基因總覽
GPSM3 是人類的蛋白質編碼基因,產物為 G protein signaling modulator 3。此蛋白質含有三個 GoLoco 結構域;其序列另有一段被註記為無序區域。來源資料將它歸於調節 G 蛋白訊號的角色,並指出它會與 G(i) alpha proteins 的次單元互作。這些資訊勾勒出 GPSM3 蛋白的基本性質與結構配置;其如何影響相關蛋白活化,則於功能段落說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000375040 ★ | 32,190,766–32,192,643 | 4 |
| ENST00000487761 | 32,190,766–32,192,868 | 4 |
| ENST00000375043 | 32,190,766–32,195,523 | 8 |
| ENST00000874270 | 32,190,766–32,192,922 | 5 |
| ENST00000874271 | 32,190,766–32,192,895 | 5 |
| ENST00000934374 | 32,190,766–32,192,868 | 3 |
| ENST00001134458 | 32,190,766–32,192,868 | 4 |
| ENST00000619085 | 32,190,767–32,193,118 | 5 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
GPSM3 的來源註解指出,它會與 G(i) alpha proteins 的次單元互作,並調節 G(i) alpha proteins 的活化。這描述了它在 G 蛋白訊號傳遞中的調節角色:其作用對象是 G(i) alpha proteins,並涉及這些蛋白的活化狀態。
就分子作用而言,現有資料支持兩項彼此相關的資訊:GPSM3 與 G(i) alpha proteins 的次單元發生互作,以及 GPSM3 會調節 G(i) alpha proteins 的活化。來源未進一步說明互作的具體分子步驟、活化調節的方向或作用條件,因此不宜據此推定更細緻的機制。
這項功能註解將 GPSM3 定位為 G(i) alpha proteins 活化的調節因子,而非僅描述其結構特徵。由於可用資料沒有列出下游效應、生物過程或細胞層級的結果,GPSM3 對更廣泛生理功能的影響仍無法由此確定。
Promoter 與基因調控
>GPSM3 ENST00000375040 GRCh38 chr6:32192543-32193643 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TATATCTCTTATGCCCAAAATAAAATTTCCCCTGCCCCTTGTCTGCACTAAACTATAAGTTTCCAAAATG AACCCTTCCCGTACTCTATTTGGTACACATCTTGTCTCCTGAATAGAGTGTATTTTTTATTTTATTTTAT TTTGGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCACCTAGGCTGGAGCGCAGTGGCACAATCTCAGTTCACCGCAACCT CCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGTGGC CACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAAAGATGGGGTTTCACCATGTTCCCCAGGCTGGTCTCCAAC TCCTGAGCTCAGGCAATCCACCCGCCTCAGCCTCCCGAAGTGCTAGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCAG CCGGCCATCTCCTGAATAGATTTTAAATACCTAGAGGTCAGGGATGATTATTCAATACATATATATTGAA TACTTACTATGTGTTGGACCCGGTGCTAGGGTTTTATGTATATATTTGAGAGCTCCACATCCCTGGATCT GAATCCTCCACTTCCCACTGGAACCATGCCCCTCCCAGTCCCGGTAAGTAAGAGGGAAGATCGGGAGGGC CAAATCCTACACCAGGGTCTATCTTAGGGAGGGAAGGGACCTGGCTGGGGGGAGGGGGATTCTGAGGAGT GAAACCACTTCCTGTGTAGCTAGTTCCTGTGTTGACAGAAAGAGCAGAAGAGGAGGTGGGGTGGAGGGAG CAGAGCCAGGGATTAGGGGACTACTGAGGCTCTGGAGATGAGACCGCCAGGAGTCCTTCCCCACCATGAG CCCCCTCCACTCCTGCAGCTGGAGGAGTTTTTCCCAGTCTCAGTGCTGCCCTGGGGCGAGAGAGACTGAA CAAGCTGTTTGGGTGGGAAGAGAATGGAGGAAGTTGACAGGGATGGGCGGGGCCCGTGGGGGGGCTGACC AGGAACCCAGCTTCCTGCTCAGTACCCAGGCATCCAGCCCCCAGCTCACCCCCACCCCTTCCAGCCCCCA CTCCCCTCAGGAACCCAAGGTTCCAGCCCTCCTCCCAAATCCCAGCCACCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| GPSM3_2 ↗ | 6:32,192,640 | 負股 | 32,192,630–32,192,689 |
| GPSM3_1 ↗ | 6:32,192,915 | 負股 | 32,192,905–32,192,964 |
| GPSM3_3 ↗ | 6:32,195,537 | 負股 | 32,195,527–32,195,586 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:160 aa
G protein signaling modulator 3 長 160 個胺基酸,含三個 GoLoco 結構域,分別位於第 62–84、104–126 與 132–155 個胺基酸。其第 1–55 個胺基酸另註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
G protein signaling modulator 3 的定位註記為細胞質。 資料未提供定位改變的條件或不同異構型之間的差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 52 個夥伴
- ACMSDQ8TDX5-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ANKRD33Q7Z3H0-1 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- ASB15Q8WXK1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BATF2Q8N1L9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BMFQ96LC9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- C9orf57Q5W0N0-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CHRDL2Q6WN34-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- COA7Q96BR5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CTAG1BP78358 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- DR1Q01658 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM86C1PQ9NVL1-2 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- FLNAP21333-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GATAD2BQ8WXI9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GNAI1P63096 · UniProt INTERACTION · 11 experiments
- GNAI2P04899 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- GNAI3P08754 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- GRNP28799 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GTF3C3Q9Y5Q9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HELTA0A087WSW0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HIGD2BQ4VC39 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSF2BPO75031 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSPB1P04792 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IQCEQ6IPM2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IVDP26440 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KCNJ5-AS1Q8TAV5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | GPSM3 與 G(i) alpha proteins 的次單元互作,並調節 G(i) alpha proteins 的活化;此註解未說明調節方向、作用條件或具體分子步驟。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with subunit of G(i) alpha proteins and regulates the activation of G(i) alpha proteins PMID 14656218 ↗ · PMID 15096500 ↗ |
| 細胞定位 | GPSM3 的細胞內定位註記為細胞質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGTACCCAGGCATCCAGCCCCCAGCTCACCCCCACCCCTT40CCAGCCCCCACTCCCCTCAGGAACCCAAGGTTCCAGCCCT80CCTCCCAAATCCCAGCCACCCCTCCCCCACCAGTTTCTCC120CCTCTAGGGGATGGAGGCTGAGAGACCCCAGGAAGAAGAG160GATGGTGAGCAGGGCCCCCCTCAGGATGAGGAAGGCTGGC200CCCCTCCAAACTCCACCACTCGGCCTTGGCGATCTGCTCC240TCCATCCCCTCCTCCTCCAGGGACCCGCCACACAGCCCTG280GGACCCCGCTCGGCCTCCCTGCTCTCCCTGCAGACTGAAC320TCCTTCTGGACCTGGTGGCTGAAGCCCAGTCCCGCCGCCT360GGAGGAGCAGAGGGCCACCTTCTACACCCCCCAAAACCCC400TCAAGCCTAGCCCCTGCCCCACTCCGTCCTCTCGAGGACA440GAGAACAGCTTTACAGCACTATCCTCAGTCACCAGTGCCA480GCGGATGGAAGCCCAGCGGTCAGAGCCTCCCCTCCCTCCA520GGGGGGCAAGAGCTCCTGGAGTTGCTGCTGAGAGTTCAGG560GTGGGGGTCGAATGGAGGAGCAAAGGTCCCGGCCCCCCAC600ACACACCTGCTGAGACTTGAGCCCCAACCAGCCCTTCCTT640GCCACTGGTCTCAAAGCTGGGCAGCCCATTGCATGCCCTC680AACTCTTGCTTGGCAGGGGTACCAGAGACTGAAAGACACG720GCACAAATCTCAATATTCATCTCCCACATCACCTTCCCTG760GGAACTGGACAGGGTGAAAGTCCTCAAACTCTGGGAACAG800GCGAGATGGAACAGGGATTTAACTCCCCGCCCACAGGTCC840ATGGGAGCTTGAGGCAGTAAGGGGGATCCCAGGCACCCAT880CTCAAGGAGTGGCTGGGAGTCTTTTCCCTAACTTGTGGGG920ACACCACCAGTTGTCAAGCTACTAGGCAGTAGGGTCTGAG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。