基因總覽
interferon induced with helicase C domain 1(IFIH1)是蛋白質編碼基因,其產物屬於細胞質先天免疫受體,參與辨識病毒感染。蛋白質全長 1,025 個胺基酸,具有兩個 N 端 CARD、解旋酶 ATP 結合區、解旋酶 C 端區,以及 C 端 RLR CTR;部分區域另有無序序列註記。這些結構特色構成一種具核酸感測與訊號傳遞能力的受體架構。IFIH1 產物在病毒感染辨識及後續抗病毒反應中扮演重要角色,相關作用可連結至第一型干擾素與促發炎細胞激素的誘導。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000649979 ★ | 162,267,074–162,318,684 | 16 |
| ENST00000679938 | 162,267,074–162,318,684 | 15 |
| ENST00000648433 | 162,267,074–162,318,684 | 15 |
| ENST00000421365 | 162,310,147–162,318,684 | 2 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
IFIH1 產物是先天免疫受體,在細胞質中感測病毒核酸,參與辨識病毒感染並啟動抗病毒反應。其配體包括 5' 端帽缺乏 2'-O-甲基化的 mRNA,以及長度超過 1 kb 的雙股 RNA(dsRNA)。來源指出,它可辨識多種病毒,包括 小 RNA 病毒科(Picornaviridae) 的成員,例如腦心肌炎病毒(encephalomyocarditis virus)、Mengo病毒(Mengo virus) 與 鼻病毒(rhinovirus),也可偵測 SARS-CoV-2、登革病毒、西尼羅病毒及呼腸孤病毒;對含雙股 DNA 基因組的 vaccinia virus 也可能參與抗病毒訊號反應。
配體結合後,IFIH1 會與粒線體抗病毒訊號蛋白 MAVS/IPS1 結合,進而活化 TBK1 與 IKBKE。這些激酶會磷酸化 IRF3 和 IRF7,後兩者再促進抗病毒免疫基因的轉錄,包括 IFN-alpha 與 IFN-beta。此訊號路徑將核酸辨識連結至干擾素生成與促發炎細胞激素誘導,形成抗病毒防禦反應的一部分。
IFIH1 也參與放大先天免疫訊號:病毒感染期間,RNase L 產生的 RNA 代謝物可被其辨識,進一步增強免疫訊號。來源並指出,IFIH1 可能增進自然殺手細胞功能,也可能參與數種腫瘤細胞株的生長抑制與細胞凋亡;這些作用在資料中以可能性描述。其 ATP 水解反應記為 ATP 與水生成 ADP、磷酸及氫離子。
Promoter 與基因調控
>IFIH1 ENST00000649979 GRCh38 chr2:162318584-162319684 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AATGAGTAGTAACCTTAAGGACTCACATTTATGTGGCTTCTGTACCAAAATGAAGCTGCCATTTTTCAGT GTGAATATGTTTTTTTTCTCTCATGACATAGACAAATGTTGATGTTTACTACAAGTTGGTACATTAGTTG CTAATTAAGTTCCTAGCTGCTCCAGCCAAAACTTGCTGTATTGAATCCAAGAAAAGAATGGCAGCTATAT CAAAAATAAGTTGTTGGGGGATTTTTTTGTTTTGTTTTATTAAAGGAAAGTTGTATATTAAAGAATATAG GGAACTTACAAGCTGGGATCTAGGAAACTTTAAGTCTTGGCTTCCTTCTAAGCTGAGTTGGTGGTTCAAG TCCATCCACATCTGTTACCAGGTCCTGGTCAAAGCTGCATAAATACCAGCAATCTAAATATGAGGCAGTA AAGTTAACTGTTTATTGTTACTCACTTTTTCGAACCCACCTCCAAATTCCCAGGGAAACAAGTTAGTGTT TGGGAACCCACAGGAGGTCAGGTTTATTTTAGGAAGGACTTCCTCCTGTCTTCTCCACATCTCTGCAAAG ATGTCTTCTGAGCTTCATCTCTCACCTGTCCCTCGCAGTCTCACCACCCTCAGCCAGGCCTGCCTACATT CACCAGCCGAGGGTAACTCCCTGTTCACGTCCGGGTCTGTGGCAGTTTCTGTTCACTTCCCCTTTGGAAA GTCCCAAATCACATGCTTTTATGCCCTGCACATTTTGGCCTACAAAGGACCTTATTGTTAAGGCAGAACC TGCTGGGAAAACAAAATATCCGCCGGAGGAGCTTTGCTAGAGCGTTGGTCTTGGTGTCAGAGAGAATTCG CTTTCCTTTTCTGTTTCCCGCGGTGTCCTTAACCAAAGGCCTCCTCTCTTCACCCGCCCCGACCAAAAGG TGGCGTCTCCCTGAGGAAACTCCCTCCCCGCCAGGCAGATTACGTTTACAAAGTCCTGAGAAGAGAATCG AAACAGAAACCAAAGTCAGGCAAACTCTGTAAGAACTGCCTGACAGAAAGCTGGACTCAAAGCTCCTACC CGAGTGTGCAGCAGGATCGCCCCGGTCCGGGACCCCAGGCGCACACCGCAG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| IFIH1_1 ↗ | 2:162,318,683 | 負股 | 162,318,673–162,318,732 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR2_53F6SC9 · CTCF_binding_site · 162318217–162318238 · regulatory
ENSR2_B377QL · promoter · 162318218–162319044 · regulatory
ENSR2_53F6SCM · CTCF_binding_site · 162318298–162318319 · regulatory
ENSR2_53F6SFS · CTCF_binding_site · 162318766–162318787 · regulatory
ENSR2_B377QP · enhancer · 162319045–162319885 · regulatory
· motif · 162313745–162313756 · motif
· motif · 162318196–162318208 · motif
· motif · 162318219–162318235 · motif
· motif · 162318222–162318231 · motif
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· motif · 162318699–162318719 · motif
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· motif · 162318768–162318784 · motif
· motif · 162318784–162318794 · motif
· motif · 162318826–162318846 · motif
· motif · 162318832–162318852 · motif
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· motif · 162318992–162319012 · motif
· motif · 162319018–162319029 · motif
· motif · 162319174–162319181 · motif
· motif · 162319206–162319219 · motif
· motif · 162319206–162319219 · motif
· motif · 162319207–162319220 · motif
· motif · 162319265–162319278 · motif
· motif · 162320100–162320113 · motif
· motif · 162320100–162320113 · motif
IFIH1 的表現受干擾素(IFN)與腫瘤壞死因子(TNF)誘導。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:1025 aa
IFIH1 產物長 1,025 個胺基酸。序列註記包括 N 端 CARD 1 與 CARD 2、Helicase ATP-binding 區、Helicase C-terminal 區及 C 端 RLR CTR。另有兩段被註記為無序區域,分別位於胺基酸 271–307 與 640–662。上述區域名稱依來源保留英文。
蛋白質三維結構
細胞內定位
IFIH1 可位於細胞質,病毒 RNA 刺激並伴隨 ISGylation 時,會由細胞質溶膠轉位至粒線體;在細胞凋亡期間也可能出現在細胞核。 來源未提供異構型間定位差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 18 個夥伴
- TRIM65 · 結構證據 · PDB 7JL0
- MAVSQ7Z434 · 複合體證據 · PDB 7DNI · 2 筆來源紀錄
- DHX58 · 功能關係;非直接結合聲明
- ATG16L1Q676U5-1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- IKBKEQ14164 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ISG15P05161 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- KEAP1Q14145 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRKRAO75569 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- RIOK3O14730 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- RNF125Q96EQ8 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TKFCQ3LXA3 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- MP0DTC5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- P/VP0C774 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- P/VP11207 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- P/VQ9EMA9 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- P/V/IP30927 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- repP0DTD1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- US11P04487 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
無配體時 IFIH1 為單體,結合雙股 RNA 配體後可形成同源二聚體;在長雙股 RNA 上還可組成螺旋或線性聚合絲。它與 MAVS/IPS1 有實體交互作用,並可透過 ECSIT 連接至粒線體的 MAVS 複合體。來源也記載 IFIH1 與多種宿主蛋白及病毒蛋白交互作用;例如 NOD1 的交互作用與抗病毒基因轉錄及抑制病毒複製有關。部分病毒蛋白交互作用則抑制 IFIH1 訊號或干擾下游干擾素反應。
疾病與遺傳關聯
IFIH1 變異與多種疾病有關,但不同條目的證據描述並不相同。Type 1 diabetes mellitus 19 的易感性可能與影響 IFIH1 的變異相關,來源未表述為直接致病。Aicardi-Goutieres syndrome 7 與 Singleton-Merten syndrome 1 則被描述為由影響此基因的變異所致。另有資料指出 IFIH1 是 CADM-140 自體抗原,並記載抗體與臨床無肌炎型皮肌炎及其相關臨床表現的關聯;這是自體抗原與抗體相關資訊,不等同於基因變異致病證據。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 18 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | IFIH1 感測病毒核酸並參與抗病毒反應。 | 含實驗來源 | 證據與來源Innate immune receptor which acts as a cytoplasmic sensor of viral nucleic acids and plays a major role in sensing viral infection and in the activation of a cascade of antiviral responses including the induction of type I interferons and pro-inflammatory cytokines PMID 14645903 ↗ · PMID 19211564 ↗ · PMID 19656871 ↗ · PMID 21217758 ↗ · PMID 21742966 ↗ · PMID 22160685 ↗ · PMID 28594402 ↗ · PMID 28606988 ↗ · PMID 29117565 ↗ · PMID 33440148 ↗ · PMID 33514628 ↗ · PMID 33727702 ↗ |
| 功能 | 配體結合後,訊號經 MAVS/IPS1、TBK1、IKBKE 傳遞至 IRF3、IRF7,促進抗病毒基因轉錄。 | 含實驗來源 | 證據與來源Upon ligand binding it associates with mitochondria antiviral signaling protein (MAVS/IPS1) which activates the IKK-related kinases: TBK1 and IKBKE which phosphorylate interferon regulatory factors: IRF3 and IRF7 which in turn activate transcription of antiviral immunological genes, including interferons (IFNs); IFN-alpha and IFN-beta. PMID 14645903 ↗ · PMID 19211564 ↗ · PMID 19656871 ↗ · PMID 21217758 ↗ · PMID 21742966 ↗ · PMID 22160685 ↗ · PMID 28594402 ↗ · PMID 28606988 ↗ · PMID 29117565 ↗ · PMID 33440148 ↗ · PMID 33514628 ↗ · PMID 33727702 ↗ |
| 細胞定位 | 病毒 RNA 刺激並伴隨 ISGylation 時,IFIH1 由細胞質溶膠轉位至粒線體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Upon viral RNA stimulation and ISGylation, translocates from cytosol to mitochondrion. PMID 11805321 ↗ · PMID 14645903 ↗ · PMID 32169843 ↗ · PMID 33727702 ↗ |
| 疾病關聯 | Aicardi-Goutieres syndrome 7 被描述為由影響 IFIH1 的變異所致。 | 含實驗來源 | 證據與來源The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry PMID 24686847 ↗ · PMID 24995871 ↗ |
| 分子活性 | ATP + H2O = ADP + phosphate + H(+) | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | IFIH1無配體時為單體,遇雙股RNA配體可形成同源二聚體,並可在長雙股RNA上組成螺旋或線性絲狀聚合物。其互作對象包括MAVS/IPS1、TKFC、PCBP2、NLRC5、PIAS2-beta、DDX60、ANKRD17、IKBKE、ATG5、ATG12、ZCCHC3、RNF123、DDX3X、NOD1及ECSIT;病毒感染會抑制其與TKFC的互作,ZCCHC3互作促進IFIH1/MDA5活化,NOD1互作促進抗病毒基因轉錄並抑制病毒複製,ECSIT則連接IFIH1與粒線體上的MAVS複合體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Monomer in the absence of ligands and homodimerizes in the presence of dsRNA ligands. Can assemble into helical or linear polymeric filaments on long dsRNA. Interacts with MAVS/IPS1. Interacts (via the CARD domains) with TKFC, the interaction is inhibited by viral infection. Interacts with PCBP2. Interacts with NLRC5. Interacts with PIAS2-beta. Interacts with DDX60. Interacts with ANKRD17. Interacts with IKBKE. Interacts with ATG5 and ATG12, either as ATG5 and ATG12 monomers or as ATG12-ATG5 conjugates. Interacts with ZCCHC3; leading to activate IFIH1/MDA5. Interacts with RNF123. Interacts with DDX3X. Interacts with NOD1; this interaction promotes transcription of antiviral genes and inhibition of viral replication. Interacts with ECSIT; this interaction bridges IFIH1 to the MAVS complex at the mitochondrion PMID 15563593 ↗ · PMID 16127453 ↗ · PMID 16177806 ↗ · PMID 17600090 ↗ · PMID 17709747 ↗ · PMID 19380577 ↗ · PMID 19531363 ↗ · PMID 19881509 ↗ · PMID 20127681 ↗ · PMID 20434986 ↗ · PMID 21156324 ↗ · PMID 21791617 ↗ · PMID 22160685 ↗ · PMID 23711367 ↗ · PMID 27312109 ↗ · PMID 30193849 ↗ · PMID 33727702 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染期間,IFIH1與副黏液病毒的V蛋白互作;這些互作會阻止IFN-beta誘導,並阻礙後續抗病毒狀態的建立。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with V protein of paramyxoviruses; these interactions prevent IFN-beta induction, and subsequent establishment of an antiviral state PMID 15563593 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染期間,IFIH1與單純疱疹病毒1型蛋白US11互作;此互作會阻止MAVS/IPS1與IFIH1之間的互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with herpes simplex virus 1 protein US11; this interaction prevents the interaction of MAVS/IPS1 to IFIH1 PMID 22301138 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染期間,IFIH1與腦心肌炎病毒(encephalomyocarditis virus)蛋白2C互作;此互作會抑制IFN-beta訊號路徑的誘導。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with Encephalomyocarditis virus protein 2C; this interaction inhibits the induction of the IFN-beta signal pathway PMID 30312637 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染期間,IFIH1與A16型克沙奇病毒蛋白酶3C互作;該互作會抑制IFIH1,進而減弱第一型干擾素的產生。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with protease 3C of coxsackievirus A16; this interaction inhibits IFIH1 thereby attenuating type-I IFN production PMID 28424289 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染期間,IFIH1與SARS-CoV-2病毒蛋白NSP3互作;NSP3透過活性去ISG15化作用,拮抗依賴ISG15的IFIH1活化。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with SARS-COV-2 virus protein NSP3; the interaction antagonizes ISG15-dependent IFIH1 activation via active de-ISGylation PMID 33727702 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染期間,IFIH1與麻疹病毒V蛋白互作;此互作參與病毒對宿主第一型干擾素訊號路徑的抑制。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with measles V protein; this interaction is involved in the inhibition of the host type I interferon signaling pathway by the virus PMID 19403670 ↗ |
| 調控 | IFIH1受干擾素(IFN)與腫瘤壞死因子(TNF)調控;此資料未進一步說明調控方向、發生條件或作用機制。 | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | 第1型糖尿病19(T1D19)是影響葡萄糖恆定的多因子疾病,未接受胰島素治療時易發生酮酸中毒,並可出現多飲、多食及多尿。高血糖引起的滲透性利尿與繼發性口渴,以及長期眼、腎、神經和血管併發症,構成其臨床特徵;疾病易感性可能與影響IFIH1的變異有關,並非此資料所述的確定因果關係。 | 含實驗來源 | 證據與來源Type 1 diabetes mellitus 19 T1D19 A multifactorial disorder of glucose homeostasis that is characterized by susceptibility to ketoacidosis in the absence of insulin therapy. Clinical features are polydipsia, polyphagia and polyuria which result from hyperglycemia-induced osmotic diuresis and secondary thirst. These derangements result in long-term complications that affect the eyes, kidneys, nerves, and blood vessels. Disease susceptibility may be associated with variants affecting the gene represented in this entry MIM: 610155 PMID 16699517 ↗ |
| 疾病關聯 | IFIH1是臨床無肌病性皮肌炎(CADM)的CADM-140自體抗原。CADM為慢性發炎疾病,具有皮肌炎典型皮膚表現,但臨床肌炎證據很少或沒有;抗CADM-140抗體對皮肌炎具有特異性,尤其見於CADM,且帶有此抗體的患者常發生可危及生命、急速進展的間質性肺病。 | 含實驗來源 | 證據與來源IFIH1 is the CADM-140 autoantigen, involved in clinically amyopathic dermatomyositis (CADM). This is a chronic inflammatory disorder that shows typical skin manifestations of dermatomyositis but has no or little evidence of clinical myositis. Anti-CADM-140 antibodies appear to be specific to dermatomyositis, especially CADM. Patients with anti-CADM-140 antibodies frequently develop life-threatening acute progressive interstitial lung disease (ILD) PMID 19565506 ↗ · PMID 20015976 ↗ |
| 疾病關聯 | Singleton-Merten症候群1(SGMRT1)是表現程度不一的體染色體顯性疾病,核心特徵包括明顯主動脈鈣化、牙齒異常、骨質減少及肢端骨溶解,亦可能有青光眼、乾癬、肌無力和關節鬆弛。疾病由影響IFIH1的變異所致;此描述亦列出牙齒發育與脫落異常、特殊面部特徵,以及關節和肌肉韌帶異常。 | 含實驗來源 | 證據與來源Singleton-Merten syndrome 1 SGMRT1 An autosomal dominant disorder with variable expression. Core features are marked aortic calcification, dental anomalies, osteopenia, acro-osteolysis, and to a lesser extent glaucoma, psoriasis, muscle weakness, and joint laxity. Dental anomalies include delayed eruption and immature root formation of anterior permanent teeth, early loss of permanent teeth due to short roots, acute root resorption, high caries, and aggressive alveolar bone loss. Additional clinical manifestations include particular facial characteristics and abnormal joint and muscle ligaments. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 182250 PMID 25620204 ↗ |
| 疾病關聯 | 免疫缺陷95(IMD95)為體染色體隱性疾病,患者在嬰兒期或幼兒期開始反覆發生嚴重病毒性呼吸道感染,且病毒感染時干擾素產生受損。資料指出此病由影響IFIH1的變異所致。 | 含實驗來源 | 證據與來源Immunodeficiency 95 IMD95 An autosomal recessive disorder characterized by the onset of recurrent and severe viral respiratory infections in infancy or early childhood, and impaired interferon production during viral infection. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 619773 PMID 28606988 ↗ · PMID 29018476 ↗ |
| 功能 | 研究分析 MDA5、RIG-I 與 LGP2 的解旋酶保守序列基序突變,評估酵素活性、RNA 結合、干擾素誘導及抗病毒訊號。所有受測基序均與 ATP 水解有關,部分也參與 RNA 結合;全長 MDA5 與 RIG-I 介導第一型干擾素的產生不依賴解旋酶催化活性。 | 文獻摘要 | 證據與來源Intracellular pattern recognition receptors MDA5, RIG-I, and LGP2 are essential components of the cellular response to virus infection and are homologous to the DEXH box subfamily of RNA helicases. However, the relevance of helicase activity in the regulation of interferon production remains elusive. To examine the importance of the helicase domain function for these signaling proteins, a series of mutations targeting conserved helicase sequence motifs were analyzed for enzymatic activity, RNA binding, interferon induction, and antiviral signaling. Results indicate that all targeted motifs are required for ATP hydrolysis, but a subset is involved in RNA binding. The enzymatically inactive mutants differed in their signaling ability. Notably, mutations to MDA5 motifs I, III, and VI and RIG-I motif III produced helicase proteins with constitutive antiviral activity, whereas mutations in RIG-I motif V retained ATP hydrolysis but failed to mediate signal transduction. These findings demonstrate that type I interferon production mediated by full-length MDA5 and RIG-I is independent of the helicase domain catalytic activity. In addition, neither enzymatic activity nor RNA binding was required for negative regulation of antiviral signaling by LGP2, supporting an RNA-independent interference mechanism. PMID 19211564 ↗Regulation of signal transduction by enzymatically inactive antiviral RNA helicase proteins MDA5, RIG-I, and LGP2. · cc by |
核酸與蛋白質序列
CAAACTCTGTAAGAACTGCCTGACAGAAAGCTGGACTCAA40AGCTCCTACCCGAGTGTGCAGCAGGATCGCCCCGGTCCGG80GACCCCAGGCGCACACCGCAGAGTCCAAAGTGCCGCGCCT120GCCGGCCGCACCTGCCTGCCGCGGCCCCGCGCGCCGCCCC160GCTGCCCACCTGCCCGCCTGCCCACCTGCCCAGGTGCGAG200TGCAGCCCCGCGCGCCGGCCTGAGAGCCCTGTGGACAACC240TCGTCATTGTCAGGCACAGAGCGGTAGACCCTGCTTCTCT280AAGTGGGCAGCGGACAGCGGCACGCACATTTCACCTGTCC320CGCAGACAACAGCACCATCTGCTTGGGAGAACCCTCTCCC360TTCTCTGAGAAAGAAAGATGTCGAATGGGTATTCCACAGA400CGAGAATTTCCGCTATCTCATCTCGTGCTTCAGGGCCAGG440GTGAAAATGTACATCCAGGTGGAGCCTGTGCTGGACTACC480TGACCTTTCTGCCTGCAGAGGTGAAGGAGCAGATTCAGAG520GACAGTCGCCACCTCCGGGAACATGCAGGCAGTTGAACTG560CTGCTGAGCACCTTGGAGAAGGGAGTCTGGCACCTTGGTT600GGACTCGGGAATTCGTGGAGGCCCTCCGGAGAACCGGCAG640CCCTCTGGCCGCCCGCTACATGAACCCTGAGCTCACGGAC680TTGCCCTCTCCATCGTTTGAGAACGCTCATGATGAATATC720TCCAACTGCTGAACCTCCTTCAGCCCACTCTGGTGGACAA760GCTTCTAGTTAGAGACGTCTTGGATAAGTGCATGGAGGAG800GAACTGTTGACAATTGAAGACAGAAACCGGATTGCTGCTG840CAGAAAACAATGGAAATGAATCAGGTGTAAGAGAGCTACT880AAAAAGGATTGTGCAGAAAGAAAACTGGTTCTCTGCATTT920CTGAATGTTCTTCGTCAAACAGGAAACAATGAACTTGTCC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。