演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

GPRC5CRAIG-3

G protein-coupled receptor class C group 5 member C

GPRC5C 編碼 retinoic acid-inducible G protein-coupled receptor,來源指出它可能連結 retinoid 與 G-protein 訊號路徑。

Homo sapiens17q25.1UniProt Q9NQ84
OFFICIAL SYMBOL
GPRC5C
CHROMOSOME
17
UNIPROT
Q9NQ84
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

GPRC5C 是人類蛋白質編碼基因,產物為 retinoic acid-inducible G protein-coupled receptor,屬於 G protein-coupled receptor 3 family。這項受體的名稱反映其可由 retinoic acid 誘導;現有資料並未提供其配體、下游訊號機制或作用組織等細節。其膜蛋白特徵與多段跨膜結構,提供了認識此受體的基本架構。

Official symbol
GPRC5C
Gene name
G protein-coupled receptor class C group 5 member C
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13309
UniProt
Q9NQ84
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
RAIG-3

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717q25.1
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegGPRC5Cpq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr17:74,424,851–74,459,120
Gene span
34,270 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000392627 ★74,432,088–74,447,4294
ENST0000058244474,424,851–74,440,2122
ENST0000065223274,430,345–74,447,4274
ENST0000087727374,430,349–74,447,4264
ENST0000112731374,430,929–74,449,2134
ENST0000100743974,430,945–74,451,9216
ENST0000112731274,431,165–74,459,1205
ENST0000103487374,431,340–74,447,4294
ENST0000111668974,431,340–74,441,3083
ENST0000096000274,431,373–74,447,4244
ENST0000100744074,431,378–74,451,6565
ENST0000096000374,431,381–74,447,0814

顯示 12/28 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

GPRC5C 的產物是一種可由 retinoic acid 誘導的 G protein-coupled receptor。現有註解將它與 retinoid 訊號及 G-protein 訊號的可能交互作用相連,表示這個受體或可作為兩類訊號途徑之間的關聯線索;但此處的證據僅支持「可能」的交互作用,不能據此認定其分子機制或因果關係已獲確立。

就功能意義而言,這項註解提出了 retinoid 與 G-protein 訊號之間可能存在聯繫的方向。它並未指出是哪一種 retinoid 直接作用於受體,也未說明 G-protein 的種類、訊號傳遞步驟或細胞反應。因此,較合適的理解是:GPRC5C 是一個受 retinoic acid 誘導的受體,其資料支持進一步關注 retinoid 與 G-protein 訊號如何相互關聯,但目前提供的描述不足以界定其具體生理作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 74432088 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>GPRC5C ENST00000392627 GRCh38 chr17:74431088-74432188 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TCAGCCCCTACGGGCCTCTGGCGCGGGCTAACTAGGCCTCGCTGCGGGCCCCCAGGACTGCGCACCCCAC
CCCCCGCGAGGCCAGCAGCCCCGGGGGAAGGCGGCCGGAAAATCTCTTGTTTATCGGGCTGGATAAGTAC
CAGCCTGGATTCGCTTCCCAATTTCTGCGGTCCAGCTTCAGCAGATTCCTGGGGCCGGAGGGGAAAGGGT
GGCAACCCACAGATCCACCCCGGAACAGGGAGTGGGGGGTGGGGCTGGTGGGAACCTGACCTCCTGGAAA
GGACGGACTCGGAGTCAGAGCCAACGTGTCCCGGAGCGCAGAGGCCCAGGGGGTCGCGCTAAACACTGTA
CCTCGGGGAACAAAACCGTGAAGGCTAATTAGGACAAGTCGGAGCAGGGAACGGGGACGCCGGGAGGGGA
GAGCGCGCTCCGAGTTGGGCAGAACCTGGAACGGTCACAGGAAACCCGGGCGCGGGGTAGTCGGGCCGAG
GGGGACCTTTGCCCACGGTCCAGAGTGGTCTGGACTCGGCCCACGCGTGAGAGGAGCGCTTGGTGACGAT
CCCACGTACGCTTGGTGACTGGTGGAGGTCCCAGAGAAGGACCGTGCGTGCAAAAGGCGAACCTCGGTGT
GCGGTGTGTCCACGTGTGCAAGCTGGGGAGGGGAGGGGGCGCAGAAGGCGTGACAAAGACGGACTCTGTC
TTGAGTGTGCGCCTCGCTCCGGCCCGCTCCCAGCGAACTGTGCCTGAAGTGTGTCTCACGGGAGGGCCAG
GACGAAGGTGACAAAGGCTAGGTGTCCCCCACGGAGACGCGCCAAGGTAGCCCCGCGCGTGTCCGTAGGC
GCGCTCTCTGGAAGACGCGGTGGGGGGTGCGCAGGGCTGCACCCTCACACCAATTGCCCCGGCGAAGGCC
GAGCCCAGAAAGTGAGTGCGCGTGAGTGTGCGCGCGCCCGCATGCGGGGGCGTGGCAGTCAACAGCAACA
ACCCACACGCCGGCAGGGCCAGAAACTCCCATCTCCCTCACCAGCCGGAAAGTACGAGTCGGCTCAGCCT
GGAGGTGAGTCGGGGCGGGGAGGGCCGGGCAGGCTTTGTTCCTGTGTAAAC
GPRC5C 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 4 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
GPRC5C_4 ↗17:74,424,767正股74,424,718–74,424,777
GPRC5C_2 ↗17:74,431,005正股74,430,956–74,431,015
GPRC5C_1 ↗17:74,431,384正股74,431,335–74,431,394
GPRC5C_3 ↗17:74,433,721正股74,433,672–74,433,731

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_BJQRT · enhancer · 74427058–74427827 · regulatory

ENSR17_84749S · enhancer · 74429759–74429893 · regulatory

ENSR17_BJQSD · promoter · 74430894–74431538 · regulatory

ENSR17_BJQSH · promoter · 74431598–74432126 · regulatory

ENSR17_934JNG · promoter · 74433207–74433707 · regulatory

ENSR17_934JNL · enhancer · 74433708–74434153 · regulatory

ENSR17_5MHP2X · CTCF_binding_site · 74434012–74434033 · regulatory

ENSR17_8474FH · enhancer · 74436089–74436255 · regulatory

· motif · 74427235–74427245 · motif

· motif · 74427265–74427280 · motif

· motif · 74427285–74427294 · motif

· motif · 74427285–74427296 · motif

· motif · 74427285–74427296 · motif

· motif · 74427632–74427642 · motif

· motif · 74429765–74429773 · motif

· motif · 74430828–74430838 · motif

· motif · 74430880–74430890 · motif

· motif · 74430931–74430941 · motif

· motif · 74431151–74431161 · motif

· motif · 74431174–74431187 · motif

· motif · 74431174–74431187 · motif

· motif · 74431233–74431253 · motif

· motif · 74431332–74431342 · motif

· motif · 74432043–74432053 · motif

· motif · 74433240–74433250 · motif

· motif · 74433268–74433278 · motif

· motif · 74433286–74433296 · motif

· motif · 74433296–74433305 · motif

· motif · 74434014–74434030 · motif

· motif · 74435960–74435974 · motif

· motif · 74435961–74435974 · motif

· motif · 74435972–74435987 · motif

· motif · 74435973–74435987 · motif

· motif · 74435974–74435987 · motif

· motif · 74436661–74436672 · motif

GPRC5C 的表現調控註記指出,all-trans retinoic acid(ATRA)與其誘導相關。資料未進一步說明誘導發生的細胞或實驗條件,也未提供調控幅度或時間等資訊。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:441 aa

1 aa441 aa功能區域訊號胜肽跨膜區拓樸區域
依 Q9NQ84 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

GPRC5C 蛋白質長 441 個胺基酸,具有 7 段跨膜螺旋,符合多次穿膜膜蛋白的結構特徵。序列註解標示 N 端訊號區,以及位於細胞外與細胞質側的區段;C 端末段另被註記為無序區。其家族分類為 G protein-coupled receptor 3 family。

訊號胜肽1–23 aa
拓樸區域Extracellular24–50 aa
跨膜區Helical; Name=151–71 aa
拓樸區域Cytoplasmic72–85 aa
跨膜區Helical; Name=286–106 aa
拓樸區域Extracellular107–120 aa
跨膜區Helical; Name=3121–141 aa
拓樸區域Cytoplasmic142–155 aa
跨膜區Helical; Name=4156–176 aa
拓樸區域Extracellular177–208 aa
跨膜區Helical; Name=5209–229 aa
拓樸區域Cytoplasmic230–241 aa
跨膜區Helical; Name=6242–262 aa
拓樸區域Extracellular263–279 aa
跨膜區Helical; Name=7280–300 aa
拓樸區域Cytoplasmic301–441 aa
功能區域Disordered412–441 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9NQ84…

AlphaFold · Q9NQ84

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Cytoplasmic vesicle membrane

GPRC5C 被註記位於細胞膜,並可見於質膜及核周囊泡;資料亦列出胞質囊泡膜定位。 現有描述未指出不同定位之間的轉換條件或動態。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
RAIG-3GPRC5CRAMP1RAMP2RAMP3
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能GPRC5C 是可由 retinoic acid 誘導的 G protein-coupled receptor;現有資料支持 retinoid 訊號與 G-protein 訊號路徑之間可能存在交互作用,但未確定其具體機制或因果關係。推論支持
證據與來源

This retinoic acid-inducible G protein-coupled receptor provide evidence for a possible interaction between retinoid and G-protein signaling pathways

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位GPRC5C 被註記為多次穿膜膜蛋白,定位包括細胞膜、質膜、胞質囊泡膜及核周囊泡;資料未提供定位改變的條件或動態。資料庫紀錄
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Cytoplasmic vesicle membrane / Multi-pass membrane protein; Localized in the plasma membrane and perinuclear vesicles

開啟資料庫紀錄 ↗

調控GPRC5C 的表現調控註記與 all-trans retinoic acid(ATRA)相關,指出 ATRA 可誘導該基因;來源未提供誘導條件、幅度或時間等細節。含實驗來源
證據與來源

By all-trans retinoic acid (ATRA)

PMID 10945465 ↗ · PMID 11311935 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000392627 · 1,813 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGAAACTCCCATCTCCCTCACCAGCCGGAAAGTACGAGTC40
41GGCTCAGCCTGGAGGGACCCAACCAGAGCCTGGCCTGGGA80
81GCCAGGATGGCCATCCACAAAGCCTTGGTGATGTGCCTGG120
121GACTGCCTCTCTTCCTGTTCCCAGGGGCCTGGGCCCAGGG160
161CCATGTCCCACCCGGCTGCAGCCAAGGCCTCAACCCCCTG200
201TACTACAACCTGTGTGACCGCTCTGGGGCGTGGGGCATCG240
241TCCTGGAGGCCGTGGCTGGGGCGGGCATTGTCACCACGTT280
281TGTGCTCACCATCATCCTGGTGGCCAGCCTCCCCTTTGTG320
321CAGGACACCAAGAAACGGAGCCTGCTGGGGACCCAGGTAT360
361TCTTCCTTCTGGGGACCCTGGGCCTCTTCTGCCTCGTGTT400
401TGCCTGTGTGGTGAAGCCCGACTTCTCCACCTGTGCCTCT440
441CGGCGCTTCCTCTTTGGGGTTCTGTTCGCCATCTGCTTCT480
481CTTGTCTGGCGGCTCACGTCTTTGCCCTCAACTTCCTGGC520
521CCGGAAGAACCACGGGCCCCGGGGCTGGGTGATCTTCACT560
561GTGGCTCTGCTGCTGACCCTGGTAGAGGTCATCATCAATA600
601CAGAGTGGCTGATCATCACCCTGGTTCGGGGCAGTGGCGA640
641GGGCGGCCCTCAGGGCAACAGCAGCGCAGGCTGGGCCGTG680
681GCCTCCCCCTGTGCCATCGCCAACATGGACTTTGTCATGG720
721CACTCATCTACGTCATGCTGCTGCTGCTGGGTGCCTTCCT760
761GGGGGCCTGGCCCGCCCTGTGTGGCCGCTACAAGCGCTGG800
801CGTAAGCATGGGGTCTTTGTGCTCCTCACCACAGCCACCT840
841CCGTTGCCATATGGGTGGTGTGGATCGTCATGTATACTTA880
881CGGCAACAAGCAGCACAACAGTCCCACCTGGGATGACCCC920
921ACGCTGGCCATCGCCCTCGCCGCCAATGCCTGGGCCTTCG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。