基因總覽
HNRNPA3P1 的正式名稱為 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 pseudogene 1，基因類型為偽基因。此位點與 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 家族成員具有序列相似性，並被描述為 HNRPA3 的表觀轉錄偽基因；HNRPA3 位於第 2 號染色體。現有資料未提供 HNRNPA3P1 的 RNA 或蛋白質產物特性、轉錄條件、結構資訊或生物學功能，因此不能據此推定它具有特定的蛋白質產物或作用。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000401429 ★ | 43,789,249–43,790,387 | 1 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
已知功能與來源註解
現有資料僅指出 HNRNPA3P1 是與 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 家族序列相似、且表觀上有轉錄的 HNRPA3 偽基因；未提供其分子作用、參與的生物學過程或功能效應，因此無法進一步說明其生物學功能。
Promoter 與基因調控
>HNRNPA3P1 ENST00000401429 GRCh38 chr10:43790287-43791387 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTGCCCCCAAATTACTCTTATCTGCCCAAAAGTAAAGAAAGTTTCAATTCAGCAAGTCAGAGCAATTCAC AGAGAAGAAGCAATGCACTGACCTCTGGCACAGAAAACTAGAAGTTGGTCCTTCTCCATTTCTTCTGTTA ACCAAGGTTCTCTTGGCATTTAATTTTACAAGGGCCAGAGACAACTCCAGGGATCTCAATGCAATCCTGC TTCTGGATGGGACAAAGAAGGCATCAGCCGCACAGGAGAAAATCACAGCTGTCCTTTCATTCTGTTCAAG CACACATGAAGCTCCTTCTAGGTTCATCCACTGTGTGCCAAACACCTGGGACAGTCAGAGAAGAATAATG ATGCCAGCCTTCTAAGAGCTGGCAGACCAGTGAGAGAGCAGGCTCAAGACATGGCAGAGTCAAACACAGA CAGAAAGCTATGGTATCTCAGAGGAAGATGATGAGATTTGGAAAGCTCCCAGAGAAGATGGGACTGGAGC TGGGCTGCTTAGCACTGAAACAGTGGATTTGGGGAGAATATTTGCATGCAAGTAAAATATGCAAAAGATG TTCAAAGAACAACCAAAAGTGGTAGAAATGTGGAGTGAGAAATACTGAAATGTCCACAGCTCAGGAAAAC ATGTTTTCCAACCAGCATCCCTGACCATTCCCCCTTCCCCAGGTCTAGGGCATCTAGAGCACCAAAATTA CCAGCAACTCTCATCTTTCCTGACCCCTCCTTACTTCACTTTTGATCTAAAAGTACATTCCGGCCTCATC TAACCATTTAAAAAGCCATTTTCAGGTCCATGTCAGTGGCTCAATTGAGATACTGCAAGACAGTGTGGTT TTTCCTGAAGTCACAAGTTATCAATGAAGTTCAGAGTAAGTCCTGAACTGCAGAGGGAAAGTGTGCTGAT CCAGGCAGAGTTGCCTAAATGAAAACGCTGGCCACCTTCCTCTCGGTCCCATATTGATCTCGAGTTGGAA GAGGTGAGTCCTGTCTCAAAATGGAGGTAAAACCGCCGCCTGGTTGCCCCCAGCCCGACTCCGGCAGTCG CCGTCGCCACTGGGGGGAGGAGGGCCATGATCCAAAGGAACCAGAGCAGCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| HNRPA3_1 ↗ | 10:43,790,427 | 負股 | 43,790,417–43,790,476 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR10_839QGR · enhancer · 43785347–43785543 · regulatory
ENSR10_5DB3RD · CTCF_binding_site · 43785433–43785454 · regulatory
ENSR10_C6CBZ · enhancer · 43793660–43794807 · regulatory
· motif · 43785435–43785451 · motif
· motif · 43793949–43793958 · motif
· motif · 43793949–43793958 · motif
· motif · 43794559–43794569 · motif
· motif · 43794566–43794579 · motif
基因座與轉錄註解
HNRNPA3P1 依 HGNC／Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000401429 ★ | processed_pseudogene | 1,139 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | HNRNPA3P1 與 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 家族具有序列相似性，並被描述為 HNRPA3 的表觀轉錄偽基因；HNRPA3 位於第 2 號染色體。這些資訊未說明 HNRNPA3P1 的轉錄條件或功能。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源This locus shares sequence similarity with heterogeneous nuclear ribonuclear proteins and represents an apparent transcribed pseudogene of the HNRPA3 gene, which maps to chromosome 2. |
DNA 與 RNA 序列
ATGGAGGTAAAACCGCCGCCTGGTTGCCCCCAGCCCGACT40CCGGCAGTCGCCGTCGCCACTGGGGGGAGGAGGGCCATGA80TCCAAAGGAACCAGAGCAGCTGAGAAAACTGTTTATTGGT120GGTCTGAGCTTTGAAACTACAGATGATAGTTTAAGAGAAC160ATTTTGAGAAATGGGGCACACTCACAGATTGTCTGGTAAT200GAGAGACCCCCAAACAAAACGTTCCAGGGGCTTTGGTTTT240GTGACTTATTCTTGTGTTACAGAGGTGGATGCAGCAATGC280GTGCTCGACCATTCAAGGTTGATGGGCGTGTAGTGGAACC320AAAGAGAGCTGTTTCTAGAGAGGATTCTGTGAAGCCTGGT360GCCCATCTAACAGTGAAGAAAATTTTTGTTGGCAGTATTA400AAGAAGATACAGAAGAATATAATTTGAGAGACTACTTTGA440AAAGTACGGCAAGATTGAAACCATAGAAGTTATGGAAGAC480AGGCAGAGTGGAAAAAAGAGAGGATTTGCTTCTGTAACTT520TTGATGATCATGATACAGTTGATAAAATTGTTGTTCAGAA560ATACCACACTATTAATGGGCATAACTGTGAAGTGAAAAAG600GCCCTTGCTAAACAAGTGATGCAGCCGGCTGGATCACAGA640GGGGTCGTGGAGGTGGATCTGGCAATTGTATGGGTCACAG680AGGAAACTTTGGAGGTGGTGGAGGTAATTTTGGCCGTGAT720GGAAACTTTGGTGGAAGAGGAGGCTATGGTGGTGGAGGTG760GTGGCAGCAGAGGTAGTTATGGAGGAGGTGATGTGGATAT800AATGGATTAGGAGGTGATGGTGGCAACTATGGCAGTGGTC840CTGGTTATAGTAGTAGAGGCGGGTATGGTGGTGGTGGACC880AGGATATGGAAACCAAGGTGGTGGATATGGTGGCGGTGTT920GGAGGATATGATGGTTACAATGAAGGAGGAAATTTTGACG960cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。