演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

HSPA13STCH

heat shock protein family A (Hsp70) member 13

HSPA13 是 heat shock protein family A (Hsp70) member 13,屬於 heat shock protein 70 家族,具有不依賴 peptide 的 ATPase 活性。

Homo sapiens21q11.2UniProt P48723
OFFICIAL SYMBOL
HSPA13
CHROMOSOME
21
UNIPROT
P48723
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

HSPA13(heat shock protein family A (Hsp70) member 13)是人類的蛋白質編碼基因,其產物屬於 heat shock protein 70 家族。這個家族成員具有 ATPase 活性;HSPA13 的資料特別指出,其 ATPase 活性不依賴 peptide。現有資料提供了家族歸屬與這項酵素活性的基本資訊,但未進一步描述其完整分子功能或生物學角色。

Official symbol
HSPA13
Gene name
heat shock protein family A (Hsp70) member 13
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11375
UniProt
P48723
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
STCH

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2121q11.2
chr21 · 46,709,983 bp · GRCh38chr21p13 · 1–3100000 · gvarchr21p12 · 3100001–7000000 · stalkchr21p11.2 · 7000001–10900000 · gvarchr21p11.1 · 10900001–12000000 · acenchr21q11.1 · 12000001–13000000 · acenchr21q11.2 · 13000001–15000000 · gnegchr21q21.1 · 15000001–22600000 · gpos100chr21q21.2 · 22600001–25500000 · gnegchr21q21.3 · 25500001–30200000 · gpos75chr21q22.11 · 30200001–34400000 · gnegchr21q22.12 · 34400001–36400000 · gpos50chr21q22.13 · 36400001–38300000 · gnegchr21q22.2 · 38300001–41200000 · gpos50chr21q22.3 · 41200001–46709983 · gnegHSPA13pq1 bp46,709,983 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr21:14,368,767–14,383,484
Gene span
14,718 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000285667 ★14,371,115–14,383,1465
ENST0000090393114,368,767–14,383,1574
ENST0000090393214,368,767–14,383,1575
ENST0000113180214,368,767–14,383,1575

顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

HSPA13 的來源註解指出,它具有不依賴 peptide 的 ATPase 活性。換言之,該 ATPase 活性不需要 peptide 作為條件;不過,現有資訊未說明 ATP 水解的具體步驟、反應速率,或此活性如何受到其他分子調節。

HSPA13 被歸入 heat shock protein 70 家族,並具有上述酵素活性;但資料沒有進一步交代 ATPase 活性與家族中其他蛋白質功能之間的關係,也未提供其作用對象或參與的細胞過程。因此,能由目前資訊確認的功能範圍,限於 peptide-independent ATPase activity,不宜延伸推論其是否具有特定伴護作用或其他生物學效應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 14383146 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>HSPA13 ENST00000285667 GRCh38 chr21:14383046-14384146 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GAACTCTAACAGCAAAAATGACAAAACCACTCTCAGAGGAGTCATTAAGTGCTACCAGTGACCAAGATGC
GAGAAAAATCCTACTTCAGACTAGAACCTGAACAGCATGTCACAAGCGTCCTAAAATGGCTGTCACGTTA
CAGGACTTGCCCATAAGGTCAATTTTGGCCACTTAAGACTTACTTGAAGAGAGAGCTAAGGGTTTTCTTT
TTAATTTCGTTTTTGTTTTTGTTTTTAATGGCCCACGTCAGTGCTAGCAATAGAGAAAATGTGTCCCTGA
TCCCTTGGATAAATCGAATTGACTGAAGAATGCTTGAATTCATTTATCCCAAAACAAAGGCAGACGGCTG
AGGGTCACTGGAGTTTCAGGGCTGCTCCCAGCGTTGGAGCACGGACGCCAGAGCCGACTTCCCTCAGGCC
CCGCACTGCGGCAGGGACCCTTCTACGGAGGATGGCTGGGGCTCCGGGAGGCTATAGGAACGCCATCTAG
AAGCTAGATCTCAGGCAAACGAACGCGCTTTAAAAGGAATTAAAACGAAAGAACACAAACTCGAATCCTG
GACCTGATTAGGGGCACGACCAAAGAAAGAAATAACTAACGGTTCTCACCCTCCCTTTCATTCCCTCCCG
CGGAAAGAGAAAGGCTGGAACTCCGCTTCCCAGAATGCAAAGCGCGGGGCGGGGCTAAAGAGATAGCCTG
TTTTCCCTCAAGTAGGATCGCGGGACCACAGGTTTGATTATAAACGCCAGTCTCTCGCCACGGCGCTCCT
CCCCCTCAGTCTCACTGGTCCTGCCGGCCGTTGCGTGGAAGGGGGACTCAGTCGTCACTGGCAGCGGTTG
AATGGAGGCTCTTTGCCCCGCGCCCTCACGGTAGATGAAGTCCTTGCTTTGGTCAGAGCGATAGCTTCTC
CGATTGCCTCAGAGCAAGCGGACTACATTTCCCAGGGGGCTGCGGGACTGCCGGGAGGAGTGGGGGCGGT
GCCTCACGTCTGGTACAGTCATCACAAGCCTGTTCGGCGGGACTGTGATGGCCAGAGAGATGACGATCTT
AGGTGGGTTCCCGGGGGTCCTTGTTGCTCTTGCGGGCGTAGAGGCGATCTG
HSPA13 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
HSPA13_1 ↗21:14,383,146負股14,383,136–14,383,195

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR21_97P5L · promoter · 14382236–14382736 · regulatory

ENSR21_97P5P · enhancer · 14382737–14383135 · regulatory

ENSR21_97P5S · promoter · 14383136–14383504 · regulatory

ENSR21_C3FJH · enhancer · 14383505–14384559 · regulatory

ENSR21_55DCC2 · CTCF_binding_site · 14383650–14383671 · regulatory

· motif · 14383059–14383076 · motif

· motif · 14383196–14383209 · motif

· motif · 14383196–14383209 · motif

· motif · 14383652–14383668 · motif

· motif · 14383659–14383669 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:471 aa

1 aa471 aa功能區域訊號胜肽
依 P48723 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

HSPA13 蛋白質長 471 個胺基酸,屬於 heat shock protein 70 家族。序列註解標示第 1–22 位為 Signal,並將第 315–352 位區域註記為無序區(Disordered)。

訊號胜肽1–22 aa
功能區域Disordered315–352 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P48723…

AlphaFold · P48723

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Microsome;Endoplasmic reticulum

HSPA13 的定位註記包括微粒體與內質網;現有資料未提供定位隨條件或異構型改變的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Microsome。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 7 個夥伴 · 最多顯示 50 個
STCHHSPA13B4GALT5CRYGASGTASGTBUBQLN1UBQLN2UBQLN4
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

HSPA13 與 UBQLN2 有結合關係。現有資料未指出兩者是否形成特定複合體,也未描述其功能關係或結合條件。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能HSPA13 具有不依賴 peptide 的 ATPase 活性;現有敘述未提供活性發生的條件、實驗系統或相關生物學作用。資料庫紀錄
證據與來源

Has peptide-independent ATPase activity

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用Binds UBQLN2資料庫紀錄
證據與來源

Binds UBQLN2

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位HSPA13 的定位註記包括微粒體與內質網;原始資訊未區分不同條件或異構型的定位差異。資料庫紀錄
證據與來源

Microsome; Endoplasmic reticulum

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000285667 · 3,945 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ATCACAAGCCTGTTCGGCGGGACTGTGATGGCCAGAGAGA40
41TGACGATCTTAGGATCGGCTGTTTTGACTCTCCTGTTGGC80
81CGGCTATTTGGCACAACAGTATTTACCATTGCCTACTCCT120
121AAAGTGATTGGTATTGATCTTGGCACCACCTATTGTTCTG160
161TTGGGGTGTTTTTTCCTGGCACAGGAAAAGTAAAGGTGAT200
201TCCAGATGAAAATGGGCATATCAGCATACCCAGCATGGTG240
241TCTTTTACTGACAATGATGTATATGTGGGATATGAAAGCG280
281TAGAGCTGGCAGATTCAAATCCTCAAAACACAATATATGA320
321TGCCAAAAGATTCATAGGCAAGATTTTTACCGCAGAAGAG360
361TTGGAGGCTGAAATTGGCAGATACCCATTTAAGGTTTTAA400
401ACAAAAATGGAATGGTTGAGTTTTCTGTGACAAGTAATGA440
441GACCATCACAGTGTCCCCAGAATATGTTGGCTCTCGACTA480
481TTGTTGAAGTTAAAGGAAATGGCAGAGGCATATCTTGGAA520
521TGCCAGTTGCCAATGCTGTCATTTCTGTACCAGCAGAATT560
561TGATCTAAAACAGAGAAATTCAACAATTGAAGCTGCTAAC600
601CTTGCAGGACTGAAGATTTTGAGGGTAATAAATGAACCCA640
641CAGCAGCAGCTATGGCCTATGGTCTCCACAAGGCTGACGT680
681CTTCCACGTCTTGGTGATAGACTTGGGCGGAGGAACTCTA720
721GATGTGTCTTTACTGAATAAACAAGGAGGGATGTTTCTAA760
761CCCGAGCAATGTCTGGAAACAATAAACTTGGAGGACAGGA800
801CTTCAATCAGAGATTGCTTCAGTACTTATATAAACAGATC840
841TATCAAACATATGGCTTCGTGCCCTCTAGGAAAGAGGAAA880
881TCCACAGATTGAGACAAGCTGTGGAAATGGTCAAATTAAA920
921TCTGACTCTTCATCAATCTGCTCAGTTGTCAGTATTACTA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。