基因總覽
IGDCC4 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 15q22.31。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000352385 ★ | 65,381,484–65,422,947 | 20 |
| ENST00000961838 | 65,381,479–65,423,083 | 18 |
| ENST00000961839 | 65,381,479–65,423,083 | 20 |
| ENST00000860245 | 65,381,479–65,423,083 | 20 |
| ENST00001135234 | 65,381,479–65,423,083 | 20 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>IGDCC4 ENST00000352385 GRCh38 chr15:65422847-65423947 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGCATCTTGGAGTTGGAAAGGACCTTAACTAGGTCATTGAATCTGTACTCTTTTCCCCACCCTAGCCTGA CAATTGAACCCTTGGCTGTAGAACAAGAAATATTTGCGGGATACTGAGGCAAACAGTCTGGCTAGGTAGG TTAGAGAAAGTACCGTTGAAGAATGAGAAAAAGGGTACTTCAGTAAATGCTGGACAGCAGAGGCAGGGTG AGGGAGTGGAGATGACCTTCCGAAGTCAGAAAACCAAGGTTCAGGTCCTGTATCTGCTGCTCCCTAGCCT CCTGTCCTTGGGCAAGTCACTTCACCTTCTCCAGCCTCAGTTTCCCCATGCGGCGACATCTGAATATGGT AGTGCTTGAAGGTAGTGTAAAAGTGTCCTGCCTGTGTTAGTTACTGCCAGAGCAAGGGAAGGAGGCCAAG AGAAGCCCTTGGTTTGGGATGGCAGATAGGACTATCAAGATCTCCGCAGGTGGGCTGGCGCAACGTGTGG AGAAGCGAACCAGCATTCAGGCCAGGACCTGGGCTGGAATGGACTGGGCTCGGGTGGCAAGGGGGCCATC TGGACAAAGACCGTGGCCCTGAATCTGCCTCCCCTGAGCCTGGAACGGAGGTGGAGACCCCGAGGCAGCA ACAGGGAGAAGAAATAGAGACGCTGAGGCAGAGAGACCAGAAGACTCAGAGACGGGGAGACTAAGAGACA GACCCAGCAACAGGCGGCCTCACGGGGGCCCGCGGCGACCCGGAGAGGGCGAGGCACCGGGACACAGACC CGGGCCGAGAGGAGCCCCCGCGAGGCGCAGGGCCGTGGCGCGCGGGCGCAGGGTCCCCGGCGGGGCCAGG GTGGCCACACTCGCCGGGCGCCCCCTCCCGGGCCGCTCGCCCAAGATGGCGATGGAGGGGCGGGTGAGGC GGCAGCGGCCCTGGCCCCCGCGCCGGCCCCAGCTCGGGCCCGGGCCCCCGAGGCCGCGCCCCCGCCCGCG GCGCCGCGCCTCCCCGGGCCACTGACGCCCGGCGCGCTCTCCCCCCGCGGCGGCGGCCGAAGCACGGGGA GGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCCCGAGCCCAGCCCCATGGCGCGGGGGGACG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| IGDCC4_1 ↗ | 15:65,423,073 | 負股 | 65,423,063–65,423,122 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR15_9XZ5B · promoter · 65422937–65423437 · regulatory
ENSR15_5KDGXM · CTCF_binding_site · 65423073–65423094 · regulatory
ENSR15_9XZ5K · enhancer · 65423920–65424249 · regulatory
· motif · 65420165–65420180 · motif
· motif · 65421489–65421499 · motif
· motif · 65421602–65421612 · motif
· motif · 65421673–65421683 · motif
· motif · 65421675–65421685 · motif
· motif · 65421679–65421689 · motif
· motif · 65421773–65421783 · motif
· motif · 65421881–65421894 · motif
· motif · 65421881–65421894 · motif
· motif · 65421987–65421999 · motif
· motif · 65421990–65421997 · motif
· motif · 65421995–65422008 · motif
· motif · 65422016–65422029 · motif
· motif · 65422016–65422029 · motif
· motif · 65422426–65422443 · motif
· motif · 65422435–65422452 · motif
· motif · 65423054–65423064 · motif
· motif · 65423075–65423091 · motif
· motif · 65424106–65424120 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1250 aa
IGDCC4 是 immunoglobulin superfamily 與 DCC family 的成員。蛋白質長 1,250 個胺基酸，含 N 端訊號肽、細胞外區、單一跨膜螺旋及細胞質區。細胞外區具有四個 Ig-like C2-type 結構域與五個 Fibronectin type-III 結構域；細胞質區另有兩段註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
IGDCC4 是單次跨膜的 I 型膜蛋白，定位於細胞膜；其大部分蛋白質位於細胞外，C 端區域則位於細胞質。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- ICAM5Q9UMF0 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- LTFP02788 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- WFIKKN2Q8TEU8 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | IGDCC4 定位於細胞膜，屬於單次跨膜的 I 型膜蛋白。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
ACTGACGCCCGGCGCGCTCTCCCCCCGCGGCGGCGGCCGA40AGCACGGGGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCCCGAGCCCA80GCCCCATGGCGCGGGGGGACGCCGGCCGCGGCCGCGGGCT120CCTCGCGTTGACCTTCTGCCTGTTGGCCGCGCGCGGGGAG160CTGCTGTTGCCCCAGGAGACGACTGTGGAGCTGAGCTGTG200GAGTGGGGCCACTGCAAGTGATCCTGGGCCCAGAGCAGGC240TGCAGTGCTAAACTGTAGCCTGGGGGCTGCTGCCGCTGGA280CCCCCCACCAGGGTGACCTGGAGCAAGGATGGGGACACCC320TGCTGGAGCACGACCACTTACACCTGCTGCCCAATGGTTC360CCTGTGGCTGTCCCAGCCACTAGCACCCAATGGCAGTGAC400GAGTCAGTCCCTGAGGCTGTGGGGGTCATTGAAGGCAACT440ATTCGTGCCTAGCCCACGGCCCCCTCGGAGTGCTGGCCAG480CCAGACTGCTGTCGTCAAGCTTGCCACACTCGCAGACTTC520TCTCTGCACCCGGAGTCTCAGACGGTGGAGGAGAACGGGA560CAGCTCGCTTTGAGTGCCACATTGAAGGGCTGCCAGCTCC600CATCATTACTTGGGAGAAGGACCAGGTGACATTGCCTGAG640GAGCCTCGGCTCATCGTGCTTCCCAACGGCGTCCTTCAGA680TCCTGGATGTTCAGGAGAGTGATGCAGGCCCCTACCGCTG720CGTGGCCACCAACTCAGCTCGCCAGCACTTCAGCCAGGAG760GCCCTACTCAGTGTGGCCCACAGAGGGTCCCTGGCGTCCA800CCAGGGGGCAGGACGTGGTCATTGTGGCAGCCCCAGAGAA840CACCACAGTGGTGTCTGGCCAGAGTGTGGTGATGGAATGT880GTGGCCTCAGCTGACCCCACCCCTTTTGTGTCCTGGGTCC920GACAAGACGGGAAGCCCATCTCCACAGATGTCATCGTCCT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。