基因總覽
IFIT5 的正式名稱為 interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 5，是一種蛋白質編碼基因，其產物屬於 RNA 結合蛋白。來源將其描述為干擾素誘導的蛋白質，並指出它參與人類先天免疫。IFIT5 能辨識不同 RNA 結構特徵；這項特性與抗病毒防禦中的 RNA 辨識專一性有關。來源亦將其歸入 IFIT family。這些基本特徵共同界定了 IFIT5 作為免疫相關 RNA 辨識蛋白的性質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000371795 ★ | 89,414,568–89,420,997 | 2 |
| ENST00000681422 | 89,414,568–89,420,997 | 2 |
| ENST00000681163 | 89,414,568–89,421,605 | 3 |
| ENST00000681348 | 89,414,568–89,418,819 | 3 |
| ENST00000680591 | 89,414,998–89,417,513 | 2 |
| ENST00000679632 | 89,417,205–89,420,997 | 2 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
IFIT5 參與人類先天免疫，能辨識多種 RNA 結構，且其廣泛、可調適的結構辨識能力與抗病毒防禦中的 RNA 辨識專一性有關。它可結合前驅與加工後的 tRNA，也能辨識帶有 poly-U 尾端的 tRNA 片段，顯示其可辨認的 RNA 類型不只限於病毒 RNA。
IFIT5 也會辨識帶有 5′ 三磷酸基團的單股 RNA（PPP-RNA），因此可作為病毒單股 RNA 的感測蛋白。來源指出，這類 RNA 帶有 5′ 三磷酸基團，且缺少 5′ 帽的 2′-O-甲基化；在病毒感染期間，宿主可藉由這些特徵區分自身與非自身的 mRNA。IFIT5 與 PPP-RNA 的直接結合不依賴特定核苷酸序列，辨識重點在於 RNA 所帶的分子特徵。
除 RNA 外，IFIT5 也能辨識並選擇性結合富含 AT 的雙股 DNA。來源因此描述了其對核酸特徵的辨識範圍，但未進一步說明此 DNA 結合在免疫反應中的具體作用。
在先天免疫訊號調節方面，IFIT5 正向調節 IKK-NFKB 訊號。它可協同促進 IKK 被招募至 MAP3K7，並與 IKK 磷酸化增加相關。這項作用使 IFIT5 除了參與核酸辨識，也能影響免疫訊號傳遞；來源未提供更進一步的下游效應細節。
Promoter 與基因調控
>IFIT5 ENST00000371795 GRCh38 chr10:89413568-89414668 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACCAGCCTGGGCAACATGGCAAAACCCCGCCTCTACAAAAAATAAATTAATTAGCCCGACATAGTGGTGC ACGCATATAGTCCCAGCCACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCGCTTGAGCCATGAAGGTTGAGGCTGC AGTGAGCTGTCATCTCACCACTGCACTCCAACCTGAGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAA AAAAACCAAAATCAATGCAAAAGATGAATTATGGACAGGATATTGAGGTTTTGAATACAGACATTAACTC AATAAGGGTAAGGCCCGTGTCTGTTTTCTTTATTGTTATATTGACAGTACTTTGAACAAAGTCTGGCTCT TACAGTTGTTTGTCAATATTTGCTGAATGAATTCAAAGGGGACAAAATGTTTAAGGTATGGGTGTTTGAC ATTTTCTGCCTAGATCCCCAATACCACTCTTGTCTTTATTGGGTCCTTATTACAAAGCACCATTGGCGAA GGTATGGAAGAGAAGCAGTCTCCTACAATTGTGGGTAAGAGTGGATTTTTAAAGCTATTTGGCAATATCC GTCAAAACTTAAAATGTATATAGATTTTAGCTCCAAATTTCTCAGTTTACACCCAACAGAAATAACAGCA TAGATGTATAGCATTGCAGTGTTGCTTGTTGAATCAAAAGACTGGAGTGGAAGCAGGGACTTAAGTTTCC GCCTGTAATCCCAGCACCTTGGGAGGCAGAGGCGGGCGCATCCCTTGAGATCACGACTGGGTGACACAGT GAGACGCTATCTCAAACAAACAAACAAACAAACAAACAGTTACACGGGCAGCATGCGAACTCAGCGTACT CAGGGAGGCAGATAAAAGCCGAGACCAAAGTGAAGGAGCCCAGCTGCAAATTCAACTCCGAAAGACCCTG GACTCCGCAAACGTCTGGCCGCGGCTCTTGAGCTCTTCTATTAAGTTTCGGTTTCTGAAGCTTACGTTTA GTTTCGATTTCTTAAGTTTCAGTTTCTGAGCGCTCGGCATCTGATTCAATCTCCAGTTTCCTGTTCTTGC TGGGGCTGGGGTCTCTCCTTTAACAAAGACACGCCGCGCGGCCGAGTCCAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| IFIT5_1 ↗ | 10:89,414,568 | 正股 | 89,414,519–89,414,578 |
| IFIT5_3 ↗ | 10:89,414,747 | 正股 | 89,414,698–89,414,757 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR10_BMQ54 · enhancer · 89413814–89414546 · regulatory
ENSR10_84LZGL · promoter · 89414547–89414772 · regulatory
ENSR10_CBTK5 · enhancer · 89414773–89415900 · regulatory
· motif · 89412410–89412421 · motif
· motif · 89412476–89412491 · motif
· motif · 89412476–89412491 · motif
· motif · 89414688–89414699 · motif
· motif · 89414688–89414699 · motif
· motif · 89414694–89414705 · motif
· motif · 89414694–89414705 · motif
· motif · 89414700–89414711 · motif
· motif · 89414700–89414711 · motif
· motif · 89415111–89415128 · motif
· motif · 89415113–89415128 · motif
· motif · 89415364–89415381 · motif
· motif · 89415421–89415441 · motif
· motif · 89415531–89415551 · motif
· motif · 89415588–89415601 · motif
· motif · 89415588–89415601 · motif
· motif · 89415614–89415623 · motif
· motif · 89415614–89415623 · motif
· motif · 89415630–89415641 · motif
· motif · 89415794–89415807 · motif
· motif · 89415794–89415807 · motif
IFIT5 的調控資訊指出，其受干擾素（IFNs）誘導。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：482 aa
IFIT5 蛋白質長 482 個胺基酸，屬於 IFIT family，序列中註記有 8 個 tetratricopeptide repeat（TPR）區段，分布於胺基酸 51–84、94–127、138–173、181–214、249–282、338–371、376–410 與 435–468。另有一段位於胺基酸 254–260 的區域，註記與 PPP-RNA 的 5′ 三磷酸基團互作。
蛋白質三維結構
細胞內定位
IFIT5 位於細胞突起的皺褶膜，並可見於頂端細胞表面富含肌動蛋白的突起。 在細胞表面皺褶處，IFIT5 與 RIGI 共定位。
未繪示構造：Cell projection, ruffle membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
IFIT5 以單體形式存在。它會與 MAP3K7 及 IKK 核心複合體的組成成分 CHUK、IKBKB 和 IKBKG 互作；這些互作可協同促進 IKK 招募至 MAP3K7，並增強 IKK 磷酸化。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | IFIT5 是干擾素誘導的 RNA 結合蛋白，參與人類先天免疫，並以廣泛且可調適的 RNA 結構辨識能力協助抗病毒防禦。它結合前驅及加工後 tRNA、帶 poly-U 尾端的 tRNA 片段，也感測帶 5′ 三磷酸且缺少 5′ 帽 2′-O-甲基化的病毒單股 RNA；其 PPP-RNA 結合不依賴序列，並可選擇性結合富含 AT 的雙股 DNA。此外，它正向調節 IKK-NFKB 訊號，協同 IKK 招募至 MAP3K7。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interferon-induced RNA-binding protein involved in the human innate immune response. Has a broad and adaptable RNA structure recognition important for RNA recognition specificity in antiviral defense. Binds precursor and processed tRNAs as well as poly-U-tailed tRNA fragments. Specifically binds single-stranded RNA bearing a 5'-triphosphate group (PPP-RNA), thereby acting as a sensor of viral single-stranded RNAs. Single-stranded PPP-RNAs, which lack 2'-O-methylation of the 5' cap and bear a 5'-triphosphate group instead, are specific from viruses, providing a molecular signature to distinguish between self and non-self mRNAs by the host during viral infection. Directly binds PPP-RNA in a non-sequence-specific manner. Also recognizes and selectively binds AT-rich dsDNA. Additionally, as a mediator in innate immunity, positively regulates IKK-NFKB signaling by sinergizing the recruitment of IKK to MAP3K7 PMID 23317505 ↗ · PMID 23334420 ↗ · PMID 23774268 ↗ · PMID 25092312 ↗ · PMID 26334375 ↗ |
| 交互作用 | IFIT5 以單體形式存在，並與 MAP3K7 及 IKK 核心複合體成分 CHUK、IKBKB、IKBKG 互作。這些互作協同促進 IKK 招募至 MAP3K7，並增強 IKK 磷酸化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Monomer. Interacts with MAP3K7 and the components of the IKK core complex CHUK, IKBKB and IKBKG; the interaction synergizes the recruitment of IKK to MAP3K7 and enhances IKK phosphorylation PMID 23317505 ↗ · PMID 23334420 ↗ · PMID 23774268 ↗ · PMID 26334375 ↗ |
| 細胞定位 | IFIT5 位於細胞突起的皺褶膜，並定位於頂端細胞表面富含肌動蛋白的突起；在細胞表面皺褶處，IFIT5 與 RIGI 共定位。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell projection, ruffle membrane; Colocalized with RIGI at cell surface ruffles. Localizes to actin-rich protrusions from the apical cell surface PMID 23317505 ↗ |
| 調控 | IFIT5 受干擾素（IFNs）誘導。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AGTTTCTGAGCGCTCGGCATCTGATTCAATCTCCAGTTTC40CTGTTCTTGCTGGGGCTGGGGTCTCTCCTTTAACAAAGAC80ACGCCGCGCGGCCGAGTCCAGGGGCTGCAGAGGCCTGGCG120CGCGCACGCGCACGCGCACGCCCACCGCGCGGCTTCCCGC160GGTCCCCGGTGCTGAGGAGAGAGCGATCCGAGGGACTGCG200CCGCCCGGACGGCCTGCAGAGCGCTGCCATCATGAGTGAA240ATTCGTAAGGACACCTTGAAGGCCATTCTGTTGGAGTTAG280AATGTCATTTTACATGGAATTTACTTAAGGAAGACATTGA320TCTGTTTGAGGTAGAAGATACAATTGGGCAACAGCTTGAA360TTTCTTACCACAAAATCTAGACTTGCTCTTTATAACCTAT400TGGCCTATGTGAAACACCTAAAAGGCCAAAATAAAGACGC440CCTTGAGTGCTTGGAACAAGCAGAAGAAATAATCCAGCAA480GAACACTCAGACAAAGAAGAAGTACGAAGCCTGGTCACTT520GGGGAAACTATGCCTGGGTGTATTATCACATGGACCAGCT560TGAAGAAGCTCAGAAGTATACAGGTAAGATAGGGAATGTC600TGTAAGAAATTGTCCAGTCCTTCTAACTACAAGTTGGAGT640GTCCTGAGACTGACTGTGAGAAAGGCTGGGCACTCTTGAA680ATTTGGAGGAAAGTATTATCAAAAGGCTAAAGCGGCTTTT720GAGAAGGCTCTGGAAGTGGAGCCTGACAATCCAGAATTTA760ACATCGGCTATGCTATCACAGTGTATCGGCTGGATGATTC800TGATAGAGAAGGGTCTGTAAAGAGCTTTTCTCTGGGGCCT840TTGAGAAAGGCTGTTACCCTGAACCCAGATAACAGCTATA880TTAAGGTTTTTCTGGCACTGAAGCTTCAAGATGTACATGC920AGAAGCTGAAGGGGAAAAGTATATTGAAGAAATCCTGGAC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。