基因總覽
GUSBP1 的正式名稱為 GUSB pseudogene 1,基因類型屬於假基因,位於人類染色體 5p14.3。假基因的分類表示此基因座不應被當作已確認的蛋白質編碼基因來描述;目前提供的資料未說明其 RNA 產物、結構特徵或其他分子性質。關於其生物學角色,資料僅提供預測性註記,並未列出相關實驗或作用機制。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000449061 ★ | 21,459,560–21,501,826 | 7 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
已知功能與來源註解
現有資料將 GUSBP1 與神經系統發育及骨骼系統發育列為預測相關的生物學過程。這項註記表示其可能參與上述發育過程,但屬於預測,並非已證實的功能;資料也未提供可據以判定其作用方式的實驗結果。
目前來源沒有說明 GUSBP1 在這些發育過程中的分子作用、作用時期或涉及的細胞類型,也未指出它是否透過 RNA 或其他方式產生影響。因此,不能進一步推定其調控機制、作用方向,或在神經與骨骼發育之間是否存在共同路徑。這些功能註記應限於預測層級,不能視為已確認的因果關係。
Promoter 與基因調控
>GUSBP1 ENST00000449061 GRCh38 chr5:21458560-21459660 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCACGCTTGTGATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGAGTGAATCAGGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAG CCTGGTCAATATGGTTAAACCCTGTTTCTACTAAAAATACAAAAAATTACCTGGGTGTGGTGGTGCGTGT CTGCAGTGCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGAAGAAACTCTTGAAACTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTG AGCCGAGATCACGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGATACTCCGCCTCAAAAAAAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAGCAAAGGGTGTCGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCGGATCACT TGAGGCCAGGAGTTCGAAACCAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCTCGTGTCTACTAAAAATACAAAAAAT TAGCTGCGCGTGGTGGTGGACGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCCGAGACAGAAGAATCGCTTGAA CCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCACACCGTTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGACTCCG TTTCAAAACAAAAACAAAAACAAACAAAAACAAAAATTAGCCGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTCG GGAGGCTGAGGAAGGAGAATCGCTTGATCCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTACGCCACTG TACTGCAGCCTGGGCGACAGAGGCTCTGGCTTAAAAAAAAAAAAAAGGGAAAGGATGTTACAGAAACTCC AGATACTACTCCCCTTCAGTGGTCTGAGTTGCGCGGCGCTTTCCCGCCTGTCCGGTAGGGGGCGCCGCGC AGAAAGCCGCAGTCCCTCTGCGGAAGGCGCCGCTCTTGGCTTCGGCGGCGCCGCTGTAGCTTGGAGGCGG TACTTCCTCCAGCATTTGCCGCGAGTTATTGGCAAGTTCCCCTGCAGTTTGGGCTGTCTCTGTGGCTGGT TCTGCGGCGTGCGGCCAGCCATGGAGCGCTCTGGGCCCAGCGAAGGTGGGTTTCATGAAGCGAGTCCTGG CGGGGTGGGCCGTGTCGGGGGAGCTGGGGCGCCGCACTAACTAGGCCGCCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR5_B68ZM · promoter · 21459048–21459631 · regulatory
ENSR5_5739L2 · CTCF_binding_site · 21459377–21459398 · regulatory
ENSR5_9BHZF · enhancer · 21459632–21459993 · regulatory
· motif · 21459379–21459395 · motif
· motif · 21459532–21459549 · motif
· motif · 21459541–21459556 · motif
· motif · 21459707–21459722 · motif
· motif · 21459714–21459722 · motif
· motif · 21459714–21459731 · motif
基因座與轉錄註解
GUSBP1 依 HGNC/Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000449061 ★ | transcribed_unprocessed_pseudogene | 758 nt | 7 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | GUSBP1 被預測可能參與神經系統發育與骨骼系統發育;此為預測性註記,未提供實驗結果或具體作用機制。 | 推論支持 | 證據與來源Predicted to be involved in nervous system development and skeletal system development. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
ATGGAGCGCTCTGGGCCCAGCGAAGTGACAGGCTCAGACG40CATCGGGACCGGACCCGCAGCTTGCGGTCACCATGGGCTT80CACGGGGTTCGGTAAAAAAGCTCGCACATTTGACTTGGAA120GCAATGTTTGAACAAACTCGAAGAACAGCTGTGGAAAGAA160GTTGCAAAACACTGGGGCTGGTGAATTACCAGATCTCCGT200CAAGTGCAGTAACCAGTTCAAGTTGGAAGTGTGTCTTTTG240AAATCAGAAAACAAAGTCGTGGACAACCAGGCTGGGACCC280AGGGCCAGCTGAAGGTGCTGGGTGCCAACCTCTGGTGGCC320GTACCTGATGCACGAACACCCCGCCTACCTGTACTCGTGG360GAGGATGGTGATTGCTCACACCAAAGCCTTGGACCCCTCC400CAGCCTGTGACCTTTGTGACCAACTCCACCTACGCAGCAG440ACAAGGGGGCTCTGTATGTGGATGTGATCCGTGTGAACAG480CTACTACTCTTGGTATCGCAACTACGGGCACCTGGAGTTG520ATTCAGCTGCAGCTGGCCGCCCAGTTTGAGAACTGGTGTA560AGACATCACAATCCCATTATTCAGAGCGTGTATGGAGTGG600AAACGCTTGTAGGGTTTCACCAGGATCCACCTTGATGTTC640AGTGAAGAGTACCAGAAAAGTCTGCTAGAGCAGTACCATC680TGGGTCTCAATCAAAAACGCAGAAAATACGTGGTTGGAGA720GCTCATCTGGAATTTTGCCGATTTCATGACTAACCAGT758cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。