基因總覽
GSTO1 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 glutathione S-transferase omega 1。其產物屬於 GST superfamily 的 Omega family,具有蛋白質酵素活性。來源列出的活性包括 glutathione-dependent thiol transferase、dehydroascorbate reductase、S-(phenacyl)glutathione reductase 及 glutathione S-transferase。這些基本特性顯示該蛋白質可參與多種以 glutathione 為底物或反應成分的轉化;其具體反應及對無機砷代謝的作用另見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000369713 ★ | 104,254,892–104,267,455 | 6 |
| ENST00000539281 | 104,254,194–104,267,461 | 6 |
| ENST00000369710 | 104,254,710–104,267,461 | 5 |
| ENST00000918902 | 104,254,710–104,267,461 | 3 |
| ENST00001098111 | 104,254,710–104,267,461 | 5 |
| ENST00001098112 | 104,254,710–104,267,461 | 4 |
| ENST00001130892 | 104,254,710–104,259,918 | 4 |
| ENST00001137136 | 104,254,710–104,267,461 | 6 |
| ENST00000445155 | 104,254,986–104,267,365 | 5 |
| ENST00000432659 | 104,255,163–104,267,404 | 4 |
顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
GSTO1 具有數種不同的酵素活性,來源指出其中包括 glutathione-dependent thiol transferase 與 glutathione S-transferase 活性。其轉移反應可用概括式表示為 RX 與 glutathione 反應,生成 S-substituted glutathione、halide anion 及 H⁺,說明 glutathione 可參與底物的轉化。
GSTO1 也具有 dehydroascorbate reductase 活性,可催化 L-dehydroascorbate 與兩分子 glutathione 反應,產生 glutathione disulfide 與 L-ascorbate。這項反應將 dehydroascorbate 轉化為 ascorbate,並伴隨 glutathione 氧化形成 glutathione disulfide。
此外,GSTO1 具有 S-(phenacyl)glutathione reductase 活性,並參與無機砷的生物轉化。來源指出它可還原 monomethylarsonic acid(MMA)及 dimethylarsonic acid;所列反應式進一步描述 methylarsonate 與 glutathione 反應,生成 methylarsonous acid、glutathione disulfide 及水。這些資料支持 GSTO1 參與砷化合物轉化,但未提供其在特定組織或生理條件下的作用程度。
Promoter 與基因調控
>GSTO1 ENST00000369713 GRCh38 chr10:104253892-104254992 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGGAACATCTGTGATCTGTGCTCTTTCCAAAGAGGGCTTGAGGACTTCAATATTTAAAGGGAAAGAGCAG GCAGTAGGGGAAAGTGGAAAGTAAAAAGGGAAGGTAGATAAAAGGGGAGAGTAGTTGCATTCTTTGGGGC CTTTGATCAGCATTCACTGAATGCGCATGTTACATTCGTGAAAGGAGGTCGTAGAGGAATAGTCAGTTAT GCATTCGTCTAGTGCTTGGTGAATCTGCATTTTTACAAGATTAAATATAGGGTAGAGGAAGCGGTCAAAT TGCATTTTTCTCCAGCGAGAGGAAGGATGACTCCTAGACCTGTCTTTGTCCCATACTTGGGAAGATAAGC TGTTAGTTTACATTGCCAAGATGAAATTCAACTGATCTGTTTTAGAGTAAAGATCTTGCGGGCCAACAAG GAATTTCCTTGGGGAGGTGTGTGGCCTTTGATCTTTGTAGCTATTTAGCAACAAAATGGGAGGCAGTGTT GCCTGACTCAGTTTCCAAGCTTGACTCTTCCCTTTGGCATAGTGAGTTTGGAGTCAAGAGATTTTTATTT TCCCTTCACAAGCTGAACAGGAGCCTTTGGAGAGAACGCTCTGGACCGGTGAGTGAGCCATGAGGTCGGG CCACAGGCTCTGAAGTCGTGAAGCCTTGGGACGGAGCGGGTGGTGCTTCGAGGTCAGTGTCACGGGAGGG AGGTCAGGGTCAGGGTCAGACGTGGAGCCCCGTGGAGTGCGGAGTGGTGACCCCTTCGTTCGGGGGCGGA GGGATGACTGAGCATTTATAACTTTTGTGTATCTCCCCGTGGGTGCAGCCCTTGGCCAGCGAGATGCTTT GACACAGCCCCTTAAGATGTTTTAAGGGCTATCCCATAAAGCCGGGAAGGCACAACGGGTGGAGCTGGCG GCCGCCGGGGGCAGGCACTTTTGAGCTAAGGAGGAAGCGGGGGAGGGAAGGAGGGCGGGAAGGACGCGCC ACCTACTTCCTGAATCCCCTGCAAACCCCAGAGGAGCTCGGCCTGCGCTGCGCCACGATGTCCGGGGAGT CAGCCAGGAGCTTGGGGAAGGGTGAGGCCTGCCCGCCGCGAAGAGGGGGTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| GSTO1_2 ↗ | 10:104,231,870 | 正股 | 104,231,821–104,231,880 |
| GSTO1_1 ↗ | 10:104,254,901 | 正股 | 104,254,852–104,254,911 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR10_93JD8T · enhancer · 104253150–104253436 · regulatory
ENSR10_853QJ2 · enhancer · 104253665–104253851 · regulatory
ENSR10_93JD94 · promoter · 104253890–104254204 · regulatory
ENSR10_BQNM5 · promoter · 104254220–104254902 · regulatory
ENSR10_5WJ4CG · CTCF_binding_site · 104254864–104254885 · regulatory
ENSR10_D76MS · enhancer · 104254903–104257034 · regulatory
ENSR10_5WJ4D3 · CTCF_binding_site · 104254996–104255017 · regulatory
· motif · 104252295–104252310 · motif
· motif · 104252295–104252310 · motif
· motif · 104253365–104253371 · motif
· motif · 104254333–104254346 · motif
· motif · 104254441–104254461 · motif
· motif · 104254571–104254578 · motif
· motif · 104254591–104254598 · motif
· motif · 104254601–104254613 · motif
· motif · 104254632–104254645 · motif
· motif · 104254638–104254645 · motif
· motif · 104254835–104254848 · motif
· motif · 104254866–104254882 · motif
· motif · 104254875–104254886 · motif
· motif · 104254875–104254886 · motif
· motif · 104254875–104254888 · motif
· motif · 104254998–104255014 · motif
· motif · 104255089–104255102 · motif
· motif · 104255597–104255612 · motif
· motif · 104255722–104255737 · motif
· motif · 104255950–104255964 · motif
· motif · 104256400–104256415 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:241 aa
glutathione S-transferase omega 1 長 241 個胺基酸,屬於 GST superfamily 的 Omega family。蛋白質註解標示兩個結構域:GST N-terminal 位於第 22–101 個胺基酸,GST C-terminal 位於第 106–230 個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
GSTO1 定位於細胞質,並記錄於 cytosol。 來源未提供定位隨條件或異構型改變的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- HSPB1P04792 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
GSTO1 以 homodimer 形式存在,表示其可由兩個相同的蛋白質亞基組成。來源未列出其他實體結合夥伴或複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | GSTO1 具有 glutathione-dependent thiol transferase、dehydroascorbate reductase、S-(phenacyl)glutathione reductase 及 glutathione S-transferase 活性;並參與無機砷的生物轉化,可還原 monomethylarsonic acid(MMA)與 dimethylarsonic acid。 | 含實驗來源 | 證據與來源Exhibits glutathione-dependent thiol transferase and dehydroascorbate reductase activities. Has S-(phenacyl)glutathione reductase activity. Also has glutathione S-transferase activity. Participates in the biotransformation of inorganic arsenic and reduces monomethylarsonic acid (MMA) and dimethylarsonic acid PMID 10783391 ↗ · PMID 11511179 ↗ · PMID 17226937 ↗ · PMID 18028863 ↗ · PMID 21106529 ↗ |
| 分子活性 | RX + glutathione = an S-substituted glutathione + a halide anion + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源RX + glutathione = an S-substituted glutathione + a halide anion + H(+) PMID 10783391 ↗ · PMID 11511179 ↗ · PMID 17226937 ↗ · PMID 18028863 ↗ · PMID 21106529 ↗ |
| 分子活性 | L-dehydroascorbate + 2 glutathione = glutathione disulfide + L-ascorbate | 含實驗來源 | 證據與來源L-dehydroascorbate + 2 glutathione = glutathione disulfide + L-ascorbate PMID 10783391 ↗ · PMID 11511179 ↗ |
| 分子活性 | methylarsonate + 2 glutathione + H(+) = methylarsonous acid + glutathione disulfide + H2O | 含實驗來源 | 證據與來源methylarsonate + 2 glutathione + H(+) = methylarsonous acid + glutathione disulfide + H2O PMID 11511179 ↗ |
| 交互作用 | Homodimer | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | GSTO1 定位於細胞質,具體記錄的位置為 cytosol。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GCAAACCCCAGAGGAGCTCGGCCTGCGCTGCGCCACGATG40TCCGGGGAGTCAGCCAGGAGCTTGGGGAAGGGAAGCGCGC80CCCCGGGGCCGGTCCCGGAGGGCTCGATCCGCATCTACAG120CATGAGGTTCTGCCCGTTTGCTGAGAGGACGCGTCTAGTC160CTGAAGGCCAAGGGAATCAGGCATGAAGTCATCAATATCA200ACCTGAAAAATAAGCCTGAGTGGTTCTTTAAGAAAAATCC240CTTTGGTCTGGTGCCAGTTCTGGAAAACAGTCAGGGTCAG280CTGATCTACGAGTCTGCCATCACCTGTGAGTACCTGGATG320AAGCATACCCAGGGAAGAAGCTGTTGCCGGATGACCCCTA360TGAGAAAGCTTGCCAGAAGATGATCTTAGAGTTGTTTTCT400AAGGTGCCATCCTTGGTAGGAAGCTTTATTAGAAGCCAAA440ATAAAGAAGACTATGCTGGCCTAAAAGAAGAATTTCGTAA480AGAATTTACCAAGCTAGAGGAGGTTCTGACTAATAAGAAG520ACGACCTTCTTTGGTGGCAATTCTATCTCTATGATTGATT560ACCTCATCTGGCCCTGGTTTGAACGGCTGGAAGCAATGAA600GTTAAATGAGTGTGTAGACCACACTCCAAAACTGAAACTG640TGGATGGCAGCCATGAAGGAAGATCCCACAGTCTCAGCCC680TGCTTACTAGTGAGAAAGACTGGCAAGGTTTCCTAGAGCT720CTACTTACAGAACAGCCCTGAGGCCTGTGACTATGGGCTC760TGAAGGGGGCAGGAGTCAGCAATAAAGCTATGTCTGATAT800TTTCCTTCACTAA813cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。