基因總覽
H2AJ（H2A.J histone）是蛋白質編碼基因，產物屬於組蛋白 H2A 家族。它是核小體的核心成分；核小體由組蛋白與 DNA 組成，是染色質的基本組織單位。現有資料未提供 H2A.J histone 的更詳細序列或結構描述。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000544848 ★ | 14,774,405–14,775,024 | 1 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
H2A.J histone 是核小體的核心成分。核小體包裹並壓縮 DNA，使其形成染色質；這種組織方式會限制需要以 DNA 為模板的細胞機制接觸 DNA。因此，組蛋白參與調節 DNA 的可及性，並與轉錄調控、DNA 修復、DNA 複製及染色體穩定性等過程相關。
DNA 的可及性並非固定不變。組蛋白的多種轉譯後修飾構成所稱的「組蛋白密碼」，而核小體重塑也參與調節 DNA 是否能被細胞機制接觸。現有資料指出這些調控方式與組蛋白功能相關，但未進一步說明 H2A.J histone 特有的修飾、重塑機制或在各項過程中的具體作用。
Promoter 與基因調控
>H2AJ ENST00000544848 GRCh38 chr12:14773405-14774505 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AATGTTCAGGTAAAAATGAAATGACCTCGATGAATTAGGAGAAAGTAATTTTTAATTAAAACAAAACACT TGAAACACTCTTTTTGTTTCAAAAAGCATGGGTCCACAATTCAGGTATATAAGAATAAGCTGCCATTCTG ACTTTAGTCTCTGGACTCATTTACAAAGAGACCCGGGGGACCTCCACGTCTTCGCAGAGGACCCGATCCG CTGATCTGTGGCGCCCTGGCTTGCGGGGAGCAAGCCAAGGCCAAGACTTTGGCCTCTCCAATAAAACCTA GTGGCTCTTTGCAGGCCCATAGCCTCAAAGACAAAAGATATTTTGGCTAGGCGAGCTTGTTCCTCCCGTC AGCACAGGAAGCATTCACGTCTGGTCATCACTCTAGCTTCAGACTCAAAAGTGAACGATTGGCTGGCTGT GAGCCGCAGGACCCTGCGGGGAGACCAGGGTGGTCTCTACACTGTTGGGTAGCTAGCTGGAGGCAAGGCG CTTGTATAAGAAACAGTCCACGGACCCTGTCCTGGGCAGGCAGAATTCCGCGGACAGGCTGTTGTTTCGC CTAAGCAGCACGGGCTGCGGAGACAGAAACCTACCTGAGTAGTACGGTGTATTATATGAGAACATCCACT TAGCATAGCAACGTCTACGGACAACCCCTGTAGCTCTTCTTCTGGATTGTTTTCTGTTTCCAACCATGTT TTCTTATTTCCTACGAGTTTATGTGCTTGGAAGCGAGCGTGGTCGTGGAAAACCCGTAACCGCTAAATTC ATCTGGGTCCCCAAAGACTGAGCCGGCTGGCCTCGTTATTTATGTGAGCGGCTATGTAAATGAGGATTCG GAGATTGCTCTATTGATTGGAGAGAGCTGGAGGAGGCGGTCTCTCTTCCAGAGCGCTAGTTGGGAGCGGA GCCTGCCTGTCATTGGTCACCAGAGCCAATGGAAAGGGGCTGCCGCGCGGCCGTAAAGAGTTTGTAGAGG CAGTTCGGGTGCGGTACGTTGCATTCCGGTACCGGACGCCGAGAGCGGTTTGTCTCCGTCTCTGGAGTTG TAGGCGAGAGGTGATCATGTCCGGTCGCGGGAAACAGGGCGGCAAAGTGCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| H2AFJ_1 ↗ | 12:14,774,633 | 正股 | 14,774,584–14,774,643 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR12_97TB5 · promoter · 14771121–14771621 · regulatory
ENSR12_C3GKN · enhancer · 14773043–14774175 · regulatory
ENSR12_8FPMX · promoter · 14774176–14774415 · regulatory
ENSR12_97TC7 · promoter · 14774895–14775395 · regulatory
ENSR12_55GSFL · CTCF_binding_site · 14774956–14774977 · regulatory
ENSR12_97TCN · enhancer · 14776660–14776996 · regulatory
ENSR12_55GSPW · CTCF_binding_site · 14776742–14776763 · regulatory
ENSR12_B4X6X · enhancer · 14777142–14777660 · regulatory
· motif · 14770004–14770011 · motif
· motif · 14770046–14770062 · motif
· motif · 14770180–14770191 · motif
· motif · 14770318–14770334 · motif
· motif · 14770350–14770361 · motif
· motif · 14770587–14770598 · motif
· motif · 14770635–14770644 · motif
· motif · 14770635–14770646 · motif
· motif · 14770635–14770646 · motif
· motif · 14770644–14770655 · motif
· motif · 14770774–14770791 · motif
· motif · 14770811–14770828 · motif
· motif · 14771020–14771029 · motif
· motif · 14771049–14771059 · motif
· motif · 14771083–14771098 · motif
· motif · 14771097–14771111 · motif
· motif · 14771097–14771111 · motif
· motif · 14771197–14771207 · motif
· motif · 14771213–14771223 · motif
· motif · 14771554–14771566 · motif
· motif · 14771788–14771797 · motif
· motif · 14771794–14771802 · motif
· motif · 14771969–14771982 · motif
· motif · 14771969–14771982 · motif
· motif · 14772016–14772038 · motif
· motif · 14772016–14772038 · motif
· motif · 14774082–14774102 · motif
· motif · 14774225–14774238 · motif
· motif · 14774958–14774974 · motif
· motif · 14775066–14775079 · motif
· motif · 14775066–14775079 · motif
· motif · 14775221–14775234 · motif
· motif · 14775608–14775617 · motif
· motif · 14775837–14775850 · motif
· motif · 14775837–14775850 · motif
· motif · 14776034–14776045 · motif
· motif · 14776744–14776760 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：129 aa
H2A.J histone 屬於組蛋白 H2A 家族，蛋白質長度為 129 個胺基酸。序列註解指出，其第 1 至 22 位胺基酸區段為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 H2A.J histone 的定位列於細胞核與染色體；未提供定位變化的條件或不同異構型之間的差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Chromosome。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
核小體中的組蛋白以八聚體組成：包含兩個 H2A、兩個 H2B、兩個 H3 與兩個 H4，排列為一個 H3-H4 異源四聚體及兩個 H2A-H2B 異源二聚體。此八聚體包裹約 147 bp 的 DNA。資料描述的是核小體的組成，未單獨指出 H2A.J histone 的特定結合夥伴。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | H2A.J histone 是核小體的核心成分。核小體包裹並壓縮 DNA 形成染色質，限制需要以 DNA 為模板的細胞機制接觸 DNA。組蛋白因此參與轉錄調控、DNA 修復、DNA 複製與染色體穩定性；DNA 可及性則受組蛋白轉譯後修飾及核小體重塑調節。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Core component of nucleosome. Nucleosomes wrap and compact DNA into chromatin, limiting DNA accessibility to the cellular machineries which require DNA as a template. Histones thereby play a central role in transcription regulation, DNA repair, DNA replication and chromosomal stability. DNA accessibility is regulated via a complex set of post-translational modifications of histones, also called histone code, and nucleosome remodeling |
| 交互作用 | 核小體含有組蛋白八聚體，組成為各兩個 H2A、H2B、H3 與 H4；其排列包含一個 H3-H4 異源四聚體及兩個 H2A-H2B 異源二聚體。八聚體包裹約 147 bp 的 DNA。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源The nucleosome is a histone octamer containing two molecules each of H2A, H2B, H3 and H4 assembled in one H3-H4 heterotetramer and two H2A-H2B heterodimers. The octamer wraps approximately 147 bp of DNA |
| 細胞定位 | 資料將 H2A.J histone 的細胞內定位標示為細胞核與染色體；未提供定位條件或其他定位差異。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GCATTCCGGTACCGGACGCCGAGAGCGGTTTGTCTCCGTC40TCTGGAGTTGTAGGCGAGAGGTGATCATGTCCGGTCGCGG80GAAACAGGGCGGCAAAGTGCGAGCAAAGGCCAAATCCCGC120TCCTCCCGCGCGGGCCTGCAGTTCCCGGTGGGCCGAGTGC160ACAGACTGCTGCGCAAAGGGAACTACGCGGAGCGAGTGGG200CGCCGGGGCGCCGGTGTACCTGGCGGCGGTGTTGGAGTAC240CTTACGGCGGAGATCCTGGAGCTGGCTGGCAACGCCGCGC280GTGACAACAAGAAGACCAGGATAATTCCCCGCCACCTGCA320GCTCGCCATCCGCAACGACGAGGAGTTAAACAAGCTGCTG360GGCAAAGTGACCATCGCTCAGGGCGGCGTCCTGCCCAACA400TCCAGGCCGTGCTGCTGCCCAAGAAGACGGAGAGTCAGAA440GACGAAGAGCAAATGACCCTGACGCCGCCCTCAGGGAGCT480GGCTCCCCCAGCAAAGGCCCTTTTCATGGTCGTCCCGCAA520TGCTTTTGAATGTGCTGGATGTCATGGAGGGCCGGTGACA560TCTAGCGGGGAGGTGGGCGGCGAGGGTCCCGGCGGGAGCC600AATAAAGTTGGTGAAAATCG620cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。