基因總覽
GPR63 基因是蛋白質編碼基因,產物為 G protein-coupled receptor 63,屬於 G protein-coupled receptor 1 家族。此受體被描述為孤兒受體,現有資料未指出其配體。蛋白質含 419 個胺基酸,具有七段跨膜螺旋,並分布於細胞膜;其序列包含細胞外與細胞質側區段。這些特徵構成其膜蛋白的基本架構。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000229955 ★ | 96,794,125–96,837,477 | 2 |
| ENST00000857872 | 96,794,125–96,838,150 | 2 |
| ENST00000857873 | 96,794,125–96,837,594 | 2 |
| ENST00000857874 | 96,794,125–96,837,899 | 3 |
| ENST00000857875 | 96,794,125–96,837,534 | 2 |
| ENST00000857876 | 96,794,125–96,837,534 | 3 |
| ENST00000917063 | 96,794,125–96,837,899 | 3 |
| ENST00000917064 | 96,794,125–96,837,899 | 3 |
| ENST00001137957 | 96,794,125–96,837,899 | 2 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
GPR63 是孤兒受體,來源資料指出它可能在腦部功能中扮演角色。不過,現有資料未提供其配體、受體活化方式、下游分子作用或特定腦部過程,因此目前只能將其功能描述為可能相關,不能據此確認其參與的具體機制或生理效應。
Promoter 與基因調控
>GPR63 ENST00000229955 GRCh38 chr6:96837377-96838477 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTGCTGCTGTGGTCTCTTCCTAGGGTGACGATAGCTGCTGATGCTGGGAGCCTCCTGGGCATCACCACCT GAGGCTGTGGCCTCAGTAATGATCACATATGTTGATAATAGCTGAAAATATCACTTGTCACTGAAAGCAG CATTTTCCACTGTCTCAAGATGATACTTTTTCTGGGGGGTCTTCCTGAGTTGTTTGGCATCTTTACAGCC CATGTGTTGATGAAAGTGAATCGTTTTAGAAATCCAGTGGGAGGCCAGCTGGGGATTGGCCATTGGAAGA GAACAGAGCACCGGGTAAAGGAGGATACCTGGCAATTCTCCCATGCCACACATCAGGGACACCTTCAAGC ATTGGTCTAGGGGCCCCAGCTGGCTTTTAGTTATTTCAGTCTTCTGGACGCCTGCGTGAGACCCTCATCA TTGTGTTGGAAATGAGGAAGAATAACCAAAGAAGAAACGCGAGTAGCCTCGGGGAACGCAAATCCACTGG GCAGTAGCCACTGGAGGTGCACTCTGGGGGCCCGTGGGAGCGGGAAACCAGGACCCTAAAAGGACTGCCA GGGATTAGGGGCGGGGCGACCGTCTGGGAGCGAGGCGCGGGGTGCAGGGCGCAGGCCAACGACGAGGGTT GCCCCAGTGCCGGGTGGGCGCACTTGCGGTACCCTCGATGCCTTTGCCCAGGCGGAGGAACGATGCGACC TGAGCATAGAGGGGTTCAGGGCAGGGAGCGGTCGAAAGGGGCCGGCGATCCGCCCTGGGGCAGCTCGGGC GTGGCCTCCAGGGATCTCTCCGTCTCTACTTGCCTCCTCCCTCTTTACTTGCCTCCTCCCTCTTTACTTG CCCCCTCCCTTTTTACTTGCCTCCTCCCTCTTTCTCTTCTCTCACTCACCTCCCGGTCTAAAACCGGGGC CGGCGCCTTTAAGAGGGAGCGTTGGTTACCCTGGGGGCGGGAACCCCTCGGCGGCTCGCGAGGCGGCGGC GCTCGTCCGCGATGCTCCTCACTTTCAGCTCCAGCTCCCGCCACCGCCGCCTGTATCGCCGCCGCCGCCA CCACCTCCTCTTCGTTGTCCTCCTTCCTCCTCCGCCTGGCAGCGTTGTTCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| GPR63_1 ↗ | 6:96,837,477 | 負股 | 96,837,467–96,837,526 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR6_CCLFZ · enhancer · 96836072–96837466 · regulatory
ENSR6_93FFR6 · promoter · 96837467–96837967 · regulatory
ENSR6_93FFRF · enhancer · 96838357–96838828 · regulatory
· motif · 96835886–96835898 · motif
· motif · 96836145–96836157 · motif
· motif · 96836170–96836183 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:419 aa
G protein-coupled receptor 63 長 419 個胺基酸,屬於 G protein-coupled receptor 1 家族。序列註解預測其含七段跨膜螺旋;各螺旋之間分布著細胞外與細胞質側區段,其中較長的細胞質區段位於第五與第六段跨膜螺旋之間。
蛋白質三維結構
細胞內定位
GPR63 定位於細胞膜,並註記為多次穿膜蛋白。 來源未提供不同條件下的定位變化、異構型差異或細胞內動態資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
ACTTTCAGCTCCAGCTCCCGCCACCGCCGCCTGTATCGCC40GCCGCCGCCACCACCTCCTCTTCGTTGTCCTCCTTCCTCC80TCCGCCTGGCAGCGTTGTTCTCTGCAGCGGAGGAGAGAAG120TGCTATGTCAGGAAAGTTCCGGGAGGGACTACATGGAGCC160ATGCTCCCTGGGCTCTTCCGCGGGCGCCCGCGCGCTGCCC200TTCGCTTGAGGCAAAAGGACTCTTGTGGAAGATGGAACTC240ATTGTCCATTTTCCAGAATGTATTTCCAAGCCCATCAATG280GGACCTGATACTGCTGTTCTGTGTTGAAATGCTTGAAGAA320CTCCTGCATCTCTGCTTGCATCTTCCATCCTACTGAAACC360ATGGTCTTCTCGGCAGTGTTGACTGCGTTCCATACCGGGA400CATCCAACACAACATTTGTCGTGTATGAAAACACCTACAT440GAATATTACACTCCCTCCACCATTCCAGCATCCTGACCTC480AGTCCATTGCTTAGATATAGTTTTGAAACCATGGCTCCCA520CTGGTTTGAGTTCCTTGACCGTGAATAGTACAGCTGTGCC560CACAACACCAGCAGCATTTAAGAGCCTAAACTTGCCTCTT600CAGATCACCCTTTCTGCTATAATGATATTCATTCTGTTTG640TGTCTTTTCTTGGGAACTTGGTTGTTTGCCTCATGGTTTA680CCAAAAAGCTGCCATGAGGTCTGCAATTAACATCCTCCTT720GCCAGCCTAGCTTTTGCAGACATGTTGCTTGCAGTGCTGA760ACATGCCCTTTGCCCTGGTAACTATTCTTACTACCCGATG800GATTTTTGGGAAATTCTTCTGTAGGGTATCTGCTATGTTT840TTCTGGTTATTTGTGATAGAAGGAGTAGCCATCCTGCTCA880TCATTAGCATAGATAGGTTCCTTATTATAGTCCAGAGGCA920GGATAAGCTAAACCCATATAGAGCTAAGGTTCTGATTGCA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。