演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

GPRC5BRAIG-2

G protein-coupled receptor class C group 5 member B

GPRC5B 編碼 G protein-coupled receptor class C group 5 member B,屬 G protein-coupled receptor,參與細胞體積調節。

Homo sapiens16p12.3UniProt Q9NZH0
OFFICIAL SYMBOL
GPRC5B
CHROMOSOME
16
UNIPROT
Q9NZH0
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

GPRC5B 是蛋白質編碼基因,其產物正式名稱為 G protein-coupled receptor class C group 5 member B。該蛋白質屬於 G protein-coupled receptor,並歸於 G protein-coupled receptor 3 family。來源指出它與細胞體積調節有關,但未提供其配體、訊號傳遞方式或更廣泛的生理作用細節。

Official symbol
GPRC5B
Gene name
G protein-coupled receptor class C group 5 member B
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13308
UniProt
Q9NZH0
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
RAIG-2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616p12.3
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegGPRC5Bpq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr16:19,856,691–19,886,173
Gene span
29,483 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000300571 ★19,856,691–19,884,8484
ENST0000056947919,856,691–19,886,1674
ENST0000056984719,856,691–19,886,1494
ENST0000089318719,856,691–19,886,1734
ENST0000089318819,856,691–19,883,3536
ENST0000089318919,856,691–19,883,3534
ENST0000089319019,856,691–19,884,9074
ENST0000089319119,856,691–19,884,9074
ENST0000089319219,856,691–19,884,8834
ENST0000089319319,856,691–19,882,5824
ENST0000089319419,856,691–19,873,0733
ENST0000091849519,856,691–19,884,9304

顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

GPRC5B 編碼的 G protein-coupled receptor class C group 5 member B 參與細胞體積的調節。這是目前來源所支持的主要功能描述;資料未進一步說明它如何感知細胞體積變化,也未指出受體活化後的分子步驟或下游反應。

來源將此蛋白質歸為 G protein-coupled receptor,並指出其屬於 G protein-coupled receptor 3 family。然而,現有功能資料沒有提供與其作用相關的配體、訊號分子或結合夥伴,因此無法據此推定細胞體積調節的具體機制。

細胞體積調節是來源明確標示的功能關聯;但資料未交代其作用發生的細胞或組織情境,也未描述在不同生理條件下的功能變化。因而,對 GPRC5B 的功能解讀應限於其受體分類及參與細胞體積調節這兩項資訊。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 19884848 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>GPRC5B ENST00000300571 GRCh38 chr16:19884748-19885848 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCCATATGGGGTGCCGGAGCGCAGCTCCCAGGCCTGGTCGAAGCAATGCGACCTCGGAGAGGCCTGAGGA
CTAGGACGGGGTGAGGGGGACTCAGAGACGGCTGCCCCGGACCCCTCCTTCAAGCAGGTCCCACGGCCGC
CCAGCGGACACGCGTCCGGGCTGTGCCCTGACCGTCTGCGGAGCGCACGGCCAGTGGCCCGGGCCGCTGA
GTGTGTGAGCCCTGAAGGGCAGTGGACATGTGCGTACGTGGGTGATGTGTGCGGTAGGGGTGGTGGCGAT
CCTGCGTAGGGACCCACGTGAGGGGTGCACCGACTGGACGTGTGTGTTTCGAGGGGCCAAGGAAGCGGGT
GTTGGTCCCAGTGTGCGTAAACGGACAACGACATCTGGGAGTTGGGCAGTGAGGAGAGAGAAGAGTGTGT
CCAGGAGGAACCTGCCTGGAGGAGGCCTAGCGGTGTGTGTGCGCCTAGGTGTATACCGGGGCGTTGGTGA
CTTCGAGAGGCACCGGGCGGGATCGATCCTCTCTGCGTCCTGGACCTGGTGCTGGTGTGTTTCGGGGAAG
TTACTGCTTATGAACCCCCCTTGGAGCGTGGCCTGGGGGCAGGAAGGCTTCCGCGCTGGGACCCCTGGGT
CGCGATACCTCCCTCGGTAAGTGTATTGGCTAGGGGAGTGTTCCCGCAAATGGATCTACCCTGGGGAGTT
GCCCGGCTCGTCTGGACTGCTTACGGGCGCACTGACGTTGTGGGGGGAATGTCCCCGAATTGGGGGCACG
AGGTCGGGGGAATCGTCTCTGAGATCCGGGCTAGAAGCTACGAGCTTGGGCTCCGGGGGTGCATGCAGAC
GGCGCCTAGCCCCGCGCGGAACCGCCGGCGGGACCGGGGGTGGGGCTCGGAGGCCCGGGGGCGGGGCCGG
CCGGGGGCGGGGGCGGGGGCGGGGCCGCGGCCGCTGCAGCAGCGCGGGCCGGGCCAGGGGGCGCCTCGCG
CGGCAGCGACTCTGGCAGGCGCTGCAGTGAAGCTGGACCCGCAGGCGGGCGTGCGTGGAGCGGGGGCCGC
GGCCGCGCCGCAGAGATGTGACTCGGGCCGAAGGCCAGCTGGAGCGTCGGC
GPRC5B 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
GPRC5B_1 ↗16:19,884,845負股19,884,835–19,884,894

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_B5XJ4 · enhancer · 19879212–19879853 · regulatory

ENSR16_56N9C6 · CTCF_binding_site · 19883261–19883282 · regulatory

ENSR16_56N9GS · CTCF_binding_site · 19884050–19884071 · regulatory

ENSR16_99W4R · promoter · 19884838–19885338 · regulatory

ENSR16_B5XK3 · promoter · 19885717–19886657 · regulatory

ENSR16_56N9TP · CTCF_binding_site · 19886398–19886419 · regulatory

ENSR16_56N9TT · CTCF_binding_site · 19886433–19886454 · regulatory

· motif · 19883263–19883279 · motif

· motif · 19884052–19884068 · motif

· motif · 19886400–19886416 · motif

· motif · 19886435–19886451 · motif

· motif · 19886584–19886593 · motif

· motif · 19886584–19886593 · motif

· motif · 19886796–19886807 · motif

來源記載 GPRC5B 與 all-trans retinoic acid(ATRA)相關的調控,但未提供作用方向、條件或調控機制的細節。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:403 aa

1 aa403 aa功能區域訊號胜肽跨膜區拓樸區域
依 Q9NZH0 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

G protein-coupled receptor class 5 member B 長 403 個胺基酸,屬於 G protein-coupled receptor 3 family。序列註解預測其具有七段跨膜螺旋;N 端含訊號胜肽,並有胞外與細胞質拓樸區段。第349至371位胺基酸區域被註記為無序區。

訊號胜肽1–28 aa
拓樸區域Extracellular29–56 aa
跨膜區Helical; Name=157–77 aa
拓樸區域Cytoplasmic78–94 aa
跨膜區Helical; Name=295–115 aa
拓樸區域Extracellular116–126 aa
跨膜區Helical; Name=3127–147 aa
拓樸區域Cytoplasmic148–162 aa
跨膜區Helical; Name=4163–183 aa
拓樸區域Extracellular184–199 aa
跨膜區Helical; Name=5200–220 aa
拓樸區域Cytoplasmic221–234 aa
跨膜區Helical; Name=6235–255 aa
拓樸區域Extracellular256–271 aa
跨膜區Helical; Name=7272–292 aa
拓樸區域Cytoplasmic293–403 aa
功能區域Disordered349–371 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9NZH0…

AlphaFold · Q9NZH0

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Cytoplasmic vesicle membrane

G protein-coupled receptor class 5 member B 定位於細胞膜及核周囊泡膜,為多次跨膜蛋白。 來源未提供定位隨條件改變的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
RAIG-2GPRC5BRAMP1RAMP3
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

GPRC5B 的變異與 Megalencephalic leukoencephalopathy with subcortical cysts 3(MLC3)相關;來源描述此病為常染色體顯性疾病。患者可在嬰兒期出現頭圍增大,幼年期逐漸發生運動與認知能力退化;行走能力可能未能建立,或在第一、第二個十年失去獨立行走能力。認知障礙程度不一,並可伴隨語言表達不佳與構音障礙;多數患者有早發癲癇,嚴重程度不一。腦部影像可見持續性大腦白質腦病、皮質下囊腫及白質腫脹。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能GPRC5B 編碼的受體參與細胞體積調節;來源未提供其作用機制或調控方向等進一步細節。含實驗來源
證據與來源

G protein-coupled receptor involved in the regulation of cell volume

PMID 37143309 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位GPRC5B 產物是多次跨膜蛋白,定位於細胞膜及細胞質囊泡膜;另有描述指出其位於質膜與核周囊泡。來源未說明定位變化的條件。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Cytoplasmic vesicle membrane / Multi-pass membrane protein; Localized in the plasma membrane and perinuclear vesicles

PMID 10945465 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

調控來源將 all-trans retinoic acid(ATRA)列為與 GPRC5B 調控相關的因素,但沒有說明調控方向、作用條件或其分子機制。含實驗來源
證據與來源

By all-trans retinoic acid (ATRA)

PMID 10945465 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯GPRC5B 相關變異會造成常染色體顯性疾病 MLC3。患者可於嬰兒期頭圍增大,幼年期出現運動及認知退化,可能無法行走或在第一、第二個十年失去獨立行走能力;認知障礙程度不一,常伴語言表達不佳、構音障礙及早發癲癇。影像可見持續性大腦白質腦病、皮質下囊腫與白質腫脹。含實驗來源
證據與來源

Megalencephalic leukoencephalopathy with subcortical cysts 3 MLC3 An autosomal dominant disorder characterized by increased head circumference apparent in infancy, followed by progressive motor and cognitive decline in early childhood. Affected individuals either do not achieve walking or lose independent ambulation in the first or second decades. Cognitive impairment is variable and accompanied by poor speech and dysarthria. Most patients have early-onset seizures, which may be mild or refractory. Brain imaging shows unremitting megalencephalic leukoencephalopathy with subcortical cysts and swelling of the cerebral white matter. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 620447

PMID 37143309 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000300571 · 5,144 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCTGCAGTGAAGCTGGACCCGCAGGCGGGCGTGCGTGGAG40
41CGGGGGCCGCGGCCGCGCCGCAGAGATGTGACTCGGGCCG80
81AAGGCCAGCTGGAGCGTCGGCGCTGCGGGGCCGCGGGGGT120
121CGAATGTTCGTGGCATCAGAGAGAAAGATGAGAGCTCACC160
161AGGTGCTCACCTTCCTCCTGCTCTTCGTGATCACCTCGGT200
201GGCCTCTGAAAACGCCAGCACATCCCGAGGCTGTGGGCTG240
241GACCTCCTCCCTCAGTACGTGTCCCTGTGCGACCTGGACG280
281CCATCTGGGGCATTGTGGTGGAGGCGGTGGCCGGGGCGGG320
321CGCCCTGATCACACTGCTCCTGATGCTCATCCTCCTGGTG360
361CGGCTGCCCTTCATCAAGGAGAAGGAGAAGAAGAGCCCTG400
401TGGGCCTCCACTTTCTGTTCCTCCTGGGGACCCTGGGCCT440
441CTTTGGGCTGACGTTTGCCTTCATCATCCAGGAGGACGAG480
481ACCATCTGCTCTGTCCGCCGCTTCCTCTGGGGCGTCCTCT520
521TTGCGCTCTGCTTCTCCTGCCTGCTGAGCCAGGCATGGCG560
561CGTGCGGAGGCTGGTGCGGCATGGCACGGGCCCCGCGGGC600
601TGGCAGCTGGTGGGCCTGGCGCTGTGCCTGATGCTGGTGC640
641AAGTCATCATCGCTGTGGAGTGGCTGGTGCTCACCGTGCT680
681GCGTGACACAAGGCCAGCCTGCGCCTACGAGCCCATGGAC720
721TTTGTGATGGCCCTCATCTACGACATGGTACTGCTTGTGG760
761TCACCCTGGGGCTGGCCCTCTTCACTCTGTGCGGCAAGTT800
801CAAGAGGTGGAAGCTGAACGGGGCCTTCCTCCTCATCACA840
841GCCTTCCTCTCTGTGCTCATCTGGGTGGCCTGGATGACCA880
881TGTACCTCTTCGGCAATGTCAAGCTGCAGCAGGGGGATGC920
921CTGGAACGACCCCACCTTGGCCATCACGCTGGCGGCCAGC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。