCTAACCTGCTCCAGTCAGCCTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR14_57HG9M · CTCF_binding_site · 23376294–23376315 · regulatory
ENSR14_9C9J4 · promoter · 23376467–23376818 · regulatory
ENSR14_57HGBM · CTCF_binding_site · 23376511–23376532 · regulatory
ENSR14_8NK39 · enhancer · 23376819–23376954 · regulatory
ENSR14_9C9J7 · promoter · 23376955–23377262 · regulatory
· motif · 23369216–23369230 · motif
· motif · 23371283–23371297 · motif
· motif · 23372129–23372143 · motif
· motif · 23376296–23376312 · motif
· motif · 23376513–23376529 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:177 aa
Interleukin 25 長 177 個胺基酸,屬於 IL-17 family。蛋白質序列第 1–32 位標註為訊號序列;第 58–81 位則標註為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Interleukin 25 的定位註記為分泌型。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- IL17RBQ9NRM6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | IL25 是由嗜酸性球、T-helper type 2(Th2)細胞及上皮細胞等多種細胞產生的細胞激素,藉由調節細胞激素生成參與適應性免疫反應,並可在局部或全身促進 Th2 反應。它透過由 IL17RA 與 IL17RB 組成的受體傳遞訊號(此受體組成為相似性推論),刺激 JAK2-STAT5A pathway,促進 IL4、IL9、IL13 分泌;也會透過 MAPK 與 NF-kappa-B pathways 共同活化,促使嗜酸性球釋出 IL8 與 IL6。此外,IL25 可藉由促進 IL4、IL5、IL13 生成,抑制 Th17 細胞分化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytokine produced by various cells such as eosinophils, T-helper type 2 (Th2) cells or epithelial cells that plays a role in internal safety of adaptive immune responses by regulating cytokine production. Promotes and augments T-helper type 2 responses locally or systemically. Exerts its activity via its receptor composed of IL17RA and IL17RB for signal transduction (By similarity). In turn, stimulates the JAK2-STAT5A pathway and promotes the secretion of type-2 associated cytokines including IL4, IL9 and IL13. Also induces the release of IL8, and IL6 from eosinophils through the combined activation of MAPK and NF-kappa-B pathways. Inhibits the differentiation of T-helper (Th17) cells via the production of IL4, IL5 and IL13 PMID 11754819 ↗ · PMID 15860795 ↗ · PMID 25821217 ↗ |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
CTCAAGTCACTCCCTAAAAAGACAGTGGAAATAAATTTGA40ATAAACAAAACAGGCTTGCTGAAAATAAAATCAGGACTCC80TAACCTGCTCCAGTCAGCCTGCTTCCACGAGGCCTGTCAG120TCAGTGCCCCACTTGTGACTGAGTGTGCAGTGCCCAGCAT160GTACCAGGTGGTTGCATTCTTGGCAATGGTCATGGGAACC200CACACCTACAGCCACTGGCCCAGCTGCTGCCCCAGCAAAG240GGCAGGACACCTCTGAGGAGCTGCTGAGGTGGAGCACTGT280GCCTGTGCCTCCCCTAGAGCCTGCTAGGCCCAACCGCCAC320CCAGAGTCCTGTAGGGCCAGTGAAGATGGACCCCTCAACA360GCAGGGCCATCTCCCCCTGGAGATATGAGTTGGACAGAGA400CTTGAACCGGCTCCCCCAGGACCTGTACCACGCCCGTTGC440CTGTGCCCGCACTGCGTCAGCCTACAGACAGGCTCCCACA480TGGACCCCCGGGGCAACTCGGAGCTGCTCTACCACAACCA520GACTGTCTTCTACCGGCGGCCATGCCATGGCGAGAAGGGC560ACCCACAAGGGCTACTGCCTGGAGCGCAGGCTGTACCGTG600TTTCCTTAGCTTGTGTGTGTGTGCGGCCCCGTGTGATGGG640CTAGCCGGACCTGCTGGAGGCTGGTCCCTTTTTGGGAAAC680CTGGAGCCAGGTGTACAACCACTTGCCATGAAGGGCCAGG720ATGCCCAGATGCTTGGCCCCTGTGAAGTGCTGTCTGGAGC760AGCAGGATCCCGGGACAGGATGGGGGGCTTTGGGGAAAGC800CTGCACTTCTGCACATTTTGAAAAGAGCAGCTGCTGCTTA840GGGCCGCCGGAAGCTGGTGTCCTGTCATTTTCTCTCAGGA880AAGGTTTTCAAAGTTCTGCCCATTTCTGGAGGCCACCACT920CCTGTCTCTTCCTCTTTTCCCATCCCCTGCTACCCTGGCC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。