基因總覽
HUNK 的正式名稱為 hormonally up-regulated Neu-associated kinase,屬於蛋白質編碼基因。其蛋白質歸在 protein kinase superfamily,並分類於 CAMK Ser/Thr protein kinase family 的 SNF1 subfamily。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000270112 ★ | 31,873,020–32,004,064 | 11 |
| ENST00000931898 | 31,872,805–32,004,071 | 10 |
| ENST00001131499 | 31,872,805–32,004,071 | 11 |
| ENST00000430354 | 31,924,552–31,968,334 | 4 |
| ENST00000439107 | 31,974,703–32,044,633 | 5 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
HUNK 的蛋白質具有蛋白質激酶所描述的磷酸轉移反應:以 ATP 作為磷酸基供體,將磷酸基加到蛋白質上的絲胺酸殘基。反應產物包括被磷酸化的蛋白質、ADP 與氫離子。
另一項所列反應描述其將磷酸基轉移至蛋白質上的蘇胺酸殘基,同樣使用 ATP,並產生 ADP、氫離子及磷酸化蛋白質。資料列出這兩種胺基酸殘基的反應,但未提供特定受質、細胞情境或下游生物效應,因此不能據此進一步判定其作用對象或生理後果。
Promoter 與基因調控
>HUNK ENST00000270112 GRCh38 chr21:31872020-31873120 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ATTTCTCTGCGTCCCTCTTCAGATGGGTCAGCGAGACCCCCAGACACTGGATTGATGACAGCTGTTGTTC CCCCACCCCCCACTCCCAATCTCAAAGCATTGCTATGGGTCGATGTCATACTTGTTTACTCAGGAATAAA CAATGAAAGGAACTTTGTTAGGACCAAATCCTTCCTTTCAGCTCTGATGTTGCATGATCGGGGTGAAGTT TCCATCAAATGCGGGCACCTCAACAGGTAGCATTTTGTAAATGCCTCCTCCTACCTACCCTCCTCCTTCT CCCTCACAAGATTCTTCATTTTCGGTTTGAGAAGACGTTGGGGATCCTGGGAGAGGGTCCAGTGTCGTCA GGGCAGTTGCAATTGTTTATGCGATGAGCACAGTCACAGCGCTTGCAGAACAAAAGCATCGAAGAGAGGC GAGCGCCGGTCCACCTCCTGCAATCACAGGCATCATTTCAATGGAAGGCAAAGAAGGTGTAAGCTACAAG CAGAGGCAGCAAACGCCCTGGTTCCTACATTGCTGCTGCTACTATTACTGCTGTGGCTGCGCCTCCTCCA ACACAGCCAACCAGGCTGCGTGCGAGCCCGGGCAGACGCCTGGCCGCCTCCCCACCCTTTCTTCCAGCCA TCCATCTATCCTTCCACCCCCGGTCCAGGGGGCCCTACTGTGTGGCGGACTCAGGGCCGGGCACGCAACC CGACTCACAGTCCACGGAGTTCGAGAGCCTTCCCCCTTCCCCCCGCCCCGGGTGGGTGCGGCCAGTGGGG GATTTCACCGCCGAAAGGTCCAGAAAACCCAAGCCCAGAATCCGGGCAAGAGGCGCAGCCGGAGGCGGCC CGACCTGGGCGGCCCGGGAGCGCGCGCCTCCGAGGCCGCGCAGGTTCTCCCTGTCTGGCGCTCAGGTGGC TTCTCCGTCCACTCCGCCGCTCCCCTCCCCGGGCCCTCCCCTCTCCAGCGAGGGTCGAGTTTGACTGTGG CGCGCGGGGAAGGAGGGGCTACTAGGGATTTGAAAGTGCACGGGCTGCGGAGTGGAGCTCGCATCTGTTC CCGCCGCCCGCGAGCGGATTAAATTTCTGCAAATTCAAACTGAATGGGGCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| HUNK_1 ↗ | 21:31,873,319 | 正股 | 31,873,270–31,873,329 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR21_9GMKG · promoter · 31872530–31873030 · regulatory
ENSR21_9GMKW · promoter · 31874137–31874637 · regulatory
ENSR21_59HFDS · CTCF_binding_site · 31874207–31874228 · regulatory
ENSR21_59HFFJ · CTCF_binding_site · 31874361–31874382 · regulatory
ENSR21_59HFG9 · CTCF_binding_site · 31874522–31874543 · regulatory
ENSR21_59HFLH · CTCF_binding_site · 31875431–31875452 · regulatory
ENSR21_9GMLB · enhancer · 31875638–31876001 · regulatory
· motif · 31874209–31874225 · motif
· motif · 31874363–31874379 · motif
· motif · 31874524–31874540 · motif
· motif · 31875433–31875449 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:714 aa
HUNK 蛋白質長 714 個胺基酸,具有位於第 62–320 位胺基酸的 Protein kinase 結構域。序列註解另標示四段無序區域,分別位於第 1–26、437–471、518–552 與 590–615 位胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- CFL1P23528 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- LIMK1P53667 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
ACTAGGGATTTGAAAGTGCACGGGCTGCGGAGTGGAGCTC40GCATCTGTTCCCGCCGCCCGCGAGCGGATTAAATTTCTGC80AAATTCAAACTGAATGGGGCTTTCTTCTGCTGCCTTCCAG120AGGGCGCCGGCAGCCCGCCGCGCGCTTCTCTCCGGCGGGA160GCGGCCGCCCAGCGCACGGCTAGGAGCGATCGCGGGAGCC200CGACCCAAGCCCGTGCGGGCCAGACGGCGGCGGCGAGGCG240GAGGCTGCGGAGGCACCCGGGCTCCCGGACCCAGGCACCC280GGACCCCGGGACCCAGGCGCCGCCGGACCGCGCCCCACCC320CGCGCGCCCGAGCAGGGCGACTGTCATTAGCTTCCTGGAC360GGGACCCGGGGCGGGATCCTGGTGTCCTGAAAGGGGCCCG400GGCGACCCTAAGAGGAAGAACTTTTGGGGGCGGGGTCCCC440GGTCCCGCGTCCCCTGGGCAGCCGCTATTGTCTACGCGCC480TCGCTGGGCGGCGCGGGGGGCGTGATCGCGGCGGCCCCGG520GCTCTGGGTGCGGAGACCCAGGCGGGGCTGGGCCCAGGGC560GGCGGCGGGAGAAGCCGGGGAAGCCGAAGAGCCTGGGGAG600GAGGAGCTGCGAGCGCGGGAGACGAGCAGGAGCCGCGCGG640GCCGCGGCGAGCGCGATGCCGGCGGCGGCGGGGGACGGGC680TCCTGGGGGAGCCGGCGGCGCCTGGGGGCGGCGGCGGCGC720GGAGGACGCGGCCAGGCCCGCGGCGGCCTGCGAGGGAAGT760TTCCTGCCTGCCTGGGTGAGCGGCGTGCCCCGCGAGCGGC800TCCGCGACTTCCAGCACCACAAGCGCGTGGGCAACTACCT840CATCGGCAGCAGGAAGCTGGGCGAGGGCTCCTTTGCCAAG880GTGCGCGAGGGGCTGCACGTGCTGACCGGGGAGAAGGTGG920CCATAAAAGTCATTGATAAGAAGAGAGCCAAAAAGGACAC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。