基因總覽
GSDMA 是蛋白質編碼基因，產物 gasdermin A 長 445 個胺基酸，屬於 gasdermin 家族。完整蛋白質是具成孔能力片段的前驅物；其 N 端區域與細胞焦亡相關。序列註解指出蛋白質含有多段 β 股跨膜區域，但這些結構特徵的證據部分來自相似性推定。gasdermin A 的主要特色，是可在特定感染情境下經切割釋出 N 端片段，進而執行成孔作用。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000301659 ★ | 39,963,004–39,977,768 | 12 |
| ENST00000635792 | 39,953,263–39,977,875 | 12 |
| ENST00001139253 | 39,963,004–39,977,875 | 12 |
| ENST00000577447 | 39,965,523–39,970,565 | 4 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
gasdermin A 可作為感染感測相關的前驅蛋白。上皮細胞感染 Streptococcus pyogenes 時，該菌效應蛋白 SpeB 會特異性切割 gasdermin A，釋出其 N 端片段。此片段具有成孔能力，會結合細胞膜並促使膜通透化，進而引發細胞焦亡。
釋出的 N 端片段可辨識膜內側的脂質，包括 cardiolipin 與 phosphatidylserine 等酸性磷脂；這些脂質有助於將片段導向膜內側。到達膜後，片段在膜中形成同源寡聚體，構成內徑約 10–15 奈米的孔洞。這種由切割、膜定位到組孔的過程，使 gasdermin A 的成孔作用與感染條件相連結。
在感染皮膚細胞的情境中，細胞焦亡會促使受感染細胞被清除，減少病原體可利用的保護性棲位，同時引發發炎反應。相關結果有助於阻止細菌穿越上皮屏障，並限制病原體進一步散布至全身。這些功能描述特定於 S. pyogenes 感染與 SpeB 切割所述的情境，不宜概括為所有感染或細胞中的作用。
Promoter 與基因調控
>GSDMA ENST00000301659 GRCh38 chr17:39962004-39963104 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TACTCTTCACAGCATTCAGGGTTGCGTTTCTTTTTCCATGAGTGGTACTAAGAAGAGCCTCAAGGTGGGA GCAGGAAGGCTCTGCTGTGTCAGGTTATACCTGCACATATGCATGGCCACATGGCCCAACACTGTAAGGG CCTTGCTTGTAAGTCCCTTATTCTGTCCTCTAGCAATGTGACCATGTAGGCAACATTTGAAATTCCTTTA AAATTCCTTCTAGGCAGAGATTTAAGCTAAGAGGAGGACCTGAGTGACCTCTGGTGCAACATCTGAAAGC CCACGACAAGCCTCCTGGGCTTTTCCATGAATATCGCCGTGCCCCTGCCTACGGATATGCTGATGTGTGT ATACAATATTCTGTGAGAAGCAGAGACGCTGAACACTAAACAACACAAACCCATTTGGTCTAACTCCATC TCTGCCTACTCAGACATCTGCTTCTAGCGGTATCAGAGTTATGTCTATGTAGCTAAAACAAATGGAGTAA GGCAGCAATACACACAGGCTGACAAGCCCAGGATGGAGGGCGGCACTGCAGATGCTCTGCTCTCTACTGG AATGTGTGGACATACAGGAATCCCTATCCCAGGACACCCGCAGACCCCCACCATGAATCCGAGATGCTCC CCAATGACGGTGATGATGACAGAACAGAGATGCCATCCCTGGTCACACACACACACACACACACACACAC ACTCCCACTGCCTCCCTCTGCACCCCTCCCAAAGGCACCTGCCTTCCTCTCCTCTCAATCCACAAGCCAA CCTCCAGCTGCCACCTCTCTATCAGCCTTGGCTACCCCCACCCACGCTGGCACCTGCCTGGCAGCTCCCT ATCCACCCCCTCAGCCCTCAGGAGGCCAGGGCACACGTGGAACAGGTTGATGTTGTTCTCCAGGAAGTGG AGTGGGAGGGGGGTGGGGTCACTAGGGCAGGCGGGGTCCCCGGAAGCCTCTGTCCCTGCATAAAGCAGCC TGTCCTGGCAAGGGATGGTCATCCTCTCAACCTACAGACCCAGTGAGCCCTAGGCCCTCACCCCAGACCC AGCTGCTGGATAGGACCCAGCCCCGCTCCCAGGTAAGAACTTGATGACAGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| GSDMA_1 ↗ | 17:39,963,004 | 正股 | 39,962,955–39,963,014 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_B9X55 · enhancer · 39958825–39959558 · regulatory
ENSR17_5CDQNX · CTCF_binding_site · 39959111–39959132 · regulatory
ENSR17_9KT9M · enhancer · 39963878–39964181 · regulatory
· motif · 39959113–39959129 · motif
· motif · 39959450–39959472 · motif
· motif · 39959450–39959472 · motif
· motif · 39962336–39962347 · motif
· motif · 39963562–39963569 · motif
· motif · 39963636–39963648 · motif
· motif · 39963638–39963645 · motif
· motif · 39963638–39963653 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：445 aa
gasdermin A 長 445 個胺基酸，屬於 gasdermin 家族。蛋白質第 1–251 個胺基酸區域註解為可觸發細胞焦亡；另有四段 β 股跨膜區域，分別位於第 78–95、99–120、163–179 與 183–197 個胺基酸。跨膜區域註解依相似性推定。
蛋白質三維結構
細胞內定位
完整 Gasdermin-A 位於細胞質，包括核周區域與胞質溶膠。 經切割釋出的 Gasdermin-A, N-terminal 則定位於細胞膜，並註記為多次跨膜蛋白；此差異反映完整蛋白與 N 端片段的定位不同。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- APOC1P02654 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- APOC4P55056 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
Gasdermin-A 可形成同源寡聚體；插入膜後，這些次單元組成環狀孔洞複合體，每個複合體含 18–36 個次單元。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | gasdermin A 的完整形式是成孔蛋白的前驅物，也參與感染感測。S. pyogenes 感染上皮細胞時，該菌效應蛋白 SpeB 會特異性切割此蛋白，釋出 N 端片段；該片段結合膜並形成孔洞，進而觸發細胞焦亡。 | 含實驗來源 | 證據與來源This form constitutes the precursor of the pore-forming protein and acts as a sensor of infection: upon infection by S.pyogenes, specifically cleaved by S.pyogenes effector protein SpeB in epithelial cells, releasing the N-terminal moiety (Gasdermin-A, N-terminal) that binds to membranes and forms pores, triggering pyroptosis PMID 27281216 ↗ · PMID 35110732 ↗ · PMID 35545676 ↗ |
| 功能 | gasdermin A 的 N 端片段是成孔蛋白，可使膜通透化並引發細胞焦亡。S. pyogenes 效應蛋白 SpeB 切割後釋出此片段，其結合膜內側的 cardiolipin、phosphatidylserine 等酸性磷脂，並在膜中形成同源寡聚體；孔洞內徑為 10–15 奈米。感染皮膚細胞發生焦亡，可清除受感染細胞、引發發炎反應，減少病原體的保護性棲位，並有助阻止細菌穿越上皮屏障及後續全身散布。 | 含實驗來源 | 證據與來源Pore-forming protein that causes membrane permeabilization and pyroptosis. Released upon cleavage by S.pyogenes effector protein SpeB, and binds to membrane inner leaflet lipids. Homooligomerizes within the membrane and forms pores of 10-15 nanometers (nm) of inner diameter, triggering pyroptosis. Pyroptosis triggers the elimination of the infected skin cell, depriving the pathogen of its protective niche, while inducing an inflammatory response. This ultimately prevents bacterial penetration of the epithelial barrier and a subsequent systemic dissemination of the pathogen. Binds to cardiolipin and other acidic phospholipids, such as phosphatidylserine, which mediate its targeting to the inner leaflet membrane PMID 17471240 ↗ · PMID 27281216 ↗ · PMID 35110732 ↗ · PMID 35545676 ↗ |
| 交互作用 | Gasdermin-A 可組成同源寡聚體；插入膜後形成環狀孔洞複合體，每個複合體含有 18–36 個次單元。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homooligomer; homooligomeric ring-shaped pore complex containing 18-36 subunits when inserted in the membrane PMID 35110732 ↗ |
| 細胞定位 | Gasdermin-A 的定位包括細胞質核周區域與細胞質溶膠。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | Gasdermin-A 的 N 端片段定位於細胞膜，並註記為多次跨膜蛋白。 | 含實驗來源 | 證據與來源Gasdermin-A, N-terminal; Cell membrane / Multi-pass membrane protein PMID 35110732 ↗ · PMID 35545676 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ATCCTCTCAACCTACAGACCCAGTGAGCCCTAGGCCCTCA40CCCCAGACCCAGCTGCTGGATAGGACCCAGCCCCGCTCCC80AGAGACAATGACCATGTTTGAAAATGTCACCCGGGCCCTG120GCCAGACAGCTAAACCCTCGAGGGGACCTGACACCACTTG160ACAGCCTCATCGACTTCAAGCGCTTCCATCCCTTCTGCCT200GGTGCTGAGGAAGAGGAAGAGCACGCTCTTCTGGGGGGCC240CGGTACGTCCGCACCGACTACACGCTGCTGGATGTGCTTG280AGCCCGGCAGCTCACCTTCAGACCCAACAGACACTGGGAA320TTTTGGCTTTAAGAATATGCTGGACACCCGAGTGGAGGGA360GATGTGGATGTACCAAAGACGGTGAAGGTGAAGGGAACGG400CAGGGCTCTCGCAGAACAGCACTCTGGAGGTCCAGACACT440CAGTGTGGCTCCCAAGGCCCTGGAGACCGTGCAGGAGAGG480AAGCTGGCAGCAGACCACCCATTCCTGAAGGAGATGCAAG520ATCAAGGGGAGAACCTGTATGTGGTGATGGAGGTGGTGGA560GACGGTGCAGGAGGTCACACTGGAGCGAGCCGGCAAGGCA600GAGGCCTGCTTCTCCCTCCCCTTCTTCGCCCCATTGGGGC640TACAGGGATCCATAAATCACAAGGAGGCTGTAACCATCCC680CAAGGGCTGCGTCCTGGCCTTTCGAGTGAGACAGCTGATG720GTCAAAGGCAAAGATGAGTGGGATATTCCACATATCTGCA760ATGATAACATGCAAACCTTCCCTCCTGGAGAAAAGTCAGG800AGAGGAGAAGGTCATCCTTATCCAGGCATCTGATGTTGGG840GACGTACACGAAGGCTTCAGGACACTAAAAGAAGAAGTTC880AGAGAGAGACCCAACAAGTGGAGAAGCTGAGCCGAGTAGG920GCAAAGCTCCCTGCTCAGCTCCCTCAGCAAACTTCTAGGG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。