基因總覽
GUCD1 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 guanylyl cyclase domain containing 1。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 22q11.23。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000435822 ★ | 24,540,438–24,555,138 | 6 |
| ENST00000621833 | 24,540,423–24,555,942 | 6 |
| ENST00000407471 | 24,540,423–24,555,182 | 6 |
| ENST00000402766 | 24,540,423–24,555,125 | 5 |
| ENST00000951439 | 24,540,423–24,555,189 | 6 |
| ENST00000404664 | 24,540,438–24,555,942 | 6 |
| ENST00000894495 | 24,540,438–24,555,182 | 6 |
| ENST00000447813 | 24,542,687–24,555,089 | 5 |
| ENST00000407973 | 24,546,917–24,555,859 | 5 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>GUCD1 ENST00000435822 GRCh38 chr22:24555038-24556138 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AAGTCTTTCTCCAGCCCCTGGCCCCTCACAGGCGCCTCGACCTCCCCTCGCCCGTCCCCAGCCTCACCGG CTCTGGCCTACTTTTCTTCTCTTCGGTCCGCTGCGAAAGATGCTACGGCGAAGGCGTGAGTCAAGCGAAT GGCGGGCCTAACACCCAGAATTCCACTCTTTCCCAAAATGCTGCGCGCAGGGCCCGCCTCCTTCCTTTCC CCAGTGTTGAGCGCGGTCTCGCCTCCGCTTCCTCCTCACTCCGCCTGCCGGCTGGGAAACTAGGGCACCA GTACGATAGTTCCGGCACCGGAAAAGAGGGCTGATGACTGGGCCCGGGGGCCGCCGCAACGACCCTTGGG GCCGGCAAAGAGCCAGAGAGGGTGCTCACACTTCCAAGCACCCCACACCAAGGACAGGCTGGACGGCAAG GCGGAGACGCGGGGCTTGGGCCCTCAGACCGGGGACAGCAGGAGGTTGGGCCAAGGGCCAGGACTTCCCG TCACAATTTCATTTGTTGATCCCGGCACCGCCAGGTAAGGGGGGCCCTGAGTGAGGCTAGGTATCTGGTA CGGATAAAGTTAGGTATAGAGTAGAGCGGCTGCCCGCTCAGGGTTATCCCTAAAGACAGTTGGAGGAGAG TTGCTTGGGGCCTCGGGGATGCACTGGGCGGGATCAGGGCTTACACCTAGGACTGGCAAAAGAGCGGGAC CCGGCAGAGGCGGGGCTTGCCGAAGGGACGAGCCTCTATTCAGGAAATGCACGAGCTTTGGGGCGGGGCT CAAAGAAAGGGGCGGGGCTTCCGGGGCCCGCGTCCTGGTGAGCTGCGCGTCTGCGCGAGGATTGGGCGAG AGGGTGGGGCCACTCAACGCTGAGGCGGCGAATGGCCGGAGCAGACTTAAATCAAGAGGCTGGGGACCTC TAAGATCAAAGTTTGGGGCGGGGCCTAAGGAGGGGGCGGGGCCTCCAGATTCGAGACCTGGAAGGGCTGG GGCGGCGCTTGGGGCGGCCCAGCCGCCGCCTCCCGTTCTCTCCTCCGCAGCGGCGGCGGTGGCGGAGAAG GAACTCGACACGCACCGACCGCCCTCCCGCCCCAGCCGAAGCGGAAGCTGT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| GUCD1_2 ↗ | 22:24,555,138 | 負股 | 24,555,128–24,555,187 |
| GUCD1_1 ↗ | 22:24,555,891 | 負股 | 24,555,881–24,555,940 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR22_B6TJS · enhancer · 24550023–24550717 · regulatory
ENSR22_9CQ5H · enhancer · 24552962–24553239 · regulatory
ENSR22_C4FR7 · enhancer · 24553489–24555078 · regulatory
ENSR22_B6TKK · promoter · 24555079–24555672 · regulatory
ENSR22_57QXF6 · CTCF_binding_site · 24555119–24555140 · regulatory
ENSR22_73FZM9 · promoter · 24555925–24556017 · regulatory
ENSR22_9CQ6D · enhancer · 24556018–24556349 · regulatory
· motif · 24550134–24550144 · motif
· motif · 24550189–24550204 · motif
· motif · 24550189–24550204 · motif
· motif · 24550360–24550370 · motif
· motif · 24550362–24550372 · motif
· motif · 24550441–24550451 · motif
· motif · 24550469–24550483 · motif
· motif · 24550469–24550484 · motif
· motif · 24550476–24550491 · motif
· motif · 24550476–24550491 · motif
· motif · 24551523–24551536 · motif
· motif · 24552554–24552566 · motif
· motif · 24552556–24552563 · motif
· motif · 24552556–24552571 · motif
· motif · 24552906–24552918 · motif
· motif · 24552966–24552977 · motif
· motif · 24553040–24553047 · motif
· motif · 24553042–24553055 · motif
· motif · 24553042–24553055 · motif
· motif · 24554356–24554368 · motif
· motif · 24554359–24554366 · motif
· motif · 24554982–24554997 · motif
· motif · 24555040–24555051 · motif
· motif · 24555121–24555137 · motif
· motif · 24555187–24555197 · motif
· motif · 24555205–24555215 · motif
· motif · 24555212–24555227 · motif
· motif · 24555213–24555227 · motif
· motif · 24555214–24555227 · motif
· motif · 24555289–24555299 · motif
· motif · 24555351–24555361 · motif
· motif · 24555370–24555380 · motif
· motif · 24555423–24555433 · motif
· motif · 24555843–24555852 · motif
· motif · 24555898–24555911 · motif
· motif · 24555992–24556002 · motif
· motif · 24556243–24556254 · motif
· motif · 24556346–24556357 · motif
· motif · 24556347–24556358 · motif
· motif · 24556686–24556695 · motif
· motif · 24556687–24556695 · motif
· motif · 24559275–24559283 · motif
· motif · 24560053–24560066 · motif
· motif · 24560053–24560066 · motif
蛋白質結構域與序列
蛋白質三維結構
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 74 個夥伴
- CRXO43186 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CTHP32929 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
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- NGLY1Q96IV0 · UniProt INTERACTION · 4 experiments · 2 筆來源紀錄
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- KPRPQ5T749 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP1-1Q07627 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
AGCCGCCGCCTCCCGTTCTCTCCTCCGCAGCGGCGGCGGT40GGCGGAGAAGGAACTCGACACGCACCGACCGCCCTCCCGC80CCCAGCCGAAGCGGAAGCTGTAGCCCGCTCTGGGCCGGGG120CCATGGGCGCCCCGCGCCGCCCGGGTCATGAGGACGGAGG160CGGAGGCAGCGGGGCCGCCGCTCGAGCCCGGGGACTTTGT200GCAACTGCCTGTGCCCGTCATCCAGCAGCTCTACCACTGG240GACTGTGGCCTGGCCTGCTCCAGGATGGTGCTGCGGTACC280TGGGCCAGCTGGACGACAGTGAGTTTGAGAGAGCCCTGCA320GAAGCTGCAGCTGACCAGGAGCATCTGGACCATCGACCTG360GCCTACCTGATGCACCACTTTGGCGTGAGGCACCGCTTCT400GTACCCAGACCCTGGGTGTCGACAAGGGCTACAAGAACCA440GTCCTTCTACAGGAAGCACTTTGACACAGAAGAGACCCGG480GTGAATCAGCTGTTTGCACAAGCAAAGGCCTGCAAGGTGC520TGGTGGAGAAATGCACAGTGAGTGTGAAGGACATCCAGGC560GCACCTGGCTCAGGGCCATGTGGCCATCGTGCTGGTGAAC600TCGGGGGTGCTGCACTGTGACCTGTGCTCCAGCCCTGTCA640AGTACTGCTGCTTCACCCCCAGTGGCCACCACTGCTTCTG680CCGCACTCCTGACTACCAGGGCCACTTCATCGTGCTGCGT720GGCTACAACCGGGCCACTGGCTGCATCTTCTACAACAACC760CAGCCTATGCCGACCGAATGTGCAGCACCAGCATCAGTAA800CTTTGAGGAGGCCAGAACCAGCTATGGCACAGATGAGGAC840ATCCTCTTTGTCTACTTGGACAGCTGACAGCAGGAGCCTG880GTGCGCCTAGGCCCTCGGACCCCATCCCCACCCCAGCCGG920GCCCGCTCAGGATGCCCTGGCCCAGGCTTGGGGCTGCTGG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。