基因總覽
GPR61 是蛋白質編碼基因,產物為 G protein-coupled receptor 61,屬於 G protein-coupled receptor 1 family。這是一種多次穿膜的受體蛋白,具有七段跨膜螺旋;其胞外與細胞質區段交替分布,N 端部分區域則被註記為無序區。來源將它描述為孤兒 G protein-coupled receptor,亦即此處未列出已知配體。其受體功能包括持續活化 G(s)-alpha/cAMP 訊號;來源另指出它與 melatonin receptor MTNR1B 有可能透過受體異源聚合呈現互相調節。食物攝取與體重調節則僅列為相似性推論所支持的可能關聯。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000527748 ★ | 109,539,872–109,547,260 | 2 |
| ENST00000689084 | 109,539,872–109,547,237 | 3 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
GPR61 被描述為孤兒 G protein-coupled receptor,來源未指出其配體。其一項已報告的訊號特性,是不需先描述外加刺激便可持續活化 G(s)-alpha/cAMP 訊號路徑;這是來源明確列出的受體功能,但資料未進一步說明啟動該訊號的分子步驟或其下游效應,因此不宜延伸推定特定細胞反應。
GPR61 與 melatonin receptor MTNR1B 之間具有互相調節的關係,來源認為這很可能透過受體異源聚合形成。此處的「很可能」表示異源聚合是對調節關係的可能解釋,而非來源確認的唯一機制;資料也未提供調節方向、條件或具體訊號變化,故不能進一步界定兩種受體如何彼此影響。
此外,GPR61 可能參與食物攝取與體重的調節,但這項關聯標示為 By similarity,屬於依相似性推論的資訊,並非此來源所述的直接功能證據。現有資料支持將它視為待進一步釐清的可能生物學角色,而不能據此認定 GPR61 對進食或體重具有已確立的因果作用。
Promoter 與基因調控
>GPR61 ENST00000527748 GRCh38 chr1:109538872-109539972 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTGGCCTGTAGGATGTCCTACAGCTTTGCAATGTTAGGATTCTATCCTTGGGTATCAGTCATGTACCCGG GTAAATGATCATTTTCTTCATAGCTAGAGGGAGGCCATGCCCCTTCATTGCGTCTCTGAAGGCCCATCAT GCCACAGATGGGCGATGCTCAGTGGCTGATGCTACCTAGCTCTGTCCAGTCCCACAAATCCAGATCAGTG TGAGCATTCCTGAGTCCCTGGCCCCCACTCTGTCTCCTTCAGGAAGCAGTGTTGTGGTGGTTCCCATGGT GGCTCGGGGGGATGTTAGATCCTCCCGCCCCCTCCCTGCCAATCTCCATCAGCCCTCACAGCCCCAGTTC CAATAAACATACAATCTAAGCAAATAATAATAATGTGCTTTTGGGAGGCAAGGGCAGGGTTAAGACAAAG CCTTCAGCTGCCCTTCAAACCTGAGTGCTGCTCCTAAACCTGTCCCCCATACGCATTAGGCAGCTTCCAA AGGGGCCAAACCTTGGACCATCCCCTGGAGCCTCAGCCGCCTCCCTGGCCTAAGCCTTGGGGCCCTGGGT CTGCGCTGACCTGCCTGCATCAGCACCTTGGTTCTGATGTCACACAGAACCATGCATCTCTCCTATCTTC TCTTTGAACTGCTAAGAAATCAAGGCCAAAATGCAACTTGCCCAAGGTCACACGGCTAGTAAGTGCCATA GCCAGGCCTTAAACCTGGATTTTCTGACTCCATGTACTTTTTTTTTTACTTCATCAGGCTGGTCAAGAGG GTCTCCCCTACCTATCATTTCCTGGCCCCACGAAATTTTTGAGACGCAATCCAGCAGCCTGAGAGAAGTG AGAGGAGTTGAGCTCACTGCCAGGCACCTTGCCTGGGGCATTGGTGCCCACCTTTTTGCTCCAGAAGTGA CTCTGAGGGGCTGGGTGGGAAGCAGGAGGCCATTAGGACCCAGAGGCTCTCGGAGCACTCTGCTTTGCCG GCTGCCTCTCACCGCTCACTGCAGTGCTTCAGGCTTCAGCAGCCTTGGAGAAGCATCAGCTGAGAGGAGC TATCACATGGGAGCCGGGACTGCTCAGCAAAGGTAGGAGTTGCCGACTAGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR1_BRPX8 · enhancer · 109535932–109536481 · regulatory
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:451 aa
G protein-coupled receptor 61 長 451 個胺基酸,屬於 G protein-coupled receptor 1 family。序列註解預測其具有七段跨膜螺旋;N 端第 1–31 個胺基酸區段另標示為無序區。胞外、細胞質區域與跨膜螺旋沿序列交錯排列,C 端第 345–451 個胺基酸位於細胞質側。
蛋白質三維結構
細胞內定位
GPR61 位於細胞膜,也可出現在胞內體膜。 來源另記載它與 ARRB2 在胞內體共定位;這項資訊描述兩者所在位置重疊,並不表示 ARRB2 的定位可直接推定為 GPR61 的其他定位。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 23 個夥伴
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GPR61 與 MTNR1B 形成異源二聚體;另有資料將兩者的互相調節描述為很可能透過受體異源聚合。GPR61 也會以自發且不依賴致效劑的方式與 ARRB1、ARRB2 互作,並導致 GPR61 內化至胞內體區室。這些資料分別涉及受體複合體、蛋白質互作及內化結果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | GPR61 是孤兒 G protein-coupled receptor,能持續活化 G(s)-alpha/cAMP 訊號路徑。它與 melatonin receptor MTNR1B 具有互相調節關係,且此作用很可能透過受體異源聚合發生;此外,GPR61 可能參與食物攝取及體重調節,但此項資訊是依相似性推論。 | 含實驗來源 | 證據與來源Orphan G protein-coupled receptor. Constitutively activates the G(s)-alpha/cAMP signaling pathway. Shows a reciprocal regulatory interaction with the melatonin receptor MTNR1B most likely through receptor heteromerization. May be involved in the regulation of food intake and body weight (By similarity) PMID 28827538 ↗ |
| 交互作用 | GPR61 與 MTNR1B 形成異源二聚體。GPR61 也會自發且不依賴致效劑地與 ARRB1、ARRB2 互作;這些互作會導致 GPR61 內化至胞內體區室。 | 含實驗來源 | 證據與來源Forms heterodimer with MTNR1B. Interacts with ARRB1 and ARRB2 in a spontaneous and agonist-independent manner; leading to the internalization of GPR61 in the endosomal compartment PMID 28827538 ↗ |
| 細胞定位 | GPR61 是多次穿膜蛋白,可定位於細胞膜與胞內體膜。來源另指出 GPR61 與 ARRB2(beta-arrestin-2)在胞內體共定位;此描述為共定位,不等同於證明兩者直接結合。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Endosome membrane / Multi-pass membrane protein; Colocalizes with ARRB2/beta-arrestin-2 in the endosome PMID 28827538 ↗ · PMID 29226084 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCAGTGCTTCAGGCTTCAGCAGCCTTGGAGAAGCATCAGC40TGAGAGGAGCTATCACATGGGAGCCGGGACTGCTCAGCAA80AGATGGATTTATGAGGAAACTGAAATTCAGAAGATTCACA120GAGTTAGTAATGCCCAGAACTGGGACTAGAAACTAAATTT160TGTGCTCCTTCTACTCCCCAGCAGCTCTTGCCATTCTGAG200GAGACAAGAAATCAGGAAATTTACATAAGGAACCCTAAAA240CTGAGGCACTATCCCAGAGATCAGCAGGACCCTGGGAAGG280AGAAACAGGATTTAGAATCCCCGGCTAACAGTTCTGGAAA320GGGTAGAAGGGTATGGAGAACAAGAATGGCAGAAAGGAGA360TGGAAAAGGAAGAGGTGAAGGCCATTCCGAAAGCGGAGTG400TTGAGTGGGTCAGGCTCCTGCACCTCTCACGTCTCCTGCT440TCTTAGCAGTCACCAAGGCAGACCCTGCAGCTACCTCCGG480CCAGAAAGGGGATGAGCTTCTGATCCTTCAGCTGCCTGGC520CTGGCGCTCTGTACGCAGACAAACCTGCCCAAGAGGCTCC560AGTGGGAGGTGCCCCCTACGAAACCAGGAAGCCTGGGCCT600GGGCTCGCCATCCCAGGGTCGCTGGACTAGGATGGGGGAT640GGGCCTGTGACAGGAGGTACCCTGGGTGCCCTCTTTCGGC680CCCATGGAGTCCTCACCCATCCCCCAGTCATCAGGGAACT720CTTCCACTTTGGGGAGGGTCCCTCAAACCCCAGGTCCCTC760TACTGCCAGTGGGGTCCCGGAGGTGGGGCTACGGGATGTT800GCTTCGGAATCTGTGGCCCTCTTCTTCATGCTCCTGCTGG840ACTTGACTGCTGTGGCTGGCAATGCCGCTGTGATGGCCGT880GATCGCCAAGACGCCTGCCCTCCGAAAATTTGTCTTCGTC920TTCCACCTCTGCCTGGTGGACCTGCTGGCTGCCCTGACCC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。