演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

HHATLMG56

hedgehog acyltransferase like

HHATL 是膜結合型 acyltransferase 家族的蛋白質,與 SHH 的 N 端 palmitoylation 調控有關。

Homo sapiens3p22.1UniProt Q9HCP6
OFFICIAL SYMBOL
HHATL
CHROMOSOME
3
UNIPROT
Q9HCP6
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

HHATL(hedgehog acyltransferase like)是蛋白質編碼基因,產生的蛋白質屬於膜結合型 acyltransferase 家族中的 HHAT subfamily。現有資料指出,HHATL 與 SHH 的 N 端 palmitoylation 調控相關;其蛋白質具有多個跨膜區段,符合膜結合型蛋白質的特徵。資料未提供更進一步的生理角色或結構細節。

Official symbol
HHATL
Gene name
hedgehog acyltransferase like
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13242
UniProt
Q9HCP6
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
MG56KIAA1173OACT3MSTP002MBOAT3C3orf3GUP1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 33p22.1
chr3 · 198,295,559 bp · GRCh38chr3p26.3 · 1–2800000 · gpos50chr3p26.2 · 2800001–4000000 · gnegchr3p26.1 · 4000001–8100000 · gpos50chr3p25.3 · 8100001–11600000 · gnegchr3p25.2 · 11600001–13200000 · gpos25chr3p25.1 · 13200001–16300000 · gnegchr3p24.3 · 16300001–23800000 · gpos100chr3p24.2 · 23800001–26300000 · gnegchr3p24.1 · 26300001–30800000 · gpos75chr3p23 · 30800001–32000000 · gnegchr3p22.3 · 32000001–36400000 · gpos50chr3p22.2 · 36400001–39300000 · gnegchr3p22.1 · 39300001–43600000 · gpos75chr3p21.33 · 43600001–44100000 · gnegchr3p21.32 · 44100001–44200000 · gpos50chr3p21.31 · 44200001–50600000 · gnegchr3p21.2 · 50600001–52300000 · gpos25chr3p21.1 · 52300001–54400000 · gnegchr3p14.3 · 54400001–58600000 · gpos50chr3p14.2 · 58600001–63800000 · gnegchr3p14.1 · 63800001–69700000 · gpos50chr3p13 · 69700001–74100000 · gnegchr3p12.3 · 74100001–79800000 · gpos75chr3p12.2 · 79800001–83500000 · gnegchr3p12.1 · 83500001–87100000 · gpos75chr3p11.2 · 87100001–87800000 · gnegchr3p11.1 · 87800001–90900000 · acenchr3q11.1 · 90900001–94000000 · acenchr3q11.2 · 94000001–98600000 · gvarchr3q12.1 · 98600001–100300000 · gnegchr3q12.2 · 100300001–101200000 · gpos25chr3q12.3 · 101200001–103100000 · gnegchr3q13.11 · 103100001–106500000 · gpos75chr3q13.12 · 106500001–108200000 · gnegchr3q13.13 · 108200001–111600000 · gpos50chr3q13.2 · 111600001–113700000 · gnegchr3q13.31 · 113700001–117600000 · gpos75chr3q13.32 · 117600001–119300000 · gnegchr3q13.33 · 119300001–122200000 · gpos75chr3q21.1 · 122200001–124100000 · gnegchr3q21.2 · 124100001–126100000 · gpos25chr3q21.3 · 126100001–129500000 · gnegchr3q22.1 · 129500001–134000000 · gpos25chr3q22.2 · 134000001–136000000 · gnegchr3q22.3 · 136000001–139000000 · gpos25chr3q23 · 139000001–143100000 · gnegchr3q24 · 143100001–149200000 · gpos100chr3q25.1 · 149200001–152300000 · gnegchr3q25.2 · 152300001–155300000 · gpos50chr3q25.31 · 155300001–157300000 · gnegchr3q25.32 · 157300001–159300000 · gpos50chr3q25.33 · 159300001–161000000 · gnegchr3q26.1 · 161000001–167900000 · gpos100chr3q26.2 · 167900001–171200000 · gnegchr3q26.31 · 171200001–176000000 · gpos75chr3q26.32 · 176000001–179300000 · gnegchr3q26.33 · 179300001–183000000 · gpos75chr3q27.1 · 183000001–184800000 · gnegchr3q27.2 · 184800001–186300000 · gpos25chr3q27.3 · 186300001–188200000 · gnegchr3q28 · 188200001–192600000 · gpos75chr3q29 · 192600001–198295559 · gnegHHATLpq1 bp198,295,559 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr3:42,692,661–42,703,260
Gene span
10,600 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000441594 ★42,692,663–42,702,79812
ENST0000031041742,692,661–42,701,54013
ENST0000088828342,692,661–42,703,26012
ENST0000088828442,692,661–42,702,83112
ENST0000088828542,692,661–42,702,83113
ENST0000088828642,692,661–42,702,83112
ENST0000088828742,692,661–42,702,83113
ENST0000088828842,692,661–42,702,83111
ENST0000088828942,692,661–42,702,83111
ENST0000088829042,692,661–42,702,83112
ENST0000088829142,692,661–42,702,83113
ENST0000088829242,692,661–42,702,83112

顯示 12/47 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

HHATL 與 SHH 的脂質修飾調控相關。資料指出,HHATL 負向調節由 HHAT/SKN 進行的 SHH N 端 palmitoylation,表示 HHATL 的作用方向是抑制這項修飾,而非促進它。

SHH 的 N 端 palmitoylation 是來源所指明的調控對象;HHAT/SKN 則是執行該修飾的分子。現有資料未說明 HHATL 如何造成此負向調節,也未提供調控發生的細胞或生物學條件,因此不宜進一步推定其分子機制或作用情境。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 42702798 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>HHATL ENST00000441594 GRCh38 chr3:42702698-42703798 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCCCTTCCTGGGCCCTGATGGGTGGGGAGCAGCACCTCCCTCCTGCCTCCTCAACTGAGCCTGAAGCTGG
GGTCATAGGATCAGCAGGGGCTCCAGGAGCTGTCCTGTGACTGATCACAGCCACAAAGCTCCTTCTACCC
CCGAGAGCCTCCCCACAAGCACACAGGTGAACAGGTCCCCCTAGATAGCACAGACACATACAGCTGCCCG
AGACTTGGCCTCAACCGAAGGGGCACTGTCAGAGGTTCTTAATCTCAGGGGCACCTTCAGGATGCCCCTC
CCCTCAGGTATCCAGGGCTGAGGCCTTGGATGCTCCCTTCCAGAATGAGGGCCCTGTCCTACCAGGACTC
CCAGTTGGTTAGGAACACACCTGTCTTCCTGTCTGCCTCCACTCTGCCACCGAGAGGATACCAGCCATTC
CAAGTACCCACAAGCCTTGCCAAGTGACCCTGCTAGCACCCCTCCATCCAGGACACTCCCTATGGGACAG
GGCTGACTTATGGGGATCCCTCTCAGCCACATGTCCCATGCCAGTTCCAGTCCCATCAGGCAAGTCAGCC
CTCCCTCAGGCACTGATGCATGGCCAGCCAGGACTCACGGCATAATGAAAAGGACCAGGTCATGGGGCGA
GACAAGTCTGCCCTGGGATAGCCCTTAGGAGGTCATATGTAAAGGTAGGAGCTGGAGTCCCTGGAGCCCA
AGCATGAAAGTGTTTGCATGTTGTGACTGTGTGTGTCTGTGGTGGGGGCAGGGCTTACAAGCCTGGAGAG
GCTGGTGGGACCACCAGGAGTCTTCCTGGAAGAGGGAAGTCCTGGGTAGCAGTGAGAGAGAGGCACAGGC
TCTCTAGGAGCCAGGGGAGGCAGGCTGAAGAGAGGCCCAGGTGTCCCTGTCTGAGCCTATGCTACTGGAC
ACCCTCCCCCCACCCAGCACCCGCCCCCCTTCAAGGATCCTCCCTGCGGCTCCCTGTGGCCAGCAGCTCT
GCAGCACTCGGCTCTGCTCCACTCTGCTCAGCTCCGCTCCAGGAAGGCCACCTCCTCCTCCCCCTCCTCC
TCCCGCTGTCACCACTCACCGCTCATAACCTCAAGGGGGTGGGGACCCCAG
HHATL 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
HHATL_2 ↗3:42,701,521負股42,701,511–42,701,570
HHATL_3 ↗3:42,702,671負股42,702,661–42,702,720
HHATL_1 ↗3:42,702,798負股42,702,788–42,702,847

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:504 aa

1 aa504 aa跨膜區
依 Q9HCP6 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

HHATL 歸屬於膜結合型 acyltransferase 家族的 HHAT subfamily。蛋白質序列長 504 個胺基酸,註解出八段螺旋型跨膜區段,位置分別為 12–31、65–87、100–122、127–149、251–273、288–310、429–446 與 461–483。這些區段屬於序列註解。

跨膜區Helical12–31 aa
跨膜區Helical65–87 aa
跨膜區Helical100–122 aa
跨膜區Helical127–149 aa
跨膜區Helical251–273 aa
跨膜區Helical288–310 aa
跨膜區Helical429–446 aa
跨膜區Helical461–483 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9HCP6…

AlphaFold · Q9HCP6

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Endoplasmic reticulum membrane

HHATL 被註解為內質網膜上的多次跨膜蛋白。 資料未提供定位變化的條件或異構型間差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 15 個夥伴 · 最多顯示 50 個
MG56HHATLAMIGO1ARLNCISD2CPLX4ERGIC3FAM209AFKBP7FNDC9GPR152GPX8MILR1MUC1PVRSUSD3TMX2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 15 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

資料記載 HHATL 與 SHH 互作,但未進一步界定此互作是否為直接結合或屬於特定複合體。另有資料指出 HHATL 負向調節 HHAT/SKN 對 SHH N 端 palmitoylation 的作用;這是功能關係的描述,不等同於 HHATL 與 HHAT/SKN 實體結合的證據。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能HHATL 負向調節 HHAT/SKN 對 SHH N 端進行的 palmitoylation;資料指出調控方向為抑制這項修飾,但未交代其分子機制或發生條件。推論支持
證據與來源

Negatively regulates N-terminal palmitoylation of SHH by HHAT/SKN

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用資料記載 HHATL 與 SHH 互作,但未說明互作是否為直接結合、發生情境或涉及何種複合體,因此不據此推定更具體的分子關係。推論支持
證據與來源

Interacts with SHH

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位HHATL 被註解為內質網膜上的多次跨膜蛋白;此項資料未描述定位變化的條件,也未指出異構型間的定位差異。推論支持
證據與來源

Endoplasmic reticulum membrane / Multi-pass membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000441594 · 1,836 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACTCTGCTCAGCTCCGCTCCAGGAAGGCCACCTCCTCCTC40
41CCCCTCCTCCTCCCGCTGTCACCACTCACCGCTCATAACC80
81TCAAGGGGGTGGGGACCCCAGGGCTGGACACACCCCACCG120
121TGGCCCCAGAGCTCAGCCGGTCGCACGGACGGACAGTTGG160
161AAGCCGGACCCCAGAGCCTGAGGTGGGCAGTGTGCCAGGG200
201TCCCTTGCGGCCTCCTCAAGCCCTGTCCAGGCTATGGGCA240
241TCAAGACAGCATTGCCGGCGGCTGAGCTGGGCCTCTACTC280
281TCTGGTGCTGAGTGGGGCCCTGGCCTATGCTGGCCGGGGC320
321CTCCTTGAGGCTTCACAAGATGGGGCCCACAGGAAGGCCT360
361TCCGGGAGTCTGTGCGACCTGGCTGGGAGTACATTGGCCG400
401GAAGATGGATGTGGCTGACTTCGAGTGGGTGATGTGGTTC440
441ACCTCCTTTCGCAACGTCATCATCTTTGCCCTCTCCGGAC480
481ATGTGCTGTTTGCTAAACTCTGCACGATGGTTGCCCCAAA520
521GCTCCGCTCCTGGATGTATGCTGTGTACGGGGCCTTGGCT560
561GTGATGGGCACAATGGGCCCTTGGTACCTGCTGCTGCTGC600
601TTGGTCACTGTGTGGGCCTCTATGTGGCCTCGCTTTTGGG640
641CCAGCCCTGGCTCTGTCTTGGCCTTGGCTTGGCCAGCCTG680
681GCCTCCTTCAAGATGGACCCCCTAATCTCTTGGCAGAGCG720
721GGTTTGTAACAGGCACTTTTGATCTTCAAGAGGTGCTGTT760
761TCATGGGGGCAGCAGCTTCACAGTGCTGCGTTGCACCAGC800
801TTTGCACTGGAGAGCTGTGCCCACCCTGACCGCCACTACT840
841CCTTAGCTGACCTGCTCAAGTACAACTTCTACCTGCCCTT880
881CTTCTTCTTCGGGCCCATCATGACCTTTGATCGCTTCCAT920
921GCTCAGGTGAGCCAGGTGGAGCCAGTGAGACGCGAGGGTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。