演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN GENE LOCUS

HSP90B2PGRP94P1

heat shock protein 90 beta family member 2, pseudogene

HSP90B2P 是 heat shock protein 90 beta family member 2, pseudogene;資料將其列為假基因。相關功能與粒線體內膜位置的描述均屬預測。

Homo sapiens15q26.3
OFFICIAL SYMBOL
HSP90B2P
CHROMOSOME
15
LOCUS TYPE
processed_pseudogene
TRANSCRIPTS
1
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

HSP90B2P 的正式名稱為 heat shock protein 90 beta family member 2, pseudogene,基因類型為假基因。現有資料未提供其 RNA 或蛋白質產物的基本性質、家族結構特色,也未說明是否產生功能性產物,因此不宜將預測的分子活動直接視為已確認的蛋白質功能。資料庫摘要僅提出若干預測的分子功能、可能參與的過程及可能位置,這些內容應保留其推論性質。

Official symbol
HSP90B2P
Gene name
heat shock protein 90 beta family member 2, pseudogene
Organism
Homo sapiens
Gene type
pseudogene
HGNC ID
HGNC:12099
Locus type
pseudogene
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
GRP94P1GRP94bTRAP1TRA1P1HSPCP2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1515q26.3
chr15 · 101,991,189 bp · GRCh38chr15p13 · 1–4200000 · gvarchr15p12 · 4200001–9700000 · stalkchr15p11.2 · 9700001–17500000 · gvarchr15p11.1 · 17500001–19000000 · acenchr15q11.1 · 19000001–20500000 · acenchr15q11.2 · 20500001–25500000 · gnegchr15q12 · 25500001–27800000 · gpos50chr15q13.1 · 27800001–30000000 · gnegchr15q13.2 · 30000001–30900000 · gpos50chr15q13.3 · 30900001–33400000 · gnegchr15q14 · 33400001–39800000 · gpos75chr15q15.1 · 39800001–42500000 · gnegchr15q15.2 · 42500001–43300000 · gpos25chr15q15.3 · 43300001–44500000 · gnegchr15q21.1 · 44500001–49200000 · gpos75chr15q21.2 · 49200001–52600000 · gnegchr15q21.3 · 52600001–58800000 · gpos75chr15q22.1 · 58800001–59000000 · gnegchr15q22.2 · 59000001–63400000 · gpos25chr15q22.31 · 63400001–66900000 · gnegchr15q22.32 · 66900001–67000000 · gpos25chr15q22.33 · 67000001–67200000 · gnegchr15q23 · 67200001–72400000 · gpos25chr15q24.1 · 72400001–74900000 · gnegchr15q24.2 · 74900001–76300000 · gpos25chr15q24.3 · 76300001–78000000 · gnegchr15q25.1 · 78000001–81400000 · gpos50chr15q25.2 · 81400001–84700000 · gnegchr15q25.3 · 84700001–88500000 · gpos50chr15q26.1 · 88500001–93800000 · gnegchr15q26.2 · 93800001–98000000 · gpos50chr15q26.3 · 98000001–101991189 · gnegHSP90B2Ppq1 bp101,991,189 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr15:99,257,632–99,260,015
Gene span
2,384 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000559111 ★99,257,632–99,260,0151

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

已知功能與來源註解

資料預測 HSP90B2P 可能具有 ATP 結合、ATP 水解,以及結合未摺疊蛋白質的能力;這些並非已確認的實驗結果。ATP 結合與 ATP 水解分別涉及對 ATP 的結合及其水解活動,但現有摘要沒有說明兩者是否由同一產物執行,也未提供具體分子機制或反應條件。由於 HSP90B2P 被分類為假基因,這些預測不應直接解讀為已證實的蛋白質活性。

資料亦預測 HSP90B2P 可能參與蛋白質摺疊。未摺疊蛋白質結合的預測,與此過程在概念上相符,但摘要沒有交代兩者之間是否存在直接因果關係,也未指出作用對象、摺疊步驟或調控方式。因此,目前能保留的結論是資料提出可能涉及蛋白質摺疊與未摺疊蛋白質結合,不能進一步推定其在細胞中的具體作用。

在細胞位置方面,資料預測其可能位於粒線體內膜。此定位同樣屬預測,摘要未提供定位驗證、產物形式或其他細胞區室資訊。綜合而言,現有資料提出 HSP90B2P 可能具有的分子活動、可能參與的生物學過程及可能位置,但沒有提供足以確認這些功能或闡明其生物學意義的實驗細節。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 99257632 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>HSP90B2P ENST00000559111 GRCh38 chr15:99256632-99257732 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ATTGCCCTGTGAAACTCAAATGATTTTGAATTGGGCTAGCATACAATTTTTTGGAAAAAATTTTGCCACA
AAGGCAACATTTAATTTGCTCTTTTTATGTTCTAAGAATAAGCACGTAGTTTTCATTATAATCTGAATTG
TATTACATATAAGATAAACTAAAAGTTTTTCAAGAGAATGTCCAAATCAAGCTTTTTATTCCTATTATTT
ATTGTAAAATTTGGTCTCTGTATTAAATGGATTTACTTTGTATGGCCTTTTCTGGTTATCACTTAACCTT
ATTTGAATCTTGTACTTGAATTCTAGTGCTTACTCATTTTAGATGATTTATGAAATCTTACTACTTTGTG
AATTTACCCATTCTTCATTCCCTTCCCTATACTGGACTTTGCTAAATATCTGGAAATTGTATCTTATTGG
CTTCAAGTATATGGCATGTTTTCCTGGAAAAGTTTTATTTAATCTATGTACAATGCCTATAGTGGGTAGA
AAGCATTATAAAATTAGTTTATCTTTGCTCTGTCTGGAAGTAAATAGATACGTATGTCTTGTTCTTTTGT
GATTGGCATATTGGCATATATGTTGAATGCCTACTTATATTTCTGAAATTAGATTTTTCAGTTTTCCAAC
TTGGAAAATCTATTTGCAGTTATAGGAATCCTTTTTTGCAAAGTCATCATCCCGTGCTATGAAACCATAT
TAGTACTTTTTAACCCTTTAACGAGAAGTGGTATAAGAAATATTTTGACAAGGATTATAGCCTAGATTTT
CCCATGTTTGTTCTTTATGTATAAAGAAAAATTTGTGATTGGATTACTTATTAACTATCTGCCATAGCCC
AATGGGGTAGACTTTGTTCAGAGAATTGACCTTTGCTTATAAAAGTTAAATTTGTGGGCGGACCACGCGG
CTGGAGGTGTGAGGATCCAACCCGGGGGTGAGAGGGTGGAGGTGGCTCTTGCGATCGAAAGGGACTTGAG
ACTCACCAGCCACAAGCTGTGAAGGCCCTGTGGGTGCTGGGGCCTCTGCTGCGTCCTGCTGACCTTCGGG
TCGGTCAGAGCTGTTGATGAAGTTGATGTGGAAGGTACAGTAGAAGAGGAT
HSP90B2P 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR15_CCSWN · enhancer · 99251552–99252706 · regulatory

ENSR15_BPNSM · enhancer · 99253500–99254023 · regulatory

· motif · 99253369–99253391 · motif

· motif · 99253369–99253391 · motif

· motif · 99253542–99253553 · motif

· motif · 99253794–99253809 · motif

· motif · 99253801–99253809 · motif

· motif · 99257297–99257311 · motif

· motif · 99257494–99257506 · motif

· motif · 99257545–99257557 · motif

· motif · 99257566–99257579 · motif

· motif · 99257667–99257679 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / GENE ANATOMY

基因座與轉錄註解

pseudogene

HSP90B2P 依 HGNC/Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。

轉錄本Biotype拼接長度Exons
ENST00000559111 ★processed_pseudogene2,384 nt1

拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與基因產物定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

1 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能資料預測 HSP90B2P 可能具有 ATP 結合、ATP 水解及未摺疊蛋白質結合功能,也可能參與蛋白質摺疊,並位於粒線體內膜。上述功能、過程與位置皆屬預測,並非已確認的實驗結果。推論支持
證據與來源

Predicted to enable several functions, including ATP binding activity; ATP hydrolysis activity; and unfolded protein binding activity. Predicted to be involved in protein folding. Predicted to be active in mitochondrial inner membrane.

開啟資料庫紀錄 ↗

· CC BY 4.0
情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

DNA 與 RNA 序列

完整非編碼轉錄本 · FASTA
ENST00000559111 · 2,384 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GAAGGCCCTGTGGGTGCTGGGGCCTCTGCTGCGTCCTGCT40
41GACCTTCGGGTCGGTCAGAGCTGTTGATGAAGTTGATGTG80
81GAAGGTACAGTAGAAGAGGATCTGGGTAAAAGTAGACAAG120
121GCTCAAGGATGGATGATGAAGTAGTACAGAGAGAGGAAGA160
161AGCTATTCAGTTGGATAAATTAAATGCATCACAAATAAGA200
201GAACTTAGAGAGAAGTTGGAAAAGTTTGCCTTCCAAGCTG240
241AAGTTAACAGAATGATGAAACTTATCATCAATTCATTGTA280
281TGAAAATAAAGAGATTTTCCTTAGAGAACTGATTCTGACG320
321CTTTAGTTAAGATAAGGCTGATATCACTGACTAATGAAAA360
361TGCTCTTTCTGGAAATGAGGAACTAACAGTCAAAATTAAG400
401TGTGATAAGGTGAAGAACCTACTGCATGTCACAGACACTG440
441GTGTAGGAATGACCAGAGAAGAGTTGGTTAAAAACCTTGG480
481TACCATAGCCAAATCTTGAACAAACGAGTTTTTAAACAAA520
521ATGACTGAAGCACAGGAAGATGGCCAGTCAACTTCTGAAT560
561TGATTGGCCAGTTTGGTGTCAGTTTCTATTCCATCTTCCT600
601TGTAGCAGATAAGGTTATTGTCACTTCAAAACACAACAAC640
641GATACCCAGTACATCTGGGAGTCTGAATCCAATGAATATT680
681CTGTAATTGCTGACCCAAGAGGAAACACTCTAGGACGGGG720
721AACGACCATTACCCTTGTCTTAAAAGAAAAAGCATTTGAT760
761TACCTTGCATTGGATACAATTAAAAATCTCATCAAAAATA800
801TTCACAGTTCATAAACTTTCCTATTTATGTATGGAGCAGC840
841AAGACTGAAACTGTTAAGGAGCCATGAAGGAAGAAGCAGC880
881AGCAAAAGAAGAGAAAGAAGAATCTTATGATGAAGCTGCA920
921GTAGAGGAAGAAGAAGAAAAACAGAAACCAAAGACTAAAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。