演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

GPSM3NG1

G protein signaling modulator 3

GPSM3 編碼 G protein signaling modulator 3,與 G(i) alpha proteins 的次單元互作,並調節其活化。

Homo sapiens6p21.32UniProt Q9Y4H4
OFFICIAL SYMBOL
GPSM3
CHROMOSOME
6
UNIPROT
Q9Y4H4
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

GPSM3 是人類的蛋白質編碼基因,產物為 G protein signaling modulator 3。此蛋白質含有三個 GoLoco 結構域;其序列另有一段被註記為無序區域。來源資料將它歸於調節 G 蛋白訊號的角色,並指出它會與 G(i) alpha proteins 的次單元互作。這些資訊勾勒出 GPSM3 蛋白的基本性質與結構配置;其如何影響相關蛋白活化,則於功能段落說明。

Official symbol
GPSM3
Gene name
G protein signaling modulator 3
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13945
UniProt
Q9Y4H4
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
NG1G18G18.1aG18.1bG18.2AGS4C6orf9

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 66p21.32
chr6 · 170,805,979 bp · GRCh38chr6p25.3 · 1–2300000 · gnegchr6p25.2 · 2300001–4200000 · gpos25chr6p25.1 · 4200001–7100000 · gnegchr6p24.3 · 7100001–10600000 · gpos50chr6p24.2 · 10600001–11600000 · gnegchr6p24.1 · 11600001–13400000 · gpos25chr6p23 · 13400001–15200000 · gnegchr6p22.3 · 15200001–25200000 · gpos75chr6p22.2 · 25200001–27100000 · gnegchr6p22.1 · 27100001–30500000 · gpos50chr6p21.33 · 30500001–32100000 · gnegchr6p21.32 · 32100001–33500000 · gpos25chr6p21.31 · 33500001–36600000 · gnegchr6p21.2 · 36600001–40500000 · gpos25chr6p21.1 · 40500001–46200000 · gnegchr6p12.3 · 46200001–51800000 · gpos100chr6p12.2 · 51800001–53000000 · gnegchr6p12.1 · 53000001–57200000 · gpos100chr6p11.2 · 57200001–58500000 · gnegchr6p11.1 · 58500001–59800000 · acenchr6q11.1 · 59800001–62600000 · acenchr6q11.2 · 62600001–62700000 · gnegchr6q12 · 62700001–69200000 · gpos100chr6q13 · 69200001–75200000 · gnegchr6q14.1 · 75200001–83200000 · gpos50chr6q14.2 · 83200001–84200000 · gnegchr6q14.3 · 84200001–87300000 · gpos50chr6q15 · 87300001–92500000 · gnegchr6q16.1 · 92500001–98900000 · gpos100chr6q16.2 · 98900001–100000000 · gnegchr6q16.3 · 100000001–105000000 · gpos100chr6q21 · 105000001–114200000 · gnegchr6q22.1 · 114200001–117900000 · gpos75chr6q22.2 · 117900001–118100000 · gnegchr6q22.31 · 118100001–125800000 · gpos100chr6q22.32 · 125800001–126800000 · gnegchr6q22.33 · 126800001–130000000 · gpos75chr6q23.1 · 130000001–130900000 · gnegchr6q23.2 · 130900001–134700000 · gpos50chr6q23.3 · 134700001–138300000 · gnegchr6q24.1 · 138300001–142200000 · gpos75chr6q24.2 · 142200001–145100000 · gnegchr6q24.3 · 145100001–148500000 · gpos75chr6q25.1 · 148500001–152100000 · gnegchr6q25.2 · 152100001–155200000 · gpos50chr6q25.3 · 155200001–160600000 · gnegchr6q26 · 160600001–164100000 · gpos50chr6q27 · 164100001–170805979 · gnegGPSM3pq1 bp170,805,979 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr6:32,190,766–32,195,523
Gene span
4,758 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000375040 ★32,190,766–32,192,6434
ENST0000048776132,190,766–32,192,8684
ENST0000037504332,190,766–32,195,5238
ENST0000087427032,190,766–32,192,9225
ENST0000087427132,190,766–32,192,8955
ENST0000093437432,190,766–32,192,8683
ENST0000113445832,190,766–32,192,8684
ENST0000061908532,190,767–32,193,1185

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

GPSM3 的來源註解指出,它會與 G(i) alpha proteins 的次單元互作,並調節 G(i) alpha proteins 的活化。這描述了它在 G 蛋白訊號傳遞中的調節角色:其作用對象是 G(i) alpha proteins,並涉及這些蛋白的活化狀態。

就分子作用而言,現有資料支持兩項彼此相關的資訊:GPSM3 與 G(i) alpha proteins 的次單元發生互作,以及 GPSM3 會調節 G(i) alpha proteins 的活化。來源未進一步說明互作的具體分子步驟、活化調節的方向或作用條件,因此不宜據此推定更細緻的機制。

這項功能註解將 GPSM3 定位為 G(i) alpha proteins 活化的調節因子,而非僅描述其結構特徵。由於可用資料沒有列出下游效應、生物過程或細胞層級的結果,GPSM3 對更廣泛生理功能的影響仍無法由此確定。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 32192643 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>GPSM3 ENST00000375040 GRCh38 chr6:32192543-32193643 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TATATCTCTTATGCCCAAAATAAAATTTCCCCTGCCCCTTGTCTGCACTAAACTATAAGTTTCCAAAATG
AACCCTTCCCGTACTCTATTTGGTACACATCTTGTCTCCTGAATAGAGTGTATTTTTTATTTTATTTTAT
TTTGGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCACCTAGGCTGGAGCGCAGTGGCACAATCTCAGTTCACCGCAACCT
CCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGTGGC
CACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAAAGATGGGGTTTCACCATGTTCCCCAGGCTGGTCTCCAAC
TCCTGAGCTCAGGCAATCCACCCGCCTCAGCCTCCCGAAGTGCTAGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCAG
CCGGCCATCTCCTGAATAGATTTTAAATACCTAGAGGTCAGGGATGATTATTCAATACATATATATTGAA
TACTTACTATGTGTTGGACCCGGTGCTAGGGTTTTATGTATATATTTGAGAGCTCCACATCCCTGGATCT
GAATCCTCCACTTCCCACTGGAACCATGCCCCTCCCAGTCCCGGTAAGTAAGAGGGAAGATCGGGAGGGC
CAAATCCTACACCAGGGTCTATCTTAGGGAGGGAAGGGACCTGGCTGGGGGGAGGGGGATTCTGAGGAGT
GAAACCACTTCCTGTGTAGCTAGTTCCTGTGTTGACAGAAAGAGCAGAAGAGGAGGTGGGGTGGAGGGAG
CAGAGCCAGGGATTAGGGGACTACTGAGGCTCTGGAGATGAGACCGCCAGGAGTCCTTCCCCACCATGAG
CCCCCTCCACTCCTGCAGCTGGAGGAGTTTTTCCCAGTCTCAGTGCTGCCCTGGGGCGAGAGAGACTGAA
CAAGCTGTTTGGGTGGGAAGAGAATGGAGGAAGTTGACAGGGATGGGCGGGGCCCGTGGGGGGGCTGACC
AGGAACCCAGCTTCCTGCTCAGTACCCAGGCATCCAGCCCCCAGCTCACCCCCACCCCTTCCAGCCCCCA
CTCCCCTCAGGAACCCAAGGTTCCAGCCCTCCTCCCAAATCCCAGCCACCC
GPSM3 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
GPSM3_2 ↗6:32,192,640負股32,192,630–32,192,689
GPSM3_1 ↗6:32,192,915負股32,192,905–32,192,964
GPSM3_3 ↗6:32,195,537負股32,195,527–32,195,586

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:160 aa

1 aa160 aa結構域功能區域
依 Q9Y4H4 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

G protein signaling modulator 3 長 160 個胺基酸,含三個 GoLoco 結構域,分別位於第 62–84、104–126 與 132–155 個胺基酸。其第 1–55 個胺基酸另註記為無序區域。

結構域GoLoco 162–84 aa
結構域GoLoco 2104–126 aa
結構域GoLoco 3132–155 aa
功能區域Disordered1–55 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9Y4H4…

AlphaFold · Q9Y4H4

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

G protein signaling modulator 3 的定位註記為細胞質。 資料未提供定位改變的條件或不同異構型之間的差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 50 個夥伴 · 最多顯示 50 個
NG1GPSM3ACMSDANKRD33ASB15BATF2BMFC9orf57CHRDL2COA7CTAG1BDR1FAM86C1PFLNAGATAD2BGNAI1GNAI2GNAI3GRNGTF3C3HELTHIGD2BHSF2BPHSPB1IQCEIVDKCNJ5-AS1KIF1BKRTAP11-1KRTAP13-3KRTAP19-4MBD3L1MEOX2NR0B2P4HA3PIAS4PRR5RIPK4RNF11RSPO4SOD1SPAG8SPMIP5SPRY3STXBP5LTADA2ATARDBPTEX11UFSP1USHBP1WFS1YWHAZ
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 52 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能GPSM3 與 G(i) alpha proteins 的次單元互作,並調節 G(i) alpha proteins 的活化;此註解未說明調節方向、作用條件或具體分子步驟。含實驗來源
證據與來源

Interacts with subunit of G(i) alpha proteins and regulates the activation of G(i) alpha proteins

PMID 14656218 ↗ · PMID 15096500 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位GPSM3 的細胞內定位註記為細胞質。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm

PMID 15096500 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000375040 · 1,213 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTACCCAGGCATCCAGCCCCCAGCTCACCCCCACCCCTT40
41CCAGCCCCCACTCCCCTCAGGAACCCAAGGTTCCAGCCCT80
81CCTCCCAAATCCCAGCCACCCCTCCCCCACCAGTTTCTCC120
121CCTCTAGGGGATGGAGGCTGAGAGACCCCAGGAAGAAGAG160
161GATGGTGAGCAGGGCCCCCCTCAGGATGAGGAAGGCTGGC200
201CCCCTCCAAACTCCACCACTCGGCCTTGGCGATCTGCTCC240
241TCCATCCCCTCCTCCTCCAGGGACCCGCCACACAGCCCTG280
281GGACCCCGCTCGGCCTCCCTGCTCTCCCTGCAGACTGAAC320
321TCCTTCTGGACCTGGTGGCTGAAGCCCAGTCCCGCCGCCT360
361GGAGGAGCAGAGGGCCACCTTCTACACCCCCCAAAACCCC400
401TCAAGCCTAGCCCCTGCCCCACTCCGTCCTCTCGAGGACA440
441GAGAACAGCTTTACAGCACTATCCTCAGTCACCAGTGCCA480
481GCGGATGGAAGCCCAGCGGTCAGAGCCTCCCCTCCCTCCA520
521GGGGGGCAAGAGCTCCTGGAGTTGCTGCTGAGAGTTCAGG560
561GTGGGGGTCGAATGGAGGAGCAAAGGTCCCGGCCCCCCAC600
601ACACACCTGCTGAGACTTGAGCCCCAACCAGCCCTTCCTT640
641GCCACTGGTCTCAAAGCTGGGCAGCCCATTGCATGCCCTC680
681AACTCTTGCTTGGCAGGGGTACCAGAGACTGAAAGACACG720
721GCACAAATCTCAATATTCATCTCCCACATCACCTTCCCTG760
761GGAACTGGACAGGGTGAAAGTCCTCAAACTCTGGGAACAG800
801GCGAGATGGAACAGGGATTTAACTCCCCGCCCACAGGTCC840
841ATGGGAGCTTGAGGCAGTAAGGGGGATCCCAGGCACCCAT880
881CTCAAGGAGTGGCTGGGAGTCTTTTCCCTAACTTGTGGGG920
921ACACCACCAGTTGTCAAGCTACTAGGCAGTAGGGTCTGAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。