基因總覽
HNF1B（HNF1 homeobox B）是位於人類第 17 號染色體 17q12 的蛋白質編碼基因，產生 557 個胺基酸的蛋白質。其產物屬於 HNF1 homeobox 家族，具有 HNF-p1、非典型 POU-specific 區域及 HNF1 型 homeobox DNA 結合區等結構特徵。這些特徵與其作為轉錄因子的性質相符；來源資料也指出其能結合特定 DNA 序列。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000617811 ★ | 37,686,431–37,745,059 | 9 |
| ENST00000621123 | 37,686,431–37,745,095 | 9 |
| ENST00000613727 | 37,686,431–37,745,095 | 7 |
| ENST00000614313 | 37,686,431–37,745,095 | 8 |
| ENST00000904916 | 37,686,431–37,745,095 | 8 |
| ENST00000904917 | 37,686,431–37,745,095 | 9 |
| ENST00000988052 | 37,686,431–37,745,095 | 7 |
| ENST00001014829 | 37,686,431–37,745,095 | 8 |
| ENST00001142657 | 37,686,431–37,745,095 | 9 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
HNF1B 是轉錄因子，可辨識並結合倒置回文序列 5'-GTTAATNATTAAC-3'。這項 DNA 結合特性是其參與轉錄調控的直接分子基礎；來源提供的資料並未進一步列出其調控的廣泛基因或生物過程，因此不宜將功能延伸至未指明的標的或組織。
在 PLAU 基因方面，HNF1B 可結合其 cAMP 調控單元中的 FPC 元件。此項結合是依相似性推定，應視為推論性註解，而非在此來源中明確描述的直接實驗證實。來源未進一步說明該結合對 PLAU 表現造成的方向或幅度變化。
HNF1B 的轉錄活性可受共活化因子 PCBD1 增強。互作資料也指出 PCBD1 與 HNF1B 的結合涉及 HNF-p1 區域，並提高其轉錄活化能力；PCBD2 的互作同樣與轉錄活性增加相關。這些資料支持共活化因子參與調節 HNF1B 的轉錄功能，但未提供其作用條件或下游靶基因的完整細節。
Promoter 與基因調控
>HNF1B ENST00000617811 GRCh38 chr17:37744959-37746059 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AAATGAGTGGGCCGGGGGGACCCTCGGCTGCAAGTGTCCACCCAGCTGCAGGTCAAGCTTTGCTTTCACT GCCTCACCATCCTAGTGCCTCACCATCCTAGTGCCTCACCATCCTAGTGCCTCACCATTCTGCCTCACCA TCCTCCCCCAAGGCGGAGGCGCCTTGACATCCGGGTTTAAACAGGAGAGTGAGGAGCCCCAGGGGTCCAG CTCCCCAGTGGCGTGGCCAGGCTGGGCGCCGGTGCAGCCCAGCTGCTGGGGGAGCTTCACTTTGGCTACT CCCTCTACCCATAAAGTAGTCTCTTTCCAAGAGTTCTCCCGGACTCCTTCACCCTCGCCTACGCTCTCTG GCGGGCAGTTCTGCAAACCCAAACCGCCAGACCAGGCCAGGGAGGTTCTGGGGCCTGGAGGTAGTAACCG AGGTAGAAATAAATGGAGTCCCTCCAGGGCATGCTCACCACACCTAACGCTGCCTCACCTCCCCCGTGGC CTCGGCGCCCCTTCCTAAGTGGTCAGTTTCTCTTCCGCCCTGCGGGCTCTCCTGGCCCACCACCTGCGTC GGCCGGGACGCATCCAGGGTCTCTACTCTTCGCTTCCTCCTGCGTCCCCTTCTTCCACGAGCACCCCAGC TTCCTCTGGCTCTCACCTGAACCCCGAAGCGTAGTGTCTTCTCTCTGGACTAAAGCGGAACTGAGAACCG GTGGAAAAGCCCCGCGCCTAGGCTGCAAGGCACTGGCTTAACAAGTCCAAAGGTTAGGTGAAGTTTGGCT GATAAGCAGAACCAGTAAAAGAAGGTCTCTAGCCCCCCAGCGTGAGTACAATGGACCCTGGCAAAGCCCC GCTCCCGGCCCAGGTCTTCTGCTCTCCAGGTCTGCCCCTCCGGCTCTCCCTCTCTCCGGGTTTCCCCCTC CCCACCATCATTTGCATCCAGCCGAAAGCTGGGCCCTTCCCACTAATTTGCATATCTTATATGGCCTAAT GGTGGCGATCATGGCAAGTTAGAAGTTTTCTGACTCCTTTCGGAGGAGCCTCCGGGACCCCGGGGAGTAA CAGGTGTCTGGAGGCTGAAGGGTGGAGGGGTTCCTGGATTTGGGGTTTGCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| HNF1B_1 ↗ | 17:37,745,059 | 負股 | 37,745,049–37,745,108 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_834Z27 · promoter · 37745008–37745157 · regulatory
ENSR17_C5Q5G · enhancer · 37745158–37746188 · regulatory
ENSR17_5BTP8R · CTCF_binding_site · 37746158–37746179 · regulatory
· motif · 37741932–37741947 · motif
· motif · 37741934–37741947 · motif
· motif · 37741937–37741949 · motif
· motif · 37741940–37741947 · motif
· motif · 37742022–37742035 · motif
· motif · 37743041–37743050 · motif
· motif · 37743041–37743050 · motif
· motif · 37743300–37743312 · motif
· motif · 37743350–37743361 · motif
· motif · 37743425–37743436 · motif
· motif · 37744820–37744827 · motif
· motif · 37745012–37745025 · motif
· motif · 37745012–37745025 · motif
· motif · 37745094–37745107 · motif
· motif · 37745130–37745143 · motif
· motif · 37745303–37745317 · motif
· motif · 37745304–37745317 · motif
· motif · 37745367–37745378 · motif
· motif · 37745367–37745380 · motif
· motif · 37745681–37745689 · motif
· motif · 37745852–37745865 · motif
· motif · 37746160–37746176 · motif
· motif · 37747459–37747481 · motif
· motif · 37747459–37747481 · motif
· motif · 37747531–37747553 · motif
· motif · 37747531–37747553 · motif
· motif · 37747981–37747992 · motif
· motif · 37748564–37748578 · motif
· motif · 37748564–37748578 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：557 aa
HNF1B 蛋白質長 557 個胺基酸，屬於 HNF1 homeobox 家族。其註解包括第 1–32 位的 HNF-p1 區域、第 93–188 位的非典型 POU-specific 區域，以及第 231–311 位的 HNF1 型 homeobox DNA 結合區。第 1–31 位另標註為二聚化區域；第 64–85 位與第 324–352 位則被註解為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
HNF1B 的細胞內定位註記為細胞核；來源未提供定位變化的條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 13 個夥伴
- BPIFA1Q9NP55 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- C10orf55Q5SWW7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CRXO43186 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HNF1AP20823 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- KRTAP26-1Q6PEX3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MLLT10P55197-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- OTX2P32243-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- OXER1Q8TDS5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PCBD1P61457 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- POU6F2P78424 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UFSP1Q6NVU6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- USP54Q70EL1-9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VAC14Q08AM6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
HNF1B 以二聚體形式結合 DNA，可形成同源二聚體，也可與 HNF1-alpha 形成異源二聚體。它亦與 PCBD1 及 PCBD2 互作；PCBD1 的結合涉及 HNF-p1 區域。這兩種互作均與 HNF1B 轉錄活性增加相關。
疾病與遺傳關聯
影響 HNF1B 的變異可造成腎囊腫與糖尿病症候群（RCAD），此常染色體顯性疾病包括因腎臟發育異常而來的非糖尿病腎病，以及糖尿病；部分病例在 25 歲前發病，符合 MODY5。腎臟表現差異很大，也可能伴有生殖道異常。另有資料指出，影響 HNF1B 的變異可能與第二型糖尿病易感性相關；這是易感性關聯，不代表必然致病。遺傳性前列腺癌 11（HPC11）則與影響 HNF1B 的變異相關，資料描述的是疾病易感性關聯。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | HNF1B 是轉錄因子，可結合序列 5'-GTTAATNATTAAC-3' 的倒置回文。在 PLAU 基因的 cAMP 調控單元中，它也可結合 FPC 元件，但此項依相似性推定。共活化因子 PCBD1 可提高 HNF1B 的轉錄活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Transcription factor that binds to the inverted palindrome 5'-GTTAATNATTAAC-3'. Binds to the FPC element in the cAMP regulatory unit of the PLAU gene (By similarity). Transcriptional activity is increased by coactivator PCBD1 PMID 17924661 ↗ · PMID 24204001 ↗ · PMID 7900999 ↗ |
| 交互作用 | HNF1B 以二聚體形式結合 DNA，可形成同源二聚體或與 HNF1-alpha 形成異源二聚體。HNF1B 可透過 HNF-p1 區域與 PCBD1 互作，也可與 PCBD2 互作；這兩種互作都會提高其轉錄活化能力。 | 含實驗來源 | 證據與來源Binds DNA as a dimer. Can form homodimer or heterodimer with HNF1-alpha. Interacts (via HNF-p1 domain) with PCBD1; the interaction increases its transactivation activity. Interacts with PCBD2; the interaction increases its transactivation activity PMID 17924661 ↗ · PMID 33749890 ↗ |
| 細胞定位 | HNF1B 的細胞內定位為細胞核。 | 資料庫紀錄 | |
| 疾病關聯 | 腎囊腫與糖尿病症候群（RCAD）為常染色體顯性疾病，包括因腎臟發育異常所致的非糖尿病腎病，以及糖尿病；部分患者在 25 歲前發病，符合 MODY5。腎臟表現多樣，並可能有生殖道異常。此病由影響 HNF1B 的變異造成。 | 含實驗來源 | 證據與來源Renal cysts and diabetes syndrome RCAD An autosomal dominant disorder comprising non-diabetic renal disease resulting from abnormal renal development, and diabetes, which in some cases occurs earlier than age 25 years and is thus consistent with a diagnosis of maturity-onset diabetes of the young (MODY5). The renal disease is highly variable and includes renal cysts, glomerular tufts, aberrant nephrogenesis, primitive tubules, irregular collecting systems, oligomeganephronia, enlarged renal pelves, abnormal calyces, small kidney, single kidney, horseshoe kidney, and hyperuricemic nephropathy. Affected individuals may also have abnormalities of the genital tract. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 137920 PMID 10484768 ↗ · PMID 10672455 ↗ · PMID 11845238 ↗ · PMID 11918730 ↗ · PMID 14583183 ↗ · PMID 15001636 ↗ · PMID 15068978 ↗ · PMID 15181075 ↗ · PMID 15930087 ↗ · PMID 16249435 ↗ · PMID 24204001 ↗ |
| 疾病關聯 | 第二型糖尿病是多因素造成的葡萄糖恆定異常，與胰島素敏感性不足有關；患者通常有肥胖體態，並可能出現胰島素阻抗、高血壓及高三酸甘油酯血症等代謝症候群表現。疾病可造成眼、腎、神經與血管的長期併發症。影響 HNF1B 的變異可能與疾病易感性相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Type 2 diabetes mellitus T2D A multifactorial disorder of glucose homeostasis caused by a lack of sensitivity to insulin. Affected individuals usually have an obese body habitus and manifestations of a metabolic syndrome characterized by diabetes, insulin resistance, hypertension and hypertriglyceridemia. The disease results in long-term complications that affect the eyes, kidneys, nerves, and blood vessels. Disease susceptibility may be associated with variants affecting the gene represented in this entry MIM: 125853 PMID 12161522 ↗ |
| 疾病關聯 | 遺傳性前列腺癌 11（HPC11）與家族性前列腺癌易感性相關；多數前列腺癌為發生於前列腺管腺泡的腺癌，另有約 5% 病例屬於多種較少見的組織病理類型。資料指出，影響 HNF1B 的變異與此疾病易感性相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Prostate cancer, hereditary, 11 HPC11 A condition associated with familial predisposition to cancer of the prostate. Most prostate cancers are adenocarcinomas that develop in the acini of the prostatic ducts. Other rare histopathologic types of prostate cancer that occur in approximately 5% of patients include small cell carcinoma, mucinous carcinoma, prostatic ductal carcinoma, transitional cell carcinoma, squamous cell carcinoma, basal cell carcinoma, adenoid cystic carcinoma (basaloid), signet-ring cell carcinoma and neuroendocrine carcinoma. Disease susceptibility is associated with variants affecting the gene represented in this entry MIM: 611955 PMID 18264097 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGAAGTTTTCTGACTCCTTTCGGAGGAGCCTCCGGGACCC40CGGGGAGTAACAGGTGTCTGGAGGCTGAAGGGTGGAGGGG80TTCCTGGATTTGGGGTTTGCTTGTGAAACTCCCCTCCACC120CTCCTCTCTCGCACCCACCCACCCCCTCACCCCCTTCTTT160TTCCGTCCTTGGAAAATGGTGTCCAAGCTCACGTCGCTCC200AGCAAGAACTCCTGAGCGCCCTGCTGAGCTCCGGGGTCAC240CAAGGAGGTGCTGGTTCAGGCCTTGGAGGAGTTGCTGCCA280TCCCCGAACTTCGGGGTGAAGCTGGAGACGCTGCCCCTGT320CCCCTGGCAGCGGGGCCGAGCCCGACACCAAGCCGGTCTT360CCATACTCTCACCAACGGCCACGCCAAGGGCCGCTTGTCC400GGCGACGAGGGCTCCGAGGACGGCGACGACTATGACACAC440CTCCCATCCTCAAGGAGCTGCAGGCGCTCAACACCGAGGA480GGCGGCGGAGCAGCGGGCGGAGGTGGACCGGATGCTCAGT520GAGGACCCTTGGAGGGCTGCTAAAATGATCAAGGGTTACA560TGCAGCAACACAACATCCCCCAGAGGGAGGTGGTCGATGT600CACCGGCCTGAACCAGTCGCACCTCTCCCAGCATCTCAAC640AAGGGCACCCCTATGAAGACCCAGAAGCGTGCCGCTCTGT680ACACCTGGTACGTCAGAAAGCAACGAGAGATCCTCCGACA720ATTCAACCAGACAGTCCAGAGTTCTGGAAATATGACAGAC760AAAAGCAGTCAGGATCAGCTGCTGTTTCTCTTTCCAGAGT800TCAGTCAACAGAGCCATGGGCCTGGGCAGTCCGATGATGC840CTGCTCTGAGCCCACCAACAAGAAGATGCGCCGCAACCGG880TTCAAATGGGGGCCCGCGTCCCAGCAAATCTTGTACCAGG920CCTACGATCGGCAAAAGAACCCCAGCAAGGAAGAGAGAGA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。