基因總覽
IGF2-AS 的正式名稱為 IGF2 antisense RNA，屬於非編碼 RNA 基因。它以與 IGF2 基因相反方向的方式轉錄，具有基因印記，並由父源等位基因表現。此基因可產生多種轉錄本變異型，這些變異型來自選擇性剪接。資料指出，IGF2-AS 被認為不編碼蛋白質；對可能蛋白質產物的保守性與翻譯後果，來源僅提供推論。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000381361 ★ | 2,140,517–2,148,666 | 3 |
| ENST00000445504 | 2,140,501–2,148,339 | 3 |
| ENST00000381363 | 2,140,644–2,147,807 | 2 |
顯示 3/3 個RNA轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
IGF2-AS 的轉錄本在腫瘤中有表現，並可能具有抑制細胞生長的作用。不過，這項功能描述屬於可能性，來源未提供足以將其表述為確立作用的細節。
此基因被認為是非編碼 RNA。來源提出的理由是，假定的蛋白質產物並不保守；此外，若發生翻譯，預測會觸發無義介導的 mRNA 降解（NMD）。因此，蛋白質編碼及其翻譯後果仍應視為推論，而非已證實的產物或機制。
Promoter 與基因調控
>IGF2-AS ENST00000381361 GRCh38 chr11:2139517-2140617 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCCCCCGCAACCCGAGCCAAGAGCGGGGCGGGGGGTGCGGGCTGGGGGCCCTGGGGCCCCGGGGGGGGGG CGGCGGTCGCAGGGGCTGGGGGGTGCGCGGGGGCGAGGCTGGGTGGGGGGCAGGGAGCCGCAGAGCGCCA AGGCCATGCTGAATGCCCGTTCTAGAGAATTCAGGGGCCCCATCCCGGGTTTCTGGGGTGCCCGGGCGGC CTGTGCTCGTGAGCTGGGGTCTCCGGGCAGGCAGGGGCAGGCGGGCTCCCAGCGCCCCACCAGGAGGCTG CACTGCGGGTGCGCCCCGTCTGAGTGCAGATGCAGGTGGCTTGGGGCTGAGTCGGGGGGTCCTTGCTGGT TGTTGCGGCTGAGGGGGCCCCTGGGCTCGGGCGGGGCGCGCAGCCGCCACCTGCCCCAGCAGGAGGAGCC GGCCACGCGGCGCTTGGAGCCTCAGCCAGATCCCGAGCGCCCCCCGGTGCCGCGCCGGAGCCCCGGAGCC CCCGCCAGGTGCGGGACGCGCGGAAGGCCGGCTGCGCCGGGCCGAATCTGGGCCAGGCTTGGAGCCTACG GAGGCTCCGGCCGCCAGAGGAGAGAGGATCAGGGCGGGAAACACAGCTCAAATCCTACCTGCATGGCCGA GCTCACCGGGGTGCGTCTAAGTAGCTCGCCTTTGCGGCCCACCCAAAATATCTGGATAATGGTTACCCCG TCCTCAGTGCGTTGGACTTGCATAGACGCGAGTTCGGTCTCGGGGGCCACCACGATAATTTGGGGGTCTG GGGAAACCATCTCCTGGAGAGTTTGAACGATGTAAGAAAGCACTGTGATTTTTACCAAGTCAAAAACCAC GCACAAAATCCCGCACCCCGCCAGCCCCCCGCCGCCTAAGCCTAGCCAAGGGGAAGGGGCCGCCGGCGGA ATCTCGCGCCCCCCTGGCCCCCCTCGCCCCCCTCGCTCCGCCATCAATCACTTCGCCCGCGCTCCGCGCG CGCCTCCCGGCGGAGTCCTAGGCCCGCGGGCTAGAGGCACTTTACCGCCCGGCGGGAGCGCCTCTCCTCC GCGTCCCTCGCCCCAGCCCCCTGCCCGCCCCACTTTGGGACCCTCCAGCCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| IGF2-AS_1 ↗ | 11:2,140,494 | 正股 | 2,140,445–2,140,504 |
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_BFG5 · enhancer · 2136305–2137276 · regulatory
ENSR11_BFG8 · promoter · 2137277–2137795 · regulatory
ENSR11_83NSQ · enhancer · 2138796–2138963 · regulatory
ENSR11_BFGJ · promoter · 2138964–2139879 · regulatory
ENSR11_5HKXB · CTCF_binding_site · 2139970–2139991 · regulatory
ENSR11_9SX9 · promoter · 2140027–2140527 · regulatory
ENSR11_5HL2P · CTCF_binding_site · 2140493–2140514 · regulatory
ENSR11_9SXF · enhancer · 2140528–2141005 · regulatory
ENSR11_9SXK · promoter · 2141006–2141396 · regulatory
ENSR11_BFH2 · enhancer · 2142368–2143255 · regulatory
ENSR11_5HLK4 · CTCF_binding_site · 2143595–2143616 · regulatory
ENSR11_BFH7 · enhancer · 2143665–2144556 · regulatory
· motif · 2139972–2139988 · motif
· motif · 2140495–2140511 · motif
· motif · 2143597–2143613 · motif
RNA 轉錄本與序列
IGF2-AS 依 HGNC／Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000381361 ★ | lncRNA | 2,063 nt | 3 |
| ENST00000445504 | lncRNA | 1,641 nt | 3 |
| ENST00000381363 | lncRNA | 1,867 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | IGF2-AS 與 IGF2 基因反義轉錄，具有基因印記並由父源等位基因表現。它被認為是非編碼 RNA，因為假定的蛋白質產物不保守，且預測其翻譯會觸發無義介導的 mRNA 降解。此基因的轉錄本在腫瘤中產生，可能抑制細胞生長；選擇性剪接則形成多種轉錄本變異型。 | 推論支持 | 證據與來源This gene is expressed in antisense to the insulin-like growth factor 2 (IGF2) gene and is imprinted and paternally expressed. It is thought to be non-coding because the putative protein is not conserved and translation is predicted to trigger nonsense mediated decay (NMD). Transcripts from this gene are produced in tumors and may function to suppress cell growth. Alternative splicing results in multiple transcript variants. |
DNA 與 RNA 序列
GGCCCGCGGGCTAGAGGCACTTTACCGCCCGGCGGGAGCG40CCTCTCCTCCGCGTCCCTCGCCCCAGCCCCCTGCCCGCCC80CACTTTGGGACCCTCCAGCCGCTTTCCCCACAAATGAGAT120CTTTGCAATGAGCAAACGAAAGTGGCGCGGATTTCGGGGC160GCCCAGCAGGAGCGAGCGCAGCCGCCAGCCGCAAGTCCGC200AGCCGTGTCCCGCGCCCCACGCCGGCCTCCCCGGCGGCAG240CCGGAGACGAGCGCCAGCACCGGCGGGACAGCAGCAGATG280CGGGCCGAGAGCCGGTCAGGGGCGCAGAGGCGGAGGGGAT320CGGCGCGGCGGGGAGCTCACCGCGAAGCTGGAGGCTGCGT360CCGCGGGCGCACCAGGAGCTCAGGCAGCGAGCGATCGAAC400GCTCTGTGGCAGGCGGTGGACGCTGCTGAAGCTCTGGCTC440TGAGCTCACCGCTCCGCCGTCCGTGGGACCAAGCCCAGCA480TTTTACAAACCCAGCTCCTTTCTCCAAGGGTCCTCAGAGC520GCCCCTCCGTCACCCCCTGCAGGGCGCCGCAGACGAGGCG560CTGACCTTGCGCTCACTCCCCTCGCTGGGGAAGGACACAC600TCGCTGGCGTCAGCCCGGCCGGCCTGGGAAGTAGGACTAA640GGACCCGAACTGCAACCCTCCACACCAGACAGCACAGACC680ACCCCAAGGCTGCTCAATCTGCCCAAAGCCAAAAGAGCTC720CCCTGCCAGGACCTCGGTGCCGTGGAGACTGCGGGGAACC760TGCTCTGCCCACACCTGCTCTGGCCCCTAGACGGAAGCAC800CTGGAGCCAACCACGGAACTCCAGATCCCAGCTGTGTGAC840TGAATCCACGCCAGCCTCTCTGAGCCAAAGCTGCTTGCAG880AAGGGGGAGATCCCAGTTCGAAGACTCCCGCGCAGAGCCT920GTGGCCCTCTCTGCCAGGCCTCAGGGTGCCTGAGACACTC960cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。