演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

GPR137BTM7SF1

G protein-coupled receptor 137B

GPR137B 是 GPR137 family 的多次穿膜蛋白,位於溶酶體膜,可調節 mTORC1 與 Rag GTPases 的溶酶體定位及活性,並參與溶酶體形態與自噬的調控。

Homo sapiens1q42.3UniProt O60478
OFFICIAL SYMBOL
GPR137B
CHROMOSOME
1
UNIPROT
O60478
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

GPR137B(G protein-coupled receptor 137B)是蛋白質編碼基因,產物為 GPR137 family 的膜蛋白。其蛋白質長 399 個胺基酸,具有七段跨膜螺旋,並含有朝向膜腔與細胞質的區段;N 端部分區域被註記為無序。這些拓撲特徵符合其作為溶酶體整合膜蛋白的性質。現有資料指出,GPR137B 的主要角色與溶酶體中的訊號調控及細胞內膜系統功能相關;其具體分子作用方式與生物學過程另見功能說明。

Official symbol
GPR137B
Gene name
G protein-coupled receptor 137B
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:11862
UniProt
O60478
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
TM7SF1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11q42.3
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegGPR137Bpq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr1:236,142,148–236,253,151
Gene span
111,004 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000366592 ★236,142,539–236,208,9077
ENST00000972103236,142,148–236,213,5258
ENST00000889782236,142,436–236,210,6815
ENST00000889783236,142,436–236,210,2778
ENST00000889784236,142,436–236,208,9066
ENST00000889785236,142,436–236,208,9076
ENST00000889786236,142,436–236,208,9078
ENST00000972104236,142,436–236,210,3317
ENST00000972105236,142,436–236,208,9044
ENST00001007807236,142,436–236,210,2767
ENST00001108337236,142,436–236,186,1565
ENST00001108338236,142,436–236,180,2434

顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

GPR137B 是溶酶體整合膜蛋白,參與調節 mTORC1 的定位與活性。mTORC1 是促進細胞生長的訊號複合體,其反應與生長因子、能量狀態及胺基酸有關。GPR137B 透過與 Rag GTPases 互作,提高 Rag GTPases 在溶酶體的定位與活性,進而調節 mTORC1 移至溶酶體及其在該處的活性。這些資料將 GPR137B 的作用連結到溶酶體上的訊號調控,但未進一步說明其如何感知或整合上述各類訊號。

GPR137B 也參與溶酶體形態與自噬的調控。現有資料未具體描述溶酶體形態改變的方向或自噬受調節的分子步驟,因此不宜據此推定其作用是促進或抑制自噬,也無法判定這些作用與 mTORC1 調節之間的先後或因果關係。

此外,依相似性推定,GPR137B 可能是破骨細胞活性的負向調節因子,並可能參與 interleukin-4 誘導的 M2 巨噬細胞極化。這兩項功能屬於相似性推論,證據性質不同於前述有 PubMed 文獻支持的溶酶體功能;可據此指出其可能涉及骨吸收相關細胞及巨噬細胞狀態,但不能視為已確立的作用機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 236142539 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>GPR137B ENST00000366592 GRCh38 chr1:236141539-236142639 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTCGGGTGGCGGGGACAGACCCTCCTTCGGCATGGGTTGGATCGGACAAGGGGGGCCGTGTGCCGTCAGC
TGCCCCACTTCTCTCTGAAGCCCAGTGGGCTCCATCCACTGACCCGCGGCCCGCGCGCCTCCCGGCACCG
GCTACATCGCTGGGAGGTGAGGCGCTGGGAGCGCGTGAGGCTCTCCGGGAGAAAACAGCCCAGCTTGCAT
CCCAGAGGAGGCAGCAGCCGCAGGCACCGTCTATTTCCTCACTCAGTATACAAATTTGACCTCAAAAATA
CGAACCCTGTCTTTGGCATGTCTGCATTTAGAAATAAACATCATTCCAGACGCCGGCCAGTTCATAGCCA
CAGAGTCGTAAAGTTTTATTTTTAAAGGGGGGGACGGAAAGGACTTGTAAAGTTTTTTTTTTAAATTTGT
TTTTAAATAAAGGAATTAACTTCTGCAAAACAAGCAATCAGCAGCAGAATGCGCGAGGCCACGAGTGCGA
TCCCCCGAGGCGCGGGGCGCGGCTGGGAAGTTTTGGGGGCGCGCGGCGCGGTGCCGGGACCGGGGAGGAG
GCGCGCGGTTCTGGGGGCGCGCAGTGCGGGAGCGCGCGGCCCCGGGGATGGGGAAGGGGCCGGGGACGGG
TAGCGCGCGGCCCCTGGGATGGGGAGGGGGCGGGAAGGGGGGAAGAGACGCGGGGCTCTGGGGGCCCGCA
GTCTGGGAGCGCGCGGCCCCGGGGATGGGGAGGGGGCCGGGAGGAGGCGTGCGGCTCTGGGGGCGCGCAC
TGCGGGAGCGCGCGGTGGCGAGGATAGGGCGGGCCGGGGTTCGCGGGGCGAAGGCGCGCGGTGCCCGGGG
GAGGGCGGGCCGGGGCGCGCGGGCCGGGGCGGGGGCGCGCGGGCCGGGGCGGGGGCGCGCGGGGCCGGTC
GGCGCGCGGGGGCGGCGGGCGCGGCGCTGCCAATCGCAGACAAAGGCCGTCCCAGTGAATCATGTGGTGC
CGGGGGAGGAAGTGCGGCTTGTTTTCTTTCCTCCAGTCTCGGGGCTGCAGGCTGAGCGCGATGCGCGGAG
ACCCCCGCGGGGGCGGCGGCGGCCGTGAGCCCCGATGAGGCCCGAGCGTCC
GPR137B 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
GPR137B_1 ↗1:236,142,553正股236,142,504–236,142,563

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_543JLZW · CTCF_binding_site · 236137650–236137671 · regulatory

ENSR1_95GPMR · enhancer · 236140758–236141048 · regulatory

ENSR1_95GPN7 · promoter · 236142049–236142549 · regulatory

ENSR1_B3PTCG · enhancer · 236144579–236145152 · regulatory

ENSR1_543JN8L · CTCF_binding_site · 236144930–236144951 · regulatory

ENSR1_543JN99 · CTCF_binding_site · 236145072–236145093 · regulatory

· motif · 236137652–236137668 · motif

· motif · 236141058–236141069 · motif

· motif · 236142404–236142417 · motif

· motif · 236142424–236142437 · motif

· motif · 236142434–236142447 · motif

· motif · 236142451–236142464 · motif

· motif · 236142592–236142605 · motif

· motif · 236142598–236142611 · motif

· motif · 236142709–236142722 · motif

· motif · 236142719–236142726 · motif

· motif · 236142860–236142873 · motif

· motif · 236143116–236143129 · motif

· motif · 236143190–236143205 · motif

· motif · 236143387–236143400 · motif

· motif · 236143387–236143400 · motif

· motif · 236143702–236143713 · motif

· motif · 236144597–236144608 · motif

· motif · 236144821–236144832 · motif

· motif · 236144932–236144948 · motif

· motif · 236144954–236144965 · motif

· motif · 236145074–236145090 · motif

· motif · 236145577–236145592 · motif

· motif · 236145582–236145594 · motif

· motif · 236145585–236145600 · motif

· motif · 236145754–236145769 · motif

· motif · 236145783–236145798 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:399 aa

1 aa399 aa功能區域跨膜區拓樸區域
依 O60478 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

GPR137B 蛋白長 399 個胺基酸,屬於 GPR137 family,具有七段跨膜螺旋。其膜拓撲包含交替朝向膜腔與細胞質的區段,C 端為細胞質側區域;N 端第 1 至 22 個胺基酸另註記為無序區。資料未提供其他功能區域或結構域註解。

拓樸區域Lumenal1–46 aa
跨膜區Helical; Name=147–67 aa
拓樸區域Cytoplasmic68–79 aa
跨膜區Helical; Name=280–100 aa
拓樸區域Lumenal101–111 aa
跨膜區Helical; Name=3112–132 aa
拓樸區域Cytoplasmic133–159 aa
跨膜區Helical; Name=4160–180 aa
拓樸區域Lumenal181–188 aa
跨膜區Helical; Name=5189–209 aa
拓樸區域Cytoplasmic210–237 aa
跨膜區Helical; Name=6238–258 aa
拓樸區域Lumenal259–292 aa
跨膜區Helical; Name=7293–313 aa
拓樸區域Cytoplasmic314–399 aa
功能區域Disordered1–22 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O60478…

AlphaFold · O60478

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Lysosome membrane

GPR137B 是多次穿膜蛋白,定位於溶酶體膜。 胺基酸刺激後,GPR137B 與 MTOR 在溶酶體中共定位;資料未提供不同異構型的定位差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
TM7SF1GPR137BTRIM32USP20USP33
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

GPR137B 與 RRAGA 互作,並提高 RRAGA 被募集至溶酶體的程度。GPR137B 也與 MTOR 互作,而此互作對胺基酸具有敏感性。資料支持這些分子互作及 RRAGA 募集關係,未指出 GPR137B 與上述分子構成特定複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能GPR137B 是溶酶體整合膜蛋白,可調節 mTORC1 的定位與活性;mTORC1 會依生長因子、能量狀態及胺基酸促進細胞生長。GPR137B 與 Rag GTPases 互作,增加其在溶酶體的定位與活性,並藉此調節 mTORC1 移至溶酶體及其活性;也參與溶酶體形態與自噬的調控。含實驗來源
證據與來源

Lysosomal integral membrane protein that regulates the localization and activity of mTORC1, a signaling complex promoting cell growth in response to growth factors, energy levels, and amino acids. Interacts with Rag GTPases and increases the lysosomal localization and activity of Rag GTPases and thereby regulates mTORC1 translocation and activity in lysosome. Involved in the regulation of lysosomal morphology and autophagy

PMID 31036939 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

功能依相似性推定,GPR137B 可能負向調節破骨細胞活性,也可能參與 interleukin-4 誘導的 M2 巨噬細胞極化;這些功能屬於推論,並非已確立的直接證據。推論支持
證據與來源

Also acts as a negative regulator of osteoclast activity (By similarity). Involved in interleukin-4-induced M2 macrophage polarization (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用GPR137B 與 RRAGA 互作,並增加 RRAGA 被募集至溶酶體的程度;它也與 MTOR 互作,且此互作會受到胺基酸影響。含實驗來源
證據與來源

Interaction with RRAGA; increases RRAGA recruitment to lysosomes. Interacts with MTOR; this interaction is amino acid sensitive

PMID 31036939 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位GPR137B 是多次穿膜蛋白,定位於溶酶體膜;胺基酸刺激後,GPR137B 與 MTOR 在溶酶體中共定位。含實驗來源
證據與來源

Lysosome membrane / Multi-pass membrane protein; Colocalized with MTOR in lysosome after amino acid stimulation

PMID 22729905 ↗ · PMID 31036939 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000366592 · 2,033 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1GTTTTCTTTCCTCCAGTCTCGGGGCTGCAGGCTGAGCGCG40
41ATGCGCGGAGACCCCCGCGGGGGCGGCGGCGGCCGTGAGC80
81CCCGATGAGGCCCGAGCGTCCCCGGCCGCGCGGCAGCGCC120
121CCCGGCCCGATGGAGACCCCGCCGTGGGACCCAGCCCGCA160
161ACGACTCGCTGCCGCCCACGCTGACCCCGGCCGTGCCCCC200
201CTACGTGAAGCTTGGCCTCACCGTCGTCTACACCGTGTTC240
241TACGCGCTGCTCTTCGTGTTCATCTACGTGCAGCTCTGGC280
281TGGTGCTGCGTTACCGCCACAAGCGGCTCAGCTACCAGAG320
321CGTCTTCCTCTTTCTCTGCCTCTTCTGGGCCTCCCTGCGG360
361ACCGTCCTCTTCTCCTTCTACTTCAAAGACTTCGTGGCGG400
401CCAATTCGCTCAGCCCCTTCGTCTTCTGGCTGCTCTACTG440
441CTTCCCTGTGTGCCTGCAGTTTTTCACCCTCACGCTGATG480
481AACTTGTACTTCACGCAGGTGATTTTCAAAGCCAAGTCAA520
521AATATTCTCCAGAATTACTCAAATACCGGTTGCCCCTCTA560
561CCTGGCCTCCCTCTTCATCAGCCTTGTTTTCCTGTTGGTG600
601AATTTAACCTGTGCTGTGCTGGTAAAGACGGGAAATTGGG640
641AGAGGAAGGTTATCGTCTCTGTGCGAGTGGCCATTAATGA680
681CACGCTCTTCGTGCTGTGTGCCGTCTCTCTCTCCATCTGT720
721CTCTACAAAATCTCTAAGATGTCCTTAGCCAACATTTACT760
761TGGAGTCCAAGGGCTCCTCCGTGTGTCAAGTGACTGCCAT800
801CGGTGTCACCGTGATACTGCTTTACACCTCTCGGGCCTGC840
841TACAACCTGTTCATCCTGTCATTTTCTCAGAACAAGAGCG880
881TCCATTCCTTTGATTATGACTGGTACAATGTATCAGACCA920
921GGCAGATTTGAAGAATCAGCTGGGAGATGCTGGATACGTA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。