基因總覽
GTSE1 的正式名稱為 G2 and S-phase expressed 1,屬於蛋白質編碼基因。其產物 G2 and S phase-expressed protein 1 長 739 個胺基酸。現有資料未提供其家族分類或完整結構資訊;序列註解指出,多段區域被標示為無序區。功能資料將 GTSE1 與細胞週期的 G2/M 期進程及微管重排聯繫起來,但所述作用仍屬可能性,並非確定結論。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000454366 ★ | 46,296,870–46,330,810 | 12 |
| ENST00000926490 | 46,296,870–46,330,810 | 11 |
| ENST00000926491 | 46,296,870–46,330,810 | 11 |
| ENST00000905433 | 46,296,944–46,330,810 | 10 |
| ENST00000926492 | 46,296,958–46,330,810 | 12 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
GTSE1 可能參與 p53 誘導的細胞週期停滯,作用時期涉及 G2/M 期。資料提出的可能機制,是 GTSE1 干擾進入有絲分裂所需的微管重排。這表示它可能藉由影響細胞進入有絲分裂前的微管變化,參與細胞週期進程的調節;但目前提供的資料未進一步說明這種干擾的分子細節,也未將該作用描述為已確立的機制。
過量表現 GTSE1 時,G2/M 期進程會延遲。這項觀察支持 GTSE1 的表現量與該階段進程存在關聯,但資料沒有提供延遲幅度、實驗系統或其他細胞週期階段的結果,因此不宜據此推論更廣泛的影響。結合可能干擾微管重排的描述,GTSE1 或能影響細胞進入有絲分裂的時序;其在 p53 誘導停滯中的具體作用仍需依現有證據審慎理解。
Promoter 與基因調控
>GTSE1 ENST00000454366 GRCh38 chr22:46295870-46296970 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AAGTGCCCGAGCCAGCCTGGAAGGCCTCTGCCCTGGGCCCCGGGTGGCTGTTTGCTGCACAGCTCTCCCC ACAGCCTGCCCCAAATAAACAGCTTATCTTCGTCCCTGAAAATGGTGCTCTCGAGTTCCATCCTTTTCAG AGCGGGTCCTCCCAGACTCCTCTTCCTGCATCCTCCTCCATCCCGCTTAGTGACACTTTGCCGTGGGTGG AGCCCCTCATTTGATCCTCAAGCCCCCGAGGTGGGTATTATACCTCGTTCGCAGGCAAAGGCTCAAGCGA GGTCAGTCTTAAGTTGCTGCCCACTGACCCGTCTACCAGTCCTGTCCTTGCGTCTCCATGGCTCAGGTCA GGGTTATCCTATCTGCTTCCCACCTCTCTCCAACACATGCACTCCCCAAGGCAGGCTCCATCACCGGGCC CCAGCCCCTGGCTCTCTCCTCCAACGCAGCTCCCCAGCCGGCCTGTAAAACCGAGGACAGGCTCCCGCCA CGCCCTCGGCGGTCCTCAGGCCTTGGCGGTTGGGGAAGCCCGCCAAGGGCGACGGTTCCCCTCCAGCCCC ACAGGCTGTGCAGCTCCGGCAATGAGTCTCCCTCAGGTCTCTGGGTCAGCCGGCGCCCCAGTGCGTGCCT CGGGGGCAGGGATCCCGGCTTTTCACTACTGTTAGTAACAGCTCGCGCGCGCTGCTTCACAGCAGGTGGG TGAGCCTACTTTTAGTCTTCCCATCGACACCCTTAGATGGCAGTTTTAACTTTCTCCCTACACACAAGGA GCTGCTATACATGGTTCCGGCTTGACGCGGATACCTAGTGACACTTGGCGGCCAGGCCGGGCAGACTTCC GGGTGGGTGATCCCTGGCGCTGTGCGGAGCCATTCGCTGCGCTGAAGCAGTGCGCATGCGCACTGGACGC TTCTTACCAGCGTCCTGACTACAATACCCAGGACGCACCCAGCCCGCCGCCTCTCGGAGCCCTTTTCAAA CCGACCAATCGGCAACCCGCGTCTCCCGGCGCCGCGTTTAAATCCGTGCCGGAGGCGCGTCCTGCATCGT CTGCCGCTTTGGGTAAGGTGGGGTCAGGGTCGGGGGCGAGGCTTGCCCGGT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| GTSE1_3 ↗ | 22:46,296,782 | 正股 | 46,296,733–46,296,792 |
| GTSE1_1 ↗ | 22:46,297,367 | 正股 | 46,297,318–46,297,377 |
| GTSE1_2 ↗ | 22:46,328,899 | 正股 | 46,328,850–46,328,909 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR22_9ND57 · enhancer · 46293607–46294054 · regulatory
ENSR22_C6L2Z · enhancer · 46295531–46296649 · regulatory
ENSR22_83CQB4 · promoter · 46296650–46296880 · regulatory
ENSR22_BC744 · enhancer · 46296881–46297761 · regulatory
· motif · 46296463–46296478 · motif
· motif · 46296703–46296712 · motif
· motif · 46296703–46296714 · motif
· motif · 46296703–46296714 · motif
· motif · 46296760–46296771 · motif
· motif · 46296760–46296771 · motif
· motif · 46296907–46296923 · motif
· motif · 46296939–46296946 · motif
· motif · 46297051–46297063 · motif
· motif · 46297053–46297060 · motif
· motif · 46297171–46297181 · motif
· motif · 46297218–46297231 · motif
· motif · 46297218–46297231 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:739 aa
G2 and S phase-expressed protein 1 長 739 個胺基酸。序列註解標出四段無序區,位置分別為胺基酸 1–20、116–136、149–306 及 320–639;資料未提供其他結構域或功能區域註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
GTSE1 被標示位於細胞質與細胞骨架,並與微管相關。 現有資料未提供定位隨條件改變的資訊,也未描述異構型間的定位差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- GGA1Q9UJY5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PLK1P53350 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | GTSE1 可能參與 p53 誘導的 G2/M 期細胞週期停滯,可能藉由干擾進入有絲分裂所需的微管重排發揮作用;過量表現 GTSE1 則會延遲 G2/M 期進程。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源May be involved in p53-induced cell cycle arrest in G2/M phase by interfering with microtubule rearrangements that are required to enter mitosis. Overexpression delays G2/M phase progression |
| 細胞定位 | GTSE1 的定位記錄包括細胞質與細胞骨架,並指出其與微管相關;此資料描述的是 GTSE1 本身的定位資訊。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GTCTCCCGGCGCCGCGTTTAAATCCGTGCCGGAGGCGCGT40CCTGCATCGTCTGCCGCTTTGGTGACTTCTGACAGCTCTC80TCCATGGAAGGAGGCGGCGGCCGCGATGAGCCTTCAGCCT120GCCGGGCAGGGGACGTGAACATGGATGACCCTAAGAAGGA160AGACATTCTTCTTTTGGCCGATGAAAAATTTGACTTCGAT200CTTTCATTGTCTTCTTCGAGTGCAAATGAAGATGATGAAG240TCTTCTTCGGACCCTTTGGACATAAAGAAAGATGTATTGC280TGCCAGCTTGGAATTAAATAATCCGGTTCCCGAACAGCCT320CCGTTGCCCACATCTGAGAGTCCCTTTGCCTGGAGCCCTC360TGGCCGGGGAGAAGTTCGTGGAGGTGTACAAAGAAGCTCA400CTTACTGGCTTTACACATTGAGAGCAGCAGCCGGAACCAG440GCAGCCCAAGCTGCCAAGCCTGAAGACCCTCGGAGCCAGG480GCGTGGAAAGATTCATACAGGAGTCAAAATTAAAAATAAA520CCTCTTTGAGAAAGAAAAGGAAATGAAGAAAAGCCCCACG560TCTCTTAAAAGGGAGACATACTACCTGTCAGACAGCCCCT600TGCTGGGGCCCCCTGTGGGTGAGCCTCGGCTCTTGGCCTC640CTCCCCGGCCCTGCCCAGCTCTGGTGCCCAGGCCCGCCTC680ACCCGGGCGCCGGGGCCTCCGCACTCTGCTCATGCTTTGC720CCAGGGAATCATGCACTGCTCATGCTGCAAGTCAGGCAGC760GACTCAGAGGAAGCCCGGGACCAAATTGCTGCTGCCTCGA800GCGGCCTCTGTTAGAGGAAGAAGCATCCCTGGGGCTGCGG840AGAAGCCCAAGAAAGAGATTCCAGCTAGTCCTTCCAGGAC880AAAAATCCCAGCTGAGAAGGAATCCCACCGGGATGTTCTC920CCTGACAAACCTGCCCCGGGTGCTGTCAATGTGCCGGCCG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。