基因總覽
GPR62(G protein-coupled receptor 62)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 G protein-coupled receptor 1 family。GPR62 是孤兒受體,來源未指出其已知配體。這種多次穿膜蛋白由 368 個胺基酸組成,具有七段跨膜螺旋,並由細胞外與細胞質區段交替連接;其 C 端大部分位於細胞質側,末端區域被註記為無序。這些結構特徵構成 GPR62 作為膜受體的基本架構。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000322241 ★ | 51,955,381–51,957,499 | 1 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
GPR62 即使沒有外加刺激,也能持續啟動 G 蛋白相關訊號。來源指出,這種構成性活性涉及 G(q/11)/inositol phosphate 路徑,以及 G(s)-alpha/cAMP 路徑,顯示 GPR62 可連結不同的訊號傳遞分支。這些結果描述的是受體自發活化的能力,來源未提供促成此活性的具體分子機制。
除了 G 蛋白訊號,GPR62 也具有自發促進 beta-arrestin 招募的活性。這項描述同樣不以外加致效劑為條件,指出受體可在沒有 agonist 的情況下與 beta-arrestin 相關聯;來源未進一步說明此招募在此處對下游訊號造成的具體影響。
GPR62 與 melatonin receptor MTNR1B 之間,訊號功能會彼此調節。資料將這種互相調節與受體異源聚合相連,但以「最可能」描述其機制,因此不能視為已確立的解釋。這項關係表示 GPR62 的訊號表現可能受到另一受體共同存在的影響;來源未詳述調節方向、條件或其生理後果。
總括而言,來源所支持的功能重點是 GPR62 的構成性訊號活性、無刺激時的 beta-arrestin 招募,以及與 MTNR1B 之間可能透過異源聚合產生的互相調節。現有資料未指出其內源性配體,也未提供足以界定這些作用在特定組織或生理情境中意義的資訊。
Promoter 與基因調控
>GPR62 ENST00000322241 GRCh38 chr3:51954381-51955481 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GTGACTTTGCCTGGGGGCATATGCCCCACGGGAGTTACATGGCTTTCCATGAGCCAACGACATTGGGGTG GGGAACCCTGACATTCACTGATTAGTCAAGACTGGGTTTTGTGCCTAATCAGGAAAATAGAGTGTGGGGA TCTTGTTCACCCAAATTTCCTGTCCTGAGAATTGGGGAGGGGTGGTTTCCTAAAGAAAATTCAGGGTGTT TAGCCAGGTGTGGTGGCTCGTGCCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCGTTTGAG CCTGGGAGGCAGAGATTACAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGACCCTG TCTCAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAGAAAATTCAGGGTGCTGTTACCAAAAGGGGACCTGTTTGCTAGCAG CAAAAACAAAAGCAAACAACAGCAACAAAAAACCAAACAGCATCTGCCTGCTAAGGCCTCCTCTCACTCA TCTCACACACTATCATGGAGCACCTATTCTCTATGAAGTTAATATTAGCTGAGCACCTACTATGTGCCAC GTTCTATGCTTTTCTCTCACTTTTCCAGCCTCCTTTCTTTCTGAGAGAACTAGCCCTCTTGGGGGGCCAG GGCATGCCTAAGGGTCCTCCTGCTTCAGCTTTTGTCTCACTGGTACCTCAGTTTCCCTTTAATATGAGAG CTAAATGCTCATCCCATTGATGAGGATGGGGCAGGACAGGAGATGGGGGGGGCACTTCTCACCACTGAGA AAGGTAGAGCAGGCTCTGGCTGACTCCAAAGCCCACACTCTAACCCTCTCAAGTCTAGGCTCCAAGTCTG TGCCTGCTCTGTCCTCCACCCCTCCACCCTAGAGGCACCCCCAAGCACTTCCACAGCAGAGCCTCCAGCC TTCAGCTGGCAGCTGCTAGGACCCAGGGGGCTGGCGCCAGGCCCTGCCCCTCCCTTGCCAGCCGTGTGTG GCAACATCAGAGTGACAGCCAGTACCATCTCCGACAGGGGCTGAGTTGCTGGAGCTGGGCTGGGGCAGGG GAGAAAGACAGCAGACTCATCCTTGCACCCCTCCATGGGCCTGGCCAAGCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR3_9QLQT · enhancer · 51953471–51953810 · regulatory
ENSR3_83J8KP · promoter · 51955224–51955391 · regulatory
· motif · 51953560–51953571 · motif
· motif · 51954310–51954323 · motif
· motif · 51956163–51956172 · motif
· motif · 51956429–51956445 · motif
· motif · 51956429–51956445 · motif
· motif · 51959303–51959315 · motif
· motif · 51959304–51959319 · motif
· motif · 51959305–51959312 · motif
· motif · 51959305–51959318 · motif
· motif · 51959305–51959319 · motif
· motif · 51959305–51959320 · motif
· motif · 51959310–51959322 · motif
· motif · 51959312–51959319 · motif
· motif · 51959374–51959381 · motif
· motif · 51959374–51959387 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:368 aa
GPR62 蛋白質長 368 個胺基酸,具有七段跨膜螺旋,屬於 G protein-coupled receptor 1 family。其跨膜區段間分布細胞外與細胞質區域;C 端位於細胞質側,其中第 332 至 368 位胺基酸區域被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
GPR62 位於細胞膜,也可見於胞內體膜。 來源另指出 GPR62 與 ARRB2 在胞內體共定位;此描述限於兩者的位置重疊,並未單獨界定 ARRB2 的其他定位。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- RAMP1O60894 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- RAMP2O60895 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
GPR62 可形成同源二聚體,此項關係標示為依相似性推定。另有資料指出 GPR62 與 MTNR1B 形成異源二聚體。GPR62 也會在自發、非依賴 agonist 的情況下與 ARRB1、ARRB2 互作,並伴隨 GPR62 內化至胞內體;此處描述的是互作與內化的關聯。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | GPR62 是孤兒 G protein-coupled receptor,可持續活化 G(q/11)/inositol phosphate 與 G(s)-alpha/cAMP 訊號路徑,也會自發促進 beta-arrestin 招募。它與 melatonin receptor MTNR1B 的訊號功能可能互相調節,推測與受體異源聚合有關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Orphan G protein-coupled receptor. Constitutively activates the G(q/11)/inositol phosphate and the G(s)-alpha/cAMP signaling pathways. Has spontaneous activity for beta-arrestin recruitment. Shows a reciprocal modulation of signaling functions with the melatonin receptor MTNR1B most likely through receptor heteromerization PMID 28827538 ↗ |
| 交互作用 | GPR62 可形成同源二聚體,此項資訊為依相似性推定;另會與 MTNR1B 形成異源二聚體。GPR62 在自發且不依賴 agonist 的情況下與 ARRB1、ARRB2 互作,並伴隨受體內化至胞內體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimers (By similarity). Forms heterodimer with MTNR1B. Interacts with ARRB1 and ARRB2 in a spontaneous and agonist-independent manner; leading to the internalization of GPR62 in the endosomal compartment PMID 28827538 ↗ |
| 細胞定位 | GPR62 是多次穿膜蛋白,定位於細胞膜與胞內體膜;另有資料指出 GPR62 與 ARRB2 在胞內體共定位。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Endosome membrane / Multi-pass membrane protein; Colocalizes with ARRB2 in the endosome PMID 28827538 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTACCATCTCCGACAGGGGCTGAGTTGCTGGAGCTGGGC40TGGGGCAGGGGAGAAAGACAGCAGACTCATCCTTGCACCC80CTCCATGGGCCTGGCCAAGCCCCCAAGAGGATGGCAGCCT120GGGCGTCGGAGCCACCTCCTGGGCAGCCAATGAGGTGAGG160GGCCGGAGGAGCAAGGGACAAGAGGAGCAGAGGACAGGTG200ATGGAAATCCTGCAGCTTTAGGCTCCATTCTGCCATCTAC240ATCCCAGCGCAGGGTGAAGCCTGAGAGCCCAAATGGCCAA280CTCCACAGGGCTGAACGCCTCAGAAGTCGCAGGCTCGTTG320GGGTTGATCCTGGCAGCTGTCGTGGAGGTGGGGGCACTGC360TGGGCAACGGCGCGCTGCTGGTCGTGGTGCTGCGCACGCC400GGGACTGCGCGACGCGCTCTACCTGGCGCACCTGTGCGTC440GTGGACCTGCTGGCGGCCGCCTCCATCATGCCGCTGGGCC480TGCTGGCCGCACCGCCGCCCGGGCTGGGCCGCGTGCGCCT520GGGCCCCGCGCCATGCCGCGCCGCTCGCTTCCTCTCCGCC560GCTCTGCTGCCGGCCTGCACGCTCGGGGTGGCCGCACTTG600GCCTGGCACGCTACCGCCTCATCGTGCACCCGCTGCGGCC640AGGCTCGCGGCCGCCGCCTGTGCTCGTGCTCACCGCCGTG680TGGGCCGCGGCGGGACTGCTGGGCGCGCTCTCCCTGCTCG720GCACGCCGCCCGCACCGCCCCCTGCTCCTGCTCGCTGCTC760GGTCCTGGCTGGGGGCCTCGGGCCCTTCCGGCCGCTCTGG800GCCCTGCTGGCCTTCGCGCTGCCCGCCCTCCTGCTGCTCG840GCGCCTACGGCGGCATCTTCGTGGTGGCGCGTCGCGCTGC880CCTGAGGCCCCCACGGCCGGCGCGCGGGTCCCGACTCCAC920TCGGACTCTCTGGATAGCCGCCTTTCCATCTTGCCGCCGC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。