基因總覽
IL22RA1 是蛋白質編碼基因,其產物 interleukin 22 receptor subunit alpha 1 屬於 type II cytokine receptor family。這是一種單次穿膜的細胞膜蛋白,具有細胞外區段與細胞質區段;其細胞外部分包含兩個 Fibronectin type-III 結構域。作為受體亞基,IL22RA1 可與其他受體亞基形成不同組合,構成辨識 IL20、IL22 或 IL24 的受體。這些組合使其能參與多種細胞激素受體功能;具體訊號與生物學作用依配對的受體亞基及細胞激素而異。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000270800 ★ | 24,119,771–24,143,140 | 7 |
| ENST00000873330 | 24,119,771–24,143,301 | 7 |
| ENST00000873331 | 24,119,771–24,143,301 | 5 |
| ENST00000873332 | 24,119,771–24,143,301 | 7 |
| ENST00001140363 | 24,119,771–24,143,301 | 7 |
| ENST00001006277 | 24,122,379–24,143,301 | 7 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
IL22RA1 是 IL20、IL22 與 IL24 受體的組成部分。對 IL22 而言,IL22RA1 與 IL10RB 形成受體複合體,藉此使 IL22 訊號可經由 JAK/STAT 路徑傳遞。IL22 也會引發 MAPK1/MAPK3 與 Akt kinase 路徑的活化,顯示其受體訊號可涉及多條細胞內路徑。
IL22RA1 也能與 IL20RB 組成辨識 IL20 與 IL24 的受體之一。這個受體組合同樣透過 STAT 活化傳遞訊號,與 IL22RA1 和 IL10RB 所組成的 IL22 受體有所區別。因而,IL22RA1 的作用取決於其搭配的受體亞基及所作用的細胞激素。
在 IL24 相關作用中,IL22RA1 介導 IL24 的抗血管新生活性,也參與 IL24 對內皮細胞管狀結構形成與分化的抑制作用。這些結果指出,IL22RA1 參與的訊號不僅涉及細胞內路徑活化,也與 IL24 對內皮細胞相關過程的抑制作用相連。
Promoter 與基因調控
>IL22RA1 ENST00000270800 GRCh38 chr1:24143040-24144140 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCCCATTACACCCAACCCGTTGGCAGGATCCCTGCTAAAATTTCGCTTGCCTTTGTGTGCTTGGGGCCAG GCAAACTCTCCCCAGGGGCAGGACCCTCCAATCGTGTCCACCCTGACCAGAGTCCAGGCCCCAGGGCCCT TCTACCTTCTCCAGGCCCTGCAGGAAGGAGAAAACCATTTCCTAAACACCTGTCCCTTCATTCACACGAA GCTCATGTGCAGATCCTGCCCTACGTGGCAAAATGATGGGAGAGCAGCCTGAATCTTCATCGTCCCGAAC CAAAGCCCCATTCATGAAGTTCAGCCCCATCTCTAGCACAGCAGAAAGAATCACTGAAGTTTGAGTTCCA TTTTTTTTCTAAACTTTTGCAGATCCTAGACCCAAAGGCTCAAGGTAAGAGCGGCTGGGCTTCCTCACCC CCAACGGCCTCTCTAGGGGAGAGCTGTTCCCAAGCCCACCCCAAGCGTGGGGACCTGCCTTGATATGGAG GATCAAGGAGGAGCATCGGGTGCCCTCAATCTCCTCCTGCCAGAAAAGCAAAGGAGTCACAGCTTTTCCT TTGCTGCAAGAAACATTCTGGGACCTTTTTTTTCCCCCTCTGTTGTCCAGTTATTTTCATCAGGGTAAAT CCCCTAGGAATAGAATTATTAAAGCAAAAGATATGTATGTGGTGTAGGCTTTTGATCCACAGTGCCAAAT TGCTTTTTGATAAGGCTGCATATCGTGGATTATTCTTGCCTTTTCTGCCCCTCAGCTCCTTGATAAACCA CTTGGGATGAATCAGCCACCGGACCAGATAAACAAGCCAGCCTGTTACTATTGCTGTTTTCTGCAAGTCG GAAGGGAACTCCCTTAGATCCCGCCCAGAACCTGGAATTCCAGAGCACACAGGGCCAGGACACCTTTGTA CCCCTGCTCCCCACCGGCACAGGTCCCACCCACCCCCTTCTCCCCGCCCCATGCCCGGGTGGAGCCAGCT GCCAGGGCGCCAAGACTCCCAGCCCTCTCTCTGTGCACGGCAGAGTAGAGGCCAAGGGAGGGCTCTGTGC CAGCCCCGATGAGGACGCTGCTGACCATCTTGACTGTGGGATCCCTGGCTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| IL22RA1_1 ↗ | 1:24,143,119 | 負股 | 24,143,109–24,143,168 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
在角質形成細胞中,IL22RA1 的調控與 IFNG(IFN-gamma)相關。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:574 aa
interleukin 22 receptor subunit alpha 1 長 574 個胺基酸,N 端含訊號肽,並具有細胞外區、單次穿膜螺旋及細胞質區。細胞外區含兩個 Fibronectin type-III 結構域;細胞質區另有數段被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
IL22RA1 是單次穿膜的第一型膜蛋白,定位於細胞膜。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- IL10RBQ08334 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- IL22Q9GZX6 · UniProt INTERACTION · 9 experiments · 2 筆來源紀錄
- JPH3Q8WXH2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
IL22RA1 分別與 IL10RB、IL20RB 形成異源二聚體。IL22 與 IL22RA1、IL10RB 組成的異源二聚體結合,較其單獨與 IL22RA1 結合更強。另有 FBXW12 與 IL22RA1 的交互作用,此交互作用會促進 IL22RA1 泛素化。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | IL22RA1 是 IL20、IL22 與 IL24 受體的組成部分;與 IL10RB 組成的 IL22 受體可經 JAK/STAT 傳遞訊號,IL22 也會活化 MAPK1/MAPK3 與 Akt 路徑。與 IL20RB 組成的受體可透過 STAT 活化傳訊;此外,IL22RA1 介導 IL24 的抗血管新生活性及其對內皮細胞管狀結構形成與分化的抑制作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the receptor for IL20, IL22 and IL24. Component of IL22 receptor formed by IL22RA1 and IL10RB enabling IL22 signaling via JAK/STAT pathways. IL22 also induces activation of MAPK1/MAPK3 and Akt kinases pathways. Component of one of the receptor for IL20 and IL24 formed by IL22RA1 and IL20RB also signaling through STATs activation. Mediates IL24 antiangiogenic activity as well as IL24 inhibitory effect on endothelial cell tube formation and differentiation PMID 11035029 ↗ · PMID 11564763 ↗ · PMID 11706020 ↗ · PMID 12351624 ↗ · PMID 12941841 ↗ · PMID 17204547 ↗ |
| 交互作用 | IL22RA1 可分別與 IL10RB 及 IL20RB 形成異源二聚體;IL22 與含 IL22RA1、IL10RB 的異源二聚體結合,強於單獨與 IL22RA1 結合。IL22RA1 也與 FBXW12 交互作用,而此交互作用會促進 IL22RA1 泛素化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Heterodimer with IL10RB and with IL20RB. IL22 binding to heterodimer is greater than binding to IL22RA1 alone. Interacts with FBXW12; the interaction promotes ubiquitination of IL22RA1 PMID 11035029 ↗ · PMID 15120653 ↗ · PMID 18675809 ↗ · PMID 26171402 ↗ |
| 細胞定位 | IL22RA1 是單次穿膜的第一型膜蛋白,定位於細胞膜。 | 推論支持 | |
| 調控 | 在角質形成細胞中,IL22RA1 的調控與 IFNG(IFN-gamma)相關。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGCCCTCTCTCTGTGCACGGCAGAGTAGAGGCCAAGGGAG40GGCTCTGTGCCAGCCCCGATGAGGACGCTGCTGACCATCT80TGACTGTGGGATCCCTGGCTGCTCACGCCCCTGAGGACCC120CTCGGATCTGCTCCAGCACGTGAAATTCCAGTCCAGCAAC160TTTGAAAACATCCTGACGTGGGACAGCGGGCCGGAGGGCA200CCCCAGACACGGTCTACAGCATCGAGTATAAGACGTACGG240AGAGAGGGACTGGGTGGCAAAGAAGGGCTGTCAGCGGATC280ACCCGGAAGTCCTGCAACCTGACGGTGGAGACGGGCAACC320TCACGGAGCTCTACTATGCCAGGGTCACCGCTGTCAGTGC360GGGAGGCCGGTCAGCCACCAAGATGACTGACAGGTTCAGC400TCTCTGCAGCACACTACCCTCAAGCCACCTGATGTGACCT440GTATCTCCAAAGTGAGATCGATTCAGATGATTGTTCATCC480TACCCCCACGCCAATCCGTGCAGGCGATGGCCACCGGCTA520ACCCTGGAAGACATCTTCCATGACCTGTTCTACCACTTAG560AGCTCCAGGTCAACCGCACCTACCAAATGCACCTTGGAGG600GAAGCAGAGAGAATATGAGTTCTTCGGCCTGACCCCTGAC640ACAGAGTTCCTTGGCACCATCATGATTTGCGTTCCCACCT680GGGCCAAGGAGAGTGCCCCCTACATGTGCCGAGTGAAGAC720ACTGCCAGACCGGACATGGACCTACTCCTTCTCCGGAGCC760TTCCTGTTCTCCATGGGCTTCCTCGTCGCAGTACTCTGCT800ACCTGAGCTACAGATATGTCACCAAGCCGCCTGCACCTCC840CAACTCCCTGAACGTCCAGCGAGTCCTGACTTTCCAGCCG880CTGCGCTTCATCCAGGAGCACGTCCTGATCCCTGTCTTTG920ACCTCAGCGGCCCCAGCAGTCTGGCCCAGCCTGTCCAGTA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。